lib/templates/RJournal.lyx

   1 #LyX 2.2 created this file. For more info see http://www.lyx.org/
   2 \lyxformat 506
   3 \begin_document
   4 \begin_header
   5 \save_transient_properties true
   6 \origin /systemlyxdir/templates/
   7 \textclass RJournal
   8 \use_default_options true
   9 \begin_modules
  10 knitr
  11 \end_modules
  12 \maintain_unincluded_children false
  13 \language english
  14 \language_package none
  15 \inputencoding auto
  16 \fontencoding global
  17 \font_roman "default" "default"
  18 \font_sans "default" "default"
  19 \font_typewriter "default" "default"
  20 \font_math "auto" "auto"
  21 \font_default_family default
  22 \use_non_tex_fonts false
  23 \font_sc false
  24 \font_osf false
  25 \font_sf_scale 100 100
  26 \font_tt_scale 100 100
  27 \graphics default
  28 \default_output_format default
  29 \output_sync 0
  30 \bibtex_command bibtex
  31 \index_command default
  32 \paperfontsize default
  33 \spacing single
  34 \use_hyperref false
  35 \papersize default
  36 \use_geometry false
  37 \use_package amsmath 1
  38 \use_package amssymb 1
  39 \use_package cancel 0
  40 \use_package esint 1
  41 \use_package mathdots 1
  42 \use_package mathtools 0
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  45 \use_package stmaryrd 0
  46 \use_package undertilde 0
  47 \cite_engine natbib
  48 \cite_engine_type authoryear
  49 \biblio_style plainnat
  50 \use_bibtopic false
  51 \use_indices false
  52 \paperorientation portrait
  53 \suppress_date false
  54 \justification true
  55 \use_refstyle 1
  56 \index Index
  57 \shortcut idx
  58 \color #008000
  59 \end_index
  60 \secnumdepth 3
  61 \tocdepth 3
  62 \paragraph_separation indent
  63 \paragraph_indentation default
  64 \quotes_language english
  65 \papercolumns 1
  66 \papersides 1
  67 \paperpagestyle default
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  69 \output_changes false
  70 \html_math_output 0
  71 \html_css_as_file 0
  72 \html_be_strict false
  73 \end_header
  74
  75 \begin_body
  76
  77 \begin_layout Standard
  78 \begin_inset ERT
  79 status open
  80
  81 \begin_layout Plain Layout
  82
  83 <<setup, include=FALSE>>=
  84 \end_layout
  85
  86 \begin_layout Plain Layout
  87
  88 render_sweave() # use Schunk, Sinput and Soutput environments defined by
  89  RJournal
  90 \end_layout
  91
  92 \begin_layout Plain Layout
  93
  94 set_header(highlight = '') # no need for
  95 \backslash
  96 usepackage{Sweave}
  97 \end_layout
  98
  99 \begin_layout Plain Layout
 100
 101 @
 102 \end_layout
 103
 104 \end_inset
 105
 106
 107 \end_layout
 108
 109 \begin_layout Title
 110 Capitalized Title Here
 111 \end_layout
 112
 113 \begin_layout Author
 114 by Author A and Author B
 115 \end_layout
 116
 117 \begin_layout Abstract
 118 An abstract of less than 150 words.
 119 \end_layout
 120
 121 \begin_layout Section
 122 Section title in sentence case
 123 \end_layout
 124
 125 \begin_layout Standard
 126 Write something here.
 127  A sample citation is
 128 \begin_inset CommandInset citation
 129 LatexCommand citet
 130 key "article-minimal"
 131
 132 \end_inset
 133
 134 .
 135 \end_layout
 136
 137 \begin_layout Section
 138 R code chunks
 139 \end_layout
 140
 141 \begin_layout Standard
 142 Press
 143 \begin_inset Info
 144 type  "shortcut"
 145 arg   "ert-insert"
 146 \end_inset
 147
 148  and input R code chunks which will be compiled with the
 149 \series bold
 150 knitr
 151 \series default
 152  package (
 153 \begin_inset Flex URL
 154 status collapsed
 155
 156 \begin_layout Plain Layout
 157
 158 http://yihui.name/knitr/
 159 \end_layout
 160
 161 \end_inset
 162
 163 ).
 164 \end_layout
 165
 166 \begin_layout Standard
 167 \begin_inset ERT
 168 status open
 169
 170 \begin_layout Plain Layout
 171
 172 <<sample-chunk, echo=TRUE>>=
 173 \end_layout
 174
 175 \begin_layout Plain Layout
 176
 177 x=1:10
 178 \end_layout
 179
 180 \begin_layout Plain Layout
 181
 182 rev(x)
 183 \end_layout
 184
 185 \begin_layout Plain Layout
 186
 187 summary(x)
 188 \end_layout
 189
 190 \begin_layout Plain Layout
 191
 192 @
 193 \end_layout
 194
 195 \end_inset
 196
 197
 198 \end_layout
 199
 200 \begin_layout Standard
 201 You can also plot your data; see Figure
 202 \begin_inset CommandInset ref
 203 LatexCommand ref
 204 reference "fig:sample-figure"
 205
 206 \end_inset
 207
 208  for example.
 209 \end_layout
 210
 211 \begin_layout Standard
 212 \begin_inset Float figure
 213 placement tbph
 214 wide false
 215 sideways false
 216 status open
 217
 218 \begin_layout Plain Layout
 219 \begin_inset ERT
 220 status open
 221
 222 \begin_layout Plain Layout
 223
 224 <<sample-figure, fig.width=5, fig.height=3, out.width='.4
 225 \backslash
 226
 227 \backslash
 228 linewidth', fig.align='center', dev=c('pdf','postscript')>>=
 229 \end_layout
 230
 231 \begin_layout Plain Layout
 232
 233 par(mar = c(4,4,.1,.1))
 234 \end_layout
 235
 236 \begin_layout Plain Layout
 237
 238 plot(x, pch=19, col=1:10)
 239 \end_layout
 240
 241 \begin_layout Plain Layout
 242
 243 @
 244 \end_layout
 245
 246 \end_inset
 247
 248
 249 \end_layout
 250
 251 \begin_layout Plain Layout
 252 \begin_inset Caption Standard
 253
 254 \begin_layout Plain Layout
 255 A sample figure.
 256 \begin_inset CommandInset label
 257 LatexCommand label
 258 name "fig:sample-figure"
 259
 260 \end_inset
 261
 262
 263 \end_layout
 264
 265 \end_inset
 266
 267
 268 \end_layout
 269
 270 \end_inset
 271
 272
 273 \end_layout
 274
 275 \begin_layout Standard
 276 \begin_inset Note Note
 277 status open
 278
 279 \begin_layout Plain Layout
 280 When you insert a Bib\SpecialChar TeX
 281  bibliography here, do not use any bib styles.
 282  The R Journal has declared the style to be
 283 \begin_inset Quotes eld
 284 \end_inset
 285
 286 abbrvnat
 287 \begin_inset Quotes erd
 288 \end_inset
 289
 290 .
 291 \end_layout
 292
 293 \end_inset
 294
 295
 296 \end_layout
 297
 298 \begin_layout Standard
 299 \begin_inset CommandInset bibtex
 300 LatexCommand bibtex
 301 bibfiles "xampl"
 302
 303 \end_inset
 304
 305
 306 \end_layout
 307
 308 \begin_layout Address
 309 Author A
 310 \begin_inset Newline newline
 311 \end_inset
 312
 313 Press
 314 \begin_inset Info
 315 type  "shortcut"
 316 arg   "newline-insert newline"
 317 \end_inset
 318
 319  to input
 320 \begin_inset Newline newline
 321 \end_inset
 322
 323 address here
 324 \begin_inset Newline newline
 325 \end_inset
 326
 327
 328 \begin_inset Flex Email
 329 status open
 330
 331 \begin_layout Plain Layout
 332 author.a@email
 333 \end_layout
 334
 335 \end_inset
 336
 337
 338 \end_layout
 339
 340 \begin_layout Address
 341 Author B
 342 \begin_inset Newline newline
 343 \end_inset
 344
 345
 346 \begin_inset Flex Email
 347 status open
 348
 349 \begin_layout Plain Layout
 350 author.b@email
 351 \end_layout
 352
 353 \end_inset
 354
 355
 356 \end_layout
 357
 358 \end_body
 359 \end_document