lib/templates/JSS-article.lyx

   1 #LyX 2.3 created this file. For more info see http://www.lyx.org/
   2 \lyxformat 544
   3 \begin_document
   4 \begin_header
   5 \save_transient_properties true
   6 \origin /systemlyxdir/templates/
   7 \textclass jss
   8 \begin_preamble
   9 %the following commands are used only for book or software reviews
  10
  11 %\Reviewer{Some Author\\University of Somewhere}
  12 %\Plainreviewer{Some Author}
  13
  14 %the following commands are used for articles, codesnippets, book reviews and software reviews
  15
  16 %publication information
  17 %do not use these commands before the article has been accepted
  18 %\Volume{00}
  19 %\Issue{0}
  20 %\Month{Month}
  21 %\Year{2000}
  22 %\Submitdate{2000-00-00}
  23 %\Acceptdate{2000-00-00}
  24
  25 %if you use Sweave,  include the following line (with % symbols):
  26 %% need no \usepackage{Sweave.sty}
  27 \end_preamble
  28 \options article
  29 \use_default_options false
  30 \maintain_unincluded_children false
  31 \language english
  32 \language_package default
  33 \inputencoding auto
  34 \fontencoding global
  35 \font_roman "default" "default"
  36 \font_sans "default" "default"
  37 \font_typewriter "default" "default"
  38 \font_math "auto" "auto"
  39 \font_default_family default
  40 \use_non_tex_fonts false
  41 \font_sc false
  42 \font_osf false
  43 \font_sf_scale 100 100
  44 \font_tt_scale 100 100
  45 \use_microtype false
  46 \use_dash_ligatures true
  47 \graphics default
  48 \default_output_format pdf2
  49 \output_sync 0
  50 \bibtex_command default
  51 \index_command default
  52 \paperfontsize default
  53 \spacing single
  54 \use_hyperref false
  55 \papersize default
  56 \use_geometry false
  57 \use_package amsmath 1
  58 \use_package amssymb 1
  59 \use_package cancel 1
  60 \use_package esint 1
  61 \use_package mathdots 1
  62 \use_package mathtools 1
  63 \use_package mhchem 1
  64 \use_package stackrel 1
  65 \use_package stmaryrd 1
  66 \use_package undertilde 1
  67 \cite_engine natbib
  68 \cite_engine_type authoryear
  69 \biblio_style plainnat
  70 \use_bibtopic false
  71 \use_indices false
  72 \paperorientation portrait
  73 \suppress_date false
  74 \justification true
  75 \use_refstyle 0
  76 \use_minted 0
  77 \index Index
  78 \shortcut idx
  79 \color #008000
  80 \end_index
  81 \secnumdepth 3
  82 \tocdepth 3
  83 \paragraph_separation indent
  84 \paragraph_indentation default
  85 \is_math_indent 0
  86 \math_numbering_side default
  87 \quotes_style english
  88 \dynamic_quotes 0
  89 \papercolumns 1
  90 \papersides 1
  91 \paperpagestyle default
  92 \tracking_changes false
  93 \output_changes false
  94 \html_math_output 0
  95 \html_css_as_file 0
  96 \html_be_strict false
  97 \end_header
  98
  99 \begin_body
 100
 101 \begin_layout Standard
 102 \begin_inset Note Note
 103 status open
 104
 105 \begin_layout Plain Layout
 106 This is a template \SpecialChar LyX
 107  file for articles to be submitted to the Journal of
 108  Statistical Software (JSS).
 109  How to install the JSS \SpecialChar LaTeX
 110  class to your \SpecialChar LaTeX
 111  system is explained in
 112 \begin_inset Flex URL
 113 status open
 114
 115 \begin_layout Plain Layout
 116
 117 https://wiki.lyx.org/Layouts/JSS
 118 \end_layout
 119
 120 \end_inset
 121
 122 .
 123 \end_layout
 124
 125 \end_inset
 126
 127
 128 \begin_inset Note Note
 129 status open
 130
 131 \begin_layout Plain Layout
 132 To use the JSS codesnippet, bookreview or softwarereview styles, replace
 133  the option
 134 \begin_inset Quotes eld
 135 \end_inset
 136
 137 article
 138 \begin_inset Quotes erd
 139 \end_inset
 140
 141  in Document\SpecialChar menuseparator
 142 Settings\SpecialChar menuseparator
 143 Document Class\SpecialChar menuseparator
 144 Options with
 145 \begin_inset Quotes eld
 146 \end_inset
 147
 148 codesnippet
 149 \begin_inset Quotes erd
 150 \end_inset
 151
 152 ,
 153 \begin_inset Quotes eld
 154 \end_inset
 155
 156 bookreview
 157 \begin_inset Quotes erd
 158 \end_inset
 159
 160  or
 161 \begin_inset Quotes eld
 162 \end_inset
 163
 164 softwarereview
 165 \begin_inset Quotes erd
 166 \end_inset
 167
 168  and remove/uncomment the relevant parts in the \SpecialChar LaTeX
 169  Preamble.
 170
 171 \end_layout
 172
 173 \begin_layout Plain Layout
 174 If you want to use this JSS article style for a non-JSS article, replace
 175  the option
 176 \begin_inset Quotes eld
 177 \end_inset
 178
 179 article
 180 \begin_inset Quotes erd
 181 \end_inset
 182
 183  with
 184 \begin_inset Quotes eld
 185 \end_inset
 186
 187 nojss
 188 \begin_inset Quotes erd
 189 \end_inset
 190
 191 .
 192  This will suppress the JSS-specific parts of the layout.
 193 \end_layout
 194
 195 \begin_layout Plain Layout
 196 To include the JSS-specific parts of the layout, the article has to be processed
 197  with PDF, i.
 198 \begin_inset space \thinspace{}
 199 \end_inset
 200
 201 e.
 202 \begin_inset space ~
 203 \end_inset
 204
 205 you cannot process it with DVI or PS.
 206  However, if the option
 207 \begin_inset Quotes eld
 208 \end_inset
 209
 210 nojss
 211 \begin_inset Quotes erd
 212 \end_inset
 213
 214  is used, it can be processed with DVI or PS.
 215 \end_layout
 216
 217 \end_inset
 218
 219
 220 \end_layout
 221
 222 \begin_layout Title
 223 A Capitalized Title: Something about a Package
 224 \begin_inset Flex Pkg
 225 status open
 226
 227 \begin_layout Plain Layout
 228 foo
 229 \end_layout
 230
 231 \end_inset
 232
 233
 234 \end_layout
 235
 236 \begin_layout Plain Title
 237 A Capitalized Title: Something about a Package foo
 238 \begin_inset Note Note
 239 status open
 240
 241 \begin_layout Plain Layout
 242 optional
 243 \end_layout
 244
 245 \end_inset
 246
 247
 248 \end_layout
 249
 250 \begin_layout Author
 251 Achim Zeileis
 252 \begin_inset Newline newline
 253 \end_inset
 254
 255 Universität Innsbruck
 256 \begin_inset ERT
 257 status collapsed
 258
 259 \begin_layout Plain Layout
 260
 261
 262 \backslash
 263 And
 264 \end_layout
 265
 266 \end_inset
 267
 268 Second Author
 269 \begin_inset Newline newline
 270 \end_inset
 271
 272 Plus Affiliation
 273 \end_layout
 274
 275 \begin_layout Plain Author
 276 Achim Zeileis, Second Author
 277 \begin_inset Note Note
 278 status open
 279
 280 \begin_layout Plain Layout
 281 optional
 282 \end_layout
 283
 284 \end_inset
 285
 286
 287 \end_layout
 288
 289 \begin_layout Short Title
 290 \begin_inset Flex Pkg
 291 status open
 292
 293 \begin_layout Plain Layout
 294 foo
 295 \end_layout
 296
 297 \end_inset
 298
 299 : A Capitalized Title
 300 \begin_inset Note Note
 301 status collapsed
 302
 303 \begin_layout Plain Layout
 304 only if necessary
 305 \end_layout
 306
 307 \end_inset
 308
 309
 310 \end_layout
 311
 312 \begin_layout Abstract
 313 \noindent
 314 The abstract of the article.
 315  The abstract of the article.The abstract of the article.The abstract of the
 316  article.The abstract of the article.The abstract of the article.The abstract
 317  of the article.The abstract of the article.The abstract of the article.The
 318  abstract of the article.The abstract of the article.The abstract of the article.Th
 319 e abstract of the article.The abstract of the article.The abstract of the
 320  article.The abstract of the article.The abstract of the article.
 321 \end_layout
 322
 323 \begin_layout Keywords
 324 keywords, comma-separated, not capitalized,
 325 \begin_inset Flex Proglang
 326 status open
 327
 328 \begin_layout Plain Layout
 329 Java
 330 \end_layout
 331
 332 \end_inset
 333
 334
 335 \begin_inset Note Note
 336 status open
 337
 338 \begin_layout Plain Layout
 339 at least one keyword must be supplied
 340 \end_layout
 341
 342 \end_inset
 343
 344
 345 \end_layout
 346
 347 \begin_layout Plain Keywords
 348 keyword 1, keyword 2, foo, R
 349 \end_layout
 350
 351 \begin_layout Address
 352 Achim Zeileis
 353 \begin_inset Newline newline
 354 \end_inset
 355
 356 Department of Statistics and Mathematics
 357 \begin_inset Newline newline
 358 \end_inset
 359
 360 Faculty of Economics and Statistics
 361 \begin_inset Newline newline
 362 \end_inset
 363
 364 Universität Innsbruck
 365 \begin_inset Newline newline
 366 \end_inset
 367
 368 6020 Innsbruck, Austria
 369 \begin_inset Newline newline
 370 \end_inset
 371
 372 E-mail:
 373 \begin_inset Flex E-mail
 374 status open
 375
 376 \begin_layout Plain Layout
 377
 378 Achim.Zeileis@uibk.ac.at
 379 \end_layout
 380
 381 \end_inset
 382
 383
 384 \begin_inset Newline newline
 385 \end_inset
 386
 387 URL:
 388 \begin_inset Flex URL
 389 status open
 390
 391 \begin_layout Plain Layout
 392
 393 http://eeecon.uibk.ac.at/~zeileis/
 394 \end_layout
 395
 396 \end_inset
 397
 398
 399 \begin_inset Note Note
 400 status open
 401
 402 \begin_layout Plain Layout
 403 It is also possible to add a telephone and fax number before the e-mail
 404  in the following format:
 405 \begin_inset Newline newline
 406 \end_inset
 407
 408 Telephone: +43/512/507-7103
 409 \end_layout
 410
 411 \begin_layout Plain Layout
 412 Fax: +43/512/507-2851
 413 \end_layout
 414
 415 \end_inset
 416
 417
 418 \end_layout
 419
 420 \begin_layout Section
 421 About package
 422 \begin_inset Flex Pkg
 423 status open
 424
 425 \begin_layout Plain Layout
 426 foo
 427 \end_layout
 428
 429 \end_inset
 430
 431  in
 432 \begin_inset Flex Proglang
 433 status open
 434
 435 \begin_layout Plain Layout
 436 R
 437 \end_layout
 438
 439 \end_inset
 440
 441
 442 \begin_inset Argument 1
 443 status open
 444
 445 \begin_layout Plain Layout
 446 About package foo in R
 447 \end_layout
 448
 449 \end_inset
 450
 451
 452 \begin_inset Note Note
 453 status collapsed
 454
 455 \begin_layout Plain Layout
 456 The short title provides bookmarks for PDF files
 457 \end_layout
 458
 459 \end_inset
 460
 461
 462 \end_layout
 463
 464 \begin_layout Standard
 465 The special JSS style commands related to software and mathematical formulas
 466  are written as follows in \SpecialChar LyX
 467 :
 468 \begin_inset Flex Proglang
 469 status open
 470
 471 \begin_layout Plain Layout
 472 R
 473 \end_layout
 474
 475 \end_inset
 476
 477  or
 478 \begin_inset Flex Proglang
 479 status open
 480
 481 \begin_layout Plain Layout
 482 R
 483 \end_layout
 484
 485 \end_inset
 486
 487  for the names of programming languages,
 488 \begin_inset Flex Pkg
 489 status open
 490
 491 \begin_layout Plain Layout
 492 foo
 493 \end_layout
 494
 495 \end_inset
 496
 497  or
 498 \begin_inset Flex Pkg
 499 status open
 500
 501 \begin_layout Plain Layout
 502 foo
 503 \end_layout
 504
 505 \end_inset
 506
 507  for software packages, and
 508 \begin_inset Flex Code
 509 status open
 510
 511 \begin_layout Plain Layout
 512 some code
 513 \end_layout
 514
 515 \end_inset
 516
 517  or
 518 \begin_inset Flex Pkg
 519 status open
 520
 521 \begin_layout Plain Layout
 522 some code
 523 \end_layout
 524
 525 \end_inset
 526
 527  for code;
 528 \begin_inset Formula $\E$
 529 \end_inset
 530
 531
 532 \begin_inset Note Note
 533 status collapsed
 534
 535 \begin_layout Plain Layout
 536 written as
 537 \backslash
 538 E
 539 \end_layout
 540
 541 \end_inset
 542
 543  for expectations,
 544 \begin_inset Formula $\VAR$
 545 \end_inset
 546
 547
 548 \begin_inset Note Note
 549 status collapsed
 550
 551 \begin_layout Plain Layout
 552 written as
 553 \backslash
 554 VAR
 555 \end_layout
 556
 557 \end_inset
 558
 559  for variances,
 560 \begin_inset Formula $\COV$
 561 \end_inset
 562
 563
 564 \begin_inset Note Note
 565 status collapsed
 566
 567 \begin_layout Plain Layout
 568 written as
 569 \backslash
 570 COV
 571 \end_layout
 572
 573 \end_inset
 574
 575  for covariances, and
 576 \begin_inset Formula $\Prob$
 577 \end_inset
 578
 579
 580 \begin_inset Note Note
 581 status collapsed
 582
 583 \begin_layout Plain Layout
 584 written as
 585 \backslash
 586 Prob
 587 \end_layout
 588
 589 \end_inset
 590
 591  for probabilities.
 592 \end_layout
 593
 594 \begin_layout Standard
 595 Writing several lines of code:
 596 \end_layout
 597
 598 \begin_layout Standard
 599 \begin_inset Flex Code Chunk
 600 status open
 601
 602 \begin_layout Code
 603
 604 first line of code
 605 \end_layout
 606
 607 \begin_layout Code
 608
 609 second line of code
 610 \end_layout
 611
 612 \begin_layout Code
 613
 614 third line of code
 615 \end_layout
 616
 617 \end_inset
 618
 619
 620 \end_layout
 621
 622 \begin_layout Standard
 623 Alternatively, you can distinguish between input and output code:
 624 \end_layout
 625
 626 \begin_layout Standard
 627 \begin_inset Flex Code Chunk
 628 status open
 629
 630 \begin_layout Code Input
 631
 632 first line of input code
 633 \end_layout
 634
 635 \begin_layout Code Input
 636
 637 second line of input code
 638 \end_layout
 639
 640 \begin_layout Code Output
 641
 642 first line of output code
 643 \end_layout
 644
 645 \begin_layout Code Output
 646
 647 second line of output code
 648 \end_layout
 649
 650 \begin_layout Code Output
 651
 652 third line of output code
 653 \end_layout
 654
 655 \end_inset
 656
 657
 658 \end_layout
 659
 660 \begin_layout Section*
 661 Acknowledgments
 662 \end_layout
 663
 664 \begin_layout Standard
 665 Here you can write some acknowledgments.
 666 \end_layout
 667
 668 \begin_layout Section
 669 \start_of_appendix
 670 This is the first appendix section
 671 \end_layout
 672
 673 \begin_layout Subsection
 674 A subsection
 675 \end_layout
 676
 677 \begin_layout Subsubsection
 678 A subsubsection
 679 \end_layout
 680
 681 \begin_layout Standard
 682 some text
 683 \end_layout
 684
 685 \end_body
 686 \end_document