lib/templates/JSS-article.lyx

   1 #LyX 2.3 created this file. For more info see http://www.lyx.org/
   2 \lyxformat 541
   3 \begin_document
   4 \begin_header
   5 \save_transient_properties true
   6 \origin /systemlyxdir/templates/
   7 \textclass jss
   8 \begin_preamble
   9 %the following commands are used only for book or software reviews
  10
  11 %\Reviewer{Some Author\\University of Somewhere}
  12 %\Plainreviewer{Some Author}
  13
  14 %the following commands are used for articles, codesnippets, book reviews and software reviews
  15
  16 %publication information
  17 %do not use these commands before the article has been accepted
  18 %\Volume{00}
  19 %\Issue{0}
  20 %\Month{Month}
  21 %\Year{2000}
  22 %\Submitdate{2000-00-00}
  23 %\Acceptdate{2000-00-00}
  24
  25 %if you use Sweave,  include the following line (with % symbols):
  26 %% need no \usepackage{Sweave.sty}
  27 \end_preamble
  28 \options article
  29 \use_default_options false
  30 \maintain_unincluded_children false
  31 \language english
  32 \language_package default
  33 \inputencoding auto
  34 \fontencoding global
  35 \font_roman "default" "default"
  36 \font_sans "default" "default"
  37 \font_typewriter "default" "default"
  38 \font_math "auto" "auto"
  39 \font_default_family default
  40 \use_non_tex_fonts false
  41 \font_sc false
  42 \font_osf false
  43 \font_sf_scale 100 100
  44 \font_tt_scale 100 100
  45 \use_microtype false
  46 \use_dash_ligatures true
  47 \graphics default
  48 \default_output_format pdf2
  49 \output_sync 0
  50 \bibtex_command default
  51 \index_command default
  52 \paperfontsize default
  53 \spacing single
  54 \use_hyperref false
  55 \papersize default
  56 \use_geometry false
  57 \use_package amsmath 1
  58 \use_package amssymb 1
  59 \use_package cancel 1
  60 \use_package esint 1
  61 \use_package mathdots 1
  62 \use_package mathtools 1
  63 \use_package mhchem 1
  64 \use_package stackrel 1
  65 \use_package stmaryrd 1
  66 \use_package undertilde 1
  67 \cite_engine natbib
  68 \cite_engine_type authoryear
  69 \biblio_style plainnat
  70 \use_bibtopic false
  71 \use_indices false
  72 \paperorientation portrait
  73 \suppress_date false
  74 \justification true
  75 \use_refstyle 0
  76 \index Index
  77 \shortcut idx
  78 \color #008000
  79 \end_index
  80 \secnumdepth 3
  81 \tocdepth 3
  82 \paragraph_separation indent
  83 \paragraph_indentation default
  84 \is_math_indent 0
  85 \quotes_style english
  86 \papercolumns 1
  87 \papersides 1
  88 \paperpagestyle default
  89 \tracking_changes false
  90 \output_changes false
  91 \html_math_output 0
  92 \html_css_as_file 0
  93 \html_be_strict false
  94 \end_header
  95
  96 \begin_body
  97
  98 \begin_layout Standard
  99 \begin_inset Note Note
 100 status open
 101
 102 \begin_layout Plain Layout
 103 This is a template \SpecialChar LyX
 104  file for articles to be submitted to the Journal of
 105  Statistical Software (JSS).
 106  How to install the JSS \SpecialChar LaTeX
 107  class to your \SpecialChar LaTeX
 108  system is explained in
 109 \begin_inset Flex URL
 110 status open
 111
 112 \begin_layout Plain Layout
 113
 114 http://wiki.lyx.org/Layouts/JSS
 115 \end_layout
 116
 117 \end_inset
 118
 119 .
 120 \end_layout
 121
 122 \end_inset
 123
 124
 125 \begin_inset Note Note
 126 status open
 127
 128 \begin_layout Plain Layout
 129 To use the JSS codesnippet, bookreview or softwarereview styles, replace
 130  the option
 131 \begin_inset Quotes eld
 132 \end_inset
 133
 134 article
 135 \begin_inset Quotes erd
 136 \end_inset
 137
 138  in Document\SpecialChar menuseparator
 139 Settings\SpecialChar menuseparator
 140 Document Class\SpecialChar menuseparator
 141 Options with
 142 \begin_inset Quotes eld
 143 \end_inset
 144
 145 codesnippet
 146 \begin_inset Quotes erd
 147 \end_inset
 148
 149 ,
 150 \begin_inset Quotes eld
 151 \end_inset
 152
 153 bookreview
 154 \begin_inset Quotes erd
 155 \end_inset
 156
 157  or
 158 \begin_inset Quotes eld
 159 \end_inset
 160
 161 softwarereview
 162 \begin_inset Quotes erd
 163 \end_inset
 164
 165  and remove/uncomment the relevant parts in the \SpecialChar LaTeX
 166  Preamble.
 167
 168 \end_layout
 169
 170 \begin_layout Plain Layout
 171 If you want to use this JSS article style for a non-JSS article, replace
 172  the option
 173 \begin_inset Quotes eld
 174 \end_inset
 175
 176 article
 177 \begin_inset Quotes erd
 178 \end_inset
 179
 180  with
 181 \begin_inset Quotes eld
 182 \end_inset
 183
 184 nojss
 185 \begin_inset Quotes erd
 186 \end_inset
 187
 188 .
 189  This will suppress the JSS-specific parts of the layout.
 190 \end_layout
 191
 192 \begin_layout Plain Layout
 193 To include the JSS-specific parts of the layout, the article has to be processed
 194  with PDF, i.
 195 \begin_inset space \thinspace{}
 196 \end_inset
 197
 198 e.
 199 \begin_inset space ~
 200 \end_inset
 201
 202 you cannot process it with DVI or PS.
 203  However, if the option
 204 \begin_inset Quotes eld
 205 \end_inset
 206
 207 nojss
 208 \begin_inset Quotes erd
 209 \end_inset
 210
 211  is used, it can be processed with DVI or PS.
 212 \end_layout
 213
 214 \end_inset
 215
 216
 217 \end_layout
 218
 219 \begin_layout Title
 220 A Capitalized Title: Something about a Package
 221 \begin_inset Flex Pkg
 222 status open
 223
 224 \begin_layout Plain Layout
 225 foo
 226 \end_layout
 227
 228 \end_inset
 229
 230
 231 \end_layout
 232
 233 \begin_layout Plain Title
 234 A Capitalized Title: Something about a Package foo
 235 \begin_inset Note Note
 236 status open
 237
 238 \begin_layout Plain Layout
 239 optional
 240 \end_layout
 241
 242 \end_inset
 243
 244
 245 \end_layout
 246
 247 \begin_layout Author
 248 Achim Zeileis
 249 \begin_inset Newline newline
 250 \end_inset
 251
 252 Universität Innsbruck
 253 \begin_inset ERT
 254 status collapsed
 255
 256 \begin_layout Plain Layout
 257
 258
 259 \backslash
 260 And
 261 \end_layout
 262
 263 \end_inset
 264
 265 Second Author
 266 \begin_inset Newline newline
 267 \end_inset
 268
 269 Plus Affiliation
 270 \end_layout
 271
 272 \begin_layout Plain Author
 273 Achim Zeileis, Second Author
 274 \begin_inset Note Note
 275 status open
 276
 277 \begin_layout Plain Layout
 278 optional
 279 \end_layout
 280
 281 \end_inset
 282
 283
 284 \end_layout
 285
 286 \begin_layout Short Title
 287 \begin_inset Flex Pkg
 288 status open
 289
 290 \begin_layout Plain Layout
 291 foo
 292 \end_layout
 293
 294 \end_inset
 295
 296 : A Capitalized Title
 297 \begin_inset Note Note
 298 status collapsed
 299
 300 \begin_layout Plain Layout
 301 only if necessary
 302 \end_layout
 303
 304 \end_inset
 305
 306
 307 \end_layout
 308
 309 \begin_layout Abstract
 310 \noindent
 311 The abstract of the article.
 312  The abstract of the article.The abstract of the article.The abstract of the
 313  article.The abstract of the article.The abstract of the article.The abstract
 314  of the article.The abstract of the article.The abstract of the article.The
 315  abstract of the article.The abstract of the article.The abstract of the article.Th
 316 e abstract of the article.The abstract of the article.The abstract of the
 317  article.The abstract of the article.The abstract of the article.
 318 \end_layout
 319
 320 \begin_layout Keywords
 321 keywords, comma-separated, not capitalized,
 322 \begin_inset Flex Proglang
 323 status open
 324
 325 \begin_layout Plain Layout
 326 Java
 327 \end_layout
 328
 329 \end_inset
 330
 331
 332 \begin_inset Note Note
 333 status open
 334
 335 \begin_layout Plain Layout
 336 at least one keyword must be supplied
 337 \end_layout
 338
 339 \end_inset
 340
 341
 342 \end_layout
 343
 344 \begin_layout Plain Keywords
 345 keyword 1, keyword 2, foo, R
 346 \end_layout
 347
 348 \begin_layout Address
 349 Achim Zeileis
 350 \begin_inset Newline newline
 351 \end_inset
 352
 353 Department of Statistics and Mathematics
 354 \begin_inset Newline newline
 355 \end_inset
 356
 357 Faculty of Economics and Statistics
 358 \begin_inset Newline newline
 359 \end_inset
 360
 361 Universität Innsbruck
 362 \begin_inset Newline newline
 363 \end_inset
 364
 365 6020 Innsbruck, Austria
 366 \begin_inset Newline newline
 367 \end_inset
 368
 369 E-mail:
 370 \begin_inset Flex E-mail
 371 status open
 372
 373 \begin_layout Plain Layout
 374
 375 Achim.Zeileis@uibk.ac.at
 376 \end_layout
 377
 378 \end_inset
 379
 380
 381 \begin_inset Newline newline
 382 \end_inset
 383
 384 URL:
 385 \begin_inset Flex URL
 386 status open
 387
 388 \begin_layout Plain Layout
 389
 390 http://eeecon.uibk.ac.at/~zeileis/
 391 \end_layout
 392
 393 \end_inset
 394
 395
 396 \begin_inset Note Note
 397 status open
 398
 399 \begin_layout Plain Layout
 400 It is also possible to add a telephone and fax number before the e-mail
 401  in the following format:
 402 \begin_inset Newline newline
 403 \end_inset
 404
 405 Telephone: +43/512/507-7103
 406 \end_layout
 407
 408 \begin_layout Plain Layout
 409 Fax: +43/512/507-2851
 410 \end_layout
 411
 412 \end_inset
 413
 414
 415 \end_layout
 416
 417 \begin_layout Section
 418 About package
 419 \begin_inset Flex Pkg
 420 status open
 421
 422 \begin_layout Plain Layout
 423 foo
 424 \end_layout
 425
 426 \end_inset
 427
 428  in
 429 \begin_inset Flex Proglang
 430 status open
 431
 432 \begin_layout Plain Layout
 433 R
 434 \end_layout
 435
 436 \end_inset
 437
 438
 439 \begin_inset Argument 1
 440 status open
 441
 442 \begin_layout Plain Layout
 443 About package foo in R
 444 \end_layout
 445
 446 \end_inset
 447
 448
 449 \begin_inset Note Note
 450 status collapsed
 451
 452 \begin_layout Plain Layout
 453 The short title provides bookmarks for PDF files
 454 \end_layout
 455
 456 \end_inset
 457
 458
 459 \end_layout
 460
 461 \begin_layout Standard
 462 The special JSS style commands related to software and mathematical formulas
 463  are written as follows in \SpecialChar LyX
 464 :
 465 \begin_inset Flex Proglang
 466 status open
 467
 468 \begin_layout Plain Layout
 469 R
 470 \end_layout
 471
 472 \end_inset
 473
 474  or
 475 \begin_inset Flex Proglang
 476 status open
 477
 478 \begin_layout Plain Layout
 479 R
 480 \end_layout
 481
 482 \end_inset
 483
 484  for the names of programming languages,
 485 \begin_inset Flex Pkg
 486 status open
 487
 488 \begin_layout Plain Layout
 489 foo
 490 \end_layout
 491
 492 \end_inset
 493
 494  or
 495 \begin_inset Flex Pkg
 496 status open
 497
 498 \begin_layout Plain Layout
 499 foo
 500 \end_layout
 501
 502 \end_inset
 503
 504  for software packages, and
 505 \begin_inset Flex Code
 506 status open
 507
 508 \begin_layout Plain Layout
 509 some code
 510 \end_layout
 511
 512 \end_inset
 513
 514  or
 515 \begin_inset Flex Pkg
 516 status open
 517
 518 \begin_layout Plain Layout
 519 some code
 520 \end_layout
 521
 522 \end_inset
 523
 524  for code;
 525 \begin_inset Formula $\E$
 526 \end_inset
 527
 528
 529 \begin_inset Note Note
 530 status collapsed
 531
 532 \begin_layout Plain Layout
 533 written as
 534 \backslash
 535 E
 536 \end_layout
 537
 538 \end_inset
 539
 540  for expectations,
 541 \begin_inset Formula $\VAR$
 542 \end_inset
 543
 544
 545 \begin_inset Note Note
 546 status collapsed
 547
 548 \begin_layout Plain Layout
 549 written as
 550 \backslash
 551 VAR
 552 \end_layout
 553
 554 \end_inset
 555
 556  for variances,
 557 \begin_inset Formula $\COV$
 558 \end_inset
 559
 560
 561 \begin_inset Note Note
 562 status collapsed
 563
 564 \begin_layout Plain Layout
 565 written as
 566 \backslash
 567 COV
 568 \end_layout
 569
 570 \end_inset
 571
 572  for covariances, and
 573 \begin_inset Formula $\Prob$
 574 \end_inset
 575
 576
 577 \begin_inset Note Note
 578 status collapsed
 579
 580 \begin_layout Plain Layout
 581 written as
 582 \backslash
 583 Prob
 584 \end_layout
 585
 586 \end_inset
 587
 588  for probabilities.
 589 \end_layout
 590
 591 \begin_layout Standard
 592 Writing several lines of code:
 593 \end_layout
 594
 595 \begin_layout Standard
 596 \begin_inset Flex Code Chunk
 597 status open
 598
 599 \begin_layout Code
 600
 601 first line of code
 602 \end_layout
 603
 604 \begin_layout Code
 605
 606 second line of code
 607 \end_layout
 608
 609 \begin_layout Code
 610
 611 third line of code
 612 \end_layout
 613
 614 \end_inset
 615
 616
 617 \end_layout
 618
 619 \begin_layout Standard
 620 Alternatively, you can distinguish between input and output code:
 621 \end_layout
 622
 623 \begin_layout Standard
 624 \begin_inset Flex Code Chunk
 625 status open
 626
 627 \begin_layout Code Input
 628
 629 first line of input code
 630 \end_layout
 631
 632 \begin_layout Code Input
 633
 634 second line of input code
 635 \end_layout
 636
 637 \begin_layout Code Output
 638
 639 first line of output code
 640 \end_layout
 641
 642 \begin_layout Code Output
 643
 644 second line of output code
 645 \end_layout
 646
 647 \begin_layout Code Output
 648
 649 third line of output code
 650 \end_layout
 651
 652 \end_inset
 653
 654
 655 \end_layout
 656
 657 \begin_layout Section*
 658 Acknowledgments
 659 \end_layout
 660
 661 \begin_layout Standard
 662 Here you can write some acknowledgments.
 663 \end_layout
 664
 665 \begin_layout Section
 666 \start_of_appendix
 667 This is the first appendix section
 668 \end_layout
 669
 670 \begin_layout Subsection
 671 A subsection
 672 \end_layout
 673
 674 \begin_layout Subsubsection
 675 A subsubsection
 676 \end_layout
 677
 678 \begin_layout Standard
 679 some text
 680 \end_layout
 681
 682 \end_body
 683 \end_document