lib/templates/JSS-article.lyx

   1 #LyX 2.3 created this file. For more info see http://www.lyx.org/
   2 \lyxformat 544
   3 \begin_document
   4 \begin_header
   5 \save_transient_properties true
   6 \origin /systemlyxdir/templates/
   7 \textclass jss
   8 \begin_preamble
   9 %the following commands are used only for book or software reviews
  10
  11 %\Reviewer{Some Author\\University of Somewhere}
  12 %\Plainreviewer{Some Author}
  13
  14 %the following commands are used for articles, codesnippets, book reviews and software reviews
  15
  16 %publication information
  17 %do not use these commands before the article has been accepted
  18 %\Volume{00}
  19 %\Issue{0}
  20 %\Month{Month}
  21 %\Year{2000}
  22 %\Submitdate{2000-00-00}
  23 %\Acceptdate{2000-00-00}
  24
  25 %if you use Sweave,  include the following line (with % symbols):
  26 %% need no \usepackage{Sweave.sty}
  27 \end_preamble
  28 \options article
  29 \use_default_options false
  30 \maintain_unincluded_children false
  31 \language english
  32 \language_package default
  33 \inputencoding auto
  34 \fontencoding global
  35 \font_roman "default" "default"
  36 \font_sans "default" "default"
  37 \font_typewriter "default" "default"
  38 \font_math "auto" "auto"
  39 \font_default_family default
  40 \use_non_tex_fonts false
  41 \font_sc false
  42 \font_osf false
  43 \font_sf_scale 100 100
  44 \font_tt_scale 100 100
  45 \use_microtype false
  46 \use_dash_ligatures true
  47 \graphics default
  48 \default_output_format pdf2
  49 \output_sync 0
  50 \bibtex_command default
  51 \index_command default
  52 \paperfontsize default
  53 \spacing single
  54 \use_hyperref false
  55 \papersize default
  56 \use_geometry false
  57 \use_package amsmath 1
  58 \use_package amssymb 1
  59 \use_package cancel 1
  60 \use_package esint 1
  61 \use_package mathdots 1
  62 \use_package mathtools 1
  63 \use_package mhchem 1
  64 \use_package stackrel 1
  65 \use_package stmaryrd 1
  66 \use_package undertilde 1
  67 \cite_engine natbib
  68 \cite_engine_type authoryear
  69 \biblio_style plainnat
  70 \use_bibtopic false
  71 \use_indices false
  72 \paperorientation portrait
  73 \suppress_date false
  74 \justification true
  75 \use_refstyle 0
  76 \index Index
  77 \shortcut idx
  78 \color #008000
  79 \end_index
  80 \secnumdepth 3
  81 \tocdepth 3
  82 \paragraph_separation indent
  83 \paragraph_indentation default
  84 \is_math_indent 0
  85 \math_numbering_side default
  86 \quotes_style english
  87 \papercolumns 1
  88 \papersides 1
  89 \paperpagestyle default
  90 \tracking_changes false
  91 \output_changes false
  92 \html_math_output 0
  93 \html_css_as_file 0
  94 \html_be_strict false
  95 \use_minted 0
  96 \end_header
  97
  98 \begin_body
  99
 100 \begin_layout Standard
 101 \begin_inset Note Note
 102 status open
 103
 104 \begin_layout Plain Layout
 105 This is a template \SpecialChar LyX
 106  file for articles to be submitted to the Journal of
 107  Statistical Software (JSS).
 108  How to install the JSS \SpecialChar LaTeX
 109  class to your \SpecialChar LaTeX
 110  system is explained in
 111 \begin_inset Flex URL
 112 status open
 113
 114 \begin_layout Plain Layout
 115
 116 http://wiki.lyx.org/Layouts/JSS
 117 \end_layout
 118
 119 \end_inset
 120
 121 .
 122 \end_layout
 123
 124 \end_inset
 125
 126
 127 \begin_inset Note Note
 128 status open
 129
 130 \begin_layout Plain Layout
 131 To use the JSS codesnippet, bookreview or softwarereview styles, replace
 132  the option
 133 \begin_inset Quotes eld
 134 \end_inset
 135
 136 article
 137 \begin_inset Quotes erd
 138 \end_inset
 139
 140  in Document\SpecialChar menuseparator
 141 Settings\SpecialChar menuseparator
 142 Document Class\SpecialChar menuseparator
 143 Options with
 144 \begin_inset Quotes eld
 145 \end_inset
 146
 147 codesnippet
 148 \begin_inset Quotes erd
 149 \end_inset
 150
 151 ,
 152 \begin_inset Quotes eld
 153 \end_inset
 154
 155 bookreview
 156 \begin_inset Quotes erd
 157 \end_inset
 158
 159  or
 160 \begin_inset Quotes eld
 161 \end_inset
 162
 163 softwarereview
 164 \begin_inset Quotes erd
 165 \end_inset
 166
 167  and remove/uncomment the relevant parts in the \SpecialChar LaTeX
 168  Preamble.
 169
 170 \end_layout
 171
 172 \begin_layout Plain Layout
 173 If you want to use this JSS article style for a non-JSS article, replace
 174  the option
 175 \begin_inset Quotes eld
 176 \end_inset
 177
 178 article
 179 \begin_inset Quotes erd
 180 \end_inset
 181
 182  with
 183 \begin_inset Quotes eld
 184 \end_inset
 185
 186 nojss
 187 \begin_inset Quotes erd
 188 \end_inset
 189
 190 .
 191  This will suppress the JSS-specific parts of the layout.
 192 \end_layout
 193
 194 \begin_layout Plain Layout
 195 To include the JSS-specific parts of the layout, the article has to be processed
 196  with PDF, i.
 197 \begin_inset space \thinspace{}
 198 \end_inset
 199
 200 e.
 201 \begin_inset space ~
 202 \end_inset
 203
 204 you cannot process it with DVI or PS.
 205  However, if the option
 206 \begin_inset Quotes eld
 207 \end_inset
 208
 209 nojss
 210 \begin_inset Quotes erd
 211 \end_inset
 212
 213  is used, it can be processed with DVI or PS.
 214 \end_layout
 215
 216 \end_inset
 217
 218
 219 \end_layout
 220
 221 \begin_layout Title
 222 A Capitalized Title: Something about a Package
 223 \begin_inset Flex Pkg
 224 status open
 225
 226 \begin_layout Plain Layout
 227 foo
 228 \end_layout
 229
 230 \end_inset
 231
 232
 233 \end_layout
 234
 235 \begin_layout Plain Title
 236 A Capitalized Title: Something about a Package foo
 237 \begin_inset Note Note
 238 status open
 239
 240 \begin_layout Plain Layout
 241 optional
 242 \end_layout
 243
 244 \end_inset
 245
 246
 247 \end_layout
 248
 249 \begin_layout Author
 250 Achim Zeileis
 251 \begin_inset Newline newline
 252 \end_inset
 253
 254 Universität Innsbruck
 255 \begin_inset ERT
 256 status collapsed
 257
 258 \begin_layout Plain Layout
 259
 260
 261 \backslash
 262 And
 263 \end_layout
 264
 265 \end_inset
 266
 267 Second Author
 268 \begin_inset Newline newline
 269 \end_inset
 270
 271 Plus Affiliation
 272 \end_layout
 273
 274 \begin_layout Plain Author
 275 Achim Zeileis, Second Author
 276 \begin_inset Note Note
 277 status open
 278
 279 \begin_layout Plain Layout
 280 optional
 281 \end_layout
 282
 283 \end_inset
 284
 285
 286 \end_layout
 287
 288 \begin_layout Short Title
 289 \begin_inset Flex Pkg
 290 status open
 291
 292 \begin_layout Plain Layout
 293 foo
 294 \end_layout
 295
 296 \end_inset
 297
 298 : A Capitalized Title
 299 \begin_inset Note Note
 300 status collapsed
 301
 302 \begin_layout Plain Layout
 303 only if necessary
 304 \end_layout
 305
 306 \end_inset
 307
 308
 309 \end_layout
 310
 311 \begin_layout Abstract
 312 \noindent
 313 The abstract of the article.
 314  The abstract of the article.The abstract of the article.The abstract of the
 315  article.The abstract of the article.The abstract of the article.The abstract
 316  of the article.The abstract of the article.The abstract of the article.The
 317  abstract of the article.The abstract of the article.The abstract of the article.Th
 318 e abstract of the article.The abstract of the article.The abstract of the
 319  article.The abstract of the article.The abstract of the article.
 320 \end_layout
 321
 322 \begin_layout Keywords
 323 keywords, comma-separated, not capitalized,
 324 \begin_inset Flex Proglang
 325 status open
 326
 327 \begin_layout Plain Layout
 328 Java
 329 \end_layout
 330
 331 \end_inset
 332
 333
 334 \begin_inset Note Note
 335 status open
 336
 337 \begin_layout Plain Layout
 338 at least one keyword must be supplied
 339 \end_layout
 340
 341 \end_inset
 342
 343
 344 \end_layout
 345
 346 \begin_layout Plain Keywords
 347 keyword 1, keyword 2, foo, R
 348 \end_layout
 349
 350 \begin_layout Address
 351 Achim Zeileis
 352 \begin_inset Newline newline
 353 \end_inset
 354
 355 Department of Statistics and Mathematics
 356 \begin_inset Newline newline
 357 \end_inset
 358
 359 Faculty of Economics and Statistics
 360 \begin_inset Newline newline
 361 \end_inset
 362
 363 Universität Innsbruck
 364 \begin_inset Newline newline
 365 \end_inset
 366
 367 6020 Innsbruck, Austria
 368 \begin_inset Newline newline
 369 \end_inset
 370
 371 E-mail:
 372 \begin_inset Flex E-mail
 373 status open
 374
 375 \begin_layout Plain Layout
 376
 377 Achim.Zeileis@uibk.ac.at
 378 \end_layout
 379
 380 \end_inset
 381
 382
 383 \begin_inset Newline newline
 384 \end_inset
 385
 386 URL:
 387 \begin_inset Flex URL
 388 status open
 389
 390 \begin_layout Plain Layout
 391
 392 http://eeecon.uibk.ac.at/~zeileis/
 393 \end_layout
 394
 395 \end_inset
 396
 397
 398 \begin_inset Note Note
 399 status open
 400
 401 \begin_layout Plain Layout
 402 It is also possible to add a telephone and fax number before the e-mail
 403  in the following format:
 404 \begin_inset Newline newline
 405 \end_inset
 406
 407 Telephone: +43/512/507-7103
 408 \end_layout
 409
 410 \begin_layout Plain Layout
 411 Fax: +43/512/507-2851
 412 \end_layout
 413
 414 \end_inset
 415
 416
 417 \end_layout
 418
 419 \begin_layout Section
 420 About package
 421 \begin_inset Flex Pkg
 422 status open
 423
 424 \begin_layout Plain Layout
 425 foo
 426 \end_layout
 427
 428 \end_inset
 429
 430  in
 431 \begin_inset Flex Proglang
 432 status open
 433
 434 \begin_layout Plain Layout
 435 R
 436 \end_layout
 437
 438 \end_inset
 439
 440
 441 \begin_inset Argument 1
 442 status open
 443
 444 \begin_layout Plain Layout
 445 About package foo in R
 446 \end_layout
 447
 448 \end_inset
 449
 450
 451 \begin_inset Note Note
 452 status collapsed
 453
 454 \begin_layout Plain Layout
 455 The short title provides bookmarks for PDF files
 456 \end_layout
 457
 458 \end_inset
 459
 460
 461 \end_layout
 462
 463 \begin_layout Standard
 464 The special JSS style commands related to software and mathematical formulas
 465  are written as follows in \SpecialChar LyX
 466 :
 467 \begin_inset Flex Proglang
 468 status open
 469
 470 \begin_layout Plain Layout
 471 R
 472 \end_layout
 473
 474 \end_inset
 475
 476  or
 477 \begin_inset Flex Proglang
 478 status open
 479
 480 \begin_layout Plain Layout
 481 R
 482 \end_layout
 483
 484 \end_inset
 485
 486  for the names of programming languages,
 487 \begin_inset Flex Pkg
 488 status open
 489
 490 \begin_layout Plain Layout
 491 foo
 492 \end_layout
 493
 494 \end_inset
 495
 496  or
 497 \begin_inset Flex Pkg
 498 status open
 499
 500 \begin_layout Plain Layout
 501 foo
 502 \end_layout
 503
 504 \end_inset
 505
 506  for software packages, and
 507 \begin_inset Flex Code
 508 status open
 509
 510 \begin_layout Plain Layout
 511 some code
 512 \end_layout
 513
 514 \end_inset
 515
 516  or
 517 \begin_inset Flex Pkg
 518 status open
 519
 520 \begin_layout Plain Layout
 521 some code
 522 \end_layout
 523
 524 \end_inset
 525
 526  for code;
 527 \begin_inset Formula $\E$
 528 \end_inset
 529
 530
 531 \begin_inset Note Note
 532 status collapsed
 533
 534 \begin_layout Plain Layout
 535 written as
 536 \backslash
 537 E
 538 \end_layout
 539
 540 \end_inset
 541
 542  for expectations,
 543 \begin_inset Formula $\VAR$
 544 \end_inset
 545
 546
 547 \begin_inset Note Note
 548 status collapsed
 549
 550 \begin_layout Plain Layout
 551 written as
 552 \backslash
 553 VAR
 554 \end_layout
 555
 556 \end_inset
 557
 558  for variances,
 559 \begin_inset Formula $\COV$
 560 \end_inset
 561
 562
 563 \begin_inset Note Note
 564 status collapsed
 565
 566 \begin_layout Plain Layout
 567 written as
 568 \backslash
 569 COV
 570 \end_layout
 571
 572 \end_inset
 573
 574  for covariances, and
 575 \begin_inset Formula $\Prob$
 576 \end_inset
 577
 578
 579 \begin_inset Note Note
 580 status collapsed
 581
 582 \begin_layout Plain Layout
 583 written as
 584 \backslash
 585 Prob
 586 \end_layout
 587
 588 \end_inset
 589
 590  for probabilities.
 591 \end_layout
 592
 593 \begin_layout Standard
 594 Writing several lines of code:
 595 \end_layout
 596
 597 \begin_layout Standard
 598 \begin_inset Flex Code Chunk
 599 status open
 600
 601 \begin_layout Code
 602
 603 first line of code
 604 \end_layout
 605
 606 \begin_layout Code
 607
 608 second line of code
 609 \end_layout
 610
 611 \begin_layout Code
 612
 613 third line of code
 614 \end_layout
 615
 616 \end_inset
 617
 618
 619 \end_layout
 620
 621 \begin_layout Standard
 622 Alternatively, you can distinguish between input and output code:
 623 \end_layout
 624
 625 \begin_layout Standard
 626 \begin_inset Flex Code Chunk
 627 status open
 628
 629 \begin_layout Code Input
 630
 631 first line of input code
 632 \end_layout
 633
 634 \begin_layout Code Input
 635
 636 second line of input code
 637 \end_layout
 638
 639 \begin_layout Code Output
 640
 641 first line of output code
 642 \end_layout
 643
 644 \begin_layout Code Output
 645
 646 second line of output code
 647 \end_layout
 648
 649 \begin_layout Code Output
 650
 651 third line of output code
 652 \end_layout
 653
 654 \end_inset
 655
 656
 657 \end_layout
 658
 659 \begin_layout Section*
 660 Acknowledgments
 661 \end_layout
 662
 663 \begin_layout Standard
 664 Here you can write some acknowledgments.
 665 \end_layout
 666
 667 \begin_layout Section
 668 \start_of_appendix
 669 This is the first appendix section
 670 \end_layout
 671
 672 \begin_layout Subsection
 673 A subsection
 674 \end_layout
 675
 676 \begin_layout Subsubsection
 677 A subsubsection
 678 \end_layout
 679
 680 \begin_layout Standard
 681 some text
 682 \end_layout
 683
 684 \end_body
 685 \end_document