lib/templates/RJournal.lyx

   1 #LyX 2.3 created this file. For more info see http://www.lyx.org/
   2 \lyxformat 544
   3 \begin_document
   4 \begin_header
   5 \save_transient_properties true
   6 \origin /systemlyxdir/templates/
   7 \textclass RJournal
   8 \use_default_options true
   9 \begin_modules
  10 knitr
  11 \end_modules
  12 \maintain_unincluded_children false
  13 \language english
  14 \language_package none
  15 \inputencoding auto
  16 \fontencoding global
  17 \font_roman "default" "default"
  18 \font_sans "default" "default"
  19 \font_typewriter "default" "default"
  20 \font_math "auto" "auto"
  21 \font_default_family default
  22 \use_non_tex_fonts false
  23 \font_sc false
  24 \font_osf false
  25 \font_sf_scale 100 100
  26 \font_tt_scale 100 100
  27 \use_microtype false
  28 \use_dash_ligatures false
  29 \graphics default
  30 \default_output_format default
  31 \output_sync 0
  32 \bibtex_command bibtex
  33 \index_command default
  34 \paperfontsize default
  35 \spacing single
  36 \use_hyperref false
  37 \papersize default
  38 \use_geometry false
  39 \use_package amsmath 1
  40 \use_package amssymb 1
  41 \use_package cancel 0
  42 \use_package esint 1
  43 \use_package mathdots 1
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  48 \use_package undertilde 0
  49 \cite_engine natbib
  50 \cite_engine_type authoryear
  51 \biblio_style plainnat
  52 \use_bibtopic false
  53 \use_indices false
  54 \paperorientation portrait
  55 \suppress_date false
  56 \justification true
  57 \use_refstyle 1
  58 \index Index
  59 \shortcut idx
  60 \color #008000
  61 \end_index
  62 \secnumdepth 3
  63 \tocdepth 3
  64 \paragraph_separation indent
  65 \paragraph_indentation default
  66 \is_math_indent 0
  67 \math_numbering_side default
  68 \quotes_style english
  69 \papercolumns 1
  70 \papersides 1
  71 \paperpagestyle default
  72 \tracking_changes false
  73 \output_changes false
  74 \html_math_output 0
  75 \html_css_as_file 0
  76 \html_be_strict false
  77 \use_minted 0
  78 \end_header
  79
  80 \begin_body
  81
  82 \begin_layout Standard
  83 \begin_inset ERT
  84 status open
  85
  86 \begin_layout Plain Layout
  87
  88 <<setup, include=FALSE>>=
  89 \end_layout
  90
  91 \begin_layout Plain Layout
  92
  93 render_sweave() # use Schunk, Sinput and Soutput environments defined by
  94  RJournal
  95 \end_layout
  96
  97 \begin_layout Plain Layout
  98
  99 set_header(highlight = '') # no need for
 100 \backslash
 101 usepackage{Sweave}
 102 \end_layout
 103
 104 \begin_layout Plain Layout
 105
 106 @
 107 \end_layout
 108
 109 \end_inset
 110
 111
 112 \end_layout
 113
 114 \begin_layout Title
 115 Capitalized Title Here
 116 \end_layout
 117
 118 \begin_layout Author
 119 by Author A and Author B
 120 \end_layout
 121
 122 \begin_layout Abstract
 123 An abstract of less than 150 words.
 124 \end_layout
 125
 126 \begin_layout Section
 127 Section title in sentence case
 128 \end_layout
 129
 130 \begin_layout Standard
 131 Write something here.
 132  A sample citation is
 133 \begin_inset CommandInset citation
 134 LatexCommand citet
 135 key "article-minimal"
 136 literal "true"
 137
 138 \end_inset
 139
 140 .
 141 \end_layout
 142
 143 \begin_layout Section
 144 R code chunks
 145 \end_layout
 146
 147 \begin_layout Standard
 148 Press
 149 \begin_inset Info
 150 type  "shortcut"
 151 arg   "ert-insert"
 152 \end_inset
 153
 154  and input R code chunks which will be compiled with the
 155 \series bold
 156 knitr
 157 \series default
 158  package (
 159 \begin_inset Flex URL
 160 status collapsed
 161
 162 \begin_layout Plain Layout
 163
 164 http://yihui.name/knitr/
 165 \end_layout
 166
 167 \end_inset
 168
 169 ).
 170 \end_layout
 171
 172 \begin_layout Standard
 173 \begin_inset ERT
 174 status open
 175
 176 \begin_layout Plain Layout
 177
 178 <<sample-chunk, echo=TRUE>>=
 179 \end_layout
 180
 181 \begin_layout Plain Layout
 182
 183 x=1:10
 184 \end_layout
 185
 186 \begin_layout Plain Layout
 187
 188 rev(x)
 189 \end_layout
 190
 191 \begin_layout Plain Layout
 192
 193 summary(x)
 194 \end_layout
 195
 196 \begin_layout Plain Layout
 197
 198 @
 199 \end_layout
 200
 201 \end_inset
 202
 203
 204 \end_layout
 205
 206 \begin_layout Standard
 207 You can also plot your data; see Figure
 208 \begin_inset CommandInset ref
 209 LatexCommand ref
 210 reference "fig:sample-figure"
 211
 212 \end_inset
 213
 214  for example.
 215 \end_layout
 216
 217 \begin_layout Standard
 218 \begin_inset Float figure
 219 placement tbph
 220 wide false
 221 sideways false
 222 status open
 223
 224 \begin_layout Plain Layout
 225 \begin_inset ERT
 226 status open
 227
 228 \begin_layout Plain Layout
 229
 230 <<sample-figure, fig.width=5, fig.height=3, out.width='.4
 231 \backslash
 232
 233 \backslash
 234 linewidth', fig.align='center', dev=c('pdf','postscript')>>=
 235 \end_layout
 236
 237 \begin_layout Plain Layout
 238
 239 par(mar = c(4,4,.1,.1))
 240 \end_layout
 241
 242 \begin_layout Plain Layout
 243
 244 plot(x, pch=19, col=1:10)
 245 \end_layout
 246
 247 \begin_layout Plain Layout
 248
 249 @
 250 \end_layout
 251
 252 \end_inset
 253
 254
 255 \end_layout
 256
 257 \begin_layout Plain Layout
 258 \begin_inset Caption Standard
 259
 260 \begin_layout Plain Layout
 261 A sample figure.
 262 \begin_inset CommandInset label
 263 LatexCommand label
 264 name "fig:sample-figure"
 265
 266 \end_inset
 267
 268
 269 \end_layout
 270
 271 \end_inset
 272
 273
 274 \end_layout
 275
 276 \end_inset
 277
 278
 279 \end_layout
 280
 281 \begin_layout Standard
 282 \begin_inset Note Note
 283 status open
 284
 285 \begin_layout Plain Layout
 286 When you insert a Bib\SpecialChar TeX
 287  bibliography here, do not use any bib styles.
 288  The R Journal has declared the style to be
 289 \begin_inset Quotes eld
 290 \end_inset
 291
 292 abbrvnat
 293 \begin_inset Quotes erd
 294 \end_inset
 295
 296 .
 297 \end_layout
 298
 299 \end_inset
 300
 301
 302 \end_layout
 303
 304 \begin_layout Standard
 305 \begin_inset CommandInset bibtex
 306 LatexCommand bibtex
 307 bibfiles "xampl"
 308
 309 \end_inset
 310
 311
 312 \end_layout
 313
 314 \begin_layout Address
 315 Author A
 316 \begin_inset Newline newline
 317 \end_inset
 318
 319 Press
 320 \begin_inset Info
 321 type  "shortcut"
 322 arg   "newline-insert newline"
 323 \end_inset
 324
 325  to input
 326 \begin_inset Newline newline
 327 \end_inset
 328
 329 address here
 330 \begin_inset Newline newline
 331 \end_inset
 332
 333
 334 \begin_inset Flex Email
 335 status open
 336
 337 \begin_layout Plain Layout
 338 author.a@email
 339 \end_layout
 340
 341 \end_inset
 342
 343
 344 \end_layout
 345
 346 \begin_layout Address
 347 Author B
 348 \begin_inset Newline newline
 349 \end_inset
 350
 351
 352 \begin_inset Flex Email
 353 status open
 354
 355 \begin_layout Plain Layout
 356 author.b@email
 357 \end_layout
 358
 359 \end_inset
 360
 361
 362 \end_layout
 363
 364 \end_body
 365 \end_document