lib/templates/Articles/R_Journal.lyx

   1 #LyX 2.4 created this file. For more info see https://www.lyx.org/
   2 \lyxformat 614
   3 \begin_document
   4 \begin_header
   5 \save_transient_properties true
   6 \origin /systemlyxdir/templates/Articles/
   7 \textclass RJournal
   8 \use_default_options true
   9 \begin_modules
  10 knitr
  11 \end_modules
  12 \maintain_unincluded_children no
  13 \language english
  14 \language_package default
  15 \inputencoding utf8
  16 \fontencoding auto
  17 \font_roman "default" "default"
  18 \font_sans "default" "default"
  19 \font_typewriter "default" "default"
  20 \font_math "auto" "auto"
  21 \font_default_family default
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  65 \end_index
  66 \secnumdepth 3
  67 \tocdepth 3
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  87 \end_header
  88
  89 \begin_body
  90
  91 \begin_layout Standard
  92 \begin_inset Note Note
  93 status open
  94
  95 \begin_layout Plain Layout
  96 This document requires the LaTeX style file
  97 \begin_inset Quotes eld
  98 \end_inset
  99
 100 RJournal.sty
 101 \begin_inset Quotes erd
 102 \end_inset
 103
 104 .
 105 \end_layout
 106
 107 \begin_layout Plain Layout
 108 See
 109 \begin_inset Flex URL
 110 status open
 111
 112 \begin_layout Plain Layout
 113
 114 https://journal.r-project.org/submissions.html
 115 \end_layout
 116
 117 \end_inset
 118
 119
 120 \end_layout
 121
 122 \end_inset
 123
 124
 125 \begin_inset ERT
 126 status open
 127
 128 \begin_layout Plain Layout
 129
 130 <<setup,
 131  include=FALSE>>=
 132 \end_layout
 133
 134 \begin_layout Plain Layout
 135
 136 render_sweave() # use Schunk,
 137  Sinput and Soutput environments defined by RJournal
 138 \end_layout
 139
 140 \begin_layout Plain Layout
 141
 142 set_header(highlight = '') # no need for
 143 \backslash
 144 usepackage{Sweave}
 145 \end_layout
 146
 147 \begin_layout Plain Layout
 148
 149 @
 150 \end_layout
 151
 152 \end_inset
 153
 154
 155 \end_layout
 156
 157 \begin_layout Title
 158 Capitalized Title Here
 159 \end_layout
 160
 161 \begin_layout Author
 162 by Author A and Author B
 163 \end_layout
 164
 165 \begin_layout Abstract
 166 An abstract of less than 150 words.
 167 \end_layout
 168
 169 \begin_layout Section
 170 Section title in sentence case
 171 \end_layout
 172
 173 \begin_layout Standard
 174 Write something here.
 175  A sample citation is
 176 \begin_inset CommandInset citation
 177 LatexCommand citet
 178 key "article-minimal"
 179 literal "true"
 180
 181 \end_inset
 182
 183 .
 184 \end_layout
 185
 186 \begin_layout Section
 187 R code chunks
 188 \end_layout
 189
 190 \begin_layout Standard
 191 Press
 192 \begin_inset Info
 193 type  "shortcut"
 194 arg   "ert-insert"
 195 \end_inset
 196
 197  and input R code chunks which will be compiled with the
 198 \series bold
 199 knitr
 200 \series default
 201  package (
 202 \begin_inset Flex URL
 203 status collapsed
 204
 205 \begin_layout Plain Layout
 206
 207 http://yihui.name/knitr/
 208 \end_layout
 209
 210 \end_inset
 211
 212 ).
 213 \end_layout
 214
 215 \begin_layout Standard
 216 \begin_inset ERT
 217 status open
 218
 219 \begin_layout Plain Layout
 220
 221 <<sample-chunk,
 222  echo=TRUE>>=
 223 \end_layout
 224
 225 \begin_layout Plain Layout
 226
 227 x=1:10
 228 \end_layout
 229
 230 \begin_layout Plain Layout
 231
 232 rev(x)
 233 \end_layout
 234
 235 \begin_layout Plain Layout
 236
 237 summary(x)
 238 \end_layout
 239
 240 \begin_layout Plain Layout
 241
 242 @
 243 \end_layout
 244
 245 \end_inset
 246
 247
 248 \end_layout
 249
 250 \begin_layout Standard
 251 You can also plot your data;
 252  see Figure
 253 \begin_inset CommandInset ref
 254 LatexCommand ref
 255 reference "fig:sample-figure"
 256 nolink "false"
 257
 258 \end_inset
 259
 260  for example.
 261 \end_layout
 262
 263 \begin_layout Standard
 264 \begin_inset Float figure
 265 placement tbph
 266 alignment document
 267 wide false
 268 sideways false
 269 status open
 270
 271 \begin_layout Plain Layout
 272 \begin_inset ERT
 273 status open
 274
 275 \begin_layout Plain Layout
 276
 277 <<sample-figure,
 278  fig.width=5,
 279  fig.height=3,
 280  out.width='.4
 281 \backslash
 282
 283 \backslash
 284 linewidth',
 285  fig.align='center',
 286  dev=c('pdf','postscript')>>=
 287 \end_layout
 288
 289 \begin_layout Plain Layout
 290
 291 par(mar = c(4,4,.1,.1))
 292 \end_layout
 293
 294 \begin_layout Plain Layout
 295
 296 plot(x,
 297  pch=19,
 298  col=1:10)
 299 \end_layout
 300
 301 \begin_layout Plain Layout
 302
 303 @
 304 \end_layout
 305
 306 \end_inset
 307
 308
 309 \end_layout
 310
 311 \begin_layout Plain Layout
 312 \begin_inset Caption Standard
 313
 314 \begin_layout Plain Layout
 315 A sample figure.
 316 \begin_inset CommandInset label
 317 LatexCommand label
 318 name "fig:sample-figure"
 319
 320 \end_inset
 321
 322
 323 \end_layout
 324
 325 \end_inset
 326
 327
 328 \end_layout
 329
 330 \end_inset
 331
 332
 333 \end_layout
 334
 335 \begin_layout Standard
 336 \begin_inset Note Note
 337 status open
 338
 339 \begin_layout Plain Layout
 340 When you insert a Bib\SpecialChar TeX
 341  bibliography here,
 342  do not use any bib styles.
 343  The R Journal has declared the style to be
 344 \begin_inset Quotes eld
 345 \end_inset
 346
 347 abbrvnat
 348 \begin_inset Quotes erd
 349 \end_inset
 350
 351 .
 352 \end_layout
 353
 354 \end_inset
 355
 356
 357 \end_layout
 358
 359 \begin_layout Standard
 360 \begin_inset CommandInset bibtex
 361 LatexCommand bibtex
 362 bibfiles "xampl"
 363
 364 \end_inset
 365
 366
 367 \end_layout
 368
 369 \begin_layout Address
 370 Author A
 371 \begin_inset Newline newline
 372 \end_inset
 373
 374 Press
 375 \begin_inset Info
 376 type  "shortcut"
 377 arg   "newline-insert newline"
 378 \end_inset
 379
 380  to input
 381 \begin_inset Newline newline
 382 \end_inset
 383
 384 address here
 385 \begin_inset Newline newline
 386 \end_inset
 387
 388
 389 \begin_inset Flex Email
 390 status open
 391
 392 \begin_layout Plain Layout
 393 author.a@email
 394 \end_layout
 395
 396 \end_inset
 397
 398
 399 \end_layout
 400
 401 \begin_layout Address
 402 Author B
 403 \begin_inset Newline newline
 404 \end_inset
 405
 406
 407 \begin_inset Flex Email
 408 status open
 409
 410 \begin_layout Plain Layout
 411 author.b@email
 412 \end_layout
 413
 414 \end_inset
 415
 416
 417 \end_layout
 418
 419 \end_body
 420 \end_document