lib/templates/JSS-article.lyx

   1 #LyX 2.2 created this file. For more info see http://www.lyx.org/
   2 \lyxformat 504
   3 \begin_document
   4 \begin_header
   5 \save_transient_properties true
   6 \origin /systemlyxdir/templates/
   7 \textclass jss
   8 \begin_preamble
   9 %the following commands are used only for book or software reviews
  10
  11 %\Reviewer{Some Author\\University of Somewhere}
  12 %\Plainreviewer{Some Author}
  13
  14 %the following commands are used for articles, codesnippets, book reviews and software reviews
  15
  16 %publication information
  17 %do not use these commands before the article has been accepted
  18 %\Volume{00}
  19 %\Issue{0}
  20 %\Month{Month}
  21 %\Year{2000}
  22 %\Submitdate{2000-00-00}
  23 %\Acceptdate{2000-00-00}
  24
  25 %if you use Sweave,  include the following line (with % symbols):
  26 %% need no \usepackage{Sweave.sty}
  27 \end_preamble
  28 \options article
  29 \use_default_options false
  30 \maintain_unincluded_children false
  31 \language english
  32 \language_package default
  33 \inputencoding auto
  34 \fontencoding global
  35 \font_roman "default" "default"
  36 \font_sans "default" "default"
  37 \font_typewriter "default" "default"
  38 \font_math "auto" "auto"
  39 \font_default_family default
  40 \use_non_tex_fonts false
  41 \font_sc false
  42 \font_osf false
  43 \font_sf_scale 100 100
  44 \font_tt_scale 100 100
  45 \graphics default
  46 \default_output_format pdf2
  47 \output_sync 0
  48 \bibtex_command default
  49 \index_command default
  50 \paperfontsize default
  51 \spacing single
  52 \use_hyperref false
  53 \papersize default
  54 \use_geometry false
  55 \use_package amsmath 0
  56 \use_package amssymb 0
  57 \use_package cancel 0
  58 \use_package esint 0
  59 \use_package mathdots 1
  60 \use_package mathtools 0
  61 \use_package mhchem 1
  62 \use_package stackrel 0
  63 \use_package stmaryrd 0
  64 \use_package undertilde 0
  65 \cite_engine natbib
  66 \cite_engine_type authoryear
  67 \biblio_style plainnat
  68 \use_bibtopic false
  69 \use_indices false
  70 \paperorientation portrait
  71 \suppress_date false
  72 \justification true
  73 \use_refstyle 0
  74 \index Index
  75 \shortcut idx
  76 \color #008000
  77 \end_index
  78 \secnumdepth 3
  79 \tocdepth 3
  80 \paragraph_separation indent
  81 \paragraph_indentation default
  82 \quotes_language english
  83 \papercolumns 1
  84 \papersides 1
  85 \paperpagestyle default
  86 \tracking_changes false
  87 \output_changes false
  88 \html_math_output 0
  89 \html_css_as_file 0
  90 \html_be_strict false
  91 \end_header
  92
  93 \begin_body
  94
  95 \begin_layout Standard
  96 \begin_inset Note Note
  97 status open
  98
  99 \begin_layout Plain Layout
 100 This is a template \SpecialChar LyX
 101  file for articles to be submitted to the Journal of
 102  Statistical Software (JSS).
 103  How to install the JSS \SpecialChar LaTeX
 104  class to your \SpecialChar LaTeX
 105  system is explained in
 106 \begin_inset Flex URL
 107 status open
 108
 109 \begin_layout Plain Layout
 110
 111 http://wiki.lyx.org/Layouts/JSS
 112 \end_layout
 113
 114 \end_inset
 115
 116 .
 117 \end_layout
 118
 119 \end_inset
 120
 121
 122 \begin_inset Note Note
 123 status open
 124
 125 \begin_layout Plain Layout
 126 To use the JSS codesnippet, bookreview or softwarereview styles, replace
 127  the option
 128 \begin_inset Quotes eld
 129 \end_inset
 130
 131 article
 132 \begin_inset Quotes erd
 133 \end_inset
 134
 135  in Document\SpecialChar menuseparator
 136 Settings\SpecialChar menuseparator
 137 Document Class\SpecialChar menuseparator
 138 Options with
 139 \begin_inset Quotes eld
 140 \end_inset
 141
 142 codesnippet
 143 \begin_inset Quotes erd
 144 \end_inset
 145
 146 ,
 147 \begin_inset Quotes eld
 148 \end_inset
 149
 150 bookreview
 151 \begin_inset Quotes erd
 152 \end_inset
 153
 154  or
 155 \begin_inset Quotes eld
 156 \end_inset
 157
 158 softwarereview
 159 \begin_inset Quotes erd
 160 \end_inset
 161
 162  and remove/uncomment the relevant parts in the \SpecialChar LaTeX
 163  Preamble.
 164
 165 \end_layout
 166
 167 \begin_layout Plain Layout
 168 If you want to use this JSS article style for a non-JSS article, replace
 169  the option
 170 \begin_inset Quotes eld
 171 \end_inset
 172
 173 article
 174 \begin_inset Quotes erd
 175 \end_inset
 176
 177  with
 178 \begin_inset Quotes eld
 179 \end_inset
 180
 181 nojss
 182 \begin_inset Quotes erd
 183 \end_inset
 184
 185 .
 186  This will suppress the JSS-specific parts of the layout.
 187 \end_layout
 188
 189 \begin_layout Plain Layout
 190 To include the JSS-specific parts of the layout, the article has to be processed
 191  with PDF, i.
 192 \begin_inset space \thinspace{}
 193 \end_inset
 194
 195 e.
 196 \begin_inset space ~
 197 \end_inset
 198
 199 you cannot process it with DVI or PS.
 200  However, if the option
 201 \begin_inset Quotes eld
 202 \end_inset
 203
 204 nojss
 205 \begin_inset Quotes erd
 206 \end_inset
 207
 208  is used, it can be processed with DVI or PS.
 209 \end_layout
 210
 211 \end_inset
 212
 213
 214 \end_layout
 215
 216 \begin_layout Title
 217 A Capitalized Title: Something about a Package
 218 \begin_inset Flex Pkg
 219 status open
 220
 221 \begin_layout Plain Layout
 222 foo
 223 \end_layout
 224
 225 \end_inset
 226
 227
 228 \end_layout
 229
 230 \begin_layout Plain Title
 231 A Capitalized Title: Something about a Package foo
 232 \begin_inset Note Note
 233 status open
 234
 235 \begin_layout Plain Layout
 236 optional
 237 \end_layout
 238
 239 \end_inset
 240
 241
 242 \end_layout
 243
 244 \begin_layout Author
 245 Achim Zeileis
 246 \begin_inset Newline newline
 247 \end_inset
 248
 249 Universität Innsbruck
 250 \begin_inset ERT
 251 status collapsed
 252
 253 \begin_layout Plain Layout
 254
 255
 256 \backslash
 257 And
 258 \end_layout
 259
 260 \end_inset
 261
 262 Second Author
 263 \begin_inset Newline newline
 264 \end_inset
 265
 266 Plus Affiliation
 267 \end_layout
 268
 269 \begin_layout Plain Author
 270 Achim Zeileis, Second Author
 271 \begin_inset Note Note
 272 status open
 273
 274 \begin_layout Plain Layout
 275 optional
 276 \end_layout
 277
 278 \end_inset
 279
 280
 281 \end_layout
 282
 283 \begin_layout Short Title
 284 \begin_inset Flex Pkg
 285 status open
 286
 287 \begin_layout Plain Layout
 288 foo
 289 \end_layout
 290
 291 \end_inset
 292
 293 : A Capitalized Title
 294 \begin_inset Note Note
 295 status collapsed
 296
 297 \begin_layout Plain Layout
 298 only if necessary
 299 \end_layout
 300
 301 \end_inset
 302
 303
 304 \end_layout
 305
 306 \begin_layout Abstract
 307 \noindent
 308 The abstract of the article.
 309  The abstract of the article.The abstract of the article.The abstract of the
 310  article.The abstract of the article.The abstract of the article.The abstract
 311  of the article.The abstract of the article.The abstract of the article.The
 312  abstract of the article.The abstract of the article.The abstract of the article.Th
 313 e abstract of the article.The abstract of the article.The abstract of the
 314  article.The abstract of the article.The abstract of the article.
 315 \end_layout
 316
 317 \begin_layout Keywords
 318 keywords, comma-separated, not capitalized,
 319 \begin_inset Flex Proglang
 320 status open
 321
 322 \begin_layout Plain Layout
 323 Java
 324 \end_layout
 325
 326 \end_inset
 327
 328
 329 \begin_inset Note Note
 330 status open
 331
 332 \begin_layout Plain Layout
 333 at least one keyword must be supplied
 334 \end_layout
 335
 336 \end_inset
 337
 338
 339 \end_layout
 340
 341 \begin_layout Plain Keywords
 342 keyword 1, keyword 2, foo, R
 343 \end_layout
 344
 345 \begin_layout Address
 346 Achim Zeileis
 347 \begin_inset Newline newline
 348 \end_inset
 349
 350 Department of Statistics and Mathematics
 351 \begin_inset Newline newline
 352 \end_inset
 353
 354 Faculty of Economics and Statistics
 355 \begin_inset Newline newline
 356 \end_inset
 357
 358 Universität Innsbruck
 359 \begin_inset Newline newline
 360 \end_inset
 361
 362 6020 Innsbruck, Austria
 363 \begin_inset Newline newline
 364 \end_inset
 365
 366 E-mail:
 367 \begin_inset Flex E-mail
 368 status open
 369
 370 \begin_layout Plain Layout
 371
 372 Achim.Zeileis@uibk.ac.at
 373 \end_layout
 374
 375 \end_inset
 376
 377
 378 \begin_inset Newline newline
 379 \end_inset
 380
 381 URL:
 382 \begin_inset Flex URL
 383 status open
 384
 385 \begin_layout Plain Layout
 386
 387 http://eeecon.uibk.ac.at/~zeileis/
 388 \end_layout
 389
 390 \end_inset
 391
 392
 393 \begin_inset Note Note
 394 status open
 395
 396 \begin_layout Plain Layout
 397 It is also possible to add a telephone and fax number before the e-mail
 398  in the following format:
 399 \begin_inset Newline newline
 400 \end_inset
 401
 402 Telephone: +43/512/507-7103
 403 \end_layout
 404
 405 \begin_layout Plain Layout
 406 Fax: +43/512/507-2851
 407 \end_layout
 408
 409 \end_inset
 410
 411
 412 \end_layout
 413
 414 \begin_layout Section
 415 About package
 416 \begin_inset Flex Pkg
 417 status open
 418
 419 \begin_layout Plain Layout
 420 foo
 421 \end_layout
 422
 423 \end_inset
 424
 425  in
 426 \begin_inset Flex Proglang
 427 status open
 428
 429 \begin_layout Plain Layout
 430 R
 431 \end_layout
 432
 433 \end_inset
 434
 435
 436 \begin_inset Argument 1
 437 status open
 438
 439 \begin_layout Plain Layout
 440 About package foo in R
 441 \end_layout
 442
 443 \end_inset
 444
 445
 446 \begin_inset Note Note
 447 status collapsed
 448
 449 \begin_layout Plain Layout
 450 The short title provides bookmarks for PDF files
 451 \end_layout
 452
 453 \end_inset
 454
 455
 456 \end_layout
 457
 458 \begin_layout Standard
 459 The special JSS style commands related to software and mathematical formulas
 460  are written as follows in \SpecialChar LyX
 461 :
 462 \begin_inset Flex Proglang
 463 status open
 464
 465 \begin_layout Plain Layout
 466 R
 467 \end_layout
 468
 469 \end_inset
 470
 471  or
 472 \begin_inset Flex Proglang
 473 status open
 474
 475 \begin_layout Plain Layout
 476 R
 477 \end_layout
 478
 479 \end_inset
 480
 481  for the names of programming languages,
 482 \begin_inset Flex Pkg
 483 status open
 484
 485 \begin_layout Plain Layout
 486 foo
 487 \end_layout
 488
 489 \end_inset
 490
 491  or
 492 \begin_inset Flex Pkg
 493 status open
 494
 495 \begin_layout Plain Layout
 496 foo
 497 \end_layout
 498
 499 \end_inset
 500
 501  for software packages, and
 502 \begin_inset Flex Code
 503 status open
 504
 505 \begin_layout Plain Layout
 506 some code
 507 \end_layout
 508
 509 \end_inset
 510
 511  or
 512 \begin_inset Flex Pkg
 513 status open
 514
 515 \begin_layout Plain Layout
 516 some code
 517 \end_layout
 518
 519 \end_inset
 520
 521  for code;
 522 \begin_inset Formula $\E$
 523 \end_inset
 524
 525
 526 \begin_inset Note Note
 527 status collapsed
 528
 529 \begin_layout Plain Layout
 530 written as
 531 \backslash
 532 E
 533 \end_layout
 534
 535 \end_inset
 536
 537  for expectations,
 538 \begin_inset Formula $\VAR$
 539 \end_inset
 540
 541
 542 \begin_inset Note Note
 543 status collapsed
 544
 545 \begin_layout Plain Layout
 546 written as
 547 \backslash
 548 VAR
 549 \end_layout
 550
 551 \end_inset
 552
 553  for variances,
 554 \begin_inset Formula $\COV$
 555 \end_inset
 556
 557
 558 \begin_inset Note Note
 559 status collapsed
 560
 561 \begin_layout Plain Layout
 562 written as
 563 \backslash
 564 COV
 565 \end_layout
 566
 567 \end_inset
 568
 569  for covariances, and
 570 \begin_inset Formula $\Prob$
 571 \end_inset
 572
 573
 574 \begin_inset Note Note
 575 status collapsed
 576
 577 \begin_layout Plain Layout
 578 written as
 579 \backslash
 580 Prob
 581 \end_layout
 582
 583 \end_inset
 584
 585  for probabilities.
 586 \end_layout
 587
 588 \begin_layout Standard
 589 Writing several lines of code:
 590 \end_layout
 591
 592 \begin_layout Standard
 593 \begin_inset Flex Code Chunk
 594 status open
 595
 596 \begin_layout Code
 597
 598 first line of code
 599 \end_layout
 600
 601 \begin_layout Code
 602
 603 second line of code
 604 \end_layout
 605
 606 \begin_layout Code
 607
 608 third line of code
 609 \end_layout
 610
 611 \end_inset
 612
 613
 614 \end_layout
 615
 616 \begin_layout Standard
 617 Alternatively, you can distinguish between input and output code:
 618 \end_layout
 619
 620 \begin_layout Standard
 621 \begin_inset Flex Code Chunk
 622 status open
 623
 624 \begin_layout Code Input
 625
 626 first line of input code
 627 \end_layout
 628
 629 \begin_layout Code Input
 630
 631 second line of input code
 632 \end_layout
 633
 634 \begin_layout Code Output
 635
 636 first line of output code
 637 \end_layout
 638
 639 \begin_layout Code Output
 640
 641 second line of output code
 642 \end_layout
 643
 644 \begin_layout Code Output
 645
 646 third line of output code
 647 \end_layout
 648
 649 \end_inset
 650
 651
 652 \end_layout
 653
 654 \begin_layout Section*
 655 Acknowledgments
 656 \end_layout
 657
 658 \begin_layout Standard
 659 Here you can write some acknowledgments.
 660 \end_layout
 661
 662 \begin_layout Section
 663 \start_of_appendix
 664 This is the first appendix section
 665 \end_layout
 666
 667 \begin_layout Subsection
 668 A subsection
 669 \end_layout
 670
 671 \begin_layout Subsubsection
 672 A subsubsection
 673 \end_layout
 674
 675 \begin_layout Standard
 676 some text
 677 \end_layout
 678
 679 \end_body
 680 \end_document