lib/templates/RJournal.lyx

   1 #LyX 2.0 created this file. For more info see http://www.lyx.org/
   2 \lyxformat 413
   3 \begin_document
   4 \begin_header
   5 \textclass RJournal
   6 \use_default_options true
   7 \begin_modules
   8 knitr
   9 \end_modules
  10 \maintain_unincluded_children false
  11 \language english
  12 \language_package none
  13 \inputencoding auto
  14 \fontencoding global
  15 \font_roman default
  16 \font_sans default
  17 \font_typewriter default
  18 \font_default_family default
  19 \use_non_tex_fonts false
  20 \font_sc false
  21 \font_osf false
  22 \font_sf_scale 100
  23 \font_tt_scale 100
  24
  25 \graphics default
  26 \default_output_format default
  27 \output_sync 0
  28 \bibtex_command default
  29 \index_command default
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  39 \cite_engine natbib_authoryear
  40 \use_bibtopic false
  41 \use_indices false
  42 \paperorientation portrait
  43 \suppress_date false
  44 \use_refstyle 1
  45 \index Index
  46 \shortcut idx
  47 \color #008000
  48 \end_index
  49 \secnumdepth 3
  50 \tocdepth 3
  51 \paragraph_separation indent
  52 \paragraph_indentation default
  53 \quotes_language english
  54 \papercolumns 1
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  56 \paperpagestyle default
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  59 \html_math_output 0
  60 \html_css_as_file 0
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  62 \end_header
  63
  64 \begin_body
  65
  66 \begin_layout Standard
  67 \begin_inset ERT
  68 status open
  69
  70 \begin_layout Plain Layout
  71
  72 <<setup, include=FALSE>>=
  73 \end_layout
  74
  75 \begin_layout Plain Layout
  76
  77 render_sweave() # use Schunk, Sinput and Soutput environments defined by
  78  RJournal
  79 \end_layout
  80
  81 \begin_layout Plain Layout
  82
  83 set_header(highlight = '') # no need for
  84 \backslash
  85 usepackage{Sweave}
  86 \end_layout
  87
  88 \begin_layout Plain Layout
  89
  90 @
  91 \end_layout
  92
  93 \end_inset
  94
  95
  96 \end_layout
  97
  98 \begin_layout Title
  99 Capitalized Title Here
 100 \end_layout
 101
 102 \begin_layout Author
 103 by Author A and Author B
 104 \end_layout
 105
 106 \begin_layout Standard
 107 \begin_inset Flex Abstract
 108 status open
 109
 110 \begin_layout Plain Layout
 111 An abstract of less than 150 words.
 112 \end_layout
 113
 114 \end_inset
 115
 116
 117 \end_layout
 118
 119 \begin_layout Section
 120 Section title in sentence case
 121 \end_layout
 122
 123 \begin_layout Standard
 124 Write something here.
 125  A sample citation is
 126 \begin_inset CommandInset citation
 127 LatexCommand citet
 128 key "Lam94"
 129
 130 \end_inset
 131
 132 .
 133 \end_layout
 134
 135 \begin_layout Section
 136 R code chunks
 137 \end_layout
 138
 139 \begin_layout Standard
 140 Press
 141 \begin_inset Info
 142 type  "shortcut"
 143 arg   "ert-insert"
 144 \end_inset
 145
 146  and input R code chunks which will be compiled with the
 147 \series bold
 148 knitr
 149 \series default
 150  package (
 151 \begin_inset Flex URL
 152 status collapsed
 153
 154 \begin_layout Plain Layout
 155
 156 http://yihui.name/knitr/
 157 \end_layout
 158
 159 \end_inset
 160
 161 ).
 162 \end_layout
 163
 164 \begin_layout Standard
 165 \begin_inset ERT
 166 status open
 167
 168 \begin_layout Plain Layout
 169
 170 <<sample-chunk, echo=TRUE>>=
 171 \end_layout
 172
 173 \begin_layout Plain Layout
 174
 175 x=1:10
 176 \end_layout
 177
 178 \begin_layout Plain Layout
 179
 180 rev(x)
 181 \end_layout
 182
 183 \begin_layout Plain Layout
 184
 185 summary(x)
 186 \end_layout
 187
 188 \begin_layout Plain Layout
 189
 190 @
 191 \end_layout
 192
 193 \end_inset
 194
 195
 196 \end_layout
 197
 198 \begin_layout Standard
 199 You can also plot your data; see Figure
 200 \begin_inset CommandInset ref
 201 LatexCommand ref
 202 reference "fig:sample-figure"
 203
 204 \end_inset
 205
 206  for example.
 207 \end_layout
 208
 209 \begin_layout Standard
 210 \begin_inset Float figure
 211 placement tbph
 212 wide false
 213 sideways false
 214 status open
 215
 216 \begin_layout Plain Layout
 217 \begin_inset ERT
 218 status open
 219
 220 \begin_layout Plain Layout
 221
 222 <<sample-figure, fig.width=5, fig.height=3, out.width='.4
 223 \backslash
 224
 225 \backslash
 226 linewidth', fig.align='center'>>=
 227 \end_layout
 228
 229 \begin_layout Plain Layout
 230
 231 par(mar = c(4,4,.1,.1))
 232 \end_layout
 233
 234 \begin_layout Plain Layout
 235
 236 plot(x, pch=19, col=1:10)
 237 \end_layout
 238
 239 \begin_layout Plain Layout
 240
 241 @
 242 \end_layout
 243
 244 \end_inset
 245
 246
 247 \end_layout
 248
 249 \begin_layout Plain Layout
 250 \begin_inset Caption
 251
 252 \begin_layout Plain Layout
 253 A sample figure.
 254 \begin_inset CommandInset label
 255 LatexCommand label
 256 name "fig:sample-figure"
 257
 258 \end_inset
 259
 260
 261 \end_layout
 262
 263 \end_inset
 264
 265
 266 \end_layout
 267
 268 \end_inset
 269
 270
 271 \end_layout
 272
 273 \begin_layout Standard
 274 \begin_inset Note Note
 275 status open
 276
 277 \begin_layout Plain Layout
 278 When you insert a BibTeX bibliography here, do not use any bib styles.
 279  The R Journal has declared the style to be
 280 \begin_inset Quotes eld
 281 \end_inset
 282
 283 abbrvnat
 284 \begin_inset Quotes erd
 285 \end_inset
 286
 287 .
 288 \end_layout
 289
 290 \end_inset
 291
 292
 293 \end_layout
 294
 295 \begin_layout Standard
 296 \begin_inset CommandInset bibtex
 297 LatexCommand bibtex
 298 bibfiles "biblio"
 299
 300 \end_inset
 301
 302
 303 \end_layout
 304
 305 \begin_layout Standard
 306 \begin_inset Flex Address
 307 status collapsed
 308
 309 \begin_layout Plain Layout
 310 Author A
 311 \begin_inset Newline newline
 312 \end_inset
 313
 314 Press
 315 \begin_inset Info
 316 type  "shortcut"
 317 arg   "newline-insert newline"
 318 \end_inset
 319
 320  to input
 321 \begin_inset Newline newline
 322 \end_inset
 323
 324 address here
 325 \end_layout
 326
 327 \end_inset
 328
 329
 330 \begin_inset Newline newline
 331 \end_inset
 332
 333
 334 \begin_inset Flex Email
 335 status collapsed
 336
 337 \begin_layout Plain Layout
 338 author.a@email
 339 \end_layout
 340
 341 \end_inset
 342
 343
 344 \end_layout
 345
 346 \begin_layout Standard
 347 \begin_inset Flex Address
 348 status collapsed
 349
 350 \begin_layout Plain Layout
 351 Author B
 352 \end_layout
 353
 354 \end_inset
 355
 356
 357 \begin_inset Newline newline
 358 \end_inset
 359
 360
 361 \begin_inset Flex Email
 362 status collapsed
 363
 364 \begin_layout Plain Layout
 365 author.b@email
 366 \end_layout
 367
 368 \end_inset
 369
 370
 371 \end_layout
 372
 373 \end_body
 374 \end_document