]> git.lyx.org Git - lyx.git/blobdiff - lib/doc/Extended.lyx
German UserGuide.lyx: update for Hartmut
[lyx.git] / lib / doc / Extended.lyx
index 5b699e8960f85ed1dcf30927b259fd22b0fd3642..d6eb910e222d48c1f4d489f22d2a82df8071fdd5 100644 (file)
@@ -1,12 +1,49 @@
-#LyX 1.5.0svn created this file. For more info see http://www.lyx.org/
-\lyxformat 256
+#LyX 1.6.0svn created this file. For more info see http://www.lyx.org/
+\lyxformat 313
 \begin_document
 \begin_header
 \textclass book
 \begin_preamble
 \usepackage{multicol}
 \newcommand{\extratablespace}[1]{\noalign{\vskip#1}}
+
+% if pdflatex is used
+\usepackage{ifpdf}
+\ifpdf
+
+% set fonts for nicer pdf view
+\IfFileExists{lmodern.sty}
+ {\usepackage{lmodern}}{}
+
+% link all cross references and URLs
+% in pdf output
+ \usepackage[colorlinks=true, bookmarks, bookmarksnumbered, bookmarksopen, bookmarksopenlevel=1,
+  linkcolor=black, citecolor=black, urlcolor=blue, filecolor=blue,
+  pdfpagelayout=OneColumn, pdfnewwindow=true,
+  pdfstartview=XYZ, plainpages=false, pdfpagelabels,
+  pdfauthor={LyX Team}, pdftex,
+  pdftitle={LyX's Extended manual},
+  pdfsubject={LyX's extended documentation},
+  pdfkeywords={LyX, Documentation, Extended}]{hyperref}
+\else % if dvi or ps is produced
+
+ % link all cross references and URLs in DVI output
+ \usepackage[ps2pdf, colorlinks=true,
+  linkcolor=black, citecolor=black, urlcolor=blue, filecolor=blue]{hyperref}
+
+\fi % end if pdflatex is used
+
+% redefine the \LyX macro for PDF bookmarks
+\def\LyX{\texorpdfstring{%
+  L\kern-.1667em\lower.25em\hbox{Y}\kern-.125emX\@}
+  {LyX }}
 \end_preamble
+\begin_modules
+logicalmkup
+theorems-ams
+theorems-ams-extended
+\end_modules
 \language english
 \inputencoding latin1
 \font_roman default
@@ -20,6 +57,7 @@
 \graphics default
 \paperfontsize default
 \spacing single
+\use_hyperref false
 \papersize default
 \use_geometry false
 \use_amsmath 0
@@ -36,8 +74,9 @@
 \papersides 2
 \paperpagestyle headings
 \tracking_changes false
-\output_changes true
-\author "usti" 
+\output_changes false
+\author "" 
+\author "" 
 \end_header
 
 \begin_body
@@ -68,7 +107,8 @@ Principal maintainer of this file is
 \end_layout
 
 \begin_layout Standard
-\begin_inset LatexCommand tableofcontents
+\begin_inset CommandInset toc
+LatexCommand tableofcontents
 
 \end_inset
 
@@ -135,9 +175,9 @@ Overextended Manual
 \begin_layout Standard
 If you haven't read the 
 \emph on
-Introduction 
+Introduction
 \emph default
-yet, you are definitely in the wrong manual.
+ yet, you are definitely in the wrong manual.
  The 
 \emph on
 Introduction
@@ -163,12 +203,8 @@ In this document, many sections are independent articles contributed by
 
 \begin_layout Standard
 Since all the topics in this manual depend heavily on LyX's interaction
- with LaTeX, this first chapter covers
-\emph on
-\emph default
-the inner workings of LyX and how to direct LyX to generate exactly the
- LaTeX code you want.
+ with LaTeX, this first chapter covers the inner workings of LyX and how
+ to direct LyX to generate exactly the LaTeX code you want.
  It is obviously for more seasoned LyX users.
 \end_layout
 
@@ -181,7 +217,8 @@ How LyX Uses LaTeX
 \end_layout
 
 \begin_layout Standard
-\begin_inset LatexCommand label
+\begin_inset CommandInset label
+LatexCommand label
 name "sec:lyxandlatex"
 
 \end_inset
@@ -471,6 +508,13 @@ ile
 
 \begin_layout Section
 Translating LaTeX files into LyX
+\begin_inset CommandInset label
+LatexCommand label
+name "sec:Translating-LaTeX-files"
+
+\end_inset
+
+
 \end_layout
 
 \begin_layout Standard
@@ -522,8 +566,10 @@ tex2lyx
 \end_layout
 
 \begin_layout Standard
-If you just want to put a piece of LaTeX code into a LyX file, see Section
-\begin_inset LatexCommand ref
+If you just want to put a piece of LaTeX code into a LyX file, see Section\InsetSpace ~
+
+\begin_inset CommandInset ref
+LatexCommand ref
 reference "sec:latexcodes"
 
 \end_inset
@@ -533,7 +579,8 @@ reference "sec:latexcodes"
 
 \begin_layout Section
 Inserting LaTeX Code into LyX Documents 
-\begin_inset LatexCommand label
+\begin_inset CommandInset label
+LatexCommand label
 name "sec:Inserting-LaTeX-Code"
 
 \end_inset
@@ -542,7 +589,8 @@ name "sec:Inserting-LaTeX-Code"
 \end_layout
 
 \begin_layout Standard
-\begin_inset LatexCommand label
+\begin_inset CommandInset label
+LatexCommand label
 name "sec:latexcodes"
 
 \end_inset
@@ -580,7 +628,7 @@ inlined
  short sections of LaTeX commands.
  
 \begin_inset ERT
-status inlined
+status open
 
 \begin_layout Standard
 
@@ -887,7 +935,8 @@ About the LaTeX Preamble
 \end_layout
 
 \begin_layout Standard
-\begin_inset LatexCommand label
+\begin_inset CommandInset label
+LatexCommand label
 name "sec:preamble"
 
 \end_inset
@@ -904,9 +953,9 @@ If you already know LaTeX, there is no need to explain here what the preamble
 \begin_layout Standard
 The LaTeX preamble comes at the very beginning of a document, 
 \emph on
-before 
+before
 \emph default
-the text.
+ the text.
  It serves to:
 \end_layout
 
@@ -932,11 +981,7 @@ Customization Manual
 declare the usage of packages.
  LaTeX packages provide special commands, which are only available within
  a document when the package has been declared in the preamble.
- For example, the
-\family typewriter
-\family default
-package 
+ For example, the package 
 \family typewriter
 indentfirst
 \family default
@@ -964,9 +1009,9 @@ declare user defined commands [with
 \family typewriter
 
 \backslash
-newcommand 
+newcommand
 \family default
-or 
+ or 
 \family typewriter
 
 \backslash
@@ -1213,9 +1258,9 @@ labels.sty
 \begin_layout Standard
 First, make sure you're using the 
 \family sans
-article 
+article
 \family default
-document class.
+ document class.
  Next, you need to put the following in your preamble:
 \end_layout
 
@@ -1379,7 +1424,8 @@ dirty tricks
 
  given in Chapter\InsetSpace ~
 
-\begin_inset LatexCommand ref
+\begin_inset CommandInset ref
+LatexCommand ref
 reference "cha:secrets"
 
 \end_inset
@@ -1453,9 +1499,8 @@ open
 \end_layout
 
 \begin_layout Standard
-Some folks also like to look at the log file directly, accessible from
+Some folks also like to look at the log file directly, accessible from 
 \family sans
 \bar under
 D
 \bar default
@@ -1907,7 +1952,8 @@ Supplemental Tools
 
 \begin_layout Section
 Preparing a Bibliography with BibTeX
-\begin_inset LatexCommand label
+\begin_inset CommandInset label
+LatexCommand label
 name "sec:Preparing-a-Bibliography"
 
 \end_inset
@@ -2144,9 +2190,9 @@ ocument\SpecialChar \menuseparator
 \bar under
 S
 \bar default
-ettings 
+ettings
 \family default
-and select the 
+ and select the 
 \family sans
 Bibliography
 \family default
@@ -2206,8 +2252,13 @@ status collapsed
 
 \begin_layout Standard
 See 
-\begin_inset LatexCommand url
-target "ftp://ctan.tug.org/tex-archive/macros/latex/contrib/custom-bib/"
+\begin_inset Flex URL
+status collapsed
+
+\begin_layout Standard
+
+ftp://ctan.tug.org/tex-archive/macros/latex/contrib/custom-bib/
+\end_layout
 
 \end_inset
 
@@ -2225,7 +2276,8 @@ natbib
 
 \begin_layout Subsection
 Sectionated Bibliographies
-\begin_inset LatexCommand label
+\begin_inset CommandInset label
+LatexCommand label
 name "sub:Sectionated-Bibliographies"
 
 \end_inset
@@ -2262,8 +2314,13 @@ status collapsed
 
 \begin_layout Standard
 Available from 
-\begin_inset LatexCommand url
-target "ftp://ctan.tug.org/tex-archive/macros/latex/contrib/bibtopic/"
+\begin_inset Flex URL
+status collapsed
+
+\begin_layout Standard
+
+ftp://ctan.tug.org/tex-archive/macros/latex/contrib/bibtopic/
+\end_layout
 
 \end_inset
 
@@ -2321,9 +2378,9 @@ ocument\SpecialChar \menuseparator
 \bar under
 S
 \bar default
-ettings 
+ettings
 \family default
-and select the 
+ and select the 
 \family sans
 Bibliography
 \family default
@@ -2340,7 +2397,8 @@ bibliography
 .
  Now you can insert multiple BibTeX references (as described in section\InsetSpace ~
 
-\begin_inset LatexCommand ref
+\begin_inset CommandInset ref
+LatexCommand ref
 reference "sec:Preparing-a-Bibliography"
 
 \end_inset
@@ -2434,7 +2492,8 @@ bibtopic
  LyX (cf.\InsetSpace ~
 section\InsetSpace ~
 
-\begin_inset LatexCommand ref
+\begin_inset CommandInset ref
+LatexCommand ref
 reference "sub:Sectionated-Bibliographies"
 
 \end_inset
@@ -2443,7 +2502,8 @@ reference "sub:Sectionated-Bibliographies"
  LaTeX-Code (ERT, cf.\InsetSpace ~
 section\InsetSpace ~
 
-\begin_inset LatexCommand ref
+\begin_inset CommandInset ref
+LatexCommand ref
 reference "sec:Inserting-LaTeX-Code"
 
 \end_inset
@@ -2480,9 +2540,9 @@ ocument\SpecialChar \menuseparator
 \bar under
 S
 \bar default
-ettings 
+ettings
 \family default
-and select the 
+ and select the 
 \family sans
 Bibliography
 \family default
@@ -2523,588 +2583,147 @@ every
  Also, the btUnits cannot be nested.
 \end_layout
 
+\begin_layout Standard
+
+\end_layout
+
 \begin_layout Section
-Making an Index
+Multipart Documents
 \end_layout
 
-\begin_layout Standard
-A good index is one of the hardest things to make in a lengthy document,
- but LyX helps make things a bit simpler by interfacing to the 
-\family typewriter
-makeindex
-\family default
- program which is found in most recent LaTeX distributions.
-\begin_inset Foot
-status collapsed
+\begin_layout Subsection
+General Operation
+\end_layout
 
 \begin_layout Standard
+When you are working on a large file with many sections, it is often convenient
+ to break up the document into several files, or perhaps you have something
+ where a table may change from time to time, but the preceding text does
+ not.
+ In these cases, you should seriously consider using multipart documents.
+ For example, scientific papers often have five major sections: the introduction
+, observations, results, discussion, and conclusion.
+ Each of these could be its own separate LyX file, with one 
+\begin_inset Quotes eld
+\end_inset
+
+master
+\begin_inset Quotes erd
+\end_inset
+
+ file which contains the title, authors, abstract, references, etc., plus
+ the five included files.
+ It is important to note that each of these files is a full LyX file which
+ can be formatted and printed on its own, as well as included in a master
+ file.
+ Each of these files must have the same document class, however--- don't
+ attempt to mix book classes with article classes.
+ You may also include LaTeX files; however, these files must not have their
+ own preamble 
+\emph on
+(i.e.
 
-\family roman
-\series medium
-\shape up
-\size normal
-\emph off
-\bar no
-\noun off
-\color none
-In the 
-\family sans
-\series default
-\shape default
-\size default
 \emph default
-\bar default
-\noun default
-Outputs\SpecialChar \menuseparator
-LaT\SpecialChar \textcompwordmark{}
-eX
-\family roman
-\series medium
-\shape up
-\size normal
-\emph off
-\bar no
-\noun off
- section of the preferences dialog, however, you can customize the index
- command, if you prefer an alternative program like 
+ everything up to and including the 
 \family typewriter
-\series default
-\shape default
-\size default
-\emph default
-\bar default
-\noun default
-xindy
-\family roman
-\series medium
-\shape up
-\size normal
-\emph off
-\bar no
-\noun off
-.
-\end_layout
 
-\end_inset
+\backslash
+begin{document}
+\family default
+ line as well as the 
+\family typewriter
 
- Inserting an index and marking words to include in it works much the same
- way as preparing a bibliography as mentioned in the last section.
+\backslash
+end{document}
+\family default
+ line must be deleted) or else errors will be generated when you try to
+ make a DVI file.
 \end_layout
 
 \begin_layout Standard
-First, go to the end of your file and select 
+LyX allows you to include files quite easily with 
 \family sans
 \bar under
 I
 \bar default
 nsert\SpecialChar \menuseparator
-List
-\family default
-\InsetSpace ~
-/\InsetSpace ~
-
-\family sans
-T
-\bar under
-O
-\bar default
-C\SpecialChar \menuseparator
-
+ChiI
 \bar under
-I
+d
 \bar default
-ndex
-\family default
 \InsetSpace ~
-
-\family sans
-List
+Document
 \family default
 .
- Then, for each word you would like to include in the index, go to the end
- of that word and click on 
-\family sans
-\bar under
-I
-\bar default
-nsert\SpecialChar \menuseparator
-
-\bar under
-I
-\bar default
-ndex
-\family default
-\InsetSpace ~
+ When you click on this selection a small box is inserted into the file
+ at the current cursor location.
+ Clicking on the box raises a dialog which allows you to select the file
+ to be included, and the method of its inclusion.
+\end_layout
 
-\family sans
-Entry
-\family default
-.
- This will insert a tag showing the word as it will appear in the index.
- That's all there is to it; LyX will automatically call 
-\family typewriter
-makeindex
-\family default
- for you and create the index itself.
- The text in the dialog available from right-clicking on the index button
- accepts LaTeX, so you'll need to be careful to avoid using any special
- characters.
- On the positive side, you can use the advanced options - have a look at
- the documentation which comes with your LaTeX distribution to find out
- how to do things like 
+\begin_layout Standard
+The file selection box should by now be obvious.
+ The three inclusion methods are 
 \begin_inset Quotes eld
 \end_inset
 
-nested entries
+include
 \begin_inset Quotes erd
 \end_inset
 
-, etc.
-\end_layout
-
-\begin_layout Standard
-Be careful not to put spaces between the word in the text and the index
- marker; apparently the wrong page number can be produced if this happens.
-\end_layout
-
-\begin_layout Section
-Glossaries
-\end_layout
-
-\begin_layout Standard
-by 
-\noun on
-Özgür U\i \~{g}
-ra\i \c{s}
- Baran
-\end_layout
-
-\begin_layout Standard
-Sometimes you need to compile a list of symbols that are mentioned in your
- document with a brief explanation of them.
- A LaTeX package named 
-\family typewriter
-nomencl
-\family default
- provides an easy way of compiling such lists.
-\family typewriter
-nomencl
-\family default
- is included in most standard Linux distributions.
- If your distribution doesn't contain it, you should download it from a
- CTAN mirror and install the package in order to use this feature of LyX.
-\end_layout
-
-\begin_layout Standard
-A glossary entry is created if you place the cursor after a symbol entry
- and then use the menu 
-\family sans
-Insert\SpecialChar \menuseparator
-Glossary\InsetSpace ~
-Entry
-\family default
-.
- A gray box labeled 
+, 
 \begin_inset Quotes eld
 \end_inset
 
-
-\family sans
-Not
-\family default
-
+input
 \begin_inset Quotes erd
 \end_inset
 
- is inserted and a window pops up asking for the glossary entry.
- A glossary entry consists of two main entries.
- The first is the symbol that you want to refer to.
- You should enter a valid LaTeX code for the corresponding field in the
- glossary dialog.
- The second is the description of the symbol.
- You should fill the corresponding field to complete the glossary entry.
-\end_layout
-
-\begin_layout Subsection
-Sort Order of Glossary Entries
-\end_layout
-
-\begin_layout Standard
-Suppose you have two glossary entries for the symbols 
-\begin_inset Formula $a$
+, and 
+\begin_inset Quotes eld
 \end_inset
 
- and 
-\begin_inset Formula $\sigma$
+verbatim
+\begin_inset Quotes erd
 \end_inset
 
 .
- The 
-\family typewriter
-nomencl
-\family default
- package automatically sorts these two entries considering the symbol entry,
- while printing the Glossary.
- However, this can lead to an undesired sort order.
- For the example given, the first entry appears as 
-\family typewriter
-$a$
-\family default
-, while the second is 
-\family typewriter
-$
-\backslash
-sigma$
-\family default
-.
- Note that, in this case 
-\begin_inset Formula $\sigma$
+ The difference between 
+\begin_inset Quotes eld
 \end_inset
 
- is located in front of the 
-\begin_inset Formula $a$
+include
+\begin_inset Quotes erd
 \end_inset
 
-, since the character 
+ and 
 \begin_inset Quotes eld
 \end_inset
 
-
-\backslash
-
+input
 \begin_inset Quotes erd
 \end_inset
 
- is considered in sorting.
- In order to control the sort order, you can edit the 
-\family sans
-Sort\InsetSpace ~
-as
-\family default
- field of the glossary dialog.
- For the given example, you can edit this field as 
-\family typewriter
-a
-\family default
- and 
-\family typewriter
-sigma 
-\family default
-correspondingly.
- Then, these entries will be effective in the sort ordering and 
-\begin_inset Formula $a$
+ is really only meaningful to LaTeXperts, but the practical difference is
+ that files which are 
+\begin_inset Quotes eld
 \end_inset
 
- will be located before 
-\begin_inset Formula $\sigma$
+included
+\begin_inset Quotes erd
 \end_inset
 
-.
-\end_layout
+ are typeset beginning on a new page, while files which are 
+\begin_inset Quotes eld
+\end_inset
 
-\begin_layout Standard
-This feature provides exciting ways of ordering the entries.
- For subgrouping and tips for using sort entries see the official nomencl
- documentation.
-\end_layout
+inputted
+\begin_inset Quotes erd
+\end_inset
 
-\begin_layout Subsection
-Referencing
-\end_layout
-
-\begin_layout Standard
-You can turn on referencing to the equations and pages in the glossary entries.
- For this purpose, you should add referencing options commands at the end
- of description field.
- There are six referencing options in nomencl package:
-\end_layout
-
-\begin_layout Paragraph*
-
-\backslash
-refeq:
-\end_layout
-
-\begin_layout Standard
-Adds reference to the equation by adding the phrase 
-\begin_inset Quotes eld
-\end_inset
-
-, see equation (#)
-\begin_inset Quotes erd
-\end_inset
-
-
-\end_layout
-
-\begin_layout Paragraph*
-
-\backslash
-refpage:
-\end_layout
-
-\begin_layout Standard
-Adds reference to the page by adding the phrase 
-\begin_inset Quotes eld
-\end_inset
-
-, page (#)
-\begin_inset Quotes erd
-\end_inset
-
-
-\end_layout
-
-\begin_layout Paragraph*
-
-\backslash
-refeqpage:
-\end_layout
-
-\begin_layout Standard
-Is the short notation of 
-\backslash
-refeq
-\backslash
-refpage.
-\end_layout
-
-\begin_layout Paragraph*
-
-\backslash
-norefeq, 
-\backslash
-norefpag, 
-\backslash
-norefeqpage:
-\end_layout
-
-\begin_layout Standard
-Turns off corresponding referencing options if they are turned on globally
- (see reference documentation of nomencl).
-\end_layout
-
-\begin_layout Subsection
-Printing Glossary
-\end_layout
-
-\begin_layout Standard
-You can insert the glossary with the menu 
-\family sans
-Insert\SpecialChar \menuseparator
-Lists\InsetSpace ~
-&TOC\SpecialChar \menuseparator
-Glossary
-\family default
-.
- A light blue box labeled 
-\begin_inset Quotes eld
-\end_inset
-
-
-\family sans
-Glossary
-\family default
-
-\begin_inset Quotes erd
-\end_inset
-
- will show the place where the index is printed in the output.
- The index list box is not clickable like other LyX-boxes.
- In the printed output the title of the glossary appears as 
-\series bold
-Nomenclature
-\series default
-
-\begin_inset Foot
-status collapsed
-
-\begin_layout Standard
-This is translated to the document language for a small number of languages,
- amongst others French and German
-\end_layout
-
-\end_inset
-
-.
- If you are not happy with the title, you can change it by re-defining the
- command 
-\family typewriter
-
-\backslash
-nomname
-\family default
- in the preamble.
- For example, in order to change the title 
-\emph on
-List of Symbols
-\emph default
- for the 
-\emph on
-Glossary
-\emph default
- add the following line to the preamble.
-\end_layout
-
-\begin_layout LyX-Code
-
-\backslash
-renewcommand{
-\backslash
-nomname}{List of Symbols}
-\end_layout
-
-\begin_layout Standard
- If you're unhappy with the amount of space for symbols, you can alter it
- by adding following line to the preamble.
-\end_layout
-
-\begin_layout LyX-Code
-
-\backslash
-renewcommand{
-\backslash
-nomlabelwidth}{3.0cm}
-\end_layout
-
-\begin_layout Section
-Multipart Documents
-\end_layout
-
-\begin_layout Subsection
-General Operation
-\end_layout
-
-\begin_layout Standard
-When you are working on a large file with many sections, it is often convenient
- to break up the document into several files, or perhaps you have something
- where a table may change from time to time, but the preceding text does
- not.
- In these cases, you should seriously consider using multipart documents.
- For example, scientific papers often have five major sections: the introduction
-, observations, results, discussion, and conclusion.
- Each of these could be its own separate LyX file, with one 
-\begin_inset Quotes eld
-\end_inset
-
-master
-\begin_inset Quotes erd
-\end_inset
-
- file which contains the title, authors, abstract, references, etc., plus
- the five included files.
- It is important to note that each of these files is a full LyX file which
- can be formatted and printed on its own, as well as included in a master
- file.
- Each of these files must have the same document class, however--- don't
- attempt to mix book classes with article classes.
- You may also include LaTeX files; however, these files must not have their
- own preamble 
-\emph on
-(i.e.
-
-\emph default
- everything up to and including the 
-\family typewriter
-
-\backslash
-begin{document}
-\family default
- line as well as the 
-\family typewriter
-
-\backslash
-end{document}
-\family default
- line must be deleted) or else errors will be generated when you try to
- make a DVI file.
-\end_layout
-
-\begin_layout Standard
-LyX allows you to include files quite easily with 
-\family sans
-\bar under
-I
-\bar default
-nsert\SpecialChar \menuseparator
-ChiI
-\bar under
-d
-\bar default
-\InsetSpace ~
-Document
-\family default
-.
- When you click on this selection a small box is inserted into the file
- at the current cursor location.
- Clicking on the box raises a dialog which allows you to select the file
- to be included, and the method of its inclusion.
-\end_layout
-
-\begin_layout Standard
-The file selection box should by now be obvious.
- The three inclusion methods are 
-\begin_inset Quotes eld
-\end_inset
-
-include
-\begin_inset Quotes erd
-\end_inset
-
-, 
-\begin_inset Quotes eld
-\end_inset
-
-input
-\begin_inset Quotes erd
-\end_inset
-
-, and 
-\begin_inset Quotes eld
-\end_inset
-
-verbatim
-\begin_inset Quotes erd
-\end_inset
-
-.
- The difference between 
-\begin_inset Quotes eld
-\end_inset
-
-include
-\begin_inset Quotes erd
-\end_inset
-
- and 
-\begin_inset Quotes eld
-\end_inset
-
-input
-\begin_inset Quotes erd
-\end_inset
-
- is really only meaningful to LaTeXperts, but the practical difference is
- that files which are 
-\begin_inset Quotes eld
-\end_inset
-
-included
-\begin_inset Quotes erd
-\end_inset
-
- are typeset beginning on a new page, while files which are 
-\begin_inset Quotes eld
-\end_inset
-
-inputted
-\begin_inset Quotes erd
-\end_inset
-
- are typeset starting on the current page.
- Perhaps the labeling in LyX will be changed someday to reflect this.
+ are typeset starting on the current page.
+ Perhaps the labeling in LyX will be changed someday to reflect this.
 \end_layout
 
 \begin_layout Standard
@@ -3149,8 +2768,6 @@ in\InsetSpace ~
 output
 \family default
  checkbox typesets a mark to unambiguously define the presence of a space.
-
-\emph on
  
 \end_layout
 
@@ -3480,7 +3097,8 @@ usepackage{graphics}
 
 \begin_layout Section
 Itemize Bullet Selection
-\begin_inset LatexCommand label
+\begin_inset CommandInset label
+LatexCommand label
 name "sec:bullet"
 
 \end_inset
@@ -3854,11 +3472,7 @@ How to use it
 \begin_layout Standard
 Select which bullet depth you want to change then select the bullet shape
  and size.
-
-\family sans
-\family default
-Any changes will not be visible in LyX, but are visible when viewing the
+ Any changes will not be visible in LyX, but are visible when viewing the
  document using xdvi or ghostview.
 \end_layout
 
@@ -3881,7 +3495,7 @@ really
 
 \begin_layout Standard
 \begin_inset ERT
-status inlined
+status open
 
 \begin_layout Standard
 
@@ -3901,7 +3515,7 @@ labelitemi
 
 \begin_layout Standard
 \begin_inset ERT
-status inlined
+status open
 
 \begin_layout Standard
 
@@ -3980,7 +3594,7 @@ labelitem
 
 \begin_layout Itemize
 \begin_inset ERT
-status inlined
+status open
 
 \begin_layout Standard
 
@@ -4012,7 +3626,7 @@ star
 
 \begin_layout Standard
 \begin_inset ERT
-status inlined
+status open
 
 \begin_layout Standard
 
@@ -4051,13 +3665,19 @@ Special Document Classes
 \end_layout
 
 \begin_layout Section
+\begin_inset CommandInset label
+LatexCommand label
+name "sec:AMS-LaTeX"
+
+\end_inset
+
 AMS LaTeX
 \end_layout
 
 \begin_layout Standard
 by 
 \noun on
-David Johnson
+David Johnson; updated by Richard Heck
 \end_layout
 
 \begin_layout Standard
@@ -4076,251 +3696,268 @@ The AMS LaTeX layouts are set up to conform to suggested styles for mathematical
  each journal (usually it will entail only changing a single line in the
  TeX output).
  That documentation is available on the Web at 
-\begin_inset LatexCommand url
-target "http://www.ams.org"
+\begin_inset Flex URL
+status open
+
+\begin_layout Standard
+
+http://www.ams.org
+\end_layout
 
 \end_inset
 
  or by ftp at 
-\begin_inset LatexCommand url
-target "ftp://ftp.ams.org/pub/tex/amslatex/"
+\begin_inset Flex URL
+status open
 
-\end_inset
+\begin_layout Standard
 
-.These layouts are appropriate, and useful, for any mathematical writing.
- There are currently 4 distinct AMS LaTeX layouts: 
+ftp://ftp.ams.org/pub/tex/amslatex/
 \end_layout
 
-\begin_layout Enumerate
-amsart: The standard AMS-article format.
- All results and similar statements are numbered as 
-\begin_inset Formula $(n.m)$
 \end_inset
 
-, where the first number refers to the section, and the second refers to
- the total number of results (Theorems, Corollaries, Propositions, Definitions
- and Remarks, etc.) in that section.
- There are also many (but not all) environments available unnumbered, which
- is occasionally needed.
- Unnumbered environments indicated by an asterisk at the end.
+.
+ These layouts are appropriate, and useful, for any mathematical writing.
 \end_layout
 
-\begin_layout Enumerate
-amsart-seq: Here, numbering for each type of statement is in its own sequence,
- with no reference to the section number.
- There are also many (but not all) environments available unnumbered, which
- is occasionally needed.
- Unnumbered environments indicated by an asterisk at the end.
+\begin_layout Standard
+There are two basic AMS LaTeX layouts: 
 \end_layout
 
 \begin_layout Enumerate
-amsart-plain: This one is even more terse, since all the environments are
- unnumbered.
+amsart: The standard AMS article format.
 \end_layout
 
 \begin_layout Enumerate
 amsbook: the standard AMS book (really, monograph) format.
- Numbering is similar to the amsart layout, except that all numbering is
- by 
-\begin_inset Formula $(n.m.p)$
-\end_inset
+\end_layout
+
+\begin_layout Standard
+These layouts themselves contain only the minimum necessary to use the AMS
+ classes.
+ They do not, in particular, contain any of the `theorem' environments used
+ for setting theorems, lemmas, and the like.
+ These are contained, instead, in the 
+\begin_inset Flex CharStyle:Code
+status collapsed
 
-, where the first number refers to the chapter, the second to the section,
- and the third is the number of the results (Theorems, Corollaries, Propositions
-, Definitions and Remarks, etc.) in that section.
- There are also many (but not all) environments available unnumbered, which
- is occasionally needed.
- Unnumbered environments indicated by an asterisk at the end.
+\begin_layout Standard
+Theorems (AMS)
 \end_layout
 
+\end_inset
+
+ module, which you will need to load separately when you selected one of
+ the AMS classes.
+ Less commonly used environments are in the 
+\begin_inset Flex CharStyle:Code
+status collapsed
+
 \begin_layout Standard
-Any AMS LyX file can be converted to either of the numbering schemes by
- simply changing the document class in the 
-\family sans
-\bar under
-D
-\bar default
-ocument\SpecialChar \menuseparator
+Theorems (AMS-Extended)
+\end_layout
 
-\bar under
-S
-\bar default
-ettings
-\family default
- dialog.
+\end_inset
+
+ module.
  
 \end_layout
 
-\begin_layout Subsection
-What these layouts provide
-\end_layout
+\begin_layout Standard
+By default, theorems and the like are numbered consecutively throughout
+ the document, but this may be modified by loading the module 
+\begin_inset Flex CharStyle:Code
+status collapsed
 
 \begin_layout Standard
-There is a long list of included environments provided by these layouts.
- Most mathematical papers or books will set as special statements most of
- these environments, in AMS-LaTeX there is an opportunity to define an unlimited
- variety of such declarations.
- However, the AMS recommends the environments that are available in LyX.
- The list of environments (not counting the standard environments such as
-\family sans
-sections, bibliography, title, author, date
-\family default
-), is:
+Theorems (Order by Section)
 \end_layout
 
-\begin_layout Description
-Theorem This is typically used for the statements of major results.
- The word 
-\begin_inset Quotes eld
 \end_inset
 
+ or, if you are using 
+\begin_inset Flex CharStyle:Code
+status collapsed
 
-\family sans
-Theorem
-\family default
+\begin_layout Standard
+book (AMS)
+\end_layout
 
-\begin_inset Quotes erd
 \end_inset
 
- appears in bold type, along with an automatically-determined number (an
- unnumbered version, 
-\family sans
-Theorem*
-\family default
-, is also available).
- The text is italicized.
-\end_layout
+, the module 
+\begin_inset Flex CharStyle:Code
+status collapsed
 
-\begin_layout Description
-Corollary This is used for statements which follow fairly directly from
- previous statements.
- Again, these can be major results.
- Unnumbered version 
-\family sans
-Corollary*
-\family default
- is available.
+\begin_layout Standard
+Theorems (Order by Chapter)
 \end_layout
 
-\begin_layout Description
-Lemma These are smaller results needed to prove other statements.
-\end_layout
+\end_inset
 
-\begin_layout Description
-Proposition These are less major results which (hopefully) add to the general
- theory being discussed.
-\end_layout
+.
+ These will number the results as 
+\begin_inset Formula $n.m$
+\end_inset
 
-\begin_layout Description
-Conjecture These are statements provided without justification, which the
- author does not know how to prove, but which seem to be true (to the author,
- at least).
-\end_layout
+, where the first number refers to the section (or chapter) and the second
+ refers to the total number of results so far in that section (or chapter).
+ Many environments are also available unnumbered.
+ These are indicated by an asterisk at the end.
+ If you happen to want 
+\emph on
+only
+\emph default
+ unnumbered results, the the module 
+\begin_inset Flex CharStyle:Code
+status collapsed
 
-\begin_layout Description
-Criterion A required condition.
+\begin_layout Standard
+Theorems (Starred)
 \end_layout
 
-\begin_layout Description
-Algorithm A general procedure to be used.
+\end_inset
+
+ provides that option.
 \end_layout
 
-\begin_layout Description
-Axiom This is a property or statement taken as true within the system being
- discussed.
+\begin_layout Standard
+Note that these modules do not 
+\emph on
+have
+\emph default
+ to be used with the AMS classes.
+ It is perfectly possible to use the 
+\begin_inset Flex CharStyle:Code
+status collapsed
+
+\begin_layout Standard
+Theorems (AMS)
 \end_layout
 
-\begin_layout Description
-Definition Guess what this is for.
- The font, both on-screen and in the output, is different for this environment
- than for the previous ones.
- The heading (
-\begin_inset Quotes eld
 \end_inset
 
-definition
-\begin_inset Quotes erd
-\end_inset
+ module, and the others mentioned, with other classes, such as 
+\begin_inset Flex CharStyle:Code
+status collapsed
 
-) is still set in boldface, along with the number, if any, but the rest
- is set upright.
+\begin_layout Standard
+article
 \end_layout
 
-\begin_layout Description
-Example Typeset similarly to Definition.
-\end_layout
+\end_inset
 
-\begin_layout Description
-Condition
-\end_layout
+, 
+\begin_inset Flex CharStyle:Code
+status collapsed
 
-\begin_layout Description
-Problem
+\begin_layout Standard
+report
 \end_layout
 
-\begin_layout Description
-Exercise
+\end_inset
+
+, 
+\begin_inset Flex CharStyle:Code
+status collapsed
+
+\begin_layout Standard
+book (KOMA-script)
 \end_layout
 
-\begin_layout Description
-Remark This environment is also a new type of theorem.
- This is set with the word Remark in italics, and the rest upright.
+\end_inset
+
+, and so forth.
 \end_layout
 
-\begin_layout Description
-Note Set similarly to the Remark environment.
+\begin_layout Subsection
+What these layouts provide
 \end_layout
 
-\begin_layout Description
-Notation
+\begin_layout Standard
+There is a long list of included environments provided by these layouts.
+ In AMS-LaTeX, there is, in fact, an opportunity to define an unlimited
+ variety of `theorem' environments.
+ However, the AMS recommends the environments that are available in LyX.
 \end_layout
 
-\begin_layout Description
-Claim
+\begin_layout Standard
+The following environments---as well as the standard environments, such
+ as 
+\begin_inset Flex CharStyle:Noun
+status collapsed
+
+\begin_layout Standard
+section
 \end_layout
 
-\begin_layout Description
-Summary
+\end_inset
+
+, 
+\begin_inset Flex CharStyle:Noun
+status collapsed
+
+\begin_layout Standard
+bibliography
 \end_layout
 
-\begin_layout Description
-Acknowledgement
+\end_inset
+
+, 
+\begin_inset Flex CharStyle:Noun
+status collapsed
+
+\begin_layout Standard
+title
 \end_layout
 
-\begin_layout Description
-Case Generally, these are used to break up long arguments, using specific
- instances of some condition.
- The numbering scheme for cases is on its own, not together with other numbered
- statements.
+\end_inset
+
+, 
+\begin_inset Flex CharStyle:Noun
+status collapsed
+
+\begin_layout Standard
+author
 \end_layout
 
-\begin_layout Description
-Conclusion
+\end_inset
+
+, and 
+\begin_inset Flex CharStyle:Noun
+status collapsed
+
+\begin_layout Standard
+date
 \end_layout
 
-\begin_layout Description
-Fact 
+\end_inset
+
+---are provided by 
+\begin_inset Flex CharStyle:Code
+status collapsed
+
+\begin_layout Standard
+article (AMS)
 \end_layout
 
-\begin_layout Description
-Proof The word 
-\begin_inset Quotes eld
 \end_inset
 
+ and 
+\begin_inset Flex CharStyle:Code
+status collapsed
 
-\shape italic
-Proof
-\shape default
+\begin_layout Standard
+book (AMS)
+\end_layout
 
-\begin_inset Quotes erd
 \end_inset
 
- is set in italics, but the rest is set upright.
- At the end of this environment (other environments can be nested within
- this one, of course) a QED symbol (usually a square, but it can vary with
- different styles) is placed.
+:
 \end_layout
 
 \begin_layout Description
@@ -4369,82 +4006,255 @@ Translator
 \end_layout
 
 \begin_layout Standard
-In addition, these environments automatically provide the AMS LaTeX and
- AMS fonts packages.
- They need to be available on your system in order to use these environments.
-\end_layout
+The following environments are provided by both the 
+\begin_inset Flex CharStyle:Code
+status collapsed
 
-\begin_layout Section
-Dinbrief
+\begin_layout Standard
+Theorems
 \end_layout
 
+\end_inset
+
+ and 
+\begin_inset Flex CharStyle:Code
+status collapsed
+
 \begin_layout Standard
-The document class 
-\family sans
-dinbrief
-\family default
- can be used to type letters according to German conventions.
- A template file is included in 
-\family typewriter
-.../lyx/share/templates
-\family default
- for you to use as a starting point.
+Theorems (AMS)
 \end_layout
 
-\begin_layout Section
-Paper
-\end_layout
+\end_inset
+
+ modules, in the latter case in both starred (unnumbered) and unstarred
+ (numbered) versions.
+ These same environments are provided only in the starred versions by the
+\begin_inset Flex CharStyle:Code
+status collapsed
 
 \begin_layout Standard
-The document class 
-\family sans
-paper
-\family default
- provides an alternative to the standard 
-\family sans
-article
-\family default
- class.
- It provides similar functionality, but you might prefer this layout with
- sans serif sections, headings, and more.
+Theorems (Starred)
 \end_layout
 
-\begin_layout Section
-A&A Paper
+\end_inset
+
+ module:
 \end_layout
 
-\begin_layout Standard
-by 
-\noun on
-Peter Sütterlin
+\begin_layout Theorem
+This is typically used for the statements of major results.
 \end_layout
 
-\begin_layout Subsection
-Introduction
+\begin_layout Corollary*
+This is used for statements which follow fairly directly from previous statement
+s.
+ Again, these can be major results.
 \end_layout
 
-\begin_layout Standard
-This section describes how LyX can be used to write articles for submission
- to the scientific journal 
-\emph on
-Astronomy and Astrophysics
-\emph default
- (
-\begin_inset LatexCommand url
-name "www.edpsciences.fr/aa/"
-target "http://www.edpsciences.fr/aa/"
+\begin_layout Lemma
+These are smaller results needed to prove other statements.
+\end_layout
 
-\end_inset
+\begin_layout Proposition
+These are less major results which (hopefully) add to the general theory
+ being discussed.
+\end_layout
 
-)
-\emph on
+\begin_layout Conjecture
+These are statements provided without justification, which the author does
+ not know how to prove, but which seem to be true (to the author, at least).
+\end_layout
+
+\begin_layout Definition*
+Guess what this is for.
+ The font is different for this environment than for the previous ones.
+\end_layout
+
+\begin_layout Example*
+Used for examples illustrating proven results.
+\end_layout
+
+\begin_layout Problem
+It's not really known what this is for.
+ You should figure it out.
+\end_layout
+
+\begin_layout Exercise*
+Write a description for this one.
+\end_layout
+
+\begin_layout Remark
+This environment is also a type of theorem, usually a lesser sort of observation.
+\end_layout
+
+\begin_layout Claim*
+Often used in the course of giving a proof of a larger result.
+\end_layout
+
+\begin_layout Case
+Generally, these are used to break up long arguments, using specific instances
+ of some condition.
+\end_layout
+
+\begin_layout Case
+The numbering scheme for cases is on its own, not together with other numbered
+ statements.
  
+\end_layout
+
+\begin_layout Proof
+At the end of this environment , a QED symbol (usually a square, but it
+ can vary with different styles) is placed.
+ If you want to have other environments within this one---for example, Case
+ environments---and have the QED symbol appear only after them, then the
+ other environments need to be nested within the proof environment.
+ See section 
+\begin_inset CommandInset ref
+LatexCommand ref
+reference "sec:Nesting"
+
+\end_inset
+
+ of the 
+\emph on
+User's Guide
 \emph default
-using
+ for information on nesting.
+\end_layout
+
+\begin_layout Standard
+And these are provided by 
+\begin_inset Flex CharStyle:Code
+status collapsed
+
+\begin_layout Standard
+Theorems (AMS-Extended)
+\end_layout
+
+\end_inset
+
+:
+\end_layout
+
+\begin_layout Criterion*
+A required condition.
+\end_layout
+
+\begin_layout Algorithm*
+A general procedure to be used.
+\end_layout
+
+\begin_layout Axiom*
+This is a property or statement taken as true within the system being discussed.
+\end_layout
+
+\begin_layout Condition*
+Sometimes used to state a condition assumed within the present context of
+ discussion.
+\end_layout
+
+\begin_layout Note*
+Similar to a Remark.
+\end_layout
+
+\begin_layout Notation*
+Used for the explanation of, yes, notation.
+\end_layout
+
+\begin_layout Summary
+Do we really need to tell you? 
+\end_layout
+
+\begin_layout Acknowledgement*
+Acknowledgement.
+\end_layout
+
+\begin_layout Conclusion*
+Sometimes used at the end of a long train of argument.
+\end_layout
+
+\begin_layout Fact
+Used in a way similar to Proposition, though perhaps lower on the scale.
+\end_layout
+
+\begin_layout Standard
+In addition, the AMS classes automatically provide the AMS LaTeX and AMS
+ fonts packages.
+ They need to be available on your system in order to use these environments.
+\end_layout
+
+\begin_layout Section
+Dinbrief
+\end_layout
+
+\begin_layout Standard
+The document class 
+\family sans
+dinbrief
+\family default
+ can be used to type letters according to German conventions.
+ A template file is included in 
+\family typewriter
+.../lyx/share/templates
+\family default
+ for you to use as a starting point.
+\end_layout
+
+\begin_layout Section
+Paper
+\end_layout
+
+\begin_layout Standard
+The document class 
+\family sans
+paper
+\family default
+ provides an alternative to the standard 
+\family sans
+article
+\family default
+ class.
+ It provides similar functionality, but you might prefer this layout with
+ sans serif sections, headings, and more.
+\end_layout
+
+\begin_layout Section
+A&A Paper
+\end_layout
+
+\begin_layout Standard
+by 
+\noun on
+Peter Sütterlin
+\end_layout
+
+\begin_layout Subsection
+Introduction
+\end_layout
+
+\begin_layout Standard
+This section describes how LyX can be used to write articles for submission
+ to the scientific journal 
 \emph on
+Astronomy and Astrophysics
 \emph default
-Version 5.01 of the document class 
+ (www.edpsciences.fr/aa/ 
+\begin_inset Flex URL
+status collapsed
+
+\begin_layout Standard
+
+http://www.edpsciences.fr/aa/
+\end_layout
+
+\end_inset
+
+) using Version 5.01 of the document class 
 \family typewriter
 aa.cls
 \family default
@@ -4461,8 +4271,13 @@ aa.cls
 
 \begin_layout Standard
 \align center
-\begin_inset LatexCommand url
-target "ftp://ftp.edpsciences.org/pub/aa/readme.html"
+\begin_inset Flex URL
+status collapsed
+
+\begin_layout Standard
+
+ftp://ftp.edpsciences.org/pub/aa/readme.html
+\end_layout
 
 \end_inset
 
@@ -4653,9 +4468,9 @@ nsert\SpecialChar \menuseparator
 F
 \bar default
 ootnote.
+
 \family default
-LyX will automagically use the term 
+ LyX will automagically use the term 
 \family typewriter
 
 \backslash
@@ -4905,9 +4720,9 @@ Figure and Table Floats
 \begin_layout Standard
 LyX provides support for the necessary float environments 
 \family sans
-figure, figure*, table 
+figure, figure*, table
 \family default
-and 
+ and 
 \family sans
 table*
 \family default
@@ -4934,11 +4749,7 @@ Settings.
 \end_layout
 
 \begin_layout Standard
-There is
-\family sans
-\family default
-only one special thing: the figures with caption besides the figure.
+There is only one special thing: the figures with caption besides the figure.
  To create such a figure, you have to do the following:
 \end_layout
 
@@ -4956,9 +4767,8 @@ a
 t\SpecialChar \menuseparator
 Figure
 \family default
-, then right click in the figure and select
+, then right click in the figure and select 
 \family sans
 \bar under
 S
 \bar default
@@ -5034,7 +4844,9 @@ Position the cursor behind the caption text, switch to LaTeX mode and insert
  the closing brace: 
 \family sans
 M-c\InsetSpace ~
-t 
+t
+\family default
 \family typewriter
 }
 \family default
@@ -5131,8 +4943,13 @@ AASTeX is a set of macros produced by the American Astronomical Society
 
 \begin_layout Standard
 \align center
-\begin_inset LatexCommand url
-target "http://www.journals.uchicago.edu/AAS/AASTeX"
+\begin_inset Flex URL
+status collapsed
+
+\begin_layout Standard
+
+http://www.journals.uchicago.edu/AAS/AASTeX
+\end_layout
 
 \end_inset
 
@@ -5168,7 +4985,10 @@ I strongly suggest that you start with the AASTeX template file.
 F
 \bar default
 ile\SpecialChar \menuseparator
-New from 
+New from
+\family default
+\family sans
 \bar under
 T
 \bar default
@@ -5354,7 +5174,7 @@ Things that work as expected
 
 \begin_layout Standard
 \begin_inset ERT
-status inlined
+status open
 
 \begin_layout Standard
 
@@ -5436,9 +5256,9 @@ subsubsection
 \backslash
 paragraph
 \family default
- (2.7),
+ (2.7), 
 \family typewriter
+
 \backslash
 facility
 \family default
@@ -5479,9 +5299,9 @@ begin{thebibliography}
 bibitem
 \family default
  (2.13.2), all the cite commands and their variations (2.13.2), the generic
- graphicx figure commands (2.14.1),
+ graphicx figure commands (2.14.1), 
 \family typewriter
+
 \backslash
 begin{table}
 \family default
@@ -5566,7 +5386,7 @@ Document
 
 \begin_layout Standard
 \begin_inset ERT
-status inlined
+status open
 
 \begin_layout Standard
 
@@ -5812,7 +5632,7 @@ Things not implemented, use ERT
 
 \begin_layout Standard
 \begin_inset ERT
-status inlined
+status open
 
 \begin_layout Standard
 
@@ -5907,15 +5727,15 @@ tablenotetext
 \backslash
 objectname
 \family default
-,
+, 
 \family typewriter
+
 \backslash
 dataset
 \family default
-,
+, 
 \family typewriter
+
 \backslash
 url
 \family default
@@ -5954,7 +5774,7 @@ twocolumn
 
 \begin_layout Standard
 \begin_inset ERT
-status inlined
+status open
 
 \begin_layout Standard
 
@@ -6028,15 +5848,11 @@ Make certain that
 \family typewriter
 aastex.layout
 \family default
- appears in 
-\family typewriter
-/usr/.../share/lyx/layouts
-\family default
- or 
+ appears in LyX's 
 \family typewriter
-~/.lyx/layouts
+layouts
 \family default
-.
+ folder
 \end_layout
 
 \begin_layout Enumerate
@@ -6122,7 +5938,8 @@ lock
 
 \begin_layout Subsubsection
 References
-\begin_inset LatexCommand label
+\begin_inset CommandInset label
+LatexCommand label
 name "cite"
 
 \end_inset
@@ -6144,9 +5961,9 @@ e.\InsetSpace \thinspace{}
 g.\InsetSpace ~
 
 \emph default
-type
+type 
 \family typewriter
- Ressler(1992)
+Ressler(1992)
 \family default
 , not 
 \family typewriter
@@ -6246,7 +6063,7 @@ Your mileage may vary.
 \end_layout
 
 \begin_layout Section
-qijmpc and ijmpd
+ijmpc and ijmpd
 \end_layout
 
 \begin_layout Standard
@@ -6284,14 +6101,24 @@ ws-ijmpd.cls
 , respectively.
  These files, together with instructions for the authors, can be downloaded
  from the sites 
-\begin_inset LatexCommand url
-target "http://www.worldscinet.com/ijmpc/mkt/guidelines.shtml"
+\begin_inset Flex URL
+status collapsed
+
+\begin_layout Standard
+
+http://www.worldscinet.com/ijmpc/mkt/guidelines.shtml
+\end_layout
 
 \end_inset
 
  and 
-\begin_inset LatexCommand url
-target "http://www.worldscinet.com/ijmpd/mkt/guidelines.shtml"
+\begin_inset Flex URL
+status collapsed
+
+\begin_layout Standard
+
+http://www.worldscinet.com/ijmpd/mkt/guidelines.shtml
+\end_layout
 
 \end_inset
 
@@ -6322,7 +6149,10 @@ As usual, the easiest way to write a paper is to start with a template.
 F
 \bar default
 ile\SpecialChar \menuseparator
-New from 
+New from
+\family default
+\family sans
 \bar under
 T
 \bar default
@@ -6821,13 +6651,13 @@ markboth{Authors' Names}{Short Paper's Title}
 \end_layout
 
 \begin_layout Section
-Kluwer
+iopart
 \end_layout
 
 \begin_layout Standard
 by 
 \noun on
-Panayotis Papasotiriou
+Uwe Stöhr
 \end_layout
 
 \begin_layout Subsection
@@ -6835,70 +6665,259 @@ Overview
 \end_layout
 
 \begin_layout Standard
-The Kluwer package is a set of macros produced by Kluwer Academic Publishers
- that facilitates electronic manuscript submission to the journals they
- publish.
- Most known of them (at least in my domain of interest) are 
-\emph on
-Astrophysics and Space Science
-\emph default
- and 
-\emph on
-Solar Physics
-\emph default
-, but there are many others (see a complete list at 
-\begin_inset LatexCommand url
-target "http://www.wkap.nl/jrnllist.htm/JRNLHOME"
+The iopart package provides a document class to create electronic manuscript
+ submission to the journals published by the Institute of Physics.
+ Instructions for the authors how to create a paper using the iopart class
+ can be downloaded together with the iopart package from the site 
+\begin_inset Flex URL
+status collapsed
 
-\end_inset
+\begin_layout Standard
 
-).
- The Kluwer package may be downloaded from the site 
-\begin_inset LatexCommand url
-target "http://www.wkap.nl/kaphtml.htm/STYLEFILES"
+ftp://ftp.iop.org/pub/journals/latex2e
+\end_layout
 
 \end_inset
 
 .
- A complete user guide is contained in that package (but it can also be
- downloaded separately).
+\end_layout
+
+\begin_layout Subsection
+Writing a paper
 \end_layout
 
 \begin_layout Standard
-LyX supports many features of the package but not everything.
- However, the ERT needed is reduced to some 
-\begin_inset Quotes eld
-\end_inset
+The easiest way to write a paper is to start with the file 
+\emph on
+IOP-article.lyx
+\emph default
+ that is available in LyX's examples files folder.
+ Open this file, save it under a new name, and start writing.
+ The example file explains how to use the special text environments.
+ Here are the most important advices:
+\end_layout
 
-peculiar
-\begin_inset Quotes erd
-\end_inset
+\begin_layout Itemize
+To be able to compile your document to a PDF, PS, or DVI, assure that the
+ two options 
+\family sans
+Use AMS math package
+\family default
+ in the document settings under 
+\family sans
+Math Options
+\family default
+ are not used!
+\end_layout
 
- commands of the package (see\InsetSpace ~
+\begin_layout Itemize
 
-\begin_inset LatexCommand ref
-reference "subsec:kluwer_peculiarities"
+\size normal
+The title environment defines the kind of your paper.
+ So use one of the following environments for the title:
+\end_layout
 
-\end_inset
+\begin_deeper
+\begin_layout Itemize
 
-).
- I have recently used LyX to write an article submitted to the 
-\emph on
-Astrophysics and Space Science
-\emph default
- without any problem.
+\family sans
+\size normal
+Title
+\family default
+ for a Paper
 \end_layout
 
-\begin_layout Subsection
-Writing a paper
+\begin_layout Itemize
+
+\family sans
+\size normal
+Review
+\family default
+ for a Review
 \end_layout
 
-\begin_layout Standard
-The easiest way to write a paper is to start with the Kluwer template file.
- Click on 
+\begin_layout Itemize
+
+\family sans
+\size normal
+Topical
+\family default
+ for a Topical review
+\end_layout
+
+\begin_layout Itemize
+
+\family sans
+\size normal
+Comment
+\family default
+ for a Comment
+\end_layout
+
+\begin_layout Itemize
+
+\family sans
+\size normal
+Note
+\family default
+ for a Note
+\end_layout
+
+\begin_layout Itemize
+
+\family sans
+\size normal
+Paper
+\family default
+ for a Paper (same as Title)
+\end_layout
+
+\begin_layout Itemize
+
+\family sans
+\size normal
+Prelim
+\family default
+ for a Preliminary communication
+\end_layout
+
+\begin_layout Itemize
+
+\family sans
+\size normal
+Rapid
+\family default
+ for a Rapid communication
+\end_layout
+
+\begin_layout Itemize
+
+\family sans
+\size normal
+Letter
+\family default
+ for a Letter to the editor
+\end_layout
+
+\end_deeper
+\begin_layout Itemize
+
+\size normal
+All title environments except of 
+\family sans
+Letter
+\family default
+ can have an optional short title.
+\end_layout
+
+\begin_layout Itemize
+There is a general title environment 
+\family sans
+Article
+\family default
+ which is not directly supported by the LyX.
+ This can be used as ERT when your document doesn't fit into one of the
+ other title types.
+\end_layout
+
+\begin_layout Standard
+For more informations like hints for special table and formula formatting,
+ look at the IOP author guidelines.
+\end_layout
+
+\begin_layout Section
+Kluwer
+\end_layout
+
+\begin_layout Standard
+by 
+\noun on
+Panayotis Papasotiriou
+\end_layout
+
+\begin_layout Subsection
+Overview
+\end_layout
+
+\begin_layout Standard
+The Kluwer package is a set of macros produced by Kluwer Academic Publishers
+ that facilitates electronic manuscript submission to the journals they
+ publish.
+ Most known of them (at least in my domain of interest) are 
+\emph on
+Astrophysics and Space Science
+\emph default
+ and 
+\emph on
+Solar Physics
+\emph default
+, but there are many others (see a complete list at 
+\begin_inset Flex URL
+status collapsed
+
+\begin_layout Standard
+
+http://www.wkap.nl/jrnllist.htm/JRNLHOME
+\end_layout
+
+\end_inset
+
+).
+ The Kluwer package may be downloaded from the site 
+\begin_inset Flex URL
+status collapsed
+
+\begin_layout Standard
+
+http://www.wkap.nl/kaphtml.htm/STYLEFILES
+\end_layout
+
+\end_inset
+
+.
+ A complete user guide is contained in that package (but it can also be
+ downloaded separately).
+\end_layout
+
+\begin_layout Standard
+LyX supports many features of the package but not everything.
+ However, the ERT needed is reduced to some 
+\begin_inset Quotes eld
+\end_inset
+
+peculiar
+\begin_inset Quotes erd
+\end_inset
+
+ commands of the package (see\InsetSpace ~
+
+\begin_inset CommandInset ref
+LatexCommand ref
+reference "subsec:kluwer_peculiarities"
+
+\end_inset
+
+).
+ I have recently used LyX to write an article submitted to the 
+\emph on
+Astrophysics and Space Science
+\emph default
+ without any problem.
+\end_layout
+
+\begin_layout Subsection
+Writing a paper
+\end_layout
+
+\begin_layout Standard
+The easiest way to write a paper is to start with the Kluwer template file.
+ Click on 
 \family sans
 File\SpecialChar \menuseparator
-New from 
+New from
+\family default
+\family sans
 \bar under
 T
 \bar default
@@ -7033,7 +7052,8 @@ Peculiarities
 \end_inset
 
  of the Kluwer package
-\begin_inset LatexCommand label
+\begin_inset CommandInset label
+LatexCommand label
 name "subsec:kluwer_peculiarities"
 
 \end_inset
@@ -7200,9 +7220,9 @@ Overview
 \end_layout
 
 \begin_layout Standard
-The LyX document classes
+The LyX document classes 
 \emph on
- article (koma-script)
+article (koma-script)
 \emph default
 , 
 \emph on
@@ -7286,9 +7306,9 @@ letter (koma-script)
 Headings, labels of the description environment, and a number of elements
  of the 
 \emph on
-letter (koma-script) 
+letter (koma-script)
 \emph default
-document class are set in a bold sans serif font.
+ document class are set in a bold sans serif font.
 \begin_inset Foot
 status collapsed
 
@@ -7298,8 +7318,9 @@ There is a big difference between the bold sans serif old cm fonts and new
  In comparison, the ec bold sans serif fonts look a bit thin.
  Here the LaTeX package 
 \family typewriter
-cmsd.sty by 
+cmsd.sty by
 \family default
 \shape smallcaps
 Walter Schmidt
 \shape default
@@ -7526,11 +7547,11 @@ Section*
 , resp., additionally inserting an entry in the table of contents.
  
 \family sans
-Addpart 
+Addpart
 \family default
-and
+ and 
 \family sans
- Addchap
+Addchap
 \family default
  are not contained in 
 \emph on
@@ -7557,9 +7578,9 @@ Addchap
 Addsec
 \family default
 , resp., additionally clearing running heads.
-
 \family sans
- Addchap*
+Addchap*
 \family default
  is not contained in 
 \emph on
@@ -7612,10 +7633,10 @@ Captionabove
 \family default
  and 
 \family sans
-Captionbelow 
+Captionbelow
 \family default
-are special captions which respect the different space settings needed for
- captions placed above or below an element (if you follow strict typographic
+ are special captions which respect the different space settings needed
for captions placed above or below an element (if you follow strict typographic
  rules, you might want to place table captions always above the table).
  You can also use the class option 
 \family typewriter
@@ -7939,7 +7960,7 @@ letter (koma-script)
 
 \begin_layout Standard
 \begin_inset ERT
-status inlined
+status open
 
 \begin_layout Standard
 
@@ -8009,7 +8030,7 @@ Verse
 
 \begin_layout Standard
 \begin_inset ERT
-status inlined
+status open
 
 \begin_layout Standard
 
@@ -8111,9 +8132,9 @@ scrguide
 \begin_layout Standard
 The types 
 \family sans
-Letter 
+Letter
 \family default
-and 
+ and 
 \family sans
 Opening
 \family default
@@ -8222,9 +8243,9 @@ Signature
 \family sans
 Address
 \family default
-,
+, 
 \family sans
- Telephone
+Telephone
 \family default
 , 
 \family sans
@@ -8801,9 +8822,9 @@ ayout\SpecialChar \menuseparator
 D
 \bar default
 ocument\SpecialChar \menuseparator
-Extra Options 
+Extra Options
 \family default
-field.
+ field.
 \end_layout
 
 \end_inset
@@ -8939,8 +8960,13 @@ Description
 \begin_layout Standard
 These are the layout files for some of the journal formats used by Springer
  Verlag and listed on 
-\begin_inset LatexCommand url
-target "http://www.springer.de/author/tex/help-journals.html"
+\begin_inset Flex URL
+status collapsed
+
+\begin_layout Standard
+
+http://www.springer.de/author/tex/help-journals.html
+\end_layout
 
 \end_inset
 
@@ -9035,9 +9061,9 @@ Journal of Geodesy
 \emph default
 : 
 \family typewriter
-svjog.layout 
+svjog.layout
 \family default
---- Martin Vermeer
+ --- Martin Vermeer
 \end_layout
 
 \begin_layout Itemize
@@ -9118,8 +9144,13 @@ These are the layout files for some of the journals of the American Geophysical
  Society.
  It is assumed that you have both the AGU's own class files and AGUplus
  installed (everything to be found at
-\begin_inset LatexCommand url
-target "ftp://ftp.agu.org/journals/latex/journals"
+\begin_inset Flex URL
+status collapsed
+
+\begin_layout Standard
+
+ftp://ftp.agu.org/journals/latex/journals
+\end_layout
 
 \end_inset
 
@@ -9230,9 +9261,9 @@ Journal of Geophysical Research
 \emph default
 : 
 \family typewriter
-jgrga.layout 
+jgrga.layout
 \family default
---- Martin Vermeer
+ --- Martin Vermeer
 \end_layout
 
 \begin_layout Standard
@@ -9331,8 +9362,13 @@ This is the layout file for the European Geophysical Society journals.
 egs.cls
 \family default
  can be downloaded from the web site of the EGS under 
-\begin_inset LatexCommand url
-target "www.copernicus.org"
+\begin_inset Flex URL
+status collapsed
+
+\begin_layout Standard
+
+www.copernicus.org
+\end_layout
 
 \end_inset
 
@@ -9368,7 +9404,8 @@ Slides [aka
 Sli
 \noun default
 TeX]
-\begin_inset LatexCommand label
+\begin_inset CommandInset label
+LatexCommand label
 name "sec:slitex"
 
 \end_inset
@@ -9454,7 +9491,8 @@ slides (FoilTeX)
 
 , check out section\InsetSpace ~
 
-\begin_inset LatexCommand ref
+\begin_inset CommandInset ref
+LatexCommand ref
 reference "sec:foiltex"
 
 \end_inset
@@ -9462,9 +9500,9 @@ reference "sec:foiltex"
 .
  The 
 \family sans
-foils 
+foils
 \family default
-class [
+ class [
 \begin_inset Quotes eld
 \end_inset
 
@@ -9531,7 +9569,8 @@ slides
 
 \begin_layout Subsection
 Getting Started
-\begin_inset LatexCommand label
+\begin_inset CommandInset label
+LatexCommand label
 name "sec:slidesetup"
 
 \end_inset
@@ -9659,7 +9698,8 @@ Note
 s.
  See section\InsetSpace ~
 
-\begin_inset LatexCommand ref
+\begin_inset CommandInset ref
+LatexCommand ref
 reference "sec:slideNote"
 
 \end_inset
@@ -9683,9 +9723,9 @@ slides.lyx
 
  to automatically set up a document to use the 
 \family sans
-slides 
+slides
 \family default
-class [using 
+ class [using 
 \family sans
 \bar under
 F
@@ -9716,9 +9756,9 @@ Supported Environments
 \begin_layout Standard
 The first thing you'll notice when you start up a new 
 \family sans
-slides 
+slides
 \family default
-document is the font size and type: it's the equivalent of the size 
+ document is the font size and type: it's the equivalent of the size 
 \begin_inset Quotes eld
 \end_inset
 
@@ -9898,7 +9938,8 @@ LaTeX magic.
 
 \begin_layout Subsubsection
 Quirks of the New Environments
-\begin_inset LatexCommand label
+\begin_inset CommandInset label
+LatexCommand label
 name "sec:slideQuirk"
 
 \end_inset
@@ -10129,9 +10170,9 @@ Making a Presentation with
 \family sans
 Slide
 \family default
-,
+, 
 \family sans
- Overlay
+Overlay
 \family default
  and 
 \family sans
@@ -10169,7 +10210,8 @@ Slide
 \family default
  environment [in the manner described in section\InsetSpace ~
 
-\begin_inset LatexCommand ref
+\begin_inset CommandInset ref
+LatexCommand ref
 reference "sec:slideQuirk"
 
 \end_inset
@@ -10238,9 +10280,9 @@ Note
 \family default
  environments work the same way as the 
 \family sans
-Slide 
+Slide
 \family default
-environment.
+ environment.
  They both create an 
 \begin_inset Quotes eld
 \end_inset
@@ -10515,7 +10557,8 @@ VisibleText
  invisible and visible, respectively.
  Note from section\InsetSpace ~
 
-\begin_inset LatexCommand ref
+\begin_inset CommandInset ref
+LatexCommand ref
 reference "sec:slideQuirk"
 
 \end_inset
@@ -10777,7 +10820,8 @@ Note
 Slide
 \family default
 
-\begin_inset LatexCommand label
+\begin_inset CommandInset label
+LatexCommand label
 name "sec:slideNote"
 
 \end_inset
@@ -10957,7 +11001,8 @@ clock
 
  [see section\InsetSpace ~
 
-\begin_inset LatexCommand ref
+\begin_inset CommandInset ref
+LatexCommand ref
 reference "sec:slidesetup"
 
 \end_inset
@@ -11270,9 +11315,9 @@ Slide
 \family sans
 Overlay
 \family default
- --
+ -- 
 \family sans
- Note
+Note
 \family default
  triplet.
  The 
@@ -11353,7 +11398,8 @@ Foils
 \family default
  class [see section\InsetSpace ~
 
-\begin_inset LatexCommand ref
+\begin_inset CommandInset ref
+LatexCommand ref
 reference "sec:foiltex"
 
 \end_inset
@@ -11395,7 +11441,8 @@ Foil
 TeX
 \noun default
 ]
-\begin_inset LatexCommand label
+\begin_inset CommandInset label
+LatexCommand label
 name "sec:foiltex"
 
 \end_inset
@@ -11479,7 +11526,8 @@ slides (default)
 
 , check out section\InsetSpace ~
 
-\begin_inset LatexCommand ref
+\begin_inset CommandInset ref
+LatexCommand ref
 reference "sec:slitex"
 
 \end_inset
@@ -11487,9 +11535,9 @@ reference "sec:slitex"
 .
  If your machine doesn't have the 
 \family sans
-foils 
+foils
 \family default
-class [
+ class [
 \begin_inset Quotes eld
 \end_inset
 
@@ -11635,7 +11683,8 @@ TeX provides extensive footer and header capabilities including a user-defined
  logo.
  See section\InsetSpace ~
 
-\begin_inset LatexCommand ref
+\begin_inset CommandInset ref
+LatexCommand ref
 reference "sec:foilfoot"
 
 \end_inset
@@ -11843,7 +11892,7 @@ TeX as well as a couple added by LyX.
 
 \begin_layout Standard
 \begin_inset ERT
-status inlined
+status open
 
 \begin_layout Standard
 
@@ -11967,7 +12016,7 @@ Comment
 
 \begin_layout Standard
 \begin_inset ERT
-status inlined
+status open
 
 \begin_layout Standard
 
@@ -12034,7 +12083,7 @@ TeX also provides a comprehensive box of goodies for presenting them:
 
 \begin_layout Standard
 \begin_inset ERT
-status inlined
+status open
 
 \begin_layout Standard
 
@@ -12116,7 +12165,7 @@ Definition*
 
 \begin_layout Standard
 \begin_inset ERT
-status inlined
+status open
 
 \begin_layout Standard
 
@@ -12173,7 +12222,7 @@ Martin Vermeer
 
 \begin_layout Standard
 \begin_inset ERT
-status inlined
+status open
 
 \begin_layout Standard
 
@@ -12230,7 +12279,7 @@ Header
 \end_deeper
 \begin_layout Standard
 \begin_inset ERT
-status inlined
+status open
 
 \begin_layout Standard
 
@@ -12252,7 +12301,8 @@ Foil
 TeX that aren't directly supported by LyX but I'll tell you what they do
  and how to use them in section\InsetSpace ~
 
-\begin_inset LatexCommand ref
+\begin_inset CommandInset ref
+LatexCommand ref
 reference "sec:unsuppfoils"
 
 \end_inset
@@ -12433,7 +12483,8 @@ Selection
 \family default
  dialog described above in section\InsetSpace ~
 
-\begin_inset LatexCommand ref
+\begin_inset CommandInset ref
+LatexCommand ref
 reference "sec:bullet"
 
 \end_inset
@@ -12444,9 +12495,9 @@ reference "sec:bullet"
 \begin_layout Standard
 The two new list styles, 
 \family sans
-TickList 
+TickList
 \family default
-and 
+ and 
 \family sans
 CrossList
 \family default
@@ -12482,7 +12533,8 @@ TeX redefines the floating tables and figures so that they appear exactly
 
 \begin_layout Subsubsection
 Page Headers and Footers
-\begin_inset LatexCommand label
+\begin_inset CommandInset label
+LatexCommand label
 name "sec:foilfoot"
 
 \end_inset
@@ -12527,9 +12579,9 @@ Confidential.
 \end_layout
 
 \begin_layout Standard
-The remaining page corners can be filled by
+The remaining page corners can be filled by 
 \family sans
- Right\InsetSpace ~
+Right\InsetSpace ~
 Footer
 \family default
  (which defaults to page numbers), 
@@ -12551,7 +12603,8 @@ Unsupported
 Foil
 \family default
 TeX Goodies
-\begin_inset LatexCommand label
+\begin_inset CommandInset label
+LatexCommand label
 name "sec:unsuppfoils"
 
 \end_inset
@@ -12660,9 +12713,9 @@ The spacings around floats can be adjusted by setting these lengths:
 \family typewriter
 
 \backslash
-abovefloatskip 
+abovefloatskip
 \family default
-Separation between the text and the top of the float
+ Separation between the text and the top of the float
 \end_layout
 
 \begin_layout List
@@ -12671,9 +12724,9 @@ Separation between the text and the top of the float
 \family typewriter
 
 \backslash
-abovecaptionskip 
+abovecaptionskip
 \family default
-Separation between the float and the caption
+ Separation between the float and the caption
 \end_layout
 
 \begin_layout List
@@ -12682,9 +12735,9 @@ Separation between the float and the caption
 \family typewriter
 
 \backslash
-belowcaptionskip 
+belowcaptionskip
 \family default
-Separation between the caption and the following text
+ Separation between the caption and the following text
 \end_layout
 
 \begin_layout List
@@ -12794,9 +12847,9 @@ Abstract
 
 \begin_layout Standard
 The last length related command affects all the list environments.
- If you place
+ If you place 
 \family typewriter
+
 \backslash
 zerolistvertdimens
 \family default
@@ -13363,9 +13416,9 @@ M-z S at
 Subtitle for 
 \family sans
 ACT.
+
 \family default
-It is just centered text.
+ It is just centered text.
 \end_layout
 
 \begin_layout Itemize
@@ -13543,10 +13596,14 @@ Installation
 \begin_layout Standard
 All you need to do is install RevTeX 4, as described in the package's README
  file.
- The package can be found at 
-\begin_inset LatexCommand url
-name "The RevTeX 4 Web Site"
-target "http://publish.aps.org/revtex4/"
+ The package can be found at The RevTeX 4 Web Site 
+\begin_inset Flex URL
+status collapsed
+
+\begin_layout Standard
+
+http://publish.aps.org/revtex4/
+\end_layout
 
 \end_inset
 
@@ -13562,7 +13619,7 @@ target "http://publish.aps.org/revtex4/"
 Probably the easiest way to get started is either to import a RevTeX 4 document
  using 
 \family typewriter
-reLyX
+tex2lyx
 \family default
 , or to use the 
 \family sans
@@ -13665,7 +13722,7 @@ status collapsed
 \begin_layout Standard
 In case you're curious, both were included so that 
 \family typewriter
-reLyX
+tex2lyx
 \family default
  would be able to translate both 
 \family typewriter
@@ -13839,9 +13896,9 @@ Tomasz Luczak
 \end_layout
 
 \begin_layout Standard
-The LyX document classes
+The LyX document classes 
 \emph on
- article (mwart)
+article (mwart)
 \emph default
 , 
 \emph on
@@ -13975,8 +14032,13 @@ elsart.cls
 \family default
 ) for submitting articles to their various journals.
  The style file can be downloaded directly from their web site: 
-\begin_inset LatexCommand url
-target "http://authors.elsevier.com/"
+\begin_inset Flex URL
+status collapsed
+
+\begin_layout Standard
+
+http://authors.elsevier.com/
+\end_layout
 
 \end_inset
 
@@ -14082,8 +14144,13 @@ status collapsed
 
 \begin_layout Standard
 You are invited to send suggestions to 
-\begin_inset LatexCommand url
-target "lyx-devel@lists.lyx.org"
+\begin_inset Flex URL
+status collapsed
+
+\begin_layout Standard
+
+lyx-devel@lists.lyx.org
+\end_layout
 
 \end_inset
 
@@ -14114,7 +14181,8 @@ status collapsed
 
 section\InsetSpace ~
 
-\begin_inset LatexCommand ref
+\begin_inset CommandInset ref
+LatexCommand ref
 reference "sec:Inserting-LaTeX-Code"
 
 \end_inset
@@ -14147,8 +14215,13 @@ status collapsed
 \end_inset
 
 
-\begin_inset LatexCommand url
-target "CTAN:/macros/latex/memoir/memman.pdf"
+\begin_inset Flex URL
+status collapsed
+
+\begin_layout Standard
+
+CTAN:/macros/latex/memoir/memman.pdf
+\end_layout
 
 \end_inset
 
@@ -14302,17 +14375,17 @@ without pagina).
 \family typewriter
 
 \backslash
-aliaspagestyle{title}{empty} 
+aliaspagestyle{title}{empty}
 \family default
-in the preamble.
+ in the preamble.
 \end_layout
 
 \begin_layout Description
 Article: With the class option 
 \emph on
-article 
+article
 \emph default
-(to be inserted in 
+ (to be inserted in 
 \family sans
 Layout\SpecialChar \menuseparator
 Document\SpecialChar \menuseparator
@@ -14412,8 +14485,13 @@ status collapsed
 \end_inset
 
 
-\begin_inset LatexCommand url
-target "CTAN:/macros/latex/memoir/memman.pdf"
+\begin_inset Flex URL
+status collapsed
+
+\begin_layout Standard
+
+CTAN:/macros/latex/memoir/memman.pdf
+\end_layout
 
 \end_inset
 
@@ -14572,18 +14650,23 @@ LaTeX
 \end_layout
 
 \begin_layout Standard
-Translating from LaTeX into LyX is performed by a Perl script called reLyX.
+Translating from LaTeX into LyX is performed by a converter program called
+\family typewriter
+tex2lyx
+\family default
+.
  Although it is a standalone program which can be called from the command
  line, LyX will call it automatically when a LaTeX document is imported.
  See section\InsetSpace ~
 
-\begin_inset LatexCommand ref
-reference "sec:reLyX"
+\begin_inset CommandInset ref
+LatexCommand ref
+reference "sec:Translating-LaTeX-files"
 
 \end_inset
 
  for a complete description.
- There are no user tunable parameters for reLyX within LyX.
 \end_layout
 
 \begin_layout Subsection
@@ -14855,7 +14938,8 @@ File->Export->PDF
  There are some issues with fonts that you need to pay attention to: see
  Section\InsetSpace ~
 
-\begin_inset LatexCommand ref
+\begin_inset CommandInset ref
+LatexCommand ref
 reference "sec:badfonts"
 
 \end_inset
@@ -14877,7 +14961,8 @@ With pdfLaTeX you cannot use pstricks.
 
 \begin_layout Subsubsection
 Why does the text look so bad when viewed with Acrobat Reader?
-\begin_inset LatexCommand label
+\begin_inset CommandInset label
+LatexCommand label
 name "sec:badfonts"
 
 \end_inset
@@ -14977,7 +15062,8 @@ pslatex
  On the other hand, the Postscript fonts have no bold symbol font, so poor
  man's bold must be used (see Section\InsetSpace ~
 
-\begin_inset LatexCommand ref
+\begin_inset CommandInset ref
+LatexCommand ref
 reference "sec:pdfbold"
 
 \end_inset
@@ -14996,7 +15082,8 @@ To sum up, both the Computer Modern and the Postscript fonts gives good
 Why doesn't the 
 \backslash
 boldsymbol{} command work when I use pslatex?
-\begin_inset LatexCommand label
+\begin_inset CommandInset label
+LatexCommand label
 name "sec:pdfbold"
 
 \end_inset
@@ -15057,712 +15144,20 @@ renewcommand{
 boldsymbol}[1]{
 \backslash
 pmb{#1}}
-\end_layout
-
-\begin_layout Standard
-in the preamble.
-\end_layout
-
-\begin_layout Subsubsection
-Is it possible to do write LaTeX-code which is processed only when running
- pdfLaTeX?
-\begin_inset OptArg
-status collapsed
-
-\begin_layout Standard
-Conditionals with pdfLaTeX
-\end_layout
-
-\end_inset
-
-
-\end_layout
-
-\begin_layout Standard
-Yes you can do this with the 
-\family typewriter
-ifpdf.sty
-\family default
- package.
- Here is an example:
-\end_layout
-
-\begin_layout LyX-Code
-
-\end_layout
-
-\begin_layout LyX-Code
-
-\backslash
-usepackage{ifpdf}
-\end_layout
-
-\begin_layout LyX-Code
-
-\backslash
-ifpdf
-\end_layout
-
-\begin_layout LyX-Code
-   
-\backslash
-pdfinfo { /Author (your name and e-mail address)
-\end_layout
-
-\begin_layout LyX-Code
-      /Title (official title -- i.e., title element)
-\end_layout
-
-\begin_layout LyX-Code
-      /Subject (one line description of the document)
-\end_layout
-
-\begin_layout LyX-Code
-   }
-\end_layout
-
-\begin_layout LyX-Code
-   
-\backslash
-pdfcatalog { /PageMode (/UseNone)
-\end_layout
-
-\begin_layout LyX-Code
-   % /OpenAction (fitbh)
-\end_layout
-
-\begin_layout LyX-Code
-   }
-\end_layout
-
-\begin_layout LyX-Code
-   
-\backslash
-usepackage[pdftex]{hyperref}
-\end_layout
-
-\begin_layout LyX-Code
-
-\backslash
-else
-\end_layout
-
-\begin_layout LyX-Code
-   
-\backslash
-usepackage[ps2pdf]{hyperref}
-\end_layout
-
-\begin_layout LyX-Code
-
-\backslash
-fi
-\end_layout
-
-\begin_layout Subsubsection
-How can I make URLs clickable?
-\end_layout
-
-\begin_layout Standard
-See the references here:
-\end_layout
-
-\begin_layout Standard
-\begin_inset LatexCommand url
-target "http://wiki.lyx.org/pmwiki.php/FAQ/PDF"
-
-\end_inset
-
-
-\end_layout
-
-\begin_layout Subsection
-Custom
-\end_layout
-
-\begin_layout Standard
-Custom exports are possible if you have some particularly weird format you
- wish to convert to, assuming you have the relevant converter, of course.
- The format of the 
-\emph on
-input
-\emph default
- file can be chosen in the 
-\family sans
-\bar under
-F
-\bar default
-ile\SpecialChar \menuseparator
-
-\bar under
-E
-\bar default
-xport\SpecialChar \menuseparator
-
-\bar under
-C
-\bar default
-ustom 
-\family default
-dialog; LyX will automatically convert the file to this point, then feed
- it to your custom converter.
- The possible values are all formats that LyX can produce from its own documents.
-\end_layout
-
-\begin_layout Standard
-The converter command is also specified in the dialog.
- It should be a completely qualified command line which uses the variable
-\family typewriter
-$$FName
-\family default
- to specify the name of the file.
- If this variable is not given, then the file will be sent to the standard
- input of your command.
- You may have to apply a bit of ingenuity to escape this sequence correctly
- so that it is compatible with your shell.
-\end_layout
-
-\begin_layout Standard
-While it is not possible to save this command using the 
-\family sans
-Preferences 
-\family default
-dialog, you can manually edit your 
-\family typewriter
-.lyx/preferences
-\family default
- to add a line like
-\end_layout
-
-\begin_layout LyX-Code
-
-\backslash
-custom_export_command "mycommand $$FName"
-\end_layout
-
-\begin_layout Chapter
-LyX Features needing Extra Software
-\end_layout
-
-\begin_layout Section
-Using LyX with SGML-Tools (aka LinuxDoc)
-\end_layout
-
-\begin_layout Standard
-by 
-\noun on
-Paul Evans
-\end_layout
-
-\begin_layout Subsection
-Overview
-\end_layout
-
-\begin_layout Standard
-LinuxDoc is a document class available in LyX if you have the 
-\family typewriter
-sgml-tools
-\family default
- package installed.
- You can use it to produce documents in the so-called Standardized General
- Mark-up Language (SGML) in the particular format used by the Linux Documentatio
-n Project.
- That is obviously helpful if you are contributing to that project.
- You can use the SGML format with the 
-\family typewriter
-sgml-tools
-\family default
- package of scripts and programs (to produce other formats, including LaTeX,
- HTML, plain text, man pages and\SpecialChar \ldots{}
-).
- You may therefore prefer to use this document class if you want to write
- something that can be easily translated into other formats.
-\end_layout
-
-\begin_layout Standard
-You will find that LinuxDoc has fewer layout options than the other text
- classes in LyX.
- This is mainly so that the translations into other formats have a chance
- of making some sense.
- In this section we describe:
-\end_layout
-
-\begin_layout Itemize
-how to setup and use a document in LinuxDoc
-\end_layout
-
-\begin_layout Itemize
-how to use the tags in LinuxDoc to layout your document
-\end_layout
-
-\begin_layout Itemize
-how to use the SGML packages to produce the various formats
-\end_layout
-
-\begin_layout Itemize
-how to sort out some problems.
-\end_layout
-
-\begin_layout Subsection
-Preparing and using a LinuxDoc document
-\end_layout
-
-\begin_layout Subsubsection
-Getting started
-\end_layout
-
-\begin_layout Standard
-You start by selecting the LinuxDoc class using the 
-\family sans
-\bar under
-D
-\bar default
-ocument\SpecialChar \menuseparator
-
-\bar under
-S
-\bar default
-ettings
-\family default
- dialog.
-
-\family sans
-\family default
-Then you will find that there are fewer paragraph environments than for
- most other classes.
- You can see them on the pull down box on the left of the tool bar.
- How to use them is described in section\InsetSpace ~
-
-\begin_inset LatexCommand ref
-reference "sec:sgmlparas"
-
-\end_inset
-
-.
-\end_layout
-
-\begin_layout Standard
-You 
-\emph on
-must
-\emph default
- enter a title for the document, followed by an author, marking each with
- the appropriate paragraph environment.
- If you don't do this, you will get errors when you try to print the file.
- You can then enter the date and an abstract.
- The document proper must start with a Section paragraph environment rather
- than any standard layout.
-\end_layout
-
-\begin_layout Standard
-After that you can prepare a document as usual using the available range
- of paragraph environments.
- See section\InsetSpace ~
-
-\begin_inset LatexCommand ref
-reference "sec:sgmlparas"
-
-\end_inset
-
- for the full list and their uses.
-\end_layout
-
-\begin_layout Subsubsection
-Output from LinuxDoc
-\end_layout
-
-\begin_layout Standard
-You can print and save these documents in the normal way.
- To use the other features of the SGML package you need to save your document
- as LinuxDoc; this is a version in which the document is translated into
- the basic sgml tags.
- Use
-\family sans
-\bar under
-F
-\bar default
-ile\SpecialChar \menuseparator
-
-\bar under
-E
-\bar default
-xport\SpecialChar \menuseparator
-Linu
-\bar under
-x
-\bar default
-Doc.
-
-\family default
- You will get a file with the same name and a 
-\family typewriter
-.sgml
-\family default
- extension rather than a 
-\family typewriter
-.lyx
-\family default
- extension.
- See\InsetSpace ~
-
-\begin_inset LatexCommand ref
-reference "sec:sgmloperate"
-
-\end_inset
-
- on how you than make use of this file.
-\end_layout
-
-\begin_layout Subsection
-Using the paragraph environments in LinuxDoc
-\end_layout
-
-\begin_layout Subsubsection
-The Structure of a LinuxDoc Document
-\end_layout
-
-\begin_layout Standard
-There is a formal structure for LinuxDoc which limits how you can place
- tags.
- There are two parts to all documents: 
-\end_layout
-
-\begin_layout Description
-Header: this is everything up to the first time you insert a Section layout
- marker.
- It can include title, author, date, abstract and ToC.
- You must include the first two.
-\end_layout
-
-\begin_layout Description
-Body: from the beginning of the first section onwards.
- All other tags are allowed.
-\end_layout
-
-\begin_layout Subsubsection
-The LinuxDoc Paragraph Environments
-\end_layout
-
-\begin_layout Standard
-\begin_inset LatexCommand label
-name "sec:sgmlparas"
-
-\end_inset
-
-Here is a list of all the tags you will find listed on the layout bar in
- the order they come there, with some comments where the purpose or use
- is not obvious:
-\end_layout
-
-\begin_layout Itemize
-
-\family sans
-Standard:
-\family roman
- works as described in [cross reference]
-\end_layout
-
-\begin_layout Itemize
-
-\family sans
-Title
-\family default
-: This will appear at the top left of the document when printed, above a
- heavy horizontal rule, although you will not see this on the LyX screen.
-\end_layout
-
-\begin_layout Itemize
-
-\family sans
-Section, Subsection, Subsubsection, Paragraph and Subparagraph:
-\family default
- all do what you would expect and in the usual order.
- Whether they are numbered or not is controlled by the 
-\family sans
-Section\InsetSpace ~
-number\InsetSpace ~
-depth
-\family default
- setting.
- You cannot get the equivalent number free versions in any other way; there
- is no 
-\family sans
-Section*
-\family default
- or similar
-\end_layout
-
-\begin_layout Itemize
-
-\family sans
-Enumerate:
-\family default
- As usual this produces a numbered and indented list as described in the
-\emph on
-User's Guide
-\emph default
-.
-\end_layout
-
-\begin_layout Itemize
-
-\family sans
-Itemize: 
-\family roman
-Again much the same as in the other classes: see the 
-\emph on
-User's Guide
-\emph default
-.
-\end_layout
-
-\begin_layout Itemize
-
-\family sans
-Description
-\family default
-: As explained in the 
-\emph on
-User's Guide
-\emph default
-.
- Remember that if you want the bold element at the start of a description
- to be more than one word then you need to put protected spaces between
- the words.
-\end_layout
-
-\begin_layout Itemize
-
-\family sans
-Verbatim: 
-\family default
-As usual.
-\end_layout
-
-\begin_layout Itemize
-
-\family sans
-Code: similar to the LyX-Code
-\family roman
- environment
-\end_layout
-
-\begin_layout Itemize
-
-\family sans
-Author
-\family default
-: Anything you mark with this will appear on the left of the heading of
- the document, under the heavy rule.
-\end_layout
-
-\begin_layout Itemize
-
-\family sans
-Date:
-\family default
- Anything you mark with this will appear on the right of the heading under
- the rule.
- You do not have to make this a date.
- Any text can be entered, e.\InsetSpace ~
-g.
- a version number.
-\end_layout
-
-\begin_layout Itemize
-
-\family sans
-Abstract
-\family default
-: You can use this to produce a free standing paragraph after the author
- and date, and before the first section.
- You are only allowed one such paragraph.
-\begin_inset Foot
-status collapsed
-
-\begin_layout Standard
-
-\emph on
-Author's note.
-\emph default
-This needs checking ---
-\emph on
-pe.
-\end_layout
-
-\end_inset
-
-
-\end_layout
-
-\begin_layout Itemize
-
-\family sans
-Displaymath
-\family default
-:
-\begin_inset Foot
-status collapsed
-
-\begin_layout Standard
-
-\emph on
-Author's note: 
-\emph default
-I have not yet checked this ---
-\emph on
-pe.
-\end_layout
-
-\end_inset
-
-
-\end_layout
-
-\begin_layout Subsubsection
-Other document features
-\end_layout
-
-\begin_layout Standard
-You can also use the 
-\family sans
-Layout 
-\family default
-menu to set fonts or to emphasis words.
- You can also use the table of contents as usual; see the corresponding
- section of the 
-\emph on
-User's Guide
-\emph default
-.
- Although you will find some some other features on the menus e.\InsetSpace ~
-g.
- inserting footnotes.
- There is some doubt about whether these will work correctly.
-\begin_inset Foot
-status collapsed
-
-\begin_layout Standard
-
-\emph on
-Author's note: 
-\emph default
-Again still checking to see whether this is my system
-\emph on
- ---pe.
-\end_layout
-
-\end_inset
-
-
-\end_layout
-
-\begin_layout Subsubsection
-Cross references and HTML 
-\end_layout
-
-\begin_layout Standard
-On the
-\family sans
- Insert
-\family default
- menu you will find two new options relating to the inclusion of URL addresses.
- If you use either option you will find some highlighted TeX code inserted
- into your document in three separate blocks with spaces available between.
- The blocks will be:
-\end_layout
-
-\begin_layout Quote
-
-\family typewriter
-
-\backslash
-htmlurl{
-\family default
- or 
-\family typewriter
-
-\backslash
-url{
-\family roman
-
-\hfill
-space
-\family default
-\family typewriter
-
-\hfill
-}{
-\family roman
-
-\hfill
-space
-\hfill
-
-\family typewriter
-}
-\end_layout
-
-\begin_layout Standard
-You insert a full HTML tag between the first and second blocks.
- This can be 
-\begin_inset LatexCommand url
-target "http://any.address"
-
-\end_inset
-
- or other valid tags such as 
-\begin_inset LatexCommand url
-target "mailto:me@my.address"
-
-\end_inset
-
-
-\family typewriter
-.
-\family default
-Then y
-\family roman
-ou 
-\family default
-insert some description between the second and third blocks.
- The differences are:
-\end_layout
-
-\begin_layout Itemize
-
-\family sans
-URL:
-\family roman
- both the HTML tag and the description will appear in the document
-\end_layout
-
-\begin_layout Itemize
+\end_layout
 
-\family sans
-HTML\InsetSpace ~
-URL: 
-\family roman
-only the description appears in the printed version
+\begin_layout Standard
+in the preamble.
 \end_layout
 
-\begin_layout Subsection
-Using the LinuxDoc Sgml scripts
-\begin_inset Note Note
+\begin_layout Subsubsection
+Is it possible to do write LaTeX-code which is processed only when running
+ pdfLaTeX?
+\begin_inset OptArg
 status collapsed
 
 \begin_layout Standard
-This section is completely outdated.
+Conditionals with pdfLaTeX
 \end_layout
 
 \end_inset
@@ -15771,109 +15166,120 @@ This section is completely outdated.
 \end_layout
 
 \begin_layout Standard
-\begin_inset LatexCommand label
-name "sec:sgmloperate"
-
-\end_inset
-
-You can use LinuxDoc as a text class without any additional scripts or programs,
- but there is not much point in doing this.
- All you will get is a document that looks like a 
-\emph on
-Linux Documentation Project Howto
-\family sans
-\emph default
-.
-\family default
-To do the document translation you need to get and install the 
+Yes you can do this with the 
 \family typewriter
-sgml-tools-1.0.x.tar.gz 
+ifpdf.sty
 \family default
-(with 
-\begin_inset Formula $x\geq3$
-\end_inset
+ package.
+ Here is an example:
+\end_layout
+
+\begin_layout LyX-Code
 
-) package from 
-\family roman
-the SGML-Tools WWW Page
-\family default
- at
 \end_layout
 
 \begin_layout LyX-Code
 
-\family roman
-\begin_inset LatexCommand url
-target "http://pobox.com/~cg/sgmltools"
+\backslash
+usepackage{ifpdf}
+\end_layout
 
-\end_inset
+\begin_layout LyX-Code
 
+\backslash
+ifpdf
+\end_layout
 
-\family default
+\begin_layout LyX-Code
+   
+\backslash
+pdfinfo { /Author (your name and e-mail address)
 \end_layout
 
-\begin_layout Standard
-Alternatively, you can go to the 
-\family typewriter
-sunsite
-\family default
- archive at
-\begin_inset Foot
-status collapsed
+\begin_layout LyX-Code
+      /Title (official title -- i.e., title element)
+\end_layout
 
-\begin_layout Standard
-Note that, at the time of this writing (01/1998), version 1.0.3 of sgml-tools
- has not yet been made available at 
-\family typewriter
-sunsite
-\family default
-.
+\begin_layout LyX-Code
+      /Subject (one line description of the document)
 \end_layout
 
-\end_inset
+\begin_layout LyX-Code
+   }
+\end_layout
+
+\begin_layout LyX-Code
+   
+\backslash
+pdfcatalog { /PageMode (/UseNone)
+\end_layout
 
+\begin_layout LyX-Code
+   % /OpenAction (fitbh)
+\end_layout
 
+\begin_layout LyX-Code
+   }
 \end_layout
 
 \begin_layout LyX-Code
+   
+\backslash
+usepackage[pdftex]{hyperref}
+\end_layout
 
-\family roman
-\begin_inset LatexCommand url
-target "ftp://sunsite.unc.edu/pub/Linux/utils/text/sgml-tools-1.0.x.tar.gz"
+\begin_layout LyX-Code
 
-\end_inset
+\backslash
+else
+\end_layout
+
+\begin_layout LyX-Code
+   
+\backslash
+usepackage[ps2pdf]{hyperref}
+\end_layout
+
+\begin_layout LyX-Code
+
+\backslash
+fi
+\end_layout
 
+\begin_layout Subsubsection
+How can I make URLs clickable?
+\end_layout
 
+\begin_layout Standard
+See the references here:
 \end_layout
 
 \begin_layout Standard
+\begin_inset Flex URL
+status collapsed
 
-\family roman
-The
-\family default
- file 
-\family typewriter
-sgml-tools-1.0.x.tar.gz
-\family default
- contains everything that you need to write SGML documents and convert them
- to groff, LaTeX, HTML, GNU info, LyX, and RTF\SpecialChar \@.
+\begin_layout Standard
 
+http://wiki.lyx.org/pmwiki.php/FAQ/PDF
 \end_layout
 
-\begin_layout Standard
-This package was renamed from 
-\family typewriter
-linuxdoc-sgml-1.5.tar.gz
-\family default
- in January 1997.
+\end_inset
+
+
+\end_layout
+
+\begin_layout Subsection
+Custom
 \end_layout
 
 \begin_layout Standard
-Follow the instructions in that package on how to install it and how to
- use it.
- All this has to be done outside of LyX, before you can use the 
+Custom exports are possible if you have some particularly weird format you
+ wish to convert to, assuming you have the relevant converter, of course.
+ The format of the 
+\emph on
+input
+\emph default
+ file can be chosen in the 
 \family sans
 \bar under
 F
@@ -15884,26 +15290,53 @@ ile\SpecialChar \menuseparator
 E
 \bar default
 xport\SpecialChar \menuseparator
-as\InsetSpace ~
-LinuxDoc 
-\family roman
-option.
+
+\bar under
+C
+\bar default
+ustom
+\family default
+ dialog; LyX will automatically convert the file to this point, then feed
+ it to your custom converter.
+ The possible values are all formats that LyX can produce from its own documents.
 \end_layout
 
-\begin_layout Subsection
-Troubleshooting LinuxDoc
+\begin_layout Standard
+The converter command is also specified in the dialog.
+ It should be a completely qualified command line which uses the variable
+\family typewriter
+$$FName
+\family default
+ to specify the name of the file.
+ If this variable is not given, then the file will be sent to the standard
+ input of your command.
+ You may have to apply a bit of ingenuity to escape this sequence correctly
+ so that it is compatible with your shell.
 \end_layout
 
 \begin_layout Standard
-When you print or preview a LinuxDoc document some checking is done of the
- tags before LaTeX is run.
- Some errors are trapped here, especially those concerning the structure
- of the document.
- LyX may produce an error message, but not leave an error box in the document
- for you to open.
- You may have to look at the files directly to discover what is wrong.
- Most problems seem to come from the use of options that are not fully available
- in the text class.
+While it is not possible to save this command using the 
+\family sans
+Preferences
+\family default
+ dialog, you can manually edit your 
+\family typewriter
+.lyx/preferences
+\family default
+ to add a line like
+\end_layout
+
+\begin_layout LyX-Code
+
+\backslash
+custom_export_command "mycommand $$FName"
+\end_layout
+
+\begin_layout Chapter
+LyX Features needing Extra Software
 \end_layout
 
 \begin_layout Section
@@ -15943,8 +15376,13 @@ chktex
 \family default
  program installed, and is grayed out if you don't have it.
  You can get it from your nearest CTAN mirror, or over the Web from 
-\begin_inset LatexCommand url
-target "http://www.ifi.uio.no/~jensthi/chktex/"
+\begin_inset Flex URL
+status collapsed
+
+\begin_layout Standard
+
+http://www.ifi.uio.no/~jensthi/chktex/
+\end_layout
 
 \end_inset
 
@@ -16037,7 +15475,8 @@ Space in front of labels and similar commands:
 The label should stick right
  up to the text to avoid falling to a wrong page.
  
-\begin_inset LatexCommand label
+\begin_inset CommandInset label
+LatexCommand label
 name "sec:chktex"
 
 \end_inset
@@ -16062,7 +15501,8 @@ In you are in bad luck,
  the text will break right between the referenced text and reference number,
  and that's a pity.
  See section 
-\begin_inset LatexCommand ref
+\begin_inset CommandInset ref
+LatexCommand ref
 reference "sec:chktex"
 
 \end_inset
@@ -16308,7 +15748,7 @@ ChkTeX
 \family default
  installation configuration file (usually with the file 
 \family typewriter
-/usr/local/share/chktexrc
+chktexrc
 \family default
 ).
  See below to learn what warnings can be enabled and disabled on the command
@@ -16595,9 +16035,9 @@ Inter-word spacing (
 \family typewriter
 
 \backslash
-\family default
 
+\family default
 \begin_inset Quotes eld
 \end_inset
 
@@ -17353,9 +16793,14 @@ The complete Literate Programming FAQ can be found at:
 \end_layout
 
 \begin_layout Quote
-\begin_inset LatexCommand url
-name "Literate Programming FAQ"
-target "http://shelob.ce.ttu.edu/daves/lpfaq/faq.html"
+Literate Programming FAQ 
+\begin_inset Flex URL
+status collapsed
+
+\begin_layout Standard
+
+http://shelob.ce.ttu.edu/daves/lpfaq/faq.html
+\end_layout
 
 \end_inset
 
@@ -17404,9 +16849,14 @@ The Noweb web page can be found at:
 \end_layout
 
 \begin_layout Quote
-\begin_inset LatexCommand url
-name "Noweb home page"
-target "http://www.cs.virginia.edu/~nr/noweb/"
+Noweb home page 
+\begin_inset Flex URL
+status collapsed
+
+\begin_layout Standard
+
+http://www.cs.virginia.edu/~nr/noweb/
+\end_layout
 
 \end_inset
 
@@ -17419,6 +16869,12 @@ Starting from there you can reach many other interesting links and even
 \end_layout
 
 \begin_layout Subsection
+\begin_inset CommandInset label
+LatexCommand label
+name "sub:LyX-and-Literate"
+
+\end_inset
+
 LyX and Literate Programming
 \end_layout
 
@@ -17648,9 +17104,9 @@ rence:
 For an example of this usage and the resulting cross-reference output, look
  at the Literate python program in 
 \emph on
-LIBDIR/examples/listerrors.lyx 
+LIBDIR/examples/listerrors.lyx
 \emph default
-which should make this all clear.
+ which should make this all clear.
 \end_layout
 
 \begin_layout Paragraph
@@ -17692,9 +17148,9 @@ pdate\SpecialChar \menuseparator
 \bar under
 D
 \bar default
-VI 
+VI
 \family default
-menu option is chosen, a LaTeX file is generated.
+ menu option is chosen, a LaTeX file is generated.
  
 \end_layout
 
@@ -17712,9 +17168,9 @@ literate
  format (defined in the Preferences panel), otherwise the file will have
  the usual 
 \family typewriter
-.tex 
+.tex
 \family default
-extension.
+ extension.
 \end_layout
 
 \end_deeper
@@ -17729,7 +17185,7 @@ Note that the only difference so far is in the name of the file, no special
 If the document is of any literate class LyX will then use the internal
  LyX to Noweb converter, followed by the Noweb to LaTeX converter
 \begin_inset Foot
-status open
+status collapsed
 
 \begin_layout Standard
 The converters are defined in the 
@@ -17753,6 +17209,18 @@ Conversion
 \end_inset
 
  tab.
+ See section 
+\begin_inset CommandInset ref
+LatexCommand ref
+reference "sub:converters"
+
+\end_inset
+
+ of the 
+\emph on
+Customization
+\emph default
+ manual for general information about converters.
 \end_layout
 
 \end_inset
@@ -17791,12 +17259,14 @@ Generating the code
 \begin_layout Standard
 When the build menu option is chosen or the corresponding button in the
  toolbar is pressed, a LaTeX file is generated just like step 1 above.
- Next, LyX invokes the
+ Next, LyX invokes the 
 \family typewriter
- Noweb->Program
+Noweb->Program
 \family default
  converter.
- Typically, this converter (like any other converter), has two parts:
+ This converter needs to be defined by the user and is not installed by
+ default, though the Program format is.
+ This converter (like any other converter) will have two parts:
 \end_layout
 
 \begin_layout Enumerate
@@ -17843,7 +17313,7 @@ build-script
 \begin_inset Quotes erd
 \end_inset
 
- (a program or script) with the name of the Noweb file (generally a file
+ (a program or script) with the name of the Noweb file (normally a file
  in the LyX temp directory).
  
 \end_layout
@@ -17887,7 +17357,7 @@ Flags
 
 
 \family typewriter
-originaldir,parselog=listerrors
+parselog=listerrors
 \family default
 
 \begin_inset Quotes erd
@@ -17916,13 +17386,13 @@ listerrors
 \begin_layout Standard
 The converter code looks in 
 \emph on
-MYLYXDIR/scripts 
+MYLYXDIR/scripts
 \emph default
-first, then in
+ first, then in 
 \emph on
- LIBDIR/scripts 
+LIBDIR/scripts
 \emph default
-then on the path for the 
+ then on the path for the 
 \begin_inset Quotes eld
 \end_inset
 
@@ -17933,6 +17403,75 @@ listerrors
  program.
 \end_layout
 
+\begin_layout Standard
+The build will normally take place in LyX's temporary directory, so the
+ files produced by the conversion will be in that directory.
+ LyX will copy out what it regards as the `main' file, but the 
+\family typewriter
+Noweb->Program
+\family default
+ conversion may produce several files, and so most of these would then be
+ deleted when LyX was closed.
+ The present solution is to use a `copier',
+\begin_inset Foot
+status collapsed
+
+\begin_layout Standard
+See section 
+\begin_inset CommandInset ref
+LatexCommand ref
+reference "sec:converters-etc"
+
+\end_inset
+
+ of the 
+\emph on
+Customization
+\emph default
+ manual for information on these.
+\end_layout
+
+\end_inset
+
+ in this case, the 
+\family typewriter
+ext_copy.py
+\family default
+ script in its default mode, so that the entire contents of the temporary
+ directory is copied.
+ More will get copied than is needed, to be sure, but nothing will be lost.
+ If, however, you know what extensions the generated files will have, this
+ can be improved by using the 
+\family typewriter
+-e
+\family default
+ option to 
+\family typewriter
+ext_copy
+\family default
+.
+ This option takes a comma-separated list of extensions to copy.
+ So, for example, if the conversion will generate only files with the extensions
+\family typewriter
+.c
+\family default
+ and 
+\family typewriter
+.h
+\family default
+, then the correct definition would be:
+\end_layout
+
+\begin_layout LyX-Code
+python -tt $$s/scripts/ext_copy.py -e c,h $$i $$o
+\end_layout
+
+\begin_layout Standard
+The result will be that only files with these two extensions will be copied
+ out.
+\end_layout
+
 \begin_layout Paragraph
 Build instructions in the document
 \end_layout
@@ -18008,9 +17547,9 @@ fi
 \begin_layout Standard
 Look in 
 \emph on
-LIBDIR/examples/listerrors.lyx 
+LIBDIR/examples/listerrors.lyx
 \emph default
-or in 
+ or in 
 \emph on
 LIBDIR/examples/Literate.lyx
 \emph default
@@ -18026,9 +17565,9 @@ listerrors
  in 
 \emph on
 LIBDIR/examples/noweb2lyx.lyx.
+
 \emph default
-Interestingly, these three files show off the language-indepence of the
+ Interestingly, these three files show off the language-indepence of the
  LyX literate programming support since they are written in Python, C and
  Perl respectively.
 \end_layout
@@ -18202,9 +17741,8 @@ When debugging code with ddd/gdb, it is possible to invoke a text editor
  at the current execution position with a single key stroke.
  The default ddd configuration for that is shift-ctrl-V.
  It happens that you can define the editor command line invocation in ddd
- by accessing the
+ by accessing the 
 \family sans
 \bar under
 E
 \bar default
@@ -18218,9 +17756,9 @@ references\SpecialChar \menuseparator
 \bar under
 H
 \bar default
-elpers 
+elpers
 \family default
-dialog and changing the "Edit Sources" entry.
+ dialog and changing the "Edit Sources" entry.
 \end_layout
 
 \begin_layout Standard
@@ -18472,7 +18010,8 @@ The next thing is the visible presence of the newline character in the screen.
 
 \begin_layout Chapter
 Secrets of the LaTeX Masters
-\begin_inset LatexCommand label
+\begin_inset CommandInset label
+LatexCommand label
 name "cha:secrets"
 
 \end_inset
@@ -18613,7 +18152,7 @@ end{multicols}
 
 \begin_layout Standard
 \begin_inset ERT
-status inlined
+status open
 
 \begin_layout Standard
 
@@ -18669,7 +18208,7 @@ ty which utterly submerged my mind.
 
 \begin_layout Standard
 \begin_inset ERT
-status inlined
+status open
 
 \begin_layout Standard
 
@@ -18693,7 +18232,7 @@ The same pattern is used when you want more than two columns:
 
 \begin_layout Standard
 \begin_inset ERT
-status inlined
+status open
 
 \begin_layout Standard
 
@@ -18733,7 +18272,7 @@ It can be imagined that my close intimacy with Sherlock Holmes had interested
 
 \begin_layout Standard
 \begin_inset ERT
-status inlined
+status open
 
 \begin_layout Standard
 
@@ -18762,7 +18301,7 @@ You can even have columns inside columns:
 
 \begin_layout Standard
 \begin_inset ERT
-status inlined
+status open
 
 \begin_layout Standard
 
@@ -18788,7 +18327,7 @@ The Honourable Ronald Adair was the second son of the Earl of Maynooth,
 
 \begin_layout Standard
 \begin_inset ERT
-status inlined
+status open
 
 \begin_layout Standard
 
@@ -18819,7 +18358,7 @@ The youth moved in the best society--had, so far as was known, no enemies
 
 \begin_layout Standard
 \begin_inset ERT
-status inlined
+status open
 
 \begin_layout Standard
 
@@ -18862,7 +18401,7 @@ The evidence of those who had played with him-- Mr.
 
 \begin_layout Standard
 \begin_inset ERT
-status inlined
+status open
 
 \begin_layout Standard
 
@@ -19232,7 +18771,7 @@ vspace*{-8.4ex}
 \begin_layout Standard
 \noindent
 \begin_inset ERT
-status inlined
+status open
 
 \begin_layout Standard
 
@@ -19262,7 +18801,7 @@ dropped capitals
 
 \begin_layout Standard
 \begin_inset ERT
-status inlined
+status open
 
 \begin_layout Standard
 
@@ -19391,7 +18930,7 @@ Mike Ressler
 
 \begin_layout Standard
 \begin_inset ERT
-status inlined
+status open
 
 \begin_layout Standard
 
@@ -19671,7 +19210,7 @@ numlines
 
 \begin_layout Standard
 \begin_inset ERT
-status inlined
+status open
 
 \begin_layout Standard