Set \origin correctly when upgrading docs

lyx2lyx did not yet know about /systemlyxdir/ and set \origin to the path
where my git tree lives instead. This path is not usable except on my machine,
so better write something more usable instead.
This is a special command line switch of lyx2lyx, so it does not interfere
with normal usage. I did not try to deduce the systemlyxdir from lyx2lyx to
be on the safe side.

Exclude old files in attic

Add utility to update documentation files

updatedocs.py is a small script that updates all documentation files to the
current format.

configure.py: support OpenDocument as input format

 - new converter for OpenDocument text -> LaTeX

Fix bug #9554: When we save a file that was not originally in the current
LyX format, create a backup of the original file. We put it in the backup
directory, if one exists, otherwise in the directory the original file is
in. This is the same strategy as for normal backups. Basically, the only
diferences are: (i) what name we use and (ii) we do not over-write any
backups that may already exist.

Fix 480937a103708a651/lyxgit. See also #9740.

Actually, the changed tests were used to prevent overwriting the encoding
changed in Buffer::writeLaTeX with a language-default encoding.
This is still required for XeTeX with TeX-fonts unless a proper solution is found.

Documents with more than one encoding and TeX-fonts fail with LuaTeX,
as "luainputenc" can only handle one encoding.

theorems-without-preamble.inc: fix a typo

Cmake export tests: Try to use language dependent inputencoding.

This enables some more pdf5_texF und dvi3_texF tests to succeed.

Cmake export tests: Set inputencoding to ascii if test with xetex and tex fonts.

Move tmpdir error message to stderr

http://thread.gmane.org/gmane.editors.lyx.general/85638/focus=157802

Fix duplication introduced at cf7f1cb7

Thanks to Georg for catching this.

thesis files: update file format

- as addendum to the previous commit

thesis template: disable the automatic usage of \autoref

- fixes bug #8569

Development.lyx: remove unused preamble code and modules

Fix regression of 2fc430d5ae

Thanks Kornel for noticing

Reset encoding after insets and environments also for LuaTeX with TeX fonts.

With inputenc == "auto" or "default", the encoding changes with
the language and must be reset after an eventual language switch in insets
or environments (see #6216).

However, whether we need to do this does not depend on 8-bit TeX vs. LuaTeX
but on the possible use of more than one encoding for the document.
With "nonTeXFonts", the encoding is utf8,
LuaTeX with TeX fonts requires encoding handling similar to 8-bit TeX.

(Additionally, the value of "params.inputenc" could be tested: if it is
not "auto" or "default", we have just one common encoding and could skip
the reset as well.) Not sure how much time this saves, though.

Cmake export tests: Adapt the test machinery to the commit 2fc430d.

Handle this this new sets of font selections properly.

Store both sets of font selections

This is one part of bug 9744: If you toggle between TeX fonts and non-TeX
fonts, the settings of the other choice are no longer thrown away, but stored
and re-activated if you switch back. Most parts of the patch are purely
mechanical (duplicating some BufferParams members), the only non-mechanical
change is in the GUI logic.

splash.lyx: correct a menu name and update file format

Improve fix to 57615915.

Reset pointer to 0 as Georg suggested in #9804.

Update the formats of lyxrc.dist.in to 19

In the end, no changes were needed. This was decided by prefs2prefs
for MacOSX and cygwin and by manual inspection for Win32.

Add the format line for Mac's lyxrc.dist.in

The file was updated to format 14 in fc22ba16 but the format line
was missing. A missing format line is interpreted as format 0, I
believe, which could lead to incorrect conversion to later formats.

Copy caveats from RELEASE-NOTES to UPGRADING

RELEASE-NOTES: move an item to different category

Also expand a little to mention that users might need to specify
babel if their document has custom code that is specific to babel.

prefs2prefs: document removing print support

Fix a Makfile.am typo preventing "make lyxdist"

Thanks to Vincent.

NEWS: add what's new in LyX 2.2

NEWS: Update from the 2.1.x branch

Update ANNOUNCE for LyX2.2.0alpha1

ANNOUNCE: give new path to RELEASE-NOTES

Also a couple of whitespace tweaks.

Move LFUN_CHANGES_TRACK and LFUN_CHANGES_OUTPUT to Buffer.cpp,
and record an undo call. This deals with the problem of marking
the Buffer dirty, as well.

Move LFUN_BUFFER_TOGGLE_COMPRESSION and LFUN_BUFFER_TOGGLE_OUTPUT_SYNC
to Buffer.cpp, and add an undo call.

The cite engine info is needed by makeDocumentClass().

Fixes both #9797 and #9848.

Be careful about accounting for the right margin

In computeRowMetrics, the right margin of the row shall be taken in account when the text is not left-aligned. Rewrite the code in terms of the available width `w' to avoid this pitfall.

Decrease and unify indentation of beamer frame content.

Make shortcuts for master-buffer-X fall back to buffer-X.

Fixes #9842.

Cmake export tests: Enable test hu/Tutorial_pdf5_systemF

Fix encoding-setting of child document with LuaTeX and TeX-fonts

Avoid using pointer after it has been invalidated

The pointer macroInset points to a vector element. When another element is inserted in this vector, some reallocation occur and the pointer points to a deleted element.

This does not crash LyX by default, but it is bad enough to make valgrind cry.

See ticket #9804.

Try to avoid horizontal scrolling with wide insets.

There was a problem with end of paragraph markers. By design, wide insets choose their size without taking in account the marker. This should not lead to unneeded horizontal scrolling.

Part of ticket #9807.

Correct reason for the failure of the math manual export with luatex.

EmbeddedObjects.lyx: describe Reflectbox and friends

Remove unused declarations

Cmake tests: Expand for some more suspended testcases

All dvi_texF and pdf5_texF testcases are nov candidates for being suspended.
After commit 279d084, now export/.*/Math_(dvi3|pdf5)_texF fails,
therefore the tests are also inverted.

Update Development.lyx to include 'suspended' cmake tests.

update sk.po

Allow quotes in PDF text properties

PDF properties (Author, Title...) need to be quoted properly when writing (normal operation and tex2lyx). Also, reading them requires to use Lexer::getString() directly, because >> uses next(), which does not handle escapes.

Fixes bug #9830.

Cmake tests: Removed tests from revertedTests.

Due to commit f739c98, some pdf4_texF are now OK

Cmake tests: Add 'suspendedTests'

This file holds regular expression to select which of the inverted
export test cases will be suspended.
These tests will not be executed with the call 'ctest -L export'.

Fix some XeTeX + TeX-fonts regressions introduced by fixing #9740.

hyperref expects LICR macros for non-ASCII chars in the PDF Header Information.
As hyperref provides good coverage for \inputencoding{utf8}, we try
this if the current input encoding does not support a character.

With XeTeX, we do not load inputenc and cannot use \inputencoding.
However, utf-8 works out of the box so we can write the content in UTF8.

lyx_2_2.py: add a safe guard

lyx_2_2.py: fix the conversion of colored boxes

lyx2lyx/lyx_2_2.py: remove unused code

achemso.layout: add a flex inset

- this one is in achemso since version 3.8

- fileformat change

Development.lyx: describe how to update the tex2lyx references on Windows

Fix bug ##9627: Make the document name available to preview insets

The \jobname macro is redefined for the preview snippets such that
it contains the name of the document without extension. This is
harmless because the moment it is redefined, TeX has already chosen
the name of the output and log files. On the other hand, any use
of \jobname in preview snippets is now consistent with what one
obtains after exporting and compiling by hand.

EmbeddedObjects.lyx: describe rotate boxes properly

- We have now a module for them
(the description of scaled boxes etc will follow soon)

Fix bugs #2645 (export BIBINPUTS) and #6634 (Better support for external files in ERT)

Other than BIBINPUTS, also BSTINPUTS and TEXFONTS are exported.
They do not replicate the setting for TEXINPUTS but are set such
that the current dir (i.e., the temp dir) and the document dir
are also searched for bibtex and fonts related files.

Fix shortcut conflict

This was introduced by d56980da954. Thanks Günter for noticing.

Amend f441590c

Fixme for the partial patch for #9740 (XeTeX with TeX fonts),

Capitalization

Add "Open Containing Directory" button to the log dialog (#9211, #9834)

It takes the place of the "Copy to Clipboard" button which was redundant.

Update it.po

Math.lyx: replace tables by formal ones - final part 7/7

Fix bug #7657: Detect inkscape from the configure script

On Windows, if inkscape is not found in the PATH, search for it
in the registry and store its full path in lyxrc.defaults.

Math.lyx: replace tables by formal ones - part 6

Cmake tests: macro setmarkedtestlabel() worked only by chance

We have to check the content of the variable.

Put logos in submenu as discussed on the list

Fix compilation with clang++ 3.6.2.

Disable warning for deprecated functions in autoconf builds

This gets rid in particular of warnings on auto_ptr. This flag should be removed when 2.3 development start and we switch to unique_ptr.

Disable setting vertical lines when using a formal table

The code in InsetTabular disables the toolbar icons and menu entries related to vertical lines.

The code in GuiTabular disables vertical lines in the Settings dialog.
Note that there was a bug in
GuiSetBorders::set(Left|Right|Top|Bottom)Enabled, where the borders
did not get drawn correctly.

Fixes bug #9816

Set current font correctly after inset-select-all

Since we modify directly the cursor, it is wise to make sure that the current font is updated.

Fixes bug #9719.

Fix algorithm that computes horizontal scroll offset

Rewrite the logic completely:
* fix cases where the offset was reset unnecessarily
* fix cases where the row was scrolled too much: as soon as a side of the row is completely visible, there is no need to scroll more.
* fix cases where offset would never reset

Fix wrong reset of horizontal scolling of current row

This partially reverts commit 0f1fdaaa9, but only redraws the current
row when the value returns by getPos is obviously false. It would also
be possible to check whether the current cursor has all its insets in
cache instead.

A better fix should be found, but this is unfortunately not 2.2 stuff.

Fixes bugs #9796 and #9812.

Update it.po

Add Georg's idea for lyx2lyx tests to TestsToDo

These tests would be like the tex2lyx tests we have and would have
the clear advantage of not depending on LyX.

Module for the changebar package

Author: Paul A. Rubin (rubin@msu.edu), based on code proposed by Juergen
Spitzmueller (http://comments.gmane.org/gmane.editors.lyx.general/66666).

http://mid.gmane.org/562ACBC5.8030102@msu.edu

Correct name

Fix bug #9813

tex/row correspondance for \end{tabular}.

Add warning message if we do no conversion.

If lyx2lyx is asked to convert a file to the format it already is,
then just perform a null conversion. This seems better than aborting
with an error. I can imagine a script that converted all files in a
certain directory to format 498, and you don't want it to be an error
if one of them is already 498.

Prior to this, what lyx2lyx would do is convert to the lowest format
in the current version. So, e.g., asked to convert 498 to 498 it would
convert to 474. That is obviously wrong.

Varwidth module provided by d.iabo

See #9417.

Cmake export tests: Remove some testcases from 'revertedTests'

Some of the tests are now compilable, probably because of some  newer
TL2015 packages.
Reverts partly commit 8a4c9b6 for export/templates/ectaart...

remove debug message.

Typo

Initial commit of a file for plans of future tests

The TestsToDo file will contain ideas for tests that we would like
to implement in the future.

Document various ways to run the tex2lyx tests

Each way might be preferred by a different developer and the more
ways that can be described of running the tests, the higher the
chance is that developers will find a way that works well for them.

Cmake tests: Display process while executing for target updatetex2lyxtests

The execution took some time and the messages were delayed
until all test files were processed. Now as each testfile
is processed, the appropriate messages are printed.

There is also a new target: cleanupdatetex2lyxtests
It is the same as updatetex2lyxtests, but removes also
some extra created files from the source directory.

ctests: invert Math.lyx tests failing from mhchem

The math document now depends on the mhchem package which produces
wrong output with XeTeX/LuaTeX and both TeX fonts and non-TeX fonts

See:
https://www.mail-archive.com/search?l=mid&q=n0sne9%24iis%241%40ger.gmane.org

Document why tests are enabled for all formats

Explain why the export tests are enabled for formats that are not
expected to work well with certain document classes, modules, or
packages. The reason is that if a .lyx file goes from compiling
successfully for one format (even if that format is not officially
supported for the combination of features used), if that document
suddenly fails to compile, there is a significant chance that a bug
was introduced in LyX. In other words, there is a high signal/noise
ratio. If it is determined that a test is failing because an
expected incompatibility is exposed, then the test can be inverted.

More updates for the documentation on tests

- general cleanup
- add some more useful commands
- specify how to configure the URL tests

Thanks to Kornel for the helpful suggestions.

Document how to run tests on windows

Add "LyX Documentation Tools" toolbar

People working on the documentation do probably want to switch this on. It
gives easy access to LyX and LaTeX logos (bug 9626), and the info and menu
separator insets.

Cmake tests: Remove the use of file(TIMESTAMP...)

Cmake versions prior to 2.8.11 don't know this command, but
our minimal requirenment is 2.6.4

Thank to Vincent, it is replaced by using 'if(file1 IS_NEWER_THAN file2)' comparision.

Disable "Show Output Anyway" button if empty file

Sometimes when compilation fails a PDF file is created but is empty
and the viewer gives an error when trying to view it. One such
example is compiling the current lib/examples/PDF-comment.lyx file
with TeX fonts and the following version of LuaTeX:

  beta-0.80.0 (TeX Live 2015) (rev 5238)

Document the export tests and other tests

The export tests, check_load tests, and URL tests are now documented
in the Development.lyx file. The export tests are described in
detail, such as how to run them and how to interpret the results.

Update format

cmake: Properly suppress CMake warning about qtmain

CMake policy CMP0020 exists since version 2.8.11, so this prevents an
error on older versions.

This fixes up commit ec6f51b.

Cmake tests: Get rid of use of command 'env', which is not available under Windows.

ctests: comment for why the Russian docs fail

The LuaTeX non-TeX font tests fail because of LyX's preamble (the
part regarding hyperref), as explained by Günter.