lib/templates/Articles/R_Journal.lyx

   1 #LyX 2.4 created this file. For more info see https://www.lyx.org/
   2 \lyxformat 600
   3 \begin_document
   4 \begin_header
   5 \save_transient_properties true
   6 \origin /systemlyxdir/templates/Articles/
   7 \textclass RJournal
   8 \use_default_options true
   9 \begin_modules
  10 knitr
  11 \end_modules
  12 \maintain_unincluded_children no
  13 \language english
  14 \language_package default
  15 \inputencoding utf8
  16 \fontencoding auto
  17 \font_roman "default" "default"
  18 \font_sans "default" "default"
  19 \font_typewriter "default" "default"
  20 \font_math "auto" "auto"
  21 \font_default_family default
  22 \use_non_tex_fonts false
  23 \font_sc false
  24 \font_sans_osf false
  25 \font_typewriter_osf false
  26 \font_roman_osf false
  27 \font_sf_scale 100 100
  28 \font_tt_scale 100 100
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  39 \papersize default
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  64 \color #008000
  65 \end_index
  66 \secnumdepth 3
  67 \tocdepth 3
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  83 \end_header
  84
  85 \begin_body
  86
  87 \begin_layout Standard
  88 \begin_inset Note Note
  89 status open
  90
  91 \begin_layout Plain Layout
  92 This document requires the LaTeX style file
  93 \begin_inset Quotes eld
  94 \end_inset
  95
  96 RJournal.sty
  97 \begin_inset Quotes erd
  98 \end_inset
  99
 100 .
 101 \end_layout
 102
 103 \begin_layout Plain Layout
 104 See
 105 \begin_inset Flex URL
 106 status open
 107
 108 \begin_layout Plain Layout
 109
 110 https://journal.r-project.org/submissions.html
 111 \end_layout
 112
 113 \end_inset
 114
 115
 116 \end_layout
 117
 118 \end_inset
 119
 120
 121 \begin_inset ERT
 122 status open
 123
 124 \begin_layout Plain Layout
 125
 126 <<setup, include=FALSE>>=
 127 \end_layout
 128
 129 \begin_layout Plain Layout
 130
 131 render_sweave() # use Schunk, Sinput and Soutput environments defined by
 132  RJournal
 133 \end_layout
 134
 135 \begin_layout Plain Layout
 136
 137 set_header(highlight = '') # no need for
 138 \backslash
 139 usepackage{Sweave}
 140 \end_layout
 141
 142 \begin_layout Plain Layout
 143
 144 @
 145 \end_layout
 146
 147 \end_inset
 148
 149
 150 \end_layout
 151
 152 \begin_layout Title
 153 Capitalized Title Here
 154 \end_layout
 155
 156 \begin_layout Author
 157 by Author A and Author B
 158 \end_layout
 159
 160 \begin_layout Abstract
 161 An abstract of less than 150 words.
 162 \end_layout
 163
 164 \begin_layout Section
 165 Section title in sentence case
 166 \end_layout
 167
 168 \begin_layout Standard
 169 Write something here.
 170  A sample citation is
 171 \begin_inset CommandInset citation
 172 LatexCommand citet
 173 key "article-minimal"
 174 literal "true"
 175
 176 \end_inset
 177
 178 .
 179 \end_layout
 180
 181 \begin_layout Section
 182 R code chunks
 183 \end_layout
 184
 185 \begin_layout Standard
 186 Press
 187 \begin_inset Info
 188 type  "shortcut"
 189 arg   "ert-insert"
 190 \end_inset
 191
 192  and input R code chunks which will be compiled with the
 193 \series bold
 194 knitr
 195 \series default
 196  package (
 197 \begin_inset Flex URL
 198 status collapsed
 199
 200 \begin_layout Plain Layout
 201
 202 http://yihui.name/knitr/
 203 \end_layout
 204
 205 \end_inset
 206
 207 ).
 208 \end_layout
 209
 210 \begin_layout Standard
 211 \begin_inset ERT
 212 status open
 213
 214 \begin_layout Plain Layout
 215
 216 <<sample-chunk, echo=TRUE>>=
 217 \end_layout
 218
 219 \begin_layout Plain Layout
 220
 221 x=1:10
 222 \end_layout
 223
 224 \begin_layout Plain Layout
 225
 226 rev(x)
 227 \end_layout
 228
 229 \begin_layout Plain Layout
 230
 231 summary(x)
 232 \end_layout
 233
 234 \begin_layout Plain Layout
 235
 236 @
 237 \end_layout
 238
 239 \end_inset
 240
 241
 242 \end_layout
 243
 244 \begin_layout Standard
 245 You can also plot your data; see Figure
 246 \begin_inset CommandInset ref
 247 LatexCommand ref
 248 reference "fig:sample-figure"
 249
 250 \end_inset
 251
 252  for example.
 253 \end_layout
 254
 255 \begin_layout Standard
 256 \begin_inset Float figure
 257 placement tbph
 258 wide false
 259 sideways false
 260 status open
 261
 262 \begin_layout Plain Layout
 263 \begin_inset ERT
 264 status open
 265
 266 \begin_layout Plain Layout
 267
 268 <<sample-figure, fig.width=5, fig.height=3, out.width='.4
 269 \backslash
 270
 271 \backslash
 272 linewidth', fig.align='center', dev=c('pdf','postscript')>>=
 273 \end_layout
 274
 275 \begin_layout Plain Layout
 276
 277 par(mar = c(4,4,.1,.1))
 278 \end_layout
 279
 280 \begin_layout Plain Layout
 281
 282 plot(x, pch=19, col=1:10)
 283 \end_layout
 284
 285 \begin_layout Plain Layout
 286
 287 @
 288 \end_layout
 289
 290 \end_inset
 291
 292
 293 \end_layout
 294
 295 \begin_layout Plain Layout
 296 \begin_inset Caption Standard
 297
 298 \begin_layout Plain Layout
 299 A sample figure.
 300 \begin_inset CommandInset label
 301 LatexCommand label
 302 name "fig:sample-figure"
 303
 304 \end_inset
 305
 306
 307 \end_layout
 308
 309 \end_inset
 310
 311
 312 \end_layout
 313
 314 \end_inset
 315
 316
 317 \end_layout
 318
 319 \begin_layout Standard
 320 \begin_inset Note Note
 321 status open
 322
 323 \begin_layout Plain Layout
 324 When you insert a Bib\SpecialChar TeX
 325  bibliography here, do not use any bib styles.
 326  The R Journal has declared the style to be
 327 \begin_inset Quotes eld
 328 \end_inset
 329
 330 abbrvnat
 331 \begin_inset Quotes erd
 332 \end_inset
 333
 334 .
 335 \end_layout
 336
 337 \end_inset
 338
 339
 340 \end_layout
 341
 342 \begin_layout Standard
 343 \begin_inset CommandInset bibtex
 344 LatexCommand bibtex
 345 bibfiles "xampl"
 346
 347 \end_inset
 348
 349
 350 \end_layout
 351
 352 \begin_layout Address
 353 Author A
 354 \begin_inset Newline newline
 355 \end_inset
 356
 357 Press
 358 \begin_inset Info
 359 type  "shortcut"
 360 arg   "newline-insert newline"
 361 \end_inset
 362
 363  to input
 364 \begin_inset Newline newline
 365 \end_inset
 366
 367 address here
 368 \begin_inset Newline newline
 369 \end_inset
 370
 371
 372 \begin_inset Flex Email
 373 status open
 374
 375 \begin_layout Plain Layout
 376 author.a@email
 377 \end_layout
 378
 379 \end_inset
 380
 381
 382 \end_layout
 383
 384 \begin_layout Address
 385 Author B
 386 \begin_inset Newline newline
 387 \end_inset
 388
 389
 390 \begin_inset Flex Email
 391 status open
 392
 393 \begin_layout Plain Layout
 394 author.b@email
 395 \end_layout
 396
 397 \end_inset
 398
 399
 400 \end_layout
 401
 402 \end_body
 403 \end_document