lib/templates/JSS-article.lyx

   1 #LyX 2.3 created this file. For more info see http://www.lyx.org/
   2 \lyxformat 510
   3 \begin_document
   4 \begin_header
   5 \save_transient_properties true
   6 \origin /systemlyxdir/templates/
   7 \textclass jss
   8 \begin_preamble
   9 %the following commands are used only for book or software reviews
  10
  11 %\Reviewer{Some Author\\University of Somewhere}
  12 %\Plainreviewer{Some Author}
  13
  14 %the following commands are used for articles, codesnippets, book reviews and software reviews
  15
  16 %publication information
  17 %do not use these commands before the article has been accepted
  18 %\Volume{00}
  19 %\Issue{0}
  20 %\Month{Month}
  21 %\Year{2000}
  22 %\Submitdate{2000-00-00}
  23 %\Acceptdate{2000-00-00}
  24
  25 %if you use Sweave,  include the following line (with % symbols):
  26 %% need no \usepackage{Sweave.sty}
  27 \end_preamble
  28 \options article
  29 \use_default_options false
  30 \maintain_unincluded_children false
  31 \language english
  32 \language_package default
  33 \inputencoding auto
  34 \fontencoding global
  35 \font_roman "default" "default"
  36 \font_sans "default" "default"
  37 \font_typewriter "default" "default"
  38 \font_math "auto" "auto"
  39 \font_default_family default
  40 \use_non_tex_fonts false
  41 \font_sc false
  42 \font_osf false
  43 \font_sf_scale 100 100
  44 \font_tt_scale 100 100
  45 \use_microtype false
  46 \graphics default
  47 \default_output_format pdf2
  48 \output_sync 0
  49 \bibtex_command default
  50 \index_command default
  51 \paperfontsize default
  52 \spacing single
  53 \use_hyperref false
  54 \papersize default
  55 \use_geometry false
  56 \use_package amsmath 1
  57 \use_package amssymb 1
  58 \use_package cancel 1
  59 \use_package esint 1
  60 \use_package mathdots 1
  61 \use_package mathtools 1
  62 \use_package mhchem 1
  63 \use_package stackrel 1
  64 \use_package stmaryrd 1
  65 \use_package undertilde 1
  66 \cite_engine natbib
  67 \cite_engine_type authoryear
  68 \biblio_style plainnat
  69 \use_bibtopic false
  70 \use_indices false
  71 \paperorientation portrait
  72 \suppress_date false
  73 \justification true
  74 \use_refstyle 0
  75 \index Index
  76 \shortcut idx
  77 \color #008000
  78 \end_index
  79 \secnumdepth 3
  80 \tocdepth 3
  81 \paragraph_separation indent
  82 \paragraph_indentation default
  83 \quotes_language english
  84 \papercolumns 1
  85 \papersides 1
  86 \paperpagestyle default
  87 \tracking_changes false
  88 \output_changes false
  89 \html_math_output 0
  90 \html_css_as_file 0
  91 \html_be_strict false
  92 \end_header
  93
  94 \begin_body
  95
  96 \begin_layout Standard
  97 \begin_inset Note Note
  98 status open
  99
 100 \begin_layout Plain Layout
 101 This is a template \SpecialChar LyX
 102  file for articles to be submitted to the Journal of
 103  Statistical Software (JSS).
 104  How to install the JSS \SpecialChar LaTeX
 105  class to your \SpecialChar LaTeX
 106  system is explained in
 107 \begin_inset Flex URL
 108 status open
 109
 110 \begin_layout Plain Layout
 111
 112 http://wiki.lyx.org/Layouts/JSS
 113 \end_layout
 114
 115 \end_inset
 116
 117 .
 118 \end_layout
 119
 120 \end_inset
 121
 122
 123 \begin_inset Note Note
 124 status open
 125
 126 \begin_layout Plain Layout
 127 To use the JSS codesnippet, bookreview or softwarereview styles, replace
 128  the option
 129 \begin_inset Quotes eld
 130 \end_inset
 131
 132 article
 133 \begin_inset Quotes erd
 134 \end_inset
 135
 136  in Document\SpecialChar menuseparator
 137 Settings\SpecialChar menuseparator
 138 Document Class\SpecialChar menuseparator
 139 Options with
 140 \begin_inset Quotes eld
 141 \end_inset
 142
 143 codesnippet
 144 \begin_inset Quotes erd
 145 \end_inset
 146
 147 ,
 148 \begin_inset Quotes eld
 149 \end_inset
 150
 151 bookreview
 152 \begin_inset Quotes erd
 153 \end_inset
 154
 155  or
 156 \begin_inset Quotes eld
 157 \end_inset
 158
 159 softwarereview
 160 \begin_inset Quotes erd
 161 \end_inset
 162
 163  and remove/uncomment the relevant parts in the \SpecialChar LaTeX
 164  Preamble.
 165
 166 \end_layout
 167
 168 \begin_layout Plain Layout
 169 If you want to use this JSS article style for a non-JSS article, replace
 170  the option
 171 \begin_inset Quotes eld
 172 \end_inset
 173
 174 article
 175 \begin_inset Quotes erd
 176 \end_inset
 177
 178  with
 179 \begin_inset Quotes eld
 180 \end_inset
 181
 182 nojss
 183 \begin_inset Quotes erd
 184 \end_inset
 185
 186 .
 187  This will suppress the JSS-specific parts of the layout.
 188 \end_layout
 189
 190 \begin_layout Plain Layout
 191 To include the JSS-specific parts of the layout, the article has to be processed
 192  with PDF, i.
 193 \begin_inset space \thinspace{}
 194 \end_inset
 195
 196 e.
 197 \begin_inset space ~
 198 \end_inset
 199
 200 you cannot process it with DVI or PS.
 201  However, if the option
 202 \begin_inset Quotes eld
 203 \end_inset
 204
 205 nojss
 206 \begin_inset Quotes erd
 207 \end_inset
 208
 209  is used, it can be processed with DVI or PS.
 210 \end_layout
 211
 212 \end_inset
 213
 214
 215 \end_layout
 216
 217 \begin_layout Title
 218 A Capitalized Title: Something about a Package
 219 \begin_inset Flex Pkg
 220 status open
 221
 222 \begin_layout Plain Layout
 223 foo
 224 \end_layout
 225
 226 \end_inset
 227
 228
 229 \end_layout
 230
 231 \begin_layout Plain Title
 232 A Capitalized Title: Something about a Package foo
 233 \begin_inset Note Note
 234 status open
 235
 236 \begin_layout Plain Layout
 237 optional
 238 \end_layout
 239
 240 \end_inset
 241
 242
 243 \end_layout
 244
 245 \begin_layout Author
 246 Achim Zeileis
 247 \begin_inset Newline newline
 248 \end_inset
 249
 250 Universität Innsbruck
 251 \begin_inset ERT
 252 status collapsed
 253
 254 \begin_layout Plain Layout
 255
 256
 257 \backslash
 258 And
 259 \end_layout
 260
 261 \end_inset
 262
 263 Second Author
 264 \begin_inset Newline newline
 265 \end_inset
 266
 267 Plus Affiliation
 268 \end_layout
 269
 270 \begin_layout Plain Author
 271 Achim Zeileis, Second Author
 272 \begin_inset Note Note
 273 status open
 274
 275 \begin_layout Plain Layout
 276 optional
 277 \end_layout
 278
 279 \end_inset
 280
 281
 282 \end_layout
 283
 284 \begin_layout Short Title
 285 \begin_inset Flex Pkg
 286 status open
 287
 288 \begin_layout Plain Layout
 289 foo
 290 \end_layout
 291
 292 \end_inset
 293
 294 : A Capitalized Title
 295 \begin_inset Note Note
 296 status collapsed
 297
 298 \begin_layout Plain Layout
 299 only if necessary
 300 \end_layout
 301
 302 \end_inset
 303
 304
 305 \end_layout
 306
 307 \begin_layout Abstract
 308 \noindent
 309 The abstract of the article.
 310  The abstract of the article.The abstract of the article.The abstract of the
 311  article.The abstract of the article.The abstract of the article.The abstract
 312  of the article.The abstract of the article.The abstract of the article.The
 313  abstract of the article.The abstract of the article.The abstract of the article.Th
 314 e abstract of the article.The abstract of the article.The abstract of the
 315  article.The abstract of the article.The abstract of the article.
 316 \end_layout
 317
 318 \begin_layout Keywords
 319 keywords, comma-separated, not capitalized,
 320 \begin_inset Flex Proglang
 321 status open
 322
 323 \begin_layout Plain Layout
 324 Java
 325 \end_layout
 326
 327 \end_inset
 328
 329
 330 \begin_inset Note Note
 331 status open
 332
 333 \begin_layout Plain Layout
 334 at least one keyword must be supplied
 335 \end_layout
 336
 337 \end_inset
 338
 339
 340 \end_layout
 341
 342 \begin_layout Plain Keywords
 343 keyword 1, keyword 2, foo, R
 344 \end_layout
 345
 346 \begin_layout Address
 347 Achim Zeileis
 348 \begin_inset Newline newline
 349 \end_inset
 350
 351 Department of Statistics and Mathematics
 352 \begin_inset Newline newline
 353 \end_inset
 354
 355 Faculty of Economics and Statistics
 356 \begin_inset Newline newline
 357 \end_inset
 358
 359 Universität Innsbruck
 360 \begin_inset Newline newline
 361 \end_inset
 362
 363 6020 Innsbruck, Austria
 364 \begin_inset Newline newline
 365 \end_inset
 366
 367 E-mail:
 368 \begin_inset Flex E-mail
 369 status open
 370
 371 \begin_layout Plain Layout
 372
 373 Achim.Zeileis@uibk.ac.at
 374 \end_layout
 375
 376 \end_inset
 377
 378
 379 \begin_inset Newline newline
 380 \end_inset
 381
 382 URL:
 383 \begin_inset Flex URL
 384 status open
 385
 386 \begin_layout Plain Layout
 387
 388 http://eeecon.uibk.ac.at/~zeileis/
 389 \end_layout
 390
 391 \end_inset
 392
 393
 394 \begin_inset Note Note
 395 status open
 396
 397 \begin_layout Plain Layout
 398 It is also possible to add a telephone and fax number before the e-mail
 399  in the following format:
 400 \begin_inset Newline newline
 401 \end_inset
 402
 403 Telephone: +43/512/507-7103
 404 \end_layout
 405
 406 \begin_layout Plain Layout
 407 Fax: +43/512/507-2851
 408 \end_layout
 409
 410 \end_inset
 411
 412
 413 \end_layout
 414
 415 \begin_layout Section
 416 About package
 417 \begin_inset Flex Pkg
 418 status open
 419
 420 \begin_layout Plain Layout
 421 foo
 422 \end_layout
 423
 424 \end_inset
 425
 426  in
 427 \begin_inset Flex Proglang
 428 status open
 429
 430 \begin_layout Plain Layout
 431 R
 432 \end_layout
 433
 434 \end_inset
 435
 436
 437 \begin_inset Argument 1
 438 status open
 439
 440 \begin_layout Plain Layout
 441 About package foo in R
 442 \end_layout
 443
 444 \end_inset
 445
 446
 447 \begin_inset Note Note
 448 status collapsed
 449
 450 \begin_layout Plain Layout
 451 The short title provides bookmarks for PDF files
 452 \end_layout
 453
 454 \end_inset
 455
 456
 457 \end_layout
 458
 459 \begin_layout Standard
 460 The special JSS style commands related to software and mathematical formulas
 461  are written as follows in \SpecialChar LyX
 462 :
 463 \begin_inset Flex Proglang
 464 status open
 465
 466 \begin_layout Plain Layout
 467 R
 468 \end_layout
 469
 470 \end_inset
 471
 472  or
 473 \begin_inset Flex Proglang
 474 status open
 475
 476 \begin_layout Plain Layout
 477 R
 478 \end_layout
 479
 480 \end_inset
 481
 482  for the names of programming languages,
 483 \begin_inset Flex Pkg
 484 status open
 485
 486 \begin_layout Plain Layout
 487 foo
 488 \end_layout
 489
 490 \end_inset
 491
 492  or
 493 \begin_inset Flex Pkg
 494 status open
 495
 496 \begin_layout Plain Layout
 497 foo
 498 \end_layout
 499
 500 \end_inset
 501
 502  for software packages, and
 503 \begin_inset Flex Code
 504 status open
 505
 506 \begin_layout Plain Layout
 507 some code
 508 \end_layout
 509
 510 \end_inset
 511
 512  or
 513 \begin_inset Flex Pkg
 514 status open
 515
 516 \begin_layout Plain Layout
 517 some code
 518 \end_layout
 519
 520 \end_inset
 521
 522  for code;
 523 \begin_inset Formula $\E$
 524 \end_inset
 525
 526
 527 \begin_inset Note Note
 528 status collapsed
 529
 530 \begin_layout Plain Layout
 531 written as
 532 \backslash
 533 E
 534 \end_layout
 535
 536 \end_inset
 537
 538  for expectations,
 539 \begin_inset Formula $\VAR$
 540 \end_inset
 541
 542
 543 \begin_inset Note Note
 544 status collapsed
 545
 546 \begin_layout Plain Layout
 547 written as
 548 \backslash
 549 VAR
 550 \end_layout
 551
 552 \end_inset
 553
 554  for variances,
 555 \begin_inset Formula $\COV$
 556 \end_inset
 557
 558
 559 \begin_inset Note Note
 560 status collapsed
 561
 562 \begin_layout Plain Layout
 563 written as
 564 \backslash
 565 COV
 566 \end_layout
 567
 568 \end_inset
 569
 570  for covariances, and
 571 \begin_inset Formula $\Prob$
 572 \end_inset
 573
 574
 575 \begin_inset Note Note
 576 status collapsed
 577
 578 \begin_layout Plain Layout
 579 written as
 580 \backslash
 581 Prob
 582 \end_layout
 583
 584 \end_inset
 585
 586  for probabilities.
 587 \end_layout
 588
 589 \begin_layout Standard
 590 Writing several lines of code:
 591 \end_layout
 592
 593 \begin_layout Standard
 594 \begin_inset Flex Code Chunk
 595 status open
 596
 597 \begin_layout Code
 598
 599 first line of code
 600 \end_layout
 601
 602 \begin_layout Code
 603
 604 second line of code
 605 \end_layout
 606
 607 \begin_layout Code
 608
 609 third line of code
 610 \end_layout
 611
 612 \end_inset
 613
 614
 615 \end_layout
 616
 617 \begin_layout Standard
 618 Alternatively, you can distinguish between input and output code:
 619 \end_layout
 620
 621 \begin_layout Standard
 622 \begin_inset Flex Code Chunk
 623 status open
 624
 625 \begin_layout Code Input
 626
 627 first line of input code
 628 \end_layout
 629
 630 \begin_layout Code Input
 631
 632 second line of input code
 633 \end_layout
 634
 635 \begin_layout Code Output
 636
 637 first line of output code
 638 \end_layout
 639
 640 \begin_layout Code Output
 641
 642 second line of output code
 643 \end_layout
 644
 645 \begin_layout Code Output
 646
 647 third line of output code
 648 \end_layout
 649
 650 \end_inset
 651
 652
 653 \end_layout
 654
 655 \begin_layout Section*
 656 Acknowledgments
 657 \end_layout
 658
 659 \begin_layout Standard
 660 Here you can write some acknowledgments.
 661 \end_layout
 662
 663 \begin_layout Section
 664 \start_of_appendix
 665 This is the first appendix section
 666 \end_layout
 667
 668 \begin_layout Subsection
 669 A subsection
 670 \end_layout
 671
 672 \begin_layout Subsubsection
 673 A subsubsection
 674 \end_layout
 675
 676 \begin_layout Standard
 677 some text
 678 \end_layout
 679
 680 \end_body
 681 \end_document