lib/templates/RJournal.lyx

   1 #LyX 2.0 created this file. For more info see http://www.lyx.org/
   2 \lyxformat 413
   3 \begin_document
   4 \begin_header
   5 \textclass RJournal
   6 \use_default_options true
   7 \begin_modules
   8 knitr
   9 \end_modules
  10 \maintain_unincluded_children false
  11 \language english
  12 \language_package none
  13 \inputencoding auto
  14 \fontencoding global
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  16 \font_sans default
  17 \font_typewriter default
  18 \font_default_family default
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  23 \font_tt_scale 100
  24
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  27 \output_sync 0
  28 \bibtex_command default
  29 \index_command default
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  39 \cite_engine natbib_authoryear
  40 \use_bibtopic false
  41 \use_indices false
  42 \paperorientation portrait
  43 \suppress_date false
  44 \use_refstyle 1
  45 \index Index
  46 \shortcut idx
  47 \color #008000
  48 \end_index
  49 \secnumdepth 3
  50 \tocdepth 3
  51 \paragraph_separation indent
  52 \paragraph_indentation default
  53 \quotes_language english
  54 \papercolumns 1
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  59 \html_math_output 0
  60 \html_css_as_file 0
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  62 \end_header
  63
  64 \begin_body
  65
  66 \begin_layout Standard
  67 \begin_inset ERT
  68 status open
  69
  70 \begin_layout Plain Layout
  71
  72 <<setup, include=FALSE>>=
  73 \end_layout
  74
  75 \begin_layout Plain Layout
  76
  77 render_sweave() # use Schunk, Sinput and Soutput environments defined by
  78  RJournal
  79 \end_layout
  80
  81 \begin_layout Plain Layout
  82
  83 set_header(highlight = '') # no need for
  84 \backslash
  85 usepackage{Sweave}
  86 \end_layout
  87
  88 \begin_layout Plain Layout
  89
  90 @
  91 \end_layout
  92
  93 \end_inset
  94
  95
  96 \end_layout
  97
  98 \begin_layout Title
  99 Capitalized Title Here
 100 \end_layout
 101
 102 \begin_layout Author
 103 by Author A and Author B
 104 \end_layout
 105
 106 \begin_layout Abstract
 107 An abstract of less than 150 words.
 108 \end_layout
 109
 110 \begin_layout Section
 111 Section title in sentence case
 112 \end_layout
 113
 114 \begin_layout Standard
 115 Write something here.
 116  A sample citation is
 117 \begin_inset CommandInset citation
 118 LatexCommand citet
 119 key "Lam94"
 120
 121 \end_inset
 122
 123 .
 124 \end_layout
 125
 126 \begin_layout Section
 127 R code chunks
 128 \end_layout
 129
 130 \begin_layout Standard
 131 Press
 132 \begin_inset Info
 133 type  "shortcut"
 134 arg   "ert-insert"
 135 \end_inset
 136
 137  and input R code chunks which will be compiled with the
 138 \series bold
 139 knitr
 140 \series default
 141  package (
 142 \begin_inset Flex URL
 143 status collapsed
 144
 145 \begin_layout Plain Layout
 146
 147 http://yihui.name/knitr/
 148 \end_layout
 149
 150 \end_inset
 151
 152 ).
 153 \end_layout
 154
 155 \begin_layout Standard
 156 \begin_inset ERT
 157 status open
 158
 159 \begin_layout Plain Layout
 160
 161 <<sample-chunk, echo=TRUE>>=
 162 \end_layout
 163
 164 \begin_layout Plain Layout
 165
 166 x=1:10
 167 \end_layout
 168
 169 \begin_layout Plain Layout
 170
 171 rev(x)
 172 \end_layout
 173
 174 \begin_layout Plain Layout
 175
 176 summary(x)
 177 \end_layout
 178
 179 \begin_layout Plain Layout
 180
 181 @
 182 \end_layout
 183
 184 \end_inset
 185
 186
 187 \end_layout
 188
 189 \begin_layout Standard
 190 You can also plot your data; see Figure
 191 \begin_inset CommandInset ref
 192 LatexCommand ref
 193 reference "fig:sample-figure"
 194
 195 \end_inset
 196
 197  for example.
 198 \end_layout
 199
 200 \begin_layout Standard
 201 \begin_inset Float figure
 202 placement tbph
 203 wide false
 204 sideways false
 205 status open
 206
 207 \begin_layout Plain Layout
 208 \begin_inset ERT
 209 status open
 210
 211 \begin_layout Plain Layout
 212
 213 <<sample-figure, fig.width=5, fig.height=3, out.width='.4
 214 \backslash
 215
 216 \backslash
 217 linewidth', fig.align='center'>>=
 218 \end_layout
 219
 220 \begin_layout Plain Layout
 221
 222 par(mar = c(4,4,.1,.1))
 223 \end_layout
 224
 225 \begin_layout Plain Layout
 226
 227 plot(x, pch=19, col=1:10)
 228 \end_layout
 229
 230 \begin_layout Plain Layout
 231
 232 @
 233 \end_layout
 234
 235 \end_inset
 236
 237
 238 \end_layout
 239
 240 \begin_layout Plain Layout
 241 \begin_inset Caption
 242
 243 \begin_layout Plain Layout
 244 A sample figure.
 245 \begin_inset CommandInset label
 246 LatexCommand label
 247 name "fig:sample-figure"
 248
 249 \end_inset
 250
 251
 252 \end_layout
 253
 254 \end_inset
 255
 256
 257 \end_layout
 258
 259 \end_inset
 260
 261
 262 \end_layout
 263
 264 \begin_layout Standard
 265 \begin_inset Note Note
 266 status open
 267
 268 \begin_layout Plain Layout
 269 When you insert a BibTeX bibliography here, do not use any bib styles.
 270  The R Journal has declared the style to be
 271 \begin_inset Quotes eld
 272 \end_inset
 273
 274 abbrvnat
 275 \begin_inset Quotes erd
 276 \end_inset
 277
 278 .
 279 \end_layout
 280
 281 \end_inset
 282
 283
 284 \end_layout
 285
 286 \begin_layout Standard
 287 \begin_inset CommandInset bibtex
 288 LatexCommand bibtex
 289 bibfiles "biblio"
 290
 291 \end_inset
 292
 293
 294 \end_layout
 295
 296 \begin_layout Standard
 297 \begin_inset Flex Address
 298 status collapsed
 299
 300 \begin_layout Plain Layout
 301 Author A
 302 \begin_inset Newline newline
 303 \end_inset
 304
 305 Press
 306 \begin_inset Info
 307 type  "shortcut"
 308 arg   "newline-insert newline"
 309 \end_inset
 310
 311  to input
 312 \begin_inset Newline newline
 313 \end_inset
 314
 315 address here
 316 \end_layout
 317
 318 \end_inset
 319
 320
 321 \begin_inset Newline newline
 322 \end_inset
 323
 324
 325 \begin_inset Flex Email
 326 status collapsed
 327
 328 \begin_layout Plain Layout
 329 author.a@email
 330 \end_layout
 331
 332 \end_inset
 333
 334
 335 \end_layout
 336
 337 \begin_layout Standard
 338 \begin_inset Flex Address
 339 status collapsed
 340
 341 \begin_layout Plain Layout
 342 Author B
 343 \end_layout
 344
 345 \end_inset
 346
 347
 348 \begin_inset Newline newline
 349 \end_inset
 350
 351
 352 \begin_inset Flex Email
 353 status collapsed
 354
 355 \begin_layout Plain Layout
 356 author.b@email
 357 \end_layout
 358
 359 \end_inset
 360
 361
 362 \end_layout
 363
 364 \end_body
 365 \end_document