Add support for R package knitr (a Sweave alternative)

This fixes #7887.

git-svn-id: svn://svn.lyx.org/lyx/lyx-devel/trunk@40674 a592a061-630c-0410-9148-cb99ea01b6c8

Forgot that in r40669.

git-svn-id: svn://svn.lyx.org/lyx/lyx-devel/trunk@40670 a592a061-630c-0410-9148-cb99ea01b6c8

reat python scripts as plain data file, since automake 1.11.2 wants to control where python files go. This fixes #6080 and #7990.

git-svn-id: svn://svn.lyx.org/lyx/lyx-devel/trunk@40669 a592a061-630c-0410-9148-cb99ea01b6c8

lyx_2_1.py: there is no need for a comma here, it is already the last entry of the list

git-svn-id: svn://svn.lyx.org/lyx/lyx-devel/trunk@40668 a592a061-630c-0410-9148-cb99ea01b6c8

Small fixups to r40663

lyx2lyx: Clean up the convert/revert queue.
LaTeXFeatures: Just add cancel to the list of packages that are
               simply used with a \usepackage{} line.

Uwe: In case cancel needs to be loaded after amsmath or something,
     please revert my changes to LaTeXFeatures and add a comment
     about package ordering to the source. Thanks.

git-svn-id: svn://svn.lyx.org/lyx/lyx-devel/trunk@40667 a592a061-630c-0410-9148-cb99ea01b6c8

version.h: fix typos

git-svn-id: svn://svn.lyx.org/lyx/lyx-devel/trunk@40666 a592a061-630c-0410-9148-cb99ea01b6c8

installer: small updates

git-svn-id: svn://svn.lyx.org/lyx/lyx-devel/trunk@40665 a592a061-630c-0410-9148-cb99ea01b6c8

LaTeXConfig.lyx: mention the cancel package (addendum to r40663)

git-svn-id: svn://svn.lyx.org/lyx/lyx-devel/trunk@40664 a592a061-630c-0410-9148-cb99ea01b6c8

add support for the package cancel in math (fixes #6819); fileformat change only for the preamble handling

git-svn-id: svn://svn.lyx.org/lyx/lyx-devel/trunk@40663 a592a061-630c-0410-9148-cb99ea01b6c8

chkconfig.ltx: add check for wasy; is necessary because LyX supports the math command \brokenvert - OK for branch too?

git-svn-id: svn://svn.lyx.org/lyx/lyx-devel/trunk@40662 a592a061-630c-0410-9148-cb99ea01b6c8

Whitespace.

git-svn-id: svn://svn.lyx.org/lyx/lyx-devel/trunk@40660 a592a061-630c-0410-9148-cb99ea01b6c8

Reuse the same code for the append* and copy* functions

git-svn-id: svn://svn.lyx.org/lyx/lyx-devel/trunk@40659 a592a061-630c-0410-9148-cb99ea01b6c8

Unify the parameters of the [append/copy][row/column] family

git-svn-id: svn://svn.lyx.org/lyx/lyx-devel/trunk@40658 a592a061-630c-0410-9148-cb99ea01b6c8

Unify the parameters of the [append/copy][row/column] family

git-svn-id: svn://svn.lyx.org/lyx/lyx-devel/trunk@40657 a592a061-630c-0410-9148-cb99ea01b6c8

Fix bug #7644: Crash when copying table column or row

git-svn-id: svn://svn.lyx.org/lyx/lyx-devel/trunk@40656 a592a061-630c-0410-9148-cb99ea01b6c8

Fix problems with odg graphics (needs r40647 and r40649 as well):
- Remove ps->eps converter (see comment for the reason)
- Remove odg-> and odg->pdf converters, since they create A4 sized images
- Get rid of file extension assumption in eps2->eps converter
- Rename eps2 format to better reflect its usage

git-svn-id: svn://svn.lyx.org/lyx/lyx-devel/trunk@40650 a592a061-630c-0410-9148-cb99ea01b6c8

Enable the graphics converter to copy with identical in and out file names.
This is already supported in Converters::convert() and needed e.g. for
eps2->eps conversion.

git-svn-id: svn://svn.lyx.org/lyx/lyx-devel/trunk@40649 a592a061-630c-0410-9148-cb99ea01b6c8

Do not py-compile also on cmake build

git-svn-id: svn://svn.lyx.org/lyx/lyx-devel/trunk@40648 a592a061-630c-0410-9148-cb99ea01b6c8

Fix converters with input redirection, such as the second htlatex one.

git-svn-id: svn://svn.lyx.org/lyx/lyx-devel/trunk@40647 a592a061-630c-0410-9148-cb99ea01b6c8

keywords in preferences are case insensitive

git-svn-id: svn://svn.lyx.org/lyx/lyx-devel/trunk@40646 a592a061-630c-0410-9148-cb99ea01b6c8

moderncv.layout: correct the format number (accidentally changed in r40640)

git-svn-id: svn://svn.lyx.org/lyx/lyx-devel/trunk@40642 a592a061-630c-0410-9148-cb99ea01b6c8

- moderncv.layout: add missing separator style
- modernCV.lyx: set page size to A4, correct subsection entry, use a separator modify preamble to be compliant with modernCV 0.16 (fixes #7991)
- biblioExample.bib: correct a much too long entry

git-svn-id: svn://svn.lyx.org/lyx/lyx-devel/trunk@40640 a592a061-630c-0410-9148-cb99ea01b6c8

Fix crash when putting a float around multiple display maths (bug #7974).

This also fixes other float-related bugs, such as this:

* select two floats in two consecutive paragraphs and insert a new float around them
=> the master float's caption is put into the lower subfloat instead of below the subfloats.

In the long term, doInsertInset needs a thorough cleanup.

git-svn-id: svn://svn.lyx.org/lyx/lyx-devel/trunk@40639 a592a061-630c-0410-9148-cb99ea01b6c8

Fix crash due to the attempt to access paragraph() from within mathed while doing forward-search (bug #7992).

This should go to branch as well.

git-svn-id: svn://svn.lyx.org/lyx/lyx-devel/trunk@40636 a592a061-630c-0410-9148-cb99ea01b6c8

Remove from svn the files that are provided by automake. This ensures that we always use the correct version.

git-svn-id: svn://svn.lyx.org/lyx/lyx-devel/trunk@40635 a592a061-630c-0410-9148-cb99ea01b6c8

Do not load font packages with encoding "utf8-plain" (bug #7766, #7782).

git-svn-id: svn://svn.lyx.org/lyx/lyx-devel/trunk@40633 a592a061-630c-0410-9148-cb99ea01b6c8

If we don't have a tooltip in the TOC, then use the display string
as the tooltip. This isn't redundant, since the TOC itself might
truncate the display string.

git-svn-id: svn://svn.lyx.org/lyx/lyx-devel/trunk@40626 a592a061-630c-0410-9148-cb99ea01b6c8

Fix bug #7774. It should be fine to show the complete index entry
in the TOC, as these generally aren't that long.

git-svn-id: svn://svn.lyx.org/lyx/lyx-devel/trunk@40625 a592a061-630c-0410-9148-cb99ea01b6c8

Change minimum value in forToc().

git-svn-id: svn://svn.lyx.org/lyx/lyx-devel/trunk@40624 a592a061-630c-0410-9148-cb99ea01b6c8

Whitespace.

git-svn-id: svn://svn.lyx.org/lyx/lyx-devel/trunk@40617 a592a061-630c-0410-9148-cb99ea01b6c8

Fix bug #7983: Do not modify params before we know we have
something valid!

git-svn-id: svn://svn.lyx.org/lyx/lyx-devel/trunk@40615 a592a061-630c-0410-9148-cb99ea01b6c8

After r40612, the check for isFullUnicode is redundant. So, partially
revert r40607 and accordingly adapt the code.

git-svn-id: svn://svn.lyx.org/lyx/lyx-devel/trunk@40613 a592a061-630c-0410-9148-cb99ea01b6c8

Avoid \inputencoding altogether if the buffer encoding permits
(part of bug #7800).

git-svn-id: svn://svn.lyx.org/lyx/lyx-devel/trunk@40612 a592a061-630c-0410-9148-cb99ea01b6c8

If we switch via the mouse, we need to update the Buffer
after we switch.

git-svn-id: svn://svn.lyx.org/lyx/lyx-devel/trunk@40610 a592a061-630c-0410-9148-cb99ea01b6c8

Fix crash reported on list when renaming a child buffer and
    then trying to compile.

    There are really two problems here. One is that the renamed
    buffer needs to be reloaded. All kinds of files, etc, may not
    exist any more, if we've been saved to a new directory; our
    children e.g. may not be in the right place. And, in this case,
    we may no longer be a child of our old parent. Reloading will
    fix all of that.

    On reload, though, we need to clear our parent, since we may
    not have one any more. It will get reset if need be.

git-svn-id: svn://svn.lyx.org/lyx/lyx-devel/trunk@40609 a592a061-630c-0410-9148-cb99ea01b6c8

Squash warning.

git-svn-id: svn://svn.lyx.org/lyx/lyx-devel/trunk@40608 a592a061-630c-0410-9148-cb99ea01b6c8

Refine fix for bug #7800. Don't use \inputencoding with unicode backends.

git-svn-id: svn://svn.lyx.org/lyx/lyx-devel/trunk@40607 a592a061-630c-0410-9148-cb99ea01b6c8

get rid of dead code and silly function

git-svn-id: svn://svn.lyx.org/lyx/lyx-devel/trunk@40605 a592a061-630c-0410-9148-cb99ea01b6c8

* sk.po

git-svn-id: svn://svn.lyx.org/lyx/lyx-devel/trunk@40604 a592a061-630c-0410-9148-cb99ea01b6c8

#7789 unify and fix buffer statistics

git-svn-id: svn://svn.lyx.org/lyx/lyx-devel/trunk@40602 a592a061-630c-0410-9148-cb99ea01b6c8

#7978 validate stored doc iterators for start position and selection range to avoid crashes in case the user does the spell check and unrelated changes in parallel

git-svn-id: svn://svn.lyx.org/lyx/lyx-devel/trunk@40601 a592a061-630c-0410-9148-cb99ea01b6c8

Be a bit more careful here. In weird cases, this can be null.

git-svn-id: svn://svn.lyx.org/lyx/lyx-devel/trunk@40600 a592a061-630c-0410-9148-cb99ea01b6c8

#7884 improved return code of EnchantChecker::check() when dictionaries are missing

git-svn-id: svn://svn.lyx.org/lyx/lyx-devel/trunk@40598 a592a061-630c-0410-9148-cb99ea01b6c8

Remove unused libreoffice2eps.py script.

git-svn-id: svn://svn.lyx.org/lyx/lyx-devel/trunk@40596 a592a061-630c-0410-9148-cb99ea01b6c8

Add gswin64c as possible executable in legacy_lyxpreview2ppm.py (#7938).

git-svn-id: svn://svn.lyx.org/lyx/lyx-devel/trunk@40595 a592a061-630c-0410-9148-cb99ea01b6c8

Update tex2lyx to format 424.

The type of citation engine is determined by the citation package
being used and, in the case of natbib, its options.

git-svn-id: svn://svn.lyx.org/lyx/lyx-devel/trunk@40593 a592a061-630c-0410-9148-cb99ea01b6c8

Buffer param \cite_engine_type (authoryear|numerical).

To avoid duplicity, remove natbib_authoryear and natbib_numerical
and replace them by natbib, and keep track of the engine `type'
in the new \cite_engine_type document setting. This will make it
easier to add more citation engines.

LyX format incremented to 424.

git-svn-id: svn://svn.lyx.org/lyx/lyx-devel/trunk@40592 a592a061-630c-0410-9148-cb99ea01b6c8

Fix bug #5906 (missing -p command) by updating the man page.
tex2lyx does not need a -p command since it detects partial files automatically.

git-svn-id: svn://svn.lyx.org/lyx/lyx-devel/trunk@40591 a592a061-630c-0410-9148-cb99ea01b6c8

Fix bug #7013: Wrong paper size passed to dvips

git-svn-id: svn://svn.lyx.org/lyx/lyx-devel/trunk@40590 a592a061-630c-0410-9148-cb99ea01b6c8

Fix bug #5029: Support \smash, \mathclap, \mathllap and \mathrlap.
Also improve lyx2lyx roundtrip for automatically loaded packages.

git-svn-id: svn://svn.lyx.org/lyx/lyx-devel/trunk@40589 a592a061-630c-0410-9148-cb99ea01b6c8

add openoffice/libreoffice converters (bugs #4267 and #7973)

git-svn-id: svn://svn.lyx.org/lyx/lyx-devel/trunk@40588 a592a061-630c-0410-9148-cb99ea01b6c8

Quick fix bug #4267.
A real fix would be to ditch the home made file format detection and use libmagic.

git-svn-id: svn://svn.lyx.org/lyx/lyx-devel/trunk@40587 a592a061-630c-0410-9148-cb99ea01b6c8

Avoid narrowing in array initializator

Gcc 4.7 warns that this kind of narrowing is illegal in C++11, so
we can just as well fix that right now.

In GuiFontMetrics this is fixed by chaning the types in the AscendDescend struct
from short int to int.
In ParagraphMetrics it is fixed by addint explicit casts.

git-svn-id: svn://svn.lyx.org/lyx/lyx-devel/trunk@40586 a592a061-630c-0410-9148-cb99ea01b6c8

Change to avoid having different types in ?: operator

Gcc 4.7 warns rightly about the questionalble practise of having different types in
the ?: operator. This patch fixes that.

git-svn-id: svn://svn.lyx.org/lyx/lyx-devel/trunk@40585 a592a061-630c-0410-9148-cb99ea01b6c8

This makes the FindAndReplace replace-related buttons de-activate
also when switching from an editable buffer to a read-only buffer,
without waiting for the moment in which the dialog is focused.

git-svn-id: svn://svn.lyx.org/lyx/lyx-devel/trunk@40582 a592a061-630c-0410-9148-cb99ea01b6c8

Math.lyx: port changes from branch

git-svn-id: svn://svn.lyx.org/lyx/lyx-devel/trunk@40581 a592a061-630c-0410-9148-cb99ea01b6c8

internal boost distribution missed an internal header file

git-svn-id: svn://svn.lyx.org/lyx/lyx-devel/trunk@40578 a592a061-630c-0410-9148-cb99ea01b6c8

elsarticle.lyx: convert to latest fileformat to reflect that it is not compatible with branch

git-svn-id: svn://svn.lyx.org/lyx/lyx-devel/trunk@40577 a592a061-630c-0410-9148-cb99ea01b6c8

elsarticle.layout: switch from \maketitle to \begin{frontmatter}, see #7977

git-svn-id: svn://svn.lyx.org/lyx/lyx-devel/trunk@40575 a592a061-630c-0410-9148-cb99ea01b6c8

Load mathtools.sty automatically (bug #7949) and make lyx2lyx reversion
more robust.

git-svn-id: svn://svn.lyx.org/lyx/lyx-devel/trunk@40574 a592a061-630c-0410-9148-cb99ea01b6c8

#7927 apply patch from mft to support posix packageing on Mac for the Gentoo prefix project

git-svn-id: svn://svn.lyx.org/lyx/lyx-devel/trunk@40573 a592a061-630c-0410-9148-cb99ea01b6c8

#7884 add check for missing dictionaries when spell check starts... forgot to implement numDictionaries for Enchant in r40568

git-svn-id: svn://svn.lyx.org/lyx/lyx-devel/trunk@40572 a592a061-630c-0410-9148-cb99ea01b6c8

Tutorial.lyx: port changes from branch

git-svn-id: svn://svn.lyx.org/lyx/lyx-devel/trunk@40571 a592a061-630c-0410-9148-cb99ea01b6c8

#7884 add check for missing dictionaries when spell check starts and popup a message box to tell the user this problem if there are no dictionaries; add /usr/share/myspell for hunspell dictionary lookup

git-svn-id: svn://svn.lyx.org/lyx/lyx-devel/trunk@40568 a592a061-630c-0410-9148-cb99ea01b6c8

UserGuide.lyx: port changes from branchUserGuide.lyx: final step of Scott's overhaul

git-svn-id: svn://svn.lyx.org/lyx/lyx-devel/trunk@40567 a592a061-630c-0410-9148-cb99ea01b6c8

UserGuide.lyx: port changes from branch

git-svn-id: svn://svn.lyx.org/lyx/lyx-devel/trunk@40565 a592a061-630c-0410-9148-cb99ea01b6c8

Second step towards a more generic package off/auto/on handling:
File format change

git-svn-id: svn://svn.lyx.org/lyx/lyx-devel/trunk@40563 a592a061-630c-0410-9148-cb99ea01b6c8

First step towards a more generic package off/auto/on handling:
Internal machinery, no file format change and no UI change yet

git-svn-id: svn://svn.lyx.org/lyx/lyx-devel/trunk@40562 a592a061-630c-0410-9148-cb99ea01b6c8

Fix #7963, fullscreen corner case for tabbar visibility.

git-svn-id: svn://svn.lyx.org/lyx/lyx-devel/trunk@40560 a592a061-630c-0410-9148-cb99ea01b6c8

* sk.po

git-svn-id: svn://svn.lyx.org/lyx/lyx-devel/trunk@40559 a592a061-630c-0410-9148-cb99ea01b6c8

#6760 add UI to configure the minimal length of a word to be added to the list of words for text completion - using richards patch and rework it to match current trunk

git-svn-id: svn://svn.lyx.org/lyx/lyx-devel/trunk@40557 a592a061-630c-0410-9148-cb99ea01b6c8

Math.lyx: improve description of modulo-functions, fixes #7961

git-svn-id: svn://svn.lyx.org/lyx/lyx-devel/trunk@40556 a592a061-630c-0410-9148-cb99ea01b6c8

#5585 disable spell checker dialog for empty documents

git-svn-id: svn://svn.lyx.org/lyx/lyx-devel/trunk@40552 a592a061-630c-0410-9148-cb99ea01b6c8

symbols: fix #7962, OK for branch too?

git-svn-id: svn://svn.lyx.org/lyx/lyx-devel/trunk@40551 a592a061-630c-0410-9148-cb99ea01b6c8

#7969 verify cursor position when spell check is done

git-svn-id: svn://svn.lyx.org/lyx/lyx-devel/trunk@40550 a592a061-630c-0410-9148-cb99ea01b6c8

Moving the GUI consistency update to a more meaningful moment, i.e., when Dialog::updateView() is called.

git-svn-id: svn://svn.lyx.org/lyx/lyx-devel/trunk@40549 a592a061-630c-0410-9148-cb99ea01b6c8

Fixing consistency of replace actions in GUI with readonly status of target document buffer
(i.e., it was possible to replace in readonly buffers!)
See also http://comments.gmane.org/gmane.editors.lyx.devel/140074

git-svn-id: svn://svn.lyx.org/lyx/lyx-devel/trunk@40548 a592a061-630c-0410-9148-cb99ea01b6c8

#7952 add a check for current buffer to detect buffer switches while in spell checker process

git-svn-id: svn://svn.lyx.org/lyx/lyx-devel/trunk@40546 a592a061-630c-0410-9148-cb99ea01b6c8

Fix bug #7933 (lyx2lyx error while running lyxpak.py)

git-svn-id: svn://svn.lyx.org/lyx/lyx-devel/trunk@40544 a592a061-630c-0410-9148-cb99ea01b6c8

In recent biber version, the log message that tells us which bib files are used has been changed. Adapt the parser, so that bib files are tracked again.

This should go to BRANCH as well

git-svn-id: svn://svn.lyx.org/lyx/lyx-devel/trunk@40542 a592a061-630c-0410-9148-cb99ea01b6c8

French Braille.lyx: fix by Jean-Pierre

git-svn-id: svn://svn.lyx.org/lyx/lyx-devel/trunk@40541 a592a061-630c-0410-9148-cb99ea01b6c8

Additional.lyx: update to latest fileformat and correct version number

git-svn-id: svn://svn.lyx.org/lyx/lyx-devel/trunk@40539 a592a061-630c-0410-9148-cb99ea01b6c8

installer:
- fix an uninstall issue
- fix a typo
- update settings

git-svn-id: svn://svn.lyx.org/lyx/lyx-devel/trunk@40538 a592a061-630c-0410-9148-cb99ea01b6c8

installer:
- fix bundle installer so that MiKTeX is installed before LyX
- fix some ImageMagick settings
- cleanups and visual feedback for new installations

git-svn-id: svn://svn.lyx.org/lyx/lyx-devel/trunk@40533 a592a061-630c-0410-9148-cb99ea01b6c8

Adapt support for distributing desktop files and icons also in cmake build

git-svn-id: svn://svn.lyx.org/lyx/lyx-devel/trunk@40532 a592a061-630c-0410-9148-cb99ea01b6c8

Improve support for distributing desktop files and icons
* add proper INSTALL_POSIX conditional for makefiles
* move all the code to Makefile.am
* rename lyx.desktop to lyx.desptop.in and add proper tags to allow handling of program_suffix.
* add code to install desktop entry and icons under the proper name.

I did not touch scons and cmake, I hope it was not necessary.

git-svn-id: svn://svn.lyx.org/lyx/lyx-devel/trunk@40531 a592a061-630c-0410-9148-cb99ea01b6c8

Fixing #7410 (weird stale selection leads to assertion after replace all).

git-svn-id: svn://svn.lyx.org/lyx/lyx-devel/trunk@40528 a592a061-630c-0410-9148-cb99ea01b6c8

Ensure that head/foot cannot be unset as long is the row is a caption

git-svn-id: svn://svn.lyx.org/lyx/lyx-devel/trunk@40527 a592a061-630c-0410-9148-cb99ea01b6c8

fix r40522 (thanks Kornel)

git-svn-id: svn://svn.lyx.org/lyx/lyx-devel/trunk@40526 a592a061-630c-0410-9148-cb99ea01b6c8

lyx2lyx files: update GPL organization address and claim copyright also for the LyX team where it is necessary

git-svn-id: svn://svn.lyx.org/lyx/lyx-devel/trunk@40524 a592a061-630c-0410-9148-cb99ea01b6c8

More sensible longtable caption handling (needed for bug #7412)

git-svn-id: svn://svn.lyx.org/lyx/lyx-devel/trunk@40522 a592a061-630c-0410-9148-cb99ea01b6c8

Partial support for mathtools.sty (part of bug #7949)

git-svn-id: svn://svn.lyx.org/lyx/lyx-devel/trunk@40521 a592a061-630c-0410-9148-cb99ea01b6c8

did anybody test this?

git-svn-id: svn://svn.lyx.org/lyx/lyx-devel/trunk@40520 a592a061-630c-0410-9148-cb99ea01b6c8

Do not install _any_ hidden file in cmake build

git-svn-id: svn://svn.lyx.org/lyx/lyx-devel/trunk@40518 a592a061-630c-0410-9148-cb99ea01b6c8

cleanup before unsubscribing

git-svn-id: svn://svn.lyx.org/lyx/lyx-devel/trunk@40517 a592a061-630c-0410-9148-cb99ea01b6c8

increment lyxrc version following r40515.

git-svn-id: svn://svn.lyx.org/lyx/lyx-devel/trunk@40516 a592a061-630c-0410-9148-cb99ea01b6c8

Introduce new RC option for QImage backend instead of macro. This can later be changed at runtime though a command line option or by auto detecting the X11 remote status.
This option is set to true by default as this is the most widespread use case.

git-svn-id: svn://svn.lyx.org/lyx/lyx-devel/trunk@40515 a592a061-630c-0410-9148-cb99ea01b6c8

Fix bug #7941 (Translation of theorem-like environment names fails if language and buffer encoding differ)

git-svn-id: svn://svn.lyx.org/lyx/lyx-devel/trunk@40513 a592a061-630c-0410-9148-cb99ea01b6c8

Braille.lyx: another fix from Sam Lewis

git-svn-id: svn://svn.lyx.org/lyx/lyx-devel/trunk@40512 a592a061-630c-0410-9148-cb99ea01b6c8

Tutorial.lyx, Braille.lyx, Intro.lyx, LFUNs.lyx: port changes from branch

git-svn-id: svn://svn.lyx.org/lyx/lyx-devel/trunk@40510 a592a061-630c-0410-9148-cb99ea01b6c8