lib/templates/JSS-article.lyx

   1 #LyX 2.2 created this file. For more info see http://www.lyx.org/
   2 \lyxformat 493
   3 \begin_document
   4 \begin_header
   5 \origin unavailable
   6 \textclass jss
   7 \begin_preamble
   8 %the following commands are used only for book or software reviews
   9
  10 %\Reviewer{Some Author\\University of Somewhere}
  11 %\Plainreviewer{Some Author}
  12
  13 %the following commands are used for articles, codesnippets, book reviews and software reviews
  14
  15 %publication information
  16 %do not use these commands before the article has been accepted
  17 %\Volume{00}
  18 %\Issue{0}
  19 %\Month{Month}
  20 %\Year{2000}
  21 %\Submitdate{2000-00-00}
  22 %\Acceptdate{2000-00-00}
  23
  24 %if you use Sweave,  include the following line (with % symbols):
  25 %% need no \usepackage{Sweave.sty}
  26 \end_preamble
  27 \options article
  28 \use_default_options false
  29 \maintain_unincluded_children false
  30 \language english
  31 \language_package default
  32 \inputencoding auto
  33 \fontencoding global
  34 \font_roman default
  35 \font_sans default
  36 \font_typewriter default
  37 \font_math auto
  38 \font_default_family default
  39 \use_non_tex_fonts false
  40 \font_sc false
  41 \font_osf false
  42 \font_sf_scale 100
  43 \font_tt_scale 100
  44 \graphics default
  45 \default_output_format pdf2
  46 \output_sync 0
  47 \bibtex_command default
  48 \index_command default
  49 \paperfontsize default
  50 \spacing single
  51 \use_hyperref false
  52 \papersize default
  53 \use_geometry false
  54 \use_package amsmath 0
  55 \use_package amssymb 0
  56 \use_package cancel 0
  57 \use_package esint 0
  58 \use_package mathdots 1
  59 \use_package mathtools 0
  60 \use_package mhchem 1
  61 \use_package stackrel 0
  62 \use_package stmaryrd 0
  63 \use_package undertilde 0
  64 \cite_engine natbib
  65 \cite_engine_type authoryear
  66 \biblio_style plainnat
  67 \use_bibtopic false
  68 \use_indices false
  69 \paperorientation portrait
  70 \suppress_date false
  71 \justification true
  72 \use_refstyle 0
  73 \index Index
  74 \shortcut idx
  75 \color #008000
  76 \end_index
  77 \secnumdepth 3
  78 \tocdepth 3
  79 \paragraph_separation indent
  80 \paragraph_indentation default
  81 \quotes_language english
  82 \papercolumns 1
  83 \papersides 1
  84 \paperpagestyle default
  85 \tracking_changes false
  86 \output_changes false
  87 \html_math_output 0
  88 \html_css_as_file 0
  89 \html_be_strict false
  90 \end_header
  91
  92 \begin_body
  93
  94 \begin_layout Standard
  95 \begin_inset Note Note
  96 status open
  97
  98 \begin_layout Plain Layout
  99 This is a template \SpecialChar LyX
 100  file for articles to be submitted to the Journal of
 101  Statistical Software (JSS).
 102  How to install the JSS \SpecialChar LaTeX
 103  class to your \SpecialChar LaTeX
 104  system is explained in
 105 \begin_inset Flex URL
 106 status open
 107
 108 \begin_layout Plain Layout
 109
 110 http://wiki.lyx.org/Layouts/JSS
 111 \end_layout
 112
 113 \end_inset
 114
 115 .
 116 \end_layout
 117
 118 \end_inset
 119
 120
 121 \begin_inset Note Note
 122 status open
 123
 124 \begin_layout Plain Layout
 125 To use the JSS codesnippet, bookreview or softwarereview styles, replace
 126  the option
 127 \begin_inset Quotes eld
 128 \end_inset
 129
 130 article
 131 \begin_inset Quotes erd
 132 \end_inset
 133
 134  in Document\SpecialChar menuseparator
 135 Settings\SpecialChar menuseparator
 136 Document Class\SpecialChar menuseparator
 137 Options with
 138 \begin_inset Quotes eld
 139 \end_inset
 140
 141 codesnippet
 142 \begin_inset Quotes erd
 143 \end_inset
 144
 145 ,
 146 \begin_inset Quotes eld
 147 \end_inset
 148
 149 bookreview
 150 \begin_inset Quotes erd
 151 \end_inset
 152
 153  or
 154 \begin_inset Quotes eld
 155 \end_inset
 156
 157 softwarereview
 158 \begin_inset Quotes erd
 159 \end_inset
 160
 161  and remove/uncomment the relevant parts in the \SpecialChar LaTeX
 162  Preamble.
 163
 164 \end_layout
 165
 166 \begin_layout Plain Layout
 167 If you want to use this JSS article style for a non-JSS article, replace
 168  the option
 169 \begin_inset Quotes eld
 170 \end_inset
 171
 172 article
 173 \begin_inset Quotes erd
 174 \end_inset
 175
 176  with
 177 \begin_inset Quotes eld
 178 \end_inset
 179
 180 nojss
 181 \begin_inset Quotes erd
 182 \end_inset
 183
 184 .
 185  This will suppress the JSS-specific parts of the layout.
 186 \end_layout
 187
 188 \begin_layout Plain Layout
 189 To include the JSS-specific parts of the layout, the article has to be processed
 190  with PDF, i.
 191 \begin_inset space \thinspace{}
 192 \end_inset
 193
 194 e.
 195 \begin_inset space ~
 196 \end_inset
 197
 198 you cannot process it with DVI or PS.
 199  However, if the option
 200 \begin_inset Quotes eld
 201 \end_inset
 202
 203 nojss
 204 \begin_inset Quotes erd
 205 \end_inset
 206
 207  is used, it can be processed with DVI or PS.
 208 \end_layout
 209
 210 \end_inset
 211
 212
 213 \end_layout
 214
 215 \begin_layout Title
 216 A Capitalized Title: Something about a Package
 217 \begin_inset Flex pkg
 218 status open
 219
 220 \begin_layout Plain Layout
 221 foo
 222 \end_layout
 223
 224 \end_inset
 225
 226
 227 \end_layout
 228
 229 \begin_layout Plain Title
 230 A Capitalized Title: Something about a Package foo
 231 \begin_inset Note Note
 232 status open
 233
 234 \begin_layout Plain Layout
 235 optional
 236 \end_layout
 237
 238 \end_inset
 239
 240
 241 \end_layout
 242
 243 \begin_layout Author
 244 Achim Zeileis
 245 \begin_inset Newline newline
 246 \end_inset
 247
 248 Universität Innsbruck
 249 \begin_inset ERT
 250 status collapsed
 251
 252 \begin_layout Plain Layout
 253
 254
 255 \backslash
 256 And
 257 \end_layout
 258
 259 \end_inset
 260
 261 Second Author
 262 \begin_inset Newline newline
 263 \end_inset
 264
 265 Plus Affiliation
 266 \end_layout
 267
 268 \begin_layout Plain Author
 269 Achim Zeileis, Second Author
 270 \begin_inset Note Note
 271 status open
 272
 273 \begin_layout Plain Layout
 274 optional
 275 \end_layout
 276
 277 \end_inset
 278
 279
 280 \end_layout
 281
 282 \begin_layout Short Title
 283 \begin_inset Flex pkg
 284 status open
 285
 286 \begin_layout Plain Layout
 287 foo
 288 \end_layout
 289
 290 \end_inset
 291
 292 : A Capitalized Title
 293 \begin_inset Note Note
 294 status collapsed
 295
 296 \begin_layout Plain Layout
 297 only if necessary
 298 \end_layout
 299
 300 \end_inset
 301
 302
 303 \end_layout
 304
 305 \begin_layout Abstract
 306 The abstract of the article.
 307 \end_layout
 308
 309 \begin_layout Keywords
 310 keywords, comma-separated, not capitalized,
 311 \begin_inset Flex proglang
 312 status open
 313
 314 \begin_layout Plain Layout
 315 Java
 316 \end_layout
 317
 318 \end_inset
 319
 320
 321 \begin_inset Note Note
 322 status open
 323
 324 \begin_layout Plain Layout
 325 at least one keyword must be supplied
 326 \end_layout
 327
 328 \end_inset
 329
 330
 331 \end_layout
 332
 333 \begin_layout Plain Keywords
 334 keyword 1, keyword 2, foo, R
 335 \end_layout
 336
 337 \begin_layout Address
 338 Achim Zeileis
 339 \begin_inset Newline newline
 340 \end_inset
 341
 342 Department of Statistics and Mathematics
 343 \begin_inset Newline newline
 344 \end_inset
 345
 346 Faculty of Economics and Statistics
 347 \begin_inset Newline newline
 348 \end_inset
 349
 350 Universität Innsbruck
 351 \begin_inset Newline newline
 352 \end_inset
 353
 354 6020 Innsbruck, Austria
 355 \begin_inset Newline newline
 356 \end_inset
 357
 358 E-mail:
 359 \begin_inset Flex E-mail
 360 status open
 361
 362 \begin_layout Plain Layout
 363
 364 Achim.Zeileis@uibk.ac.at
 365 \end_layout
 366
 367 \end_inset
 368
 369
 370 \begin_inset Newline newline
 371 \end_inset
 372
 373 URL:
 374 \begin_inset Flex URL
 375 status open
 376
 377 \begin_layout Plain Layout
 378
 379 http://eeecon.uibk.ac.at/~zeileis/
 380 \end_layout
 381
 382 \end_inset
 383
 384
 385 \begin_inset Note Note
 386 status open
 387
 388 \begin_layout Plain Layout
 389 It is also possible to add a telephone and fax number before the e-mail
 390  in the following format:
 391 \begin_inset Newline newline
 392 \end_inset
 393
 394 Telephone: +43/512/507-7103
 395 \end_layout
 396
 397 \begin_layout Plain Layout
 398 Fax: +43/512/507-2851
 399 \end_layout
 400
 401 \end_inset
 402
 403
 404 \end_layout
 405
 406 \begin_layout Section
 407 About package
 408 \begin_inset Flex pkg
 409 status open
 410
 411 \begin_layout Plain Layout
 412 foo
 413 \end_layout
 414
 415 \end_inset
 416
 417  in
 418 \begin_inset Flex proglang
 419 status open
 420
 421 \begin_layout Plain Layout
 422 R
 423 \end_layout
 424
 425 \end_inset
 426
 427
 428 \begin_inset Argument 1
 429 status open
 430
 431 \begin_layout Plain Layout
 432 About package foo in R
 433 \end_layout
 434
 435 \end_inset
 436
 437
 438 \begin_inset Note Note
 439 status collapsed
 440
 441 \begin_layout Plain Layout
 442 The short title provides bookmarks for PDF files
 443 \end_layout
 444
 445 \end_inset
 446
 447
 448 \end_layout
 449
 450 \begin_layout Standard
 451 The special JSS style commands related to software and mathematical formulas
 452  are written as follows in \SpecialChar LyX
 453 :
 454 \begin_inset Flex proglang
 455 status open
 456
 457 \begin_layout Plain Layout
 458 R
 459 \end_layout
 460
 461 \end_inset
 462
 463  or
 464 \begin_inset Flex proglang
 465 status open
 466
 467 \begin_layout Plain Layout
 468 R
 469 \end_layout
 470
 471 \end_inset
 472
 473  for the names of programming languages,
 474 \begin_inset Flex pkg
 475 status open
 476
 477 \begin_layout Plain Layout
 478 foo
 479 \end_layout
 480
 481 \end_inset
 482
 483  or
 484 \begin_inset Flex pkg
 485 status open
 486
 487 \begin_layout Plain Layout
 488 foo
 489 \end_layout
 490
 491 \end_inset
 492
 493  for software packages, and
 494 \begin_inset Flex code
 495 status open
 496
 497 \begin_layout Plain Layout
 498 some code
 499 \end_layout
 500
 501 \end_inset
 502
 503  or
 504 \begin_inset Flex pkg
 505 status open
 506
 507 \begin_layout Plain Layout
 508 some code
 509 \end_layout
 510
 511 \end_inset
 512
 513  for code;
 514 \begin_inset Formula $\E$
 515 \end_inset
 516
 517
 518 \begin_inset Note Note
 519 status collapsed
 520
 521 \begin_layout Plain Layout
 522 written as
 523 \backslash
 524 E
 525 \end_layout
 526
 527 \end_inset
 528
 529  for expectations,
 530 \begin_inset Formula $\VAR$
 531 \end_inset
 532
 533
 534 \begin_inset Note Note
 535 status collapsed
 536
 537 \begin_layout Plain Layout
 538 written as
 539 \backslash
 540 VAR
 541 \end_layout
 542
 543 \end_inset
 544
 545  for variances,
 546 \begin_inset Formula $\COV$
 547 \end_inset
 548
 549
 550 \begin_inset Note Note
 551 status collapsed
 552
 553 \begin_layout Plain Layout
 554 written as
 555 \backslash
 556 COV
 557 \end_layout
 558
 559 \end_inset
 560
 561  for covariances, and
 562 \begin_inset Formula $\Prob$
 563 \end_inset
 564
 565
 566 \begin_inset Note Note
 567 status collapsed
 568
 569 \begin_layout Plain Layout
 570 written as
 571 \backslash
 572 Prob
 573 \end_layout
 574
 575 \end_inset
 576
 577  for probabilities.
 578 \end_layout
 579
 580 \begin_layout Standard
 581 Writing several lines of code:
 582 \end_layout
 583
 584 \begin_layout Code Chunk
 585
 586 \end_layout
 587
 588 \begin_deeper
 589 \begin_layout Standard Code
 590
 591 first line of code
 592 \end_layout
 593
 594 \begin_layout Standard Code
 595
 596 second line of code
 597 \end_layout
 598
 599 \begin_layout Standard Code
 600
 601 third line of code
 602 \end_layout
 603
 604 \end_deeper
 605 \begin_layout Standard
 606 Alternatively, you can distinguish between input and output code:
 607 \end_layout
 608
 609 \begin_layout Code Chunk
 610
 611 \end_layout
 612
 613 \begin_deeper
 614 \begin_layout Code Input
 615
 616 first line of input code
 617 \end_layout
 618
 619 \begin_layout Code Input
 620
 621 second line of input code
 622 \end_layout
 623
 624 \begin_layout Code Output
 625
 626 first line of output code
 627 \end_layout
 628
 629 \begin_layout Code Output
 630
 631 second line of output code
 632 \end_layout
 633
 634 \begin_layout Code Output
 635
 636 third line of output code
 637 \end_layout
 638
 639 \end_deeper
 640 \begin_layout Section*
 641 Acknowledgments
 642 \end_layout
 643
 644 \begin_layout Standard
 645 Here you can write some acknowledgments.
 646 \end_layout
 647
 648 \end_body
 649 \end_document