lib/templates/RJournal.lyx

   1 #LyX 2.3 created this file. For more info see http://www.lyx.org/
   2 \lyxformat 541
   3 \begin_document
   4 \begin_header
   5 \save_transient_properties true
   6 \origin /systemlyxdir/templates/
   7 \textclass RJournal
   8 \use_default_options true
   9 \begin_modules
  10 knitr
  11 \end_modules
  12 \maintain_unincluded_children false
  13 \language english
  14 \language_package none
  15 \inputencoding auto
  16 \fontencoding global
  17 \font_roman "default" "default"
  18 \font_sans "default" "default"
  19 \font_typewriter "default" "default"
  20 \font_math "auto" "auto"
  21 \font_default_family default
  22 \use_non_tex_fonts false
  23 \font_sc false
  24 \font_osf false
  25 \font_sf_scale 100 100
  26 \font_tt_scale 100 100
  27 \use_microtype false
  28 \use_dash_ligatures false
  29 \graphics default
  30 \default_output_format default
  31 \output_sync 0
  32 \bibtex_command bibtex
  33 \index_command default
  34 \paperfontsize default
  35 \spacing single
  36 \use_hyperref false
  37 \papersize default
  38 \use_geometry false
  39 \use_package amsmath 1
  40 \use_package amssymb 1
  41 \use_package cancel 0
  42 \use_package esint 1
  43 \use_package mathdots 1
  44 \use_package mathtools 0
  45 \use_package mhchem 1
  46 \use_package stackrel 0
  47 \use_package stmaryrd 0
  48 \use_package undertilde 0
  49 \cite_engine natbib
  50 \cite_engine_type authoryear
  51 \biblio_style plainnat
  52 \use_bibtopic false
  53 \use_indices false
  54 \paperorientation portrait
  55 \suppress_date false
  56 \justification true
  57 \use_refstyle 1
  58 \index Index
  59 \shortcut idx
  60 \color #008000
  61 \end_index
  62 \secnumdepth 3
  63 \tocdepth 3
  64 \paragraph_separation indent
  65 \paragraph_indentation default
  66 \is_math_indent 0
  67 \quotes_style english
  68 \papercolumns 1
  69 \papersides 1
  70 \paperpagestyle default
  71 \tracking_changes false
  72 \output_changes false
  73 \html_math_output 0
  74 \html_css_as_file 0
  75 \html_be_strict false
  76 \end_header
  77
  78 \begin_body
  79
  80 \begin_layout Standard
  81 \begin_inset ERT
  82 status open
  83
  84 \begin_layout Plain Layout
  85
  86 <<setup, include=FALSE>>=
  87 \end_layout
  88
  89 \begin_layout Plain Layout
  90
  91 render_sweave() # use Schunk, Sinput and Soutput environments defined by
  92  RJournal
  93 \end_layout
  94
  95 \begin_layout Plain Layout
  96
  97 set_header(highlight = '') # no need for
  98 \backslash
  99 usepackage{Sweave}
 100 \end_layout
 101
 102 \begin_layout Plain Layout
 103
 104 @
 105 \end_layout
 106
 107 \end_inset
 108
 109
 110 \end_layout
 111
 112 \begin_layout Title
 113 Capitalized Title Here
 114 \end_layout
 115
 116 \begin_layout Author
 117 by Author A and Author B
 118 \end_layout
 119
 120 \begin_layout Abstract
 121 An abstract of less than 150 words.
 122 \end_layout
 123
 124 \begin_layout Section
 125 Section title in sentence case
 126 \end_layout
 127
 128 \begin_layout Standard
 129 Write something here.
 130  A sample citation is
 131 \begin_inset CommandInset citation
 132 LatexCommand citet
 133 key "article-minimal"
 134 literal "true"
 135
 136 \end_inset
 137
 138 .
 139 \end_layout
 140
 141 \begin_layout Section
 142 R code chunks
 143 \end_layout
 144
 145 \begin_layout Standard
 146 Press
 147 \begin_inset Info
 148 type  "shortcut"
 149 arg   "ert-insert"
 150 \end_inset
 151
 152  and input R code chunks which will be compiled with the
 153 \series bold
 154 knitr
 155 \series default
 156  package (
 157 \begin_inset Flex URL
 158 status collapsed
 159
 160 \begin_layout Plain Layout
 161
 162 http://yihui.name/knitr/
 163 \end_layout
 164
 165 \end_inset
 166
 167 ).
 168 \end_layout
 169
 170 \begin_layout Standard
 171 \begin_inset ERT
 172 status open
 173
 174 \begin_layout Plain Layout
 175
 176 <<sample-chunk, echo=TRUE>>=
 177 \end_layout
 178
 179 \begin_layout Plain Layout
 180
 181 x=1:10
 182 \end_layout
 183
 184 \begin_layout Plain Layout
 185
 186 rev(x)
 187 \end_layout
 188
 189 \begin_layout Plain Layout
 190
 191 summary(x)
 192 \end_layout
 193
 194 \begin_layout Plain Layout
 195
 196 @
 197 \end_layout
 198
 199 \end_inset
 200
 201
 202 \end_layout
 203
 204 \begin_layout Standard
 205 You can also plot your data; see Figure
 206 \begin_inset CommandInset ref
 207 LatexCommand ref
 208 reference "fig:sample-figure"
 209
 210 \end_inset
 211
 212  for example.
 213 \end_layout
 214
 215 \begin_layout Standard
 216 \begin_inset Float figure
 217 placement tbph
 218 wide false
 219 sideways false
 220 status open
 221
 222 \begin_layout Plain Layout
 223 \begin_inset ERT
 224 status open
 225
 226 \begin_layout Plain Layout
 227
 228 <<sample-figure, fig.width=5, fig.height=3, out.width='.4
 229 \backslash
 230
 231 \backslash
 232 linewidth', fig.align='center', dev=c('pdf','postscript')>>=
 233 \end_layout
 234
 235 \begin_layout Plain Layout
 236
 237 par(mar = c(4,4,.1,.1))
 238 \end_layout
 239
 240 \begin_layout Plain Layout
 241
 242 plot(x, pch=19, col=1:10)
 243 \end_layout
 244
 245 \begin_layout Plain Layout
 246
 247 @
 248 \end_layout
 249
 250 \end_inset
 251
 252
 253 \end_layout
 254
 255 \begin_layout Plain Layout
 256 \begin_inset Caption Standard
 257
 258 \begin_layout Plain Layout
 259 A sample figure.
 260 \begin_inset CommandInset label
 261 LatexCommand label
 262 name "fig:sample-figure"
 263
 264 \end_inset
 265
 266
 267 \end_layout
 268
 269 \end_inset
 270
 271
 272 \end_layout
 273
 274 \end_inset
 275
 276
 277 \end_layout
 278
 279 \begin_layout Standard
 280 \begin_inset Note Note
 281 status open
 282
 283 \begin_layout Plain Layout
 284 When you insert a Bib\SpecialChar TeX
 285  bibliography here, do not use any bib styles.
 286  The R Journal has declared the style to be
 287 \begin_inset Quotes eld
 288 \end_inset
 289
 290 abbrvnat
 291 \begin_inset Quotes erd
 292 \end_inset
 293
 294 .
 295 \end_layout
 296
 297 \end_inset
 298
 299
 300 \end_layout
 301
 302 \begin_layout Standard
 303 \begin_inset CommandInset bibtex
 304 LatexCommand bibtex
 305 bibfiles "xampl"
 306
 307 \end_inset
 308
 309
 310 \end_layout
 311
 312 \begin_layout Address
 313 Author A
 314 \begin_inset Newline newline
 315 \end_inset
 316
 317 Press
 318 \begin_inset Info
 319 type  "shortcut"
 320 arg   "newline-insert newline"
 321 \end_inset
 322
 323  to input
 324 \begin_inset Newline newline
 325 \end_inset
 326
 327 address here
 328 \begin_inset Newline newline
 329 \end_inset
 330
 331
 332 \begin_inset Flex Email
 333 status open
 334
 335 \begin_layout Plain Layout
 336 author.a@email
 337 \end_layout
 338
 339 \end_inset
 340
 341
 342 \end_layout
 343
 344 \begin_layout Address
 345 Author B
 346 \begin_inset Newline newline
 347 \end_inset
 348
 349
 350 \begin_inset Flex Email
 351 status open
 352
 353 \begin_layout Plain Layout
 354 author.b@email
 355 \end_layout
 356
 357 \end_inset
 358
 359
 360 \end_layout
 361
 362 \end_body
 363 \end_document