lib/templates/JSS-article.lyx

   1 #LyX 2.2 created this file. For more info see http://www.lyx.org/
   2 \lyxformat 495
   3 \begin_document
   4 \begin_header
   5 \origin unavailable
   6 \textclass jss
   7 \begin_preamble
   8 %the following commands are used only for book or software reviews
   9
  10 %\Reviewer{Some Author\\University of Somewhere}
  11 %\Plainreviewer{Some Author}
  12
  13 %the following commands are used for articles, codesnippets, book reviews and software reviews
  14
  15 %publication information
  16 %do not use these commands before the article has been accepted
  17 %\Volume{00}
  18 %\Issue{0}
  19 %\Month{Month}
  20 %\Year{2000}
  21 %\Submitdate{2000-00-00}
  22 %\Acceptdate{2000-00-00}
  23
  24 %if you use Sweave,  include the following line (with % symbols):
  25 %% need no \usepackage{Sweave.sty}
  26 \end_preamble
  27 \options article
  28 \use_default_options false
  29 \maintain_unincluded_children false
  30 \language english
  31 \language_package default
  32 \inputencoding auto
  33 \fontencoding global
  34 \font_roman default
  35 \font_sans default
  36 \font_typewriter default
  37 \font_math auto
  38 \font_default_family default
  39 \use_non_tex_fonts false
  40 \font_sc false
  41 \font_osf false
  42 \font_sf_scale 100
  43 \font_tt_scale 100
  44 \graphics default
  45 \default_output_format pdf2
  46 \output_sync 0
  47 \bibtex_command default
  48 \index_command default
  49 \paperfontsize default
  50 \spacing single
  51 \use_hyperref false
  52 \papersize default
  53 \use_geometry false
  54 \use_package amsmath 0
  55 \use_package amssymb 0
  56 \use_package cancel 0
  57 \use_package esint 0
  58 \use_package mathdots 1
  59 \use_package mathtools 0
  60 \use_package mhchem 1
  61 \use_package stackrel 0
  62 \use_package stmaryrd 0
  63 \use_package undertilde 0
  64 \cite_engine natbib
  65 \cite_engine_type authoryear
  66 \biblio_style plainnat
  67 \use_bibtopic false
  68 \use_indices false
  69 \paperorientation portrait
  70 \suppress_date false
  71 \justification true
  72 \use_refstyle 0
  73 \index Index
  74 \shortcut idx
  75 \color #008000
  76 \end_index
  77 \secnumdepth 3
  78 \tocdepth 3
  79 \paragraph_separation indent
  80 \paragraph_indentation default
  81 \quotes_language english
  82 \papercolumns 1
  83 \papersides 1
  84 \paperpagestyle default
  85 \tracking_changes false
  86 \output_changes false
  87 \html_math_output 0
  88 \html_css_as_file 0
  89 \html_be_strict false
  90 \end_header
  91
  92 \begin_body
  93
  94 \begin_layout Standard
  95 \begin_inset Note Note
  96 status open
  97
  98 \begin_layout Plain Layout
  99 This is a template \SpecialChar LyX
 100  file for articles to be submitted to the Journal of
 101  Statistical Software (JSS).
 102  How to install the JSS \SpecialChar LaTeX
 103  class to your \SpecialChar LaTeX
 104  system is explained in
 105 \begin_inset Flex URL
 106 status open
 107
 108 \begin_layout Plain Layout
 109
 110 http://wiki.lyx.org/Layouts/JSS
 111 \end_layout
 112
 113 \end_inset
 114
 115 .
 116 \end_layout
 117
 118 \end_inset
 119
 120
 121 \begin_inset Note Note
 122 status open
 123
 124 \begin_layout Plain Layout
 125 To use the JSS codesnippet, bookreview or softwarereview styles, replace
 126  the option
 127 \begin_inset Quotes eld
 128 \end_inset
 129
 130 article
 131 \begin_inset Quotes erd
 132 \end_inset
 133
 134  in Document\SpecialChar menuseparator
 135 Settings\SpecialChar menuseparator
 136 Document Class\SpecialChar menuseparator
 137 Options with
 138 \begin_inset Quotes eld
 139 \end_inset
 140
 141 codesnippet
 142 \begin_inset Quotes erd
 143 \end_inset
 144
 145 ,
 146 \begin_inset Quotes eld
 147 \end_inset
 148
 149 bookreview
 150 \begin_inset Quotes erd
 151 \end_inset
 152
 153  or
 154 \begin_inset Quotes eld
 155 \end_inset
 156
 157 softwarereview
 158 \begin_inset Quotes erd
 159 \end_inset
 160
 161  and remove/uncomment the relevant parts in the \SpecialChar LaTeX
 162  Preamble.
 163
 164 \end_layout
 165
 166 \begin_layout Plain Layout
 167 If you want to use this JSS article style for a non-JSS article, replace
 168  the option
 169 \begin_inset Quotes eld
 170 \end_inset
 171
 172 article
 173 \begin_inset Quotes erd
 174 \end_inset
 175
 176  with
 177 \begin_inset Quotes eld
 178 \end_inset
 179
 180 nojss
 181 \begin_inset Quotes erd
 182 \end_inset
 183
 184 .
 185  This will suppress the JSS-specific parts of the layout.
 186 \end_layout
 187
 188 \begin_layout Plain Layout
 189 To include the JSS-specific parts of the layout, the article has to be processed
 190  with PDF, i.
 191 \begin_inset space \thinspace{}
 192 \end_inset
 193
 194 e.
 195 \begin_inset space ~
 196 \end_inset
 197
 198 you cannot process it with DVI or PS.
 199  However, if the option
 200 \begin_inset Quotes eld
 201 \end_inset
 202
 203 nojss
 204 \begin_inset Quotes erd
 205 \end_inset
 206
 207  is used, it can be processed with DVI or PS.
 208 \end_layout
 209
 210 \end_inset
 211
 212
 213 \end_layout
 214
 215 \begin_layout Title
 216 A Capitalized Title: Something about a Package
 217 \begin_inset Flex pkg
 218 status open
 219
 220 \begin_layout Plain Layout
 221 foo
 222 \end_layout
 223
 224 \end_inset
 225
 226
 227 \end_layout
 228
 229 \begin_layout Plain Title
 230 A Capitalized Title: Something about a Package foo
 231 \begin_inset Note Note
 232 status open
 233
 234 \begin_layout Plain Layout
 235 optional
 236 \end_layout
 237
 238 \end_inset
 239
 240
 241 \end_layout
 242
 243 \begin_layout Author
 244 Achim Zeileis
 245 \begin_inset Newline newline
 246 \end_inset
 247
 248 Universität Innsbruck
 249 \begin_inset ERT
 250 status collapsed
 251
 252 \begin_layout Plain Layout
 253
 254
 255 \backslash
 256 And
 257 \end_layout
 258
 259 \end_inset
 260
 261 Second Author
 262 \begin_inset Newline newline
 263 \end_inset
 264
 265 Plus Affiliation
 266 \end_layout
 267
 268 \begin_layout Plain Author
 269 Achim Zeileis, Second Author
 270 \begin_inset Note Note
 271 status open
 272
 273 \begin_layout Plain Layout
 274 optional
 275 \end_layout
 276
 277 \end_inset
 278
 279
 280 \end_layout
 281
 282 \begin_layout Short Title
 283 \begin_inset Flex pkg
 284 status open
 285
 286 \begin_layout Plain Layout
 287 foo
 288 \end_layout
 289
 290 \end_inset
 291
 292 : A Capitalized Title
 293 \begin_inset Note Note
 294 status collapsed
 295
 296 \begin_layout Plain Layout
 297 only if necessary
 298 \end_layout
 299
 300 \end_inset
 301
 302
 303 \end_layout
 304
 305 \begin_layout Abstract
 306 \noindent
 307 The abstract of the article.
 308  The abstract of the article.The abstract of the article.The abstract of the
 309  article.The abstract of the article.The abstract of the article.The abstract
 310  of the article.The abstract of the article.The abstract of the article.The
 311  abstract of the article.The abstract of the article.The abstract of the article.Th
 312 e abstract of the article.The abstract of the article.The abstract of the
 313  article.The abstract of the article.The abstract of the article.
 314 \end_layout
 315
 316 \begin_layout Keywords
 317 keywords, comma-separated, not capitalized,
 318 \begin_inset Flex proglang
 319 status open
 320
 321 \begin_layout Plain Layout
 322 Java
 323 \end_layout
 324
 325 \end_inset
 326
 327
 328 \begin_inset Note Note
 329 status open
 330
 331 \begin_layout Plain Layout
 332 at least one keyword must be supplied
 333 \end_layout
 334
 335 \end_inset
 336
 337
 338 \end_layout
 339
 340 \begin_layout Plain Keywords
 341 keyword 1, keyword 2, foo, R
 342 \end_layout
 343
 344 \begin_layout Address
 345 Achim Zeileis
 346 \begin_inset Newline newline
 347 \end_inset
 348
 349 Department of Statistics and Mathematics
 350 \begin_inset Newline newline
 351 \end_inset
 352
 353 Faculty of Economics and Statistics
 354 \begin_inset Newline newline
 355 \end_inset
 356
 357 Universität Innsbruck
 358 \begin_inset Newline newline
 359 \end_inset
 360
 361 6020 Innsbruck, Austria
 362 \begin_inset Newline newline
 363 \end_inset
 364
 365 E-mail:
 366 \begin_inset Flex E-mail
 367 status open
 368
 369 \begin_layout Plain Layout
 370
 371 Achim.Zeileis@uibk.ac.at
 372 \end_layout
 373
 374 \end_inset
 375
 376
 377 \begin_inset Newline newline
 378 \end_inset
 379
 380 URL:
 381 \begin_inset Flex URL
 382 status open
 383
 384 \begin_layout Plain Layout
 385
 386 http://eeecon.uibk.ac.at/~zeileis/
 387 \end_layout
 388
 389 \end_inset
 390
 391
 392 \begin_inset Note Note
 393 status open
 394
 395 \begin_layout Plain Layout
 396 It is also possible to add a telephone and fax number before the e-mail
 397  in the following format:
 398 \begin_inset Newline newline
 399 \end_inset
 400
 401 Telephone: +43/512/507-7103
 402 \end_layout
 403
 404 \begin_layout Plain Layout
 405 Fax: +43/512/507-2851
 406 \end_layout
 407
 408 \end_inset
 409
 410
 411 \end_layout
 412
 413 \begin_layout Section
 414 About package
 415 \begin_inset Flex pkg
 416 status open
 417
 418 \begin_layout Plain Layout
 419 foo
 420 \end_layout
 421
 422 \end_inset
 423
 424  in
 425 \begin_inset Flex proglang
 426 status open
 427
 428 \begin_layout Plain Layout
 429 R
 430 \end_layout
 431
 432 \end_inset
 433
 434
 435 \begin_inset Argument 1
 436 status open
 437
 438 \begin_layout Plain Layout
 439 About package foo in R
 440 \end_layout
 441
 442 \end_inset
 443
 444
 445 \begin_inset Note Note
 446 status collapsed
 447
 448 \begin_layout Plain Layout
 449 The short title provides bookmarks for PDF files
 450 \end_layout
 451
 452 \end_inset
 453
 454
 455 \end_layout
 456
 457 \begin_layout Standard
 458 The special JSS style commands related to software and mathematical formulas
 459  are written as follows in \SpecialChar LyX
 460 :
 461 \begin_inset Flex proglang
 462 status open
 463
 464 \begin_layout Plain Layout
 465 R
 466 \end_layout
 467
 468 \end_inset
 469
 470  or
 471 \begin_inset Flex proglang
 472 status open
 473
 474 \begin_layout Plain Layout
 475 R
 476 \end_layout
 477
 478 \end_inset
 479
 480  for the names of programming languages,
 481 \begin_inset Flex pkg
 482 status open
 483
 484 \begin_layout Plain Layout
 485 foo
 486 \end_layout
 487
 488 \end_inset
 489
 490  or
 491 \begin_inset Flex pkg
 492 status open
 493
 494 \begin_layout Plain Layout
 495 foo
 496 \end_layout
 497
 498 \end_inset
 499
 500  for software packages, and
 501 \begin_inset Flex code
 502 status open
 503
 504 \begin_layout Plain Layout
 505 some code
 506 \end_layout
 507
 508 \end_inset
 509
 510  or
 511 \begin_inset Flex pkg
 512 status open
 513
 514 \begin_layout Plain Layout
 515 some code
 516 \end_layout
 517
 518 \end_inset
 519
 520  for code;
 521 \begin_inset Formula $\E$
 522 \end_inset
 523
 524
 525 \begin_inset Note Note
 526 status collapsed
 527
 528 \begin_layout Plain Layout
 529 written as
 530 \backslash
 531 E
 532 \end_layout
 533
 534 \end_inset
 535
 536  for expectations,
 537 \begin_inset Formula $\VAR$
 538 \end_inset
 539
 540
 541 \begin_inset Note Note
 542 status collapsed
 543
 544 \begin_layout Plain Layout
 545 written as
 546 \backslash
 547 VAR
 548 \end_layout
 549
 550 \end_inset
 551
 552  for variances,
 553 \begin_inset Formula $\COV$
 554 \end_inset
 555
 556
 557 \begin_inset Note Note
 558 status collapsed
 559
 560 \begin_layout Plain Layout
 561 written as
 562 \backslash
 563 COV
 564 \end_layout
 565
 566 \end_inset
 567
 568  for covariances, and
 569 \begin_inset Formula $\Prob$
 570 \end_inset
 571
 572
 573 \begin_inset Note Note
 574 status collapsed
 575
 576 \begin_layout Plain Layout
 577 written as
 578 \backslash
 579 Prob
 580 \end_layout
 581
 582 \end_inset
 583
 584  for probabilities.
 585 \end_layout
 586
 587 \begin_layout Standard
 588 Writing several lines of code:
 589 \end_layout
 590
 591 \begin_layout Code Chunk
 592
 593 \end_layout
 594
 595 \begin_deeper
 596 \begin_layout Standard Code
 597 first line of code
 598 \end_layout
 599
 600 \begin_layout Standard Code
 601 second line of code
 602 \end_layout
 603
 604 \begin_layout Standard Code
 605 third line of code
 606 \end_layout
 607
 608 \end_deeper
 609 \begin_layout Standard
 610 Alternatively, you can distinguish between input and output code:
 611 \end_layout
 612
 613 \begin_layout Code Chunk
 614
 615 \end_layout
 616
 617 \begin_deeper
 618 \begin_layout Code Input
 619 first line of input code
 620 \end_layout
 621
 622 \begin_layout Code Input
 623 second line of input code
 624 \end_layout
 625
 626 \begin_layout Code Output
 627 first line of output code
 628 \end_layout
 629
 630 \begin_layout Code Output
 631 second line of output code
 632 \end_layout
 633
 634 \begin_layout Code Output
 635 third line of output code
 636 \end_layout
 637
 638 \end_deeper
 639 \begin_layout Section*
 640 Acknowledgments
 641 \end_layout
 642
 643 \begin_layout Standard
 644 Here you can write some acknowledgments.
 645 \end_layout
 646
 647 \begin_layout Section
 648 \start_of_appendix
 649 This is the first appendix section
 650 \end_layout
 651
 652 \begin_layout Subsection
 653 A subsection
 654 \end_layout
 655
 656 \begin_layout Subsubsection
 657 A subsubsection
 658 \end_layout
 659
 660 \begin_layout Standard
 661 some text
 662 \end_layout
 663
 664 \end_body
 665 \end_document