lib/templates/RJournal.lyx

   1 #LyX 2.2 created this file. For more info see http://www.lyx.org/
   2 \lyxformat 501
   3 \begin_document
   4 \begin_header
   5 \origin /systemlyxdir/templates/
   6 \textclass RJournal
   7 \use_default_options true
   8 \begin_modules
   9 knitr
  10 \end_modules
  11 \maintain_unincluded_children false
  12 \language english
  13 \language_package none
  14 \inputencoding auto
  15 \fontencoding global
  16 \font_roman "default" "default"
  17 \font_sans "default" "default"
  18 \font_typewriter "default" "default"
  19 \font_math "auto" "auto"
  20 \font_default_family default
  21 \use_non_tex_fonts false
  22 \font_sc false
  23 \font_osf false
  24 \font_sf_scale 100 100
  25 \font_tt_scale 100 100
  26 \graphics default
  27 \default_output_format default
  28 \output_sync 0
  29 \bibtex_command bibtex
  30 \index_command default
  31 \paperfontsize default
  32 \spacing single
  33 \use_hyperref false
  34 \papersize default
  35 \use_geometry false
  36 \use_package amsmath 1
  37 \use_package amssymb 1
  38 \use_package cancel 0
  39 \use_package esint 1
  40 \use_package mathdots 1
  41 \use_package mathtools 0
  42 \use_package mhchem 1
  43 \use_package stackrel 0
  44 \use_package stmaryrd 0
  45 \use_package undertilde 0
  46 \cite_engine natbib
  47 \cite_engine_type authoryear
  48 \biblio_style plainnat
  49 \use_bibtopic false
  50 \use_indices false
  51 \paperorientation portrait
  52 \suppress_date false
  53 \justification true
  54 \use_refstyle 1
  55 \index Index
  56 \shortcut idx
  57 \color #008000
  58 \end_index
  59 \secnumdepth 3
  60 \tocdepth 3
  61 \paragraph_separation indent
  62 \paragraph_indentation default
  63 \quotes_language english
  64 \papercolumns 1
  65 \papersides 1
  66 \paperpagestyle default
  67 \tracking_changes false
  68 \output_changes false
  69 \html_math_output 0
  70 \html_css_as_file 0
  71 \html_be_strict false
  72 \end_header
  73
  74 \begin_body
  75
  76 \begin_layout Standard
  77 \begin_inset ERT
  78 status open
  79
  80 \begin_layout Plain Layout
  81
  82 <<setup, include=FALSE>>=
  83 \end_layout
  84
  85 \begin_layout Plain Layout
  86
  87 render_sweave() # use Schunk, Sinput and Soutput environments defined by
  88  RJournal
  89 \end_layout
  90
  91 \begin_layout Plain Layout
  92
  93 set_header(highlight = '') # no need for
  94 \backslash
  95 usepackage{Sweave}
  96 \end_layout
  97
  98 \begin_layout Plain Layout
  99
 100 @
 101 \end_layout
 102
 103 \end_inset
 104
 105
 106 \end_layout
 107
 108 \begin_layout Title
 109 Capitalized Title Here
 110 \end_layout
 111
 112 \begin_layout Author
 113 by Author A and Author B
 114 \end_layout
 115
 116 \begin_layout Abstract
 117 An abstract of less than 150 words.
 118 \end_layout
 119
 120 \begin_layout Section
 121 Section title in sentence case
 122 \end_layout
 123
 124 \begin_layout Standard
 125 Write something here.
 126  A sample citation is
 127 \begin_inset CommandInset citation
 128 LatexCommand citet
 129 key "article-minimal"
 130
 131 \end_inset
 132
 133 .
 134 \end_layout
 135
 136 \begin_layout Section
 137 R code chunks
 138 \end_layout
 139
 140 \begin_layout Standard
 141 Press
 142 \begin_inset Info
 143 type  "shortcut"
 144 arg   "ert-insert"
 145 \end_inset
 146
 147  and input R code chunks which will be compiled with the
 148 \series bold
 149 knitr
 150 \series default
 151  package (
 152 \begin_inset Flex URL
 153 status collapsed
 154
 155 \begin_layout Plain Layout
 156
 157 http://yihui.name/knitr/
 158 \end_layout
 159
 160 \end_inset
 161
 162 ).
 163 \end_layout
 164
 165 \begin_layout Standard
 166 \begin_inset ERT
 167 status open
 168
 169 \begin_layout Plain Layout
 170
 171 <<sample-chunk, echo=TRUE>>=
 172 \end_layout
 173
 174 \begin_layout Plain Layout
 175
 176 x=1:10
 177 \end_layout
 178
 179 \begin_layout Plain Layout
 180
 181 rev(x)
 182 \end_layout
 183
 184 \begin_layout Plain Layout
 185
 186 summary(x)
 187 \end_layout
 188
 189 \begin_layout Plain Layout
 190
 191 @
 192 \end_layout
 193
 194 \end_inset
 195
 196
 197 \end_layout
 198
 199 \begin_layout Standard
 200 You can also plot your data; see Figure
 201 \begin_inset CommandInset ref
 202 LatexCommand ref
 203 reference "fig:sample-figure"
 204
 205 \end_inset
 206
 207  for example.
 208 \end_layout
 209
 210 \begin_layout Standard
 211 \begin_inset Float figure
 212 placement tbph
 213 wide false
 214 sideways false
 215 status open
 216
 217 \begin_layout Plain Layout
 218 \begin_inset ERT
 219 status open
 220
 221 \begin_layout Plain Layout
 222
 223 <<sample-figure, fig.width=5, fig.height=3, out.width='.4
 224 \backslash
 225
 226 \backslash
 227 linewidth', fig.align='center', dev=c('pdf','postscript')>>=
 228 \end_layout
 229
 230 \begin_layout Plain Layout
 231
 232 par(mar = c(4,4,.1,.1))
 233 \end_layout
 234
 235 \begin_layout Plain Layout
 236
 237 plot(x, pch=19, col=1:10)
 238 \end_layout
 239
 240 \begin_layout Plain Layout
 241
 242 @
 243 \end_layout
 244
 245 \end_inset
 246
 247
 248 \end_layout
 249
 250 \begin_layout Plain Layout
 251 \begin_inset Caption Standard
 252
 253 \begin_layout Plain Layout
 254 A sample figure.
 255 \begin_inset CommandInset label
 256 LatexCommand label
 257 name "fig:sample-figure"
 258
 259 \end_inset
 260
 261
 262 \end_layout
 263
 264 \end_inset
 265
 266
 267 \end_layout
 268
 269 \end_inset
 270
 271
 272 \end_layout
 273
 274 \begin_layout Standard
 275 \begin_inset Note Note
 276 status open
 277
 278 \begin_layout Plain Layout
 279 When you insert a Bib\SpecialCharNoPassThru TeX
 280  bibliography here, do not use any bib styles.
 281  The R Journal has declared the style to be
 282 \begin_inset Quotes eld
 283 \end_inset
 284
 285 abbrvnat
 286 \begin_inset Quotes erd
 287 \end_inset
 288
 289 .
 290 \end_layout
 291
 292 \end_inset
 293
 294
 295 \end_layout
 296
 297 \begin_layout Standard
 298 \begin_inset CommandInset bibtex
 299 LatexCommand bibtex
 300 bibfiles "xampl"
 301
 302 \end_inset
 303
 304
 305 \end_layout
 306
 307 \begin_layout Address
 308 Author A
 309 \begin_inset Newline newline
 310 \end_inset
 311
 312 Press
 313 \begin_inset Info
 314 type  "shortcut"
 315 arg   "newline-insert newline"
 316 \end_inset
 317
 318  to input
 319 \begin_inset Newline newline
 320 \end_inset
 321
 322 address here
 323 \begin_inset Newline newline
 324 \end_inset
 325
 326
 327 \begin_inset Flex Email
 328 status open
 329
 330 \begin_layout Plain Layout
 331 author.a@email
 332 \end_layout
 333
 334 \end_inset
 335
 336
 337 \end_layout
 338
 339 \begin_layout Address
 340 Author B
 341 \begin_inset Newline newline
 342 \end_inset
 343
 344
 345 \begin_inset Flex Email
 346 status open
 347
 348 \begin_layout Plain Layout
 349 author.b@email
 350 \end_layout
 351
 352 \end_inset
 353
 354
 355 \end_layout
 356
 357 \end_body
 358 \end_document