]> git.lyx.org Git - lyx.git/blobdiff - lib/examples/noweb2lyx.lyx
achemso.layout: add a flex inset
[lyx.git] / lib / examples / noweb2lyx.lyx
index 768bacce97e5e8796d5095bfd1874ecbddfe35c7..c951a89b5b090e47dc32522b0de9cff92590988f 100644 (file)
@@ -1,8 +1,8 @@
-#LyX 1.5.0svn created this file. For more info see http://www.lyx.org/
-\lyxformat 245
+#LyX 2.1 created this file. For more info see http://www.lyx.org/
+\lyxformat 474
 \begin_document
 \begin_header
-\textclass literate-article
+\textclass article
 \begin_preamble
 %
 % This relaxes the noweb constraint that chunks are
 \def\nwendcode{\endtrivlist \endgroup}
 \let\nwdocspar=\smallbreak
 \end_preamble
+\use_default_options false
+\begin_modules
+noweb
+\end_modules
+\maintain_unincluded_children false
 \language english
+\language_package default
 \inputencoding default
-\fontscheme default
+\fontencoding global
+\font_roman default
+\font_sans default
+\font_typewriter default
+\font_math auto
+\font_default_family default
+\use_non_tex_fonts false
+\font_sc false
+\font_osf false
+\font_sf_scale 100
+\font_tt_scale 100
 \graphics default
+\default_output_format default
+\output_sync 0
+\bibtex_command default
+\index_command default
 \paperfontsize default
 \spacing single
+\use_hyperref false
 \papersize default
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-\use_amsmath 0
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+\use_package mathdots 1
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+\use_package stackrel 0
+\use_package stmaryrd 0
+\use_package undertilde 0
 \cite_engine basic
+\cite_engine_type default
+\biblio_style plain
 \use_bibtopic false
+\use_indices false
 \paperorientation portrait
+\suppress_date false
+\justification true
+\use_refstyle 0
+\index Index
+\shortcut idx
+\color #008000
+\end_index
 \secnumdepth 3
 \tocdepth 3
 \paragraph_separation indent
-\defskip medskip
+\paragraph_indentation default
 \quotes_language english
 \papercolumns 1
 \papersides 1
 \paperpagestyle default
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-\output_changes true
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+\html_math_output 0
+\html_css_as_file 0
+\html_be_strict false
 \end_header
 
 \begin_body
 
 \begin_layout Title
 
-
 \noun on
 noweb2lyx
 \end_layout
 
 \begin_layout Author
-
 Kayvan A.
  Sylvan <kayvan@sylvan.com>
 \end_layout
 
 \begin_layout Date
-
 May 6, 1999
 \end_layout
 
 \begin_layout Abstract
-
 This document describes and implements a perl script for importing noweb
  files into LyX
 \end_layout
 
 \begin_layout Standard
-
-
-\begin_inset LatexCommand \tableofcontents{}
+\begin_inset CommandInset toc
+LatexCommand tableofcontents
 
 \end_inset
 
@@ -74,20 +112,17 @@ This document describes and implements a perl script for importing noweb
 \end_layout
 
 \begin_layout Standard
+\begin_inset Newpage newpage
+\end_inset
 
 
-\newpage
-
 \end_layout
 
-
 \begin_layout Section
-
 Introduction
 \end_layout
 
 \begin_layout Standard
-
 Since version 1.0.1, LyX now supports Literate Programming using 
 \noun on
 noweb
@@ -105,7 +140,6 @@ noweb
 \end_layout
 
 \begin_layout Standard
-
 The purpose of 
 \noun on
 noweb2lyx
@@ -117,56 +151,116 @@ noweb
  file to LyX.
 \end_layout
 
-\begin_layout Scrap
+\begin_layout Standard
+\begin_inset Flex Chunk
+status open
+
+\begin_layout Plain Layout
+
+\begin_inset Argument 1
+status open
+
+\begin_layout Plain Layout
+noweb2lyx.in
+\end_layout
+
+\end_inset
 
-<<noweb2lyx.in>>=
-\newline
 #!@PERL@
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
 # 
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
 # Copyright (C) 1999 Kayvan A.
  Sylvan <kayvan@sylvan.com>
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
 # You are free to use and modify this code under the terms of
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
 # the GNU General Public Licence version 2 or later.
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
 #
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
 # Written with assistance from:
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
 #   Edmar Wienskoski Jr.
  <edmar-w-jr@technologist.com>
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
 #   Amir Karger <karger@post.harvard.edu>
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
 #
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
 # $Id: noweb2lyx.lyx,v 1.5 2005/07/18 09:42:27 jamatos Exp $
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
 #
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
 # NOTE: This file was automatically generated from noweb2lyx.lyx using noweb.
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
 #
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
 <<Setup variables from user supplied args>>
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
 <<Subroutines>>
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
 <<Convert noweb to LyX>>
-\newline
-@
 \end_layout
 
-\begin_layout Section
+\end_inset
+
 
+\end_layout
+
+\begin_layout Section
 The Noweb file defined
 \end_layout
 
 \begin_layout Standard
-
 A 
 \noun on
 noweb
@@ -176,27 +270,40 @@ noweb
 \end_layout
 
 \begin_layout LyX-Code
-
 @ Here is some documentation.
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Standard
+\begin_inset ERT
+status open
+
+\begin_layout Plain Layout
+
 We can do arbitrary LaTeX code here.
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
 [...
  blah blah blah ...]
 \end_layout
 
-\begin_layout Standard
+\end_inset
 
+
+\end_layout
+
+\begin_layout Standard
 Code chunks look like this:
 \end_layout
 
 \begin_layout LyX-Code
-
 <
 \begin_inset ERT
 status collapsed
 
-\begin_layout Standard
+\begin_layout Plain Layout
+
 {}
 \end_layout
 
@@ -206,33 +313,37 @@ status collapsed
 \begin_inset ERT
 status collapsed
 
-\begin_layout Standard
+\begin_layout Plain Layout
+
 {}
 \end_layout
 
 \end_inset
 
 >=
-\newline
+\begin_inset Newline newline
+\end_inset
+
 {...
  code for the chunk goes here ...}
-\newline
+\begin_inset Newline newline
+\end_inset
+
 @ 
 \end_layout
 
 \begin_layout Standard
-
 The ``@'' is a necessary delimiter to end the code chunk.
  The other form that the ``@'' line takes is as follows:
 \end_layout
 
 \begin_layout LyX-Code
-
 <
 \begin_inset ERT
 status collapsed
 
-\begin_layout Standard
+\begin_layout Plain Layout
+
 {}
 \end_layout
 
@@ -242,22 +353,26 @@ status collapsed
 \begin_inset ERT
 status collapsed
 
-\begin_layout Standard
+\begin_layout Plain Layout
+
 {}
 \end_layout
 
 \end_inset
 
 >=
-\newline
+\begin_inset Newline newline
+\end_inset
+
 {...
  code for the chunk ...}
-\newline
+\begin_inset Newline newline
+\end_inset
+
 @ %def identifier1 identifier2
 \end_layout
 
 \begin_layout Standard
-
 In the latter form, we are declaring to 
 \noun on
 noweb
@@ -266,14 +381,12 @@ noweb
 \end_layout
 
 \begin_layout Standard
-
 When first tackling this problem, I spoke with members of the LyX team that
  knew about the literate programming extensions and reLyX (the LaTeX importing
  code).
 \end_layout
 
 \begin_layout Standard
-
 One of the first ideas was to extend the reLyX code to understand the 
 \noun on
 noweb
@@ -283,8 +396,7 @@ noweb
 \begin_inset Foot
 status collapsed
 
-\begin_layout Standard
-
+\begin_layout Plain Layout
 Not the least of these problems is the fact that << is a quote in French.
 \end_layout
 
@@ -298,20 +410,22 @@ Not the least of these problems is the fact that << is a quote in French.
 
 \begin_layout LyX-Code
 
-
 \backslash
 begin{reLyXskip}
-\newline
+\begin_inset Newline newline
+\end_inset
+
 {...
  LaTeX stuff ...}
-\newline
+\begin_inset Newline newline
+\end_inset
+
 
 \backslash
 end{reLyXskip}
 \end_layout
 
 \begin_layout Standard
-
 then reLyX will copy the surrounded code to the output file verbatim.
  Given this, the first part of the translation is easy; we simply have to
  copy the code chunks into an intermediate file that surrounds them with
@@ -331,13 +445,11 @@ end{reLyXskip}
 \end_layout
 
 \begin_layout Standard
-
 Once reLyX is done with the input file, the problem is reduced to changing
- the code chunks from LyX's LaTeX layout to the Scrap layout.
+ the code chunks from LyX's LaTeX layout to the Chunk layout.
 \end_layout
 
 \begin_layout Standard
-
 There is one final constraint on 
 \noun on
 noweb2lyx
@@ -358,7 +470,8 @@ noweb2lyx
 \begin_inset ERT
 status collapsed
 
-\begin_layout Standard
+\begin_layout Plain Layout
+
 [[pre_only]]
 \end_layout
 
@@ -372,8 +485,11 @@ status collapsed
 \emph default
 \bar default
 \noun default
 \color inherit
- and 
+and
+\color none
 \family roman
 \series medium
 \shape up
@@ -381,12 +497,12 @@ status collapsed
 \emph off
 \bar no
 \noun off
-\color none
 
 \begin_inset ERT
 status collapsed
 
-\begin_layout Standard
+\begin_layout Plain Layout
+
 [[post_only]]
 \end_layout
 
@@ -400,66 +516,125 @@ status collapsed
 \emph default
 \bar default
 \noun default
 \color inherit
- before we reach the main conversion code.
+before we reach the main conversion code.
 \end_layout
 
 \begin_layout Standard
-
 With all that preamble out of the way, we now have the basic high-level
  outline for our code:
 \end_layout
 
-\begin_layout Scrap
+\begin_layout Standard
+\begin_inset Flex Chunk
+status open
+
+\begin_layout Plain Layout
+
+\begin_inset Argument 1
+status open
+
+\begin_layout Plain Layout
+Convert noweb to LyX
+\end_layout
+
+\end_inset
 
-<<Convert noweb to LyX>>=
-\newline
 if (!$post_only) {
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
   <<Transform noweb for reLyX>>
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
 }
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
 if ((!$pre_only) && (!$post_only)) {
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
   <<Run reLyX on intermediate file>>
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
 }
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
 if (!$pre_only) {
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
   <<Fix up LyX file>>
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
 }
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
 <<Clean up>>
-\newline
-@
 \end_layout
 
-\begin_layout Section
+\end_inset
 
+
+\end_layout
+
+\begin_layout Section
 Making a file that reLyX can process
 \end_layout
 
 \begin_layout Standard
-
 In this section, we present the code that performs the task of creating
  the intermediate file that reLyX can process, using the algorithm that
  we just outlined.
  This algorithm is outlined in the code that follows:
 \end_layout
 
-\begin_layout Scrap
+\begin_layout Standard
+\begin_inset Flex Chunk
+status open
+
+\begin_layout Plain Layout
+
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
 
 <<Transform noweb for reLyX>>=
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
 <<Setup INPUT and OUTPUT>>
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
 inputline: while(<INPUT>)
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
 {
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
   if (/^
 \backslash
 s*
@@ -470,16 +645,28 @@ s*
 \backslash
 >
 \backslash
->=/) { # Beginning of a noweb scrap
-\newline
+>=/) { # Beginning of a noweb chunk
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
     <<Read in and output the noweb code chunk>>
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
   } elsif (/^@
 \backslash
 s+(.*)/) { # Beginning of a documentation chunk
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
     print OUTPUT $1; # We do not need the ``@'' part
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
   } elsif (/
 \backslash
 [
@@ -489,33 +676,60 @@ s+(.*)/) { # Beginning of a documentation chunk
 ]
 \backslash
 ]/) { # noweb quoted code
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
     <<Perform special input quoting of [[var]]>>
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
   } else {
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
     print OUTPUT; # Just let the line pass through
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
   }
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
 }
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
 <<Close INPUT and OUTPUT>>
-\newline
-@
 \end_layout
 
-\begin_layout Standard
+\end_inset
+
 
+\end_layout
+
+\begin_layout Standard
 In the code above, we do some pre-processing of the noweb ``[[...]]'' construct.
  This avoids some problems with reLyX confusing lists composed of ``[[...]]''
  constructs.
 \end_layout
 
-\begin_layout Scrap
+\begin_layout Standard
+\begin_inset ERT
+status open
+
+\begin_layout Plain Layout
 
 <<Perform special input quoting of [[var]]>>=
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
 s/
 \backslash
 [
@@ -523,14 +737,24 @@ s/
 [.+?
 \backslash
 ]{2,}/{$&}/g;
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
 print OUTPUT;
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
 @
 \end_layout
 
-\begin_layout Standard
+\end_inset
+
+
+\end_layout
 
+\begin_layout Standard
 While reading in the 
 \family roman
 \series medium
@@ -544,7 +768,8 @@ While reading in the
 \begin_inset ERT
 status collapsed
 
-\begin_layout Standard
+\begin_layout Plain Layout
+
 [[INPUT]]
 \end_layout
 
@@ -558,34 +783,53 @@ status collapsed
 \emph default
 \bar default
 \noun default
 \color inherit
- file, once we have identified a 
+file, once we have identified a 
 \noun on
 noweb
 \noun default
  code chunk, we transform it into a form that is usable by reLyX.
 \end_layout
 
-\begin_layout Scrap
+\begin_layout Standard
+\begin_inset Flex Chunk
+status open
 
-<<Read in and output the noweb code chunk>>= 
-\newline
-<<Save the beginning of the scrap to savedScrap>>
-\newline
-<<Concatenate the rest of the scrap>>
-\newline
-<<print out the scrap in a reLyXskip block>>
-\newline
-@
-\end_layout
+\begin_layout Plain Layout
 
-\begin_layout Subsection
+\begin_inset Argument 1
+status open
 
+\begin_layout Plain Layout
+Read in and output the noweb code chunk
+\end_layout
+
+\end_inset
+
+<<Save the beginning of the chunk to savedchunk>>
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
+<<Concatenate the rest of the chunk>>
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
+<<print out the chunk in a reLyXskip block>>
+\end_layout
+
+\end_inset
+
+
+\end_layout
+
+\begin_layout Subsection
 File input and output for the pre-processing step
 \end_layout
 
 \begin_layout Standard
-
 In 
 \noun on
 noweb2lyx
@@ -603,7 +847,8 @@ noweb2lyx
 \begin_inset ERT
 status collapsed
 
-\begin_layout Standard
+\begin_layout Plain Layout
+
 [[INPUT]]
 \end_layout
 
@@ -617,8 +862,11 @@ status collapsed
 \emph default
 \bar default
 \noun default
 \color inherit
- and 
+and
+\color none
 \family roman
 \series medium
 \shape up
@@ -626,12 +874,12 @@ status collapsed
 \emph off
 \bar no
 \noun off
-\color none
 
 \begin_inset ERT
 status collapsed
 
-\begin_layout Standard
+\begin_layout Plain Layout
+
 [[OUTPUT]]
 \end_layout
 
@@ -645,35 +893,64 @@ status collapsed
 \emph default
 \bar default
 \noun default
 \color inherit
- to read and write files.
+to read and write files.
  In the code fragment above, we need to read from the input file and write
  to a file that will be later transformed by reLyX.
  If we are being called only to pre-process the input file, then there is
  no need to create a temporary file.
 \end_layout
 
-\begin_layout Scrap
+\begin_layout Standard
+\begin_inset Flex Chunk
+status open
+
+\begin_layout Plain Layout
+
+\begin_inset Argument 1
+status open
+
+\begin_layout Plain Layout
+Setup INPUT and OUTPUT
+\end_layout
+
+\end_inset
 
-<<Setup INPUT and OUTPUT>>=
-\newline
 if ($pre_only) {
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
   &setup_files($input_file, $output_file);
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
 } else {
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
   $relyx_file = "temp$$";
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
   &setup_files($input_file, $relyx_file);
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
 }
-\newline
-@
 \end_layout
 
-\begin_layout Standard
+\end_inset
+
+
+\end_layout
 
+\begin_layout Standard
 This code uses a small perl subroutine, 
 \family roman
 \series medium
@@ -687,7 +964,8 @@ This code uses a small perl subroutine,
 \begin_inset ERT
 status collapsed
 
-\begin_layout Standard
+\begin_layout Plain Layout
+
 [[setup_files]]
 \end_layout
 
@@ -705,104 +983,194 @@ status collapsed
 , which we define below:
 \end_layout
 
-\begin_layout Scrap
+\begin_layout Standard
+\begin_inset ERT
+status open
+
+\begin_layout Plain Layout
 
 <<Subroutines>>=
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
 sub setup_files {
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
   my($in, $out) = @_;
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
   open(INPUT, "<$in") || die "Cannot read $in: $!
 \backslash
 n";
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
   open(OUTPUT, ">$out") || die "Cannot write $out: $!
 \backslash
 n";
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
 }
-\newline
-@ %def setup_files   
 \end_layout
 
-\begin_layout Subsection
+\begin_layout Plain Layout
+
+@ %def setup_files
+\end_layout
+
+\end_inset
+
 
+\end_layout
+
+\begin_layout Subsection
 Reading in the 
 \noun on
 noweb
 \noun default
- scrap
+ chunk
+\end_layout
+
+\begin_layout Standard
+After we see the beginning of the chunk, we need to read in and save the
+ rest of the chunk for output.
 \end_layout
 
 \begin_layout Standard
+\begin_inset Flex Chunk
+status open
+
+\begin_layout Plain Layout
+
+\begin_inset Argument 1
+status open
+
+\begin_layout Plain Layout
+Save the beginning of the chunk to savedchunk
+\end_layout
+
+\end_inset
 
-After we see the beginning of the scrap, we need to read in and save the
- rest of the scrap for output.
+$savedchunk = $_;
 \end_layout
 
-\begin_layout Scrap
+\begin_layout Plain Layout
 
-<<Save the beginning of the scrap to savedScrap>>=
-\newline
-$savedScrap = $_;
-\newline
 $endLine = "";
-\newline
-@
 \end_layout
 
-\begin_layout Scrap
+\end_inset
+
+
+\end_layout
+
+\begin_layout Standard
+\begin_inset ERT
+status open
+
+\begin_layout Plain Layout
+
+<<Concatenate the rest of the chunk>>=
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
 
-<<Concatenate the rest of the scrap>>=
-\newline
-scrapline: while (<INPUT>) {
-\newline
-  last scrapline if /^@
+chunkline: while (<INPUT>) {
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
+ last chunkline if /^@
 \backslash
 s+/;
-\newline
-  $savedScrap .= $_;
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
+ $savedchunk .= $_;
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
 };
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
 switch: {
-\newline
-  if (/^@
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
+ if (/^@
 \backslash
-s+$/) {$savedScrap .= $_; last switch; }
-\newline
-  if (/^@
+s+$/) {$savedchunk .= $_; last switch; }
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
+ if (/^@
 \backslash
-s+%def.*$/) {$savedScrap .= $_; last switch; }
-\newline
-  if (/^@
+s+%def.*$/) {$savedchunk .= $_; last switch; }
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
+ if (/^@
 \backslash
-s+(.*)$/) {$savedScrap .= "@
+s+(.*)$/) {$savedchunk .= "@
 \backslash
 n"; $endLine = "$1
 \backslash
 n"; }
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
 }
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
 @
 \end_layout
 
+\end_inset
+
+
+\end_layout
+
 \begin_layout Subsection
+Printing out the chunk
+\end_layout
 
-Printing out the scrap
+\begin_layout Standard
+The final piece of the first pass of the conversion is done by this code.
 \end_layout
 
 \begin_layout Standard
+\begin_inset Flex Chunk
+status open
 
-The final piece of the first pass of the conversion is done by this code.
+\begin_layout Plain Layout
+
+\begin_inset Argument 1
+status open
+
+\begin_layout Plain Layout
+print out the chunk in a reLyXskip block
 \end_layout
 
-\begin_layout Scrap
+\end_inset
 
-<<print out the scrap in a reLyXskip block>>=
-\newline
 print OUTPUT "
 \backslash
 
@@ -810,9 +1178,15 @@ print OUTPUT "
 begin{reLyXskip}
 \backslash
 n";
-\newline
-print OUTPUT $savedScrap;
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
+print OUTPUT $savedchunk;
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
 print OUTPUT "
 \backslash
 
@@ -822,14 +1196,19 @@ end{reLyXskip}
 n
 \backslash
 n";
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
 print OUTPUT "$endLine";
-\newline
-@
 \end_layout
 
-\begin_layout Standard
+\end_inset
+
 
+\end_layout
+
+\begin_layout Standard
 Finally, we need to close the 
 \family roman
 \series medium
@@ -843,7 +1222,8 @@ Finally, we need to close the
 \begin_inset ERT
 status collapsed
 
-\begin_layout Standard
+\begin_layout Plain Layout
+
 [[INPUT]]
 \end_layout
 
@@ -857,8 +1237,11 @@ status collapsed
 \emph default
 \bar default
 \noun default
 \color inherit
- and 
+and
+\color none
 \family roman
 \series medium
 \shape up
@@ -866,12 +1249,12 @@ status collapsed
 \emph off
 \bar no
 \noun off
-\color none
 
 \begin_inset ERT
 status collapsed
 
-\begin_layout Standard
+\begin_layout Plain Layout
+
 [[OUTPUT]]
 \end_layout
 
@@ -885,28 +1268,44 @@ status collapsed
 \emph default
 \bar default
 \noun default
 \color inherit
- files.
+files.
+\end_layout
+
+\begin_layout Standard
+\begin_inset Flex Chunk
+status open
+
+\begin_layout Plain Layout
+
+\begin_inset Argument 1
+status open
+
+\begin_layout Plain Layout
+Close INPUT and OUTPUT
 \end_layout
 
-\begin_layout Scrap
+\end_inset
 
-<<Close INPUT and OUTPUT>>=
-\newline
 close(INPUT);
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
 close(OUTPUT);
-\newline
-@
 \end_layout
 
-\begin_layout Section
+\end_inset
+
+
+\end_layout
 
+\begin_layout Section
 Running reLyX
 \end_layout
 
 \begin_layout Standard
-
 In this section, we describe and implement the code that runs reLyX on the
  intermediate file 
 \family roman
@@ -921,7 +1320,8 @@ In this section, we describe and implement the code that runs reLyX on the
 \begin_inset ERT
 status collapsed
 
-\begin_layout Standard
+\begin_layout Plain Layout
+
 [[relyx_file]]
 \end_layout
 
@@ -941,30 +1341,44 @@ status collapsed
 \end_layout
 
 \begin_layout Subsection
-
 Selecting the document class
 \end_layout
 
 \begin_layout Standard
-
 In order to run reLyX, we need to know the article class of the input document
  (to choose the corresponding literate document layout).
  For this, we need to parse the intermediate file.
 \end_layout
 
-\begin_layout Scrap
+\begin_layout Standard
+\begin_inset Flex Chunk
+status open
+
+\begin_layout Plain Layout
+
+\begin_inset Argument 1
+status open
+
+\begin_layout Plain Layout
+Run reLyX on intermediate file
+\end_layout
+
+\end_inset
 
-<<Run reLyX on intermediate file>>=
-\newline
 <<Parse for document class>>
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
 <<Run reLyX with document class>>
-\newline
-@
 \end_layout
 
-\begin_layout Standard
+\end_inset
 
+
+\end_layout
+
+\begin_layout Standard
 In the code below, you'll see a strange regular expression to search for
  the document class.
  The reason for this kludge is that without it, we can't run 
@@ -979,8 +1393,7 @@ noweb2lyx.nw
 \begin_inset Foot
 status collapsed
 
-\begin_layout Standard
-
+\begin_layout Plain Layout
 reLyX searches for 
 \backslash
 
@@ -998,7 +1411,8 @@ doc
 \begin_inset ERT
 status collapsed
 
-\begin_layout Standard
+\begin_layout Plain Layout
+
 {}
 \end_layout
 
@@ -1026,7 +1440,8 @@ ument
 \begin_inset ERT
 status collapsed
 
-\begin_layout Standard
+\begin_layout Plain Layout
+
 {}
 \end_layout
 
@@ -1054,67 +1469,126 @@ noweb2lyx
  on itself and a produce a quite reasonable LyX file.
 \end_layout
 
-\begin_layout Scrap
+\begin_layout Standard
+\begin_inset Flex Chunk
+status open
+
+\begin_layout Plain Layout
+
+\begin_inset Argument 1
+status open
+
+\begin_layout Plain Layout
+Parse for document class
+\end_layout
+
+\end_inset
 
-<<Parse for document class>>=
-\newline
 open(INPUT, "<$relyx_file") ||
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
   die "Cannot read $relyx_file: $!
 \backslash
 n";
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
 $class = "article"; # default if none found
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
 parse: while(<INPUT>) {
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
   if (/
 \backslash
 
 \backslash
 docu[m]entclass{(.*)}/) {
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
     $class = $1;
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
     last parse;
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
   }
-\newline
-}
-\newline
-close(INPUT);
-\newline
-@
 \end_layout
 
-\begin_layout Subsection
+\begin_layout Plain Layout
 
-Running reLyX with the corresponding literate document layout
+}
 \end_layout
 
-\begin_layout Standard
+\begin_layout Plain Layout
 
-Now that we know what the document class ought to be, we do:
+close(INPUT);
 \end_layout
 
-\begin_layout Scrap
+\end_inset
+
+
+\end_layout
+
+\begin_layout Subsection
+Running reLyX with the corresponding literate document layout
+\end_layout
+
+\begin_layout Standard
+Now that we know what the document class ought to be, we do:
+\end_layout
+
+\begin_layout Standard
+\begin_inset ERT
+status open
+
+\begin_layout Plain Layout
 
 <<Run reLyX with document class>>= 
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
 $doc_class = "literate-" .
  $class;
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
 die "reLyX returned non-zero: $!
 \backslash
 n"
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
   if (system("reLyX -c $doc_class $relyx_file"));
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
 @
 \end_layout
 
-\begin_layout Standard
+\end_inset
+
 
+\end_layout
+
+\begin_layout Standard
 reLyX performs the main bulk of the translation work.
  Note that if the ``literate-
 \emph on
@@ -1129,42 +1603,74 @@ noweb
 \end_layout
 
 \begin_layout Section
-
 Fixing the reLyX output
 \end_layout
 
 \begin_layout Standard
-
 We need to perform some post-processing of what reLyX produces in order
  to have the best output for our literate document.
  The outline of the post-processing steps are:
 \end_layout
 
-\begin_layout Scrap
+\begin_layout Standard
+\begin_inset Flex Chunk
+status open
+
+\begin_layout Plain Layout
+
+\begin_inset Argument 1
+status open
+
+\begin_layout Plain Layout
+Fix up LyX file
+\end_layout
+
+\end_inset
 
-<<Fix up LyX file>>=
-\newline
 <<Setup INPUT and OUTPUT for the final output>>
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
 line: while(<INPUT>)
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
 {
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
   <<Fix code chunks in latex layout>>
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
   <<Fix [[var]] noweb construct>>
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
   print OUTPUT; # default
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
 } 
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
 <<Close INPUT and OUTPUT>>
-\newline
-@
 \end_layout
 
-\begin_layout Standard
+\end_inset
+
+
+\end_layout
 
+\begin_layout Standard
 Note that in the perl code that is contained in the 
 \family roman
 \series medium
@@ -1178,7 +1684,8 @@ Note that in the perl code that is contained in the
 \begin_inset ERT
 status collapsed
 
-\begin_layout Standard
+\begin_layout Plain Layout
+
 [[while(<INPUT>)]]
 \end_layout
 
@@ -1192,8 +1699,11 @@ status collapsed
 \emph default
 \bar default
 \noun default
 \color inherit
- loop above, the perl construct 
+loop above, the perl construct
+\color none
 \family roman
 \series medium
 \shape up
@@ -1201,12 +1711,12 @@ status collapsed
 \emph off
 \bar no
 \noun off
-\color none
 
 \begin_inset ERT
 status collapsed
 
-\begin_layout Standard
+\begin_layout Plain Layout
+
 [[next line]]
 \end_layout
 
@@ -1220,19 +1730,18 @@ status collapsed
 \emph default
 \bar default
 \noun default
 \color inherit
- is sufficient to restart the loop.
+is sufficient to restart the loop.
  We can use this construct to do some relatively complex parsing of the
  reLyX generated file.
 \end_layout
 
 \begin_layout Subsection
-
 File input and output for the post-processing
 \end_layout
 
 \begin_layout Standard
-
 Setting up the 
 \family roman
 \series medium
@@ -1246,7 +1755,8 @@ Setting up the
 \begin_inset ERT
 status collapsed
 
-\begin_layout Standard
+\begin_layout Plain Layout
+
 [[INPUT]]
 \end_layout
 
@@ -1260,8 +1770,11 @@ status collapsed
 \emph default
 \bar default
 \noun default
 \color inherit
- and 
+and
+\color none
 \family roman
 \series medium
 \shape up
@@ -1269,12 +1782,12 @@ status collapsed
 \emph off
 \bar no
 \noun off
-\color none
 
 \begin_inset ERT
 status collapsed
 
-\begin_layout Standard
+\begin_layout Plain Layout
+
 [[OUTPUT]]
 \end_layout
 
@@ -1288,145 +1801,271 @@ status collapsed
 \emph default
 \bar default
 \noun default
 \color inherit
- is taken care of by this code:
+is taken care of by this code:
 \end_layout
 
-\begin_layout Scrap
+\begin_layout Standard
+\begin_inset Flex Chunk
+status open
+
+\begin_layout Plain Layout
+
+\begin_inset Argument 1
+status open
+
+\begin_layout Plain Layout
+Setup INPUT and OUTPUT for the final output
+\end_layout
+
+\end_inset
 
-<<Setup INPUT and OUTPUT for the final output>>=
-\newline
 if ($post_only) {
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
   &setup_files("$input_file", "$output_file");
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
 } else {
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
   &setup_files("$relyx_file.lyx", "$output_file");
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
 }
-\newline
-@
+\end_layout
+
+\end_inset
+
+
 \end_layout
 
 \begin_layout Subsection
+Making sure the code chunks are in the Chunk layout
+\end_layout
 
-Making sure the code chunks are in the Scrap layout
+\begin_layout Standard
+Now, as we outlined before, the final step is transforming the code-chunks
+ which have been put into a LaTeX layout by LyX into the Chunk layout.
 \end_layout
 
 \begin_layout Standard
+\begin_inset Flex Chunk
+status open
 
-Now, as we outlined before, the final step is transforming the code-chunks
- which have been put into a LaTeX layout by LyX into the scrap layout.
+\begin_layout Plain Layout
+
+\begin_inset Argument 1
+status open
+
+\begin_layout Plain Layout
+Fix code chunks in latex layout
 \end_layout
 
-\begin_layout Scrap
+\end_inset
 
-<<Fix code chunks in latex layout>>=
-\newline
 if (/
 \backslash
 
 \backslash
 latex latex/) { # Beginning of some latex code
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
   if (($line = <INPUT>) =~ /^
 \backslash
-s*<</) { # code scrap
-\newline
-    <<Transform this chunk into layout scrap>>
-\newline
+s*<</) { # code chunk
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
+    <<Transform this chunk into layout chunk>>
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
   } else {
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
     # print the 
 \backslash
 latex latex line + next line
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
     print OUTPUT "$_$line";
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
   }
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
   next line;
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
 }
-\newline
-@
 \end_layout
 
-\begin_layout Standard
+\end_inset
+
+
+\end_layout
 
+\begin_layout Standard
 When we are sure that we are in a code chunk, we must read in the rest of
- the code chunk and output a scrap layout for it:
+ the code chunk and output a chunk layout for it:
 \end_layout
 
-\begin_layout Scrap
+\begin_layout Standard
+\begin_inset ERT
+status open
+
+\begin_layout Plain Layout
+
+<<Transform this chunk into layout chunk>>=
+\end_layout
 
-<<Transform this chunk into layout scrap>>=
-\newline
-$savedScrap = "
+\begin_layout Plain Layout
+
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
+$savedchunk = "
 \backslash
 
 \backslash
-layout Scrap
+layout Chunk
 \backslash
 n
 \backslash
 n$line";
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
 codeline: while (<INPUT>) {
-\newline
-  $savedScrap .= $_;
-\newline
-  last codeline if /^@
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
+ $savedchunk .= $_;
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
+ last codeline if /^@
 \backslash
 s+/;
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
 };
-\newline
-print OUTPUT $savedScrap;
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
+print OUTPUT $savedchunk;
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
 <<Slurp up to the end of the latex layout>>
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
 @
 \end_layout
 
-\begin_layout Standard
+\end_inset
+
 
+\end_layout
+
+\begin_layout Standard
 Okay, now we just need to eat the rest of the latex layout.
  There should only be a few different types of lines for us to match:
 \end_layout
 
-\begin_layout Scrap
+\begin_layout Standard
+\begin_inset Flex Chunk
+status open
+
+\begin_layout Plain Layout
+
+\begin_inset Argument 1
+status open
+
+\begin_layout Plain Layout
+Slurp up to the end of the latex layout
+\end_layout
+
+\end_inset
 
-<<Slurp up to the end of the latex layout>>=
-\newline
 slurp: while (<INPUT>) {
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
   last slurp if /
 \backslash
 
 \backslash
 latex /;
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
   next slurp if /
 \backslash
 
 \backslash
 newline/;
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
   next slurp if /^
 \backslash
 s*$/;
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
   warn "confused by line: $_";
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
 }
-\newline
-@
 \end_layout
 
-\begin_layout Subsection
+\end_inset
+
+
+\end_layout
 
+\begin_layout Subsection
 Taking care of the 
 \noun on
 noweb
@@ -1440,7 +2079,6 @@ noweb
 
 \begin_layout Standard
 
-
 \noun on
 noweb
 \noun default
@@ -1460,10 +2098,21 @@ noweb
  when it generates the final LaTeX code.
 \end_layout
 
-\begin_layout Scrap
+\begin_layout Standard
+\begin_inset Flex Chunk
+status open
+
+\begin_layout Plain Layout
+
+\begin_inset Argument 1
+status open
+
+\begin_layout Plain Layout
+Fix [[var]] noweb construct
+\end_layout
+
+\end_inset
 
-<<Fix [[var]] noweb construct>>=
-\newline
 if (/
 \backslash
 [
@@ -1473,7 +2122,10 @@ if (/
 ]
 \backslash
 ]/) { # special code for [[var]]
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
   s/
 \backslash
 [
 latex default
 \backslash
 n/g;
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
   print OUTPUT;
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
   next line;
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
 }
-\newline
-@
 \end_layout
 
-\begin_layout Section
+\end_inset
+
 
+\end_layout
+
+\begin_layout Section
 Cleaning up intermediate files
 \end_layout
 
 \begin_layout Standard
-
 The cleanup code is very simple:
 \end_layout
 
-\begin_layout Scrap
+\begin_layout Standard
+\begin_inset Flex Chunk
+status open
+
+\begin_layout Plain Layout
+
+\begin_inset Argument 1
+status open
+
+\begin_layout Plain Layout
+Clean up
+\end_layout
+
+\end_inset
 
-<<Clean up>>=
-\newline
 system("rm -f $relyx_file*") unless ($post_only || $pre_only);
-\newline
-@
 \end_layout
 
-\begin_layout Section
+\end_inset
+
 
+\end_layout
+
+\begin_layout Section
 User supplied arguments
 \end_layout
 
 \begin_layout Standard
-
 The 
 \noun on
 noweb2lyx
@@ -1542,66 +2216,139 @@ noweb2lyx
  files in the import pipeline.
 \end_layout
 
-\begin_layout Scrap
+\begin_layout Standard
+\begin_inset ERT
+status open
+
+\begin_layout Plain Layout
 
 <<Setup variables from user supplied args>>=
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
 &usage() if ($#ARGV < 1); # zero or one argument 
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
 if ($ARGV[0] eq "-pre") {
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
   &usage unless ($#ARGV == 2);
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
   $input_file = $ARGV[1]; $output_file = $ARGV[2]; $pre_only = 1;
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
 } elsif ($ARGV[0] eq "-post") {
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
   &usage unless ($#ARGV == 2);
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
   $input_file = $ARGV[1]; $output_file = $ARGV[2]; $post_only = 1;
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
 } else {
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
   &usage unless ($#ARGV == 1);
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
   $input_file = $ARGV[0]; $output_file = $ARGV[1];
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
   $pre_only = 0; $post_only = 0;
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
 }
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
 @ %def input_file output_file pre_only post_only
 \end_layout
 
-\begin_layout Scrap
+\begin_layout Plain Layout
 
 <<Subroutines>>=
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
 sub usage() {
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
   print "Usage: noweb2lyx [-pre | -post] input-file output-file
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
 
-\newline
 If -pre is specified, only pre-processes the input-file for reLyX.
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
 Similarly, in the case of -post, post-processes reLyX output.
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
 In case of bugs, Email Kayvan Sylvan <kayvan
 \backslash
 @sylvan.com>.
 \backslash
 n";
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
   exit;
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
 }
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
 @ %def usage
 \end_layout
 
-\begin_layout Section
+\end_inset
+
+
+\end_layout
 
+\begin_layout Section
 Generating the 
 \noun on
 noweb2lyx
@@ -1610,14 +2357,13 @@ noweb2lyx
 \end_layout
 
 \begin_layout Standard
-
 The noweb2lyx script can be tangled from LyX if you set 
 \family typewriter
 
 \backslash
 build_command
 \family default
- to call a generic script that always extracts a scrap named 
+ to call a generic script that always extracts a chunk named 
 \family typewriter
 build-script
 \family default
@@ -1626,43 +2372,64 @@ build-script
 \end_layout
 
 \begin_layout LyX-Code
-
 #!/bin/sh
-\newline
-notangle -Rbuild-script $1 | sh
+\begin_inset Newline newline
+\end_inset
+
+notangle -Rbuild-script $1 | env NOWEB_SOURCE=$1 NOWEB_OUTPUT_DIR=$2 sh
 \end_layout
 
-\begin_layout Scrap
+\begin_layout Standard
+\begin_inset Flex Chunk
+status open
+
+\begin_layout Plain Layout
+
+\begin_inset Argument 1
+status open
+
+\begin_layout Plain Layout
+build-script
+\end_layout
+
+\end_inset
 
-<<build-script>>=
-\newline
 PREFIX=/usr
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
 notangle -Rnoweb2lyx.in noweb2lyx.nw > noweb2lyx.in
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
 sed -e "s=@PERL@=$PREFIX/bin/perl=" noweb2lyx.in > noweb2lyx
-\newline
+\end_layout
+
+\begin_layout Plain Layout
+
 chmod +x noweb2lyx
-\newline
-@
 \end_layout
 
+\end_inset
 
-\begin_layout Standard
 
+\end_layout
+
+\begin_layout Standard
+\begin_inset Newpage newpage
+\end_inset
 
-\newpage
 
 \end_layout
 
 \begin_layout Section*
-
 Macros
 \end_layout
 
 \begin_layout Standard
 
-
 \family roman
 \series medium
 \shape up
@@ -1671,11 +2438,11 @@ Macros
 \bar no
 \noun off
 \color none
-
 \begin_inset ERT
 status collapsed
 
-\begin_layout Standard
+\begin_layout Plain Layout
+
 
 \backslash
 nowebchunks
@@ -1687,13 +2454,11 @@ nowebchunks
 \end_layout
 
 \begin_layout Section*
-
 Identifiers
 \end_layout
 
 \begin_layout Standard
 
-
 \family roman
 \series medium
 \shape up
@@ -1702,11 +2467,11 @@ Identifiers
 \bar no
 \noun off
 \color none
-
 \begin_inset ERT
 status collapsed
 
-\begin_layout Standard
+\begin_layout Plain Layout
+
 
 \backslash
 nowebindex