Add xmingw and LyXDestinations.cmake to distribution files

Cmake windows build: Discard use of configCompiler.h.msvc

This file doubles the struggle when inventing new configuration tests.
Hopefully we get soon a confirmation if the withdraw is OK.

Cmake dist: Expand the list of not distributed files.

Whitespace.

Add missing images to source package

Thanks to Kornel for noticing.
We cannot use ${x} style variables with autotools, these work only in the
final Makefile. We need to use $(x).

Replace coverity comment with assertion.

Fix compilation with gcc 4.6

Fix bug #10195

The computation of the index of the main text entry of a row did not take into
account the fact that the entry could be optimised away.

amend 6144bbfb

amend e2bc7ffa

Detect clang version in autoconf (and use it a bit)

The version is read by checking the macros __clang_major__,
__clang_minor__ and __clang_patchlevel__. Hopefully they will have
coherent values everywhere.

For now, the version is used to set warnings a bit more reasonably for
older clang versions, which do not support -Wdeprecated-register and
some others that are used in pragmas in boost.

This removes many warnings when compiling with clang 3.3.

Remove a conversion to_utf8() inside FontSetChanger

This requires to change many docstrings into std::strings. The logic behind that
is that they represent a fixed set of math fonts, and therefore “string” means
here “poor man's enum” rather than text (this is consistent with MetricsBase).

Profiling of scrolling inside a document over macro-instensive areas:

Before the patch:
  44,1% BufferView::updateMetrics()
   -> 34,8% InsetMathHull::metrics()
     -> 9,8% FontSetChanger::FontSetChanger()
  28,4% BufferView::draw()

After the patch:
  35,3% BufferView::updateMetrics()
   -> 27,2% InsetMathHull::metrics
     -> 0,4% FontSetChanger::FontSetChanger()
  47,5% BufferView::draw()

FontSetChanger::FontSetChanger() is made 41x less expensive (with reference
BV::draw()) just by removing this conversion. The remaining 0,4% could be
squished by replacing the strings with a proper enum, but this is premature. Of
course, this only treats the symptoms: there is no good reason that this
function is called 45500 times over the time of 40 repaints.

ScrollbarParameters: clean-up and document

Position is always 0.

Fix computation of scroll value

Simplify the TexRow information for mathed output

Replace the manual manipulation of a stack of RowEntries with a Changer
function. When I introduced the stack of RowEntries, I did not know about the
Changer mechanism.

Do not include MetricsInfo.h in MathStream.h

Fixes the FIXME in MathStream.h

Change tracking cue: paint over labels in text and prepare for further work

* Inset::canTrackChange() had two meanings: can it deal with change tracking?
  Will it paint its own CT status? The latter information is now given by
  Inset::canPaintChange().

* Line thickness computation is moved from RowPainter to MetricsBase.

* Painting function for Changes moved to lyx::Change. (One new, that strikes
  diagonally.)

RefChanger

RefChanger temporarily assigns a value to a non-const reference of any
kind. RefChanger provides a flexible and uniform generalisation of the various
scope guards previously derived from the old Changer class in MetricsInfo.h.

As before, a temporary assignment lasts as long as the Changer object lives. But
the new Changer is movable. In particular, contorsions are no longer needed to
change a private field. Special code can be moved into the appropriate classes,
and it is no longer necessary to create a new class for each specific use.

Syntax change:

   FontSetChanger dummy(mi.base, value);
-> Changer dummy = mi.base.changeFontSet(value);

New function for generating arbitrary Changers:

  Changer dummy = make_change(ref, val, condition);

Bugfix:

* Fix the display of \displaystyle{\substack{\frac{xyz}{}}} (missing style
  change).

ShortcutOverride again

Re: fix for #9218 (not #10119)

Now it matches the example given in the docs. This time tested on qt4.

* Math.lyx put last changes under CT.

Make lyx2lyx infrastructure python3 ready

The LyX class works now with python 3. Certain file format conversions may
still fail (convert_multiencoding() is a hot candidate), but this will need
to be fixed in the individual modules.

Remove that pesky broken window that pops up with Qt5 when saving preferences

It turns out this show event is not necessary (tested with Qt4.8 and Qt5)

Add perf comment

Toc: clean-up

Replace foreach with for

C++11 allows foreach-style iterations with the following syntax:

for (auto & element : container) {
 ...
}

climits

It's as you prefer, Jean-Marc.

rewrite 51a15c45

Poor wording

Cmake build: Check for make_unique and PATH_MAX symbols added.

Use iostream instead of sstream and move it from header to cpp-source of LyX-Server

When we use InPremable styles, we want to write as many versions
to the premable as the user enters.

Add comments to fix coverity #23505 and 23507.

Add comment to fix coverity #111935.

Fix coverity issue #127197.

We may fail to get a buffer when we request one.

Add comment about coverity #102061.

Add a check to please coverity.

Fixes #23496.

Fix a number of other uninitialized members.

Fixes coverity #23392, 23394, 23397, 23403, 23414, 23424,
23448, 23477.

Add comment to fix coverity #23438.

Initialize a bunch of uninitialized members. It does not seem to
matter what they are initialized to. Fixes coverity #23391.

Add some comments to fix coverity #23386.

False positive on coverity #23366.

Add a LATTEST, just in case this ever causes a problem.

Fixes coverity #23363.

Check to make sure we have a preview loader.

Fixes coverity #23353.

Add comment fixing coverity #23351.

Add comment about coverity #23335.

Add comment to fix coverity #23308

Make sure we have a buffer in VC_COMPARE.

Fixes coverity #23304.

Add comment for coverity, fixing #23307.

Mark a number of coverity false positives.

Fixes coverity #23284, 23285, 23286, 23287, 23289.

Add a comment and FIXME that lualatex can make DVI

The command 'lualatex' can produce a DVI with the option
--output-format=dvi
It is best to keep things as is because it is better to guess a PDF
than to guess a DVI (we do not use that feature of the 'lualatex'
command internally; we use 'dvilualatex' instead). However, we
should ideally get this information in a more robust way.

Thanks to Günter for pointing this out.

* Math.lyx : add few maxima examples to ch. 23.1.

Improve comments and add missing decoding call

We do already fill the first line of the body in the first pass, so the body
has to be converted to the correct encoding as well.

fix #10199 Non-encodable characters with XeTeX and utf8-plain

XeTeX with TeX fonts is only safe with ASCII input encoding (see #9740)
and we therefore force "ascii" when exporting with XeTeX and 8-bit TeX-fonts.

However, "utf8-plain" is a "power-user" option, which allows to switch off LyX's
encoding of the LaTeX file:
keep this also for "XeTeX with TeX fonts".

The user is responsible to ensure all characters can be processed and are
correctly shown in the output. The provided test sample shows the problems
with this encoding without special measures (like loading fontspec in the
user-preamble or a document class).

Cmake build: Correct wrong comment

Cmake build: Determine availability of 'std::regex' if using clang compiler

Some python 3 fixes for lyx2lyx

These were found by 2to3 and later adapted to use the compatibility code
which was already used in some parts of lyx2lyx, e.g. lyx_1_5.py.

Fix linking with std::regex and included boost

Add missing includes after change to boost signals2

Do not try to build an empty boost lib

This should fix a build failure on OS X:
Making all in boost
  AR       liblyxboost.a
  ar: no archive members specified

Skip boost linking test if not needed

We only link against boost libraries if we do not use std::regex.
Therefore, we do not need to test how to link against boost libs unconditionally.
Also, the warning regarding stdlib-debug is only needed if we link against boost.

Get rid of boost signals in multithreading test

Test for regex instead since this is the only boost library we are linking against.

Fix silly error outputting math sizes. Fixes bug #10129.

Fix bug #10119

This makes Qt 5.4 as usable as Qt 5.5.1 in my experience. Otherwise, fix again
INSTALL.

Clarify Qt requirements for 2.3

As discussed on the list. If the needs to drop Qt 4.8 arises, then this should
be discussed again.

Add missing header

Spotted by jkulesza

Restore last selected label when using the "go to label" feature
of the reference dialog.

Cmake build: Finetune some destination data paths on UNIX

Allow to disable std::regex manually with autoconf

Update INSTALL and remove mention of --disable-cxx11.

Replace Boost.Signals with Boost.Signals2

Boost.Signals is deprecated. This fixes bug #9943.
The only thing left to do is to rewrite (or get rid of) the boost -mt test
in config/lyxinclude.m4 not to use signals anymore.

Rerun extract.sh to get rid of more boost

After the latest changes we require less parts of boost, but unfortunaly the
effect is only small.

Exercise: simplify the definition of IconvProcessor

It is no longer needed to create fake copy constructors and assignment and to
deal with deletion by hand, thanks to unique_ptr, the inference of move
constructor and assignment operator, and the compatibility of standard
containers with movable objects.

Remove non-copyable idioms

Two better ways of making a class non-copyable in C++11:

* Store the p. impl. in a unique_ptr (for the cases of classes with p. impl.),
  or:

* Define publicly the copy constructor and assignment as deleted

Lots of other classes could be cleaned up in this way.

Missing headers

Found by Jean-Marc

Initialize GuiDocument:biblioChanged_ in constructor

Found by Coverity

Initialize correctly SystemcallPrivate in constructor

It seems that Error is the best possibility when nothing has been done yet.

Found by Coverity

Initialize bool member of Package in default constructor

Found by Coverity

Initialize properly InsetTabular members in constructor

Found by Coverity

Initialize Parse::theCatCode_ in constructor

Normally, it is done before tokenizing, but it does not hurt to do it
even before.

Found by Coverity.

Initialize FindAndReplaceOptions in default constructor

Found by coverity

Initialize correctly GuiErrorList::from_master_ in constructor

Found by Coverity

Initialize InsetExteralParams::preview_mode in constructor

The value PREVIEW_OFF is the same default as for external::Template.

Found by Coverity

Initialize GuiSendto::format_ in constructor

Found by Coverity.

Always initialize InsetQuote language in constructor

Found by Coverity

Initialize some GuiTabular members in constructor

Found by Coverity.

Initialize ScopeBuffer::buffer member in constructor

Found by Coverity.

Initialize LyXModule::available_ in constructor

Found by Coverity.

Replace boost::tuple with std::tuple

Replace support/shared_ptr.h and boost::shared_ptr with std::shared_ptr

shared_ptrs now only require the <memory> header.

Replace boost::scoped_ptr with unique_ptr

Autotools: restore deprecation warning

-Wno-deprecated-declarations was added at 314a121c.

Replace auto_ptr with unique_ptr

This is a mechanical replacement. For now it seems that unique_ptrs are
essentially used for exception-safety. More could certainly be done to clarify
pointer ownership in general.

unique_ptr and make_unique

Initialize all MathMacroTemplate members in constructors

Found by coverity.

Please Coverity (code should be equivalent)

The parameter passed to allowDisplayMath will need to be copied, so it
made sense to pass it by value. Since Coverity complains about that,
the code is rewritten to make the copy explicit.

Annotate source code to please coverity

This code is signalled as a copy and paste error, but it is a false
positive.

According to the documentation, adding a comment starting with
  // coverity[name_of_error]
should be enough to flag the false positive.

Fix right_boundary properly after a row is shortened

Instead of resetting it to false, do a proper test to see whether
there is a separator at the end of the row.

Fixes bug #10180.

Improve build for FreeBSD.

Patch from Shankar Giri Venkita Giri.

Win installer: new version with Qt 5.6.1

- the update to JabRef 3.4 which fixes installation problems if user has no admin privileges
- also update MiKTeX and ImageMagick

Add missing backslashes

Found by 2to3, but useful for python2 as well for consistency reasons.

Make scripts python3 compatible

Again using 2to3 and manual checking

Make configure.py python3 compatible

This was done using 2to3 and manual tweaking afterwards to ensure that it
works with python2 as well.