lib/templates/Articles/R_Journal.lyx

   1 #LyX 2.4 created this file. For more info see https://www.lyx.org/
   2 \lyxformat 544
   3 \begin_document
   4 \begin_header
   5 \save_transient_properties true
   6 \origin /systemlyxdir/templates/Articles/
   7 \textclass RJournal
   8 \use_default_options true
   9 \begin_modules
  10 knitr
  11 \end_modules
  12 \maintain_unincluded_children false
  13 \language english
  14 \language_package default
  15 \inputencoding utf8
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  17 \font_roman "default" "default"
  18 \font_sans "default" "default"
  19 \font_typewriter "default" "default"
  20 \font_math "auto" "auto"
  21 \font_default_family default
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  30 \default_output_format default
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  59 \index Index
  60 \shortcut idx
  61 \color #008000
  62 \end_index
  63 \secnumdepth 3
  64 \tocdepth 3
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  79 \end_header
  80
  81 \begin_body
  82
  83 \begin_layout Standard
  84 \begin_inset Note Note
  85 status open
  86
  87 \begin_layout Plain Layout
  88 This document requires the LaTeX style file
  89 \begin_inset Quotes eld
  90 \end_inset
  91
  92 RJournal.sty
  93 \begin_inset Quotes erd
  94 \end_inset
  95
  96 .
  97 \end_layout
  98
  99 \begin_layout Plain Layout
 100 See
 101 \begin_inset Flex URL
 102 status open
 103
 104 \begin_layout Plain Layout
 105
 106 https://journal.r-project.org/submissions.html
 107 \end_layout
 108
 109 \end_inset
 110
 111
 112 \end_layout
 113
 114 \end_inset
 115
 116
 117 \begin_inset ERT
 118 status open
 119
 120 \begin_layout Plain Layout
 121
 122 <<setup, include=FALSE>>=
 123 \end_layout
 124
 125 \begin_layout Plain Layout
 126
 127 render_sweave() # use Schunk, Sinput and Soutput environments defined by
 128  RJournal
 129 \end_layout
 130
 131 \begin_layout Plain Layout
 132
 133 set_header(highlight = '') # no need for
 134 \backslash
 135 usepackage{Sweave}
 136 \end_layout
 137
 138 \begin_layout Plain Layout
 139
 140 @
 141 \end_layout
 142
 143 \end_inset
 144
 145
 146 \end_layout
 147
 148 \begin_layout Title
 149 Capitalized Title Here
 150 \end_layout
 151
 152 \begin_layout Author
 153 by Author A and Author B
 154 \end_layout
 155
 156 \begin_layout Abstract
 157 An abstract of less than 150 words.
 158 \end_layout
 159
 160 \begin_layout Section
 161 Section title in sentence case
 162 \end_layout
 163
 164 \begin_layout Standard
 165 Write something here.
 166  A sample citation is
 167 \begin_inset CommandInset citation
 168 LatexCommand citet
 169 key "article-minimal"
 170 literal "true"
 171
 172 \end_inset
 173
 174 .
 175 \end_layout
 176
 177 \begin_layout Section
 178 R code chunks
 179 \end_layout
 180
 181 \begin_layout Standard
 182 Press
 183 \begin_inset Info
 184 type  "shortcut"
 185 arg   "ert-insert"
 186 \end_inset
 187
 188  and input R code chunks which will be compiled with the
 189 \series bold
 190 knitr
 191 \series default
 192  package (
 193 \begin_inset Flex URL
 194 status collapsed
 195
 196 \begin_layout Plain Layout
 197
 198 http://yihui.name/knitr/
 199 \end_layout
 200
 201 \end_inset
 202
 203 ).
 204 \end_layout
 205
 206 \begin_layout Standard
 207 \begin_inset ERT
 208 status open
 209
 210 \begin_layout Plain Layout
 211
 212 <<sample-chunk, echo=TRUE>>=
 213 \end_layout
 214
 215 \begin_layout Plain Layout
 216
 217 x=1:10
 218 \end_layout
 219
 220 \begin_layout Plain Layout
 221
 222 rev(x)
 223 \end_layout
 224
 225 \begin_layout Plain Layout
 226
 227 summary(x)
 228 \end_layout
 229
 230 \begin_layout Plain Layout
 231
 232 @
 233 \end_layout
 234
 235 \end_inset
 236
 237
 238 \end_layout
 239
 240 \begin_layout Standard
 241 You can also plot your data; see Figure
 242 \begin_inset CommandInset ref
 243 LatexCommand ref
 244 reference "fig:sample-figure"
 245
 246 \end_inset
 247
 248  for example.
 249 \end_layout
 250
 251 \begin_layout Standard
 252 \begin_inset Float figure
 253 placement tbph
 254 wide false
 255 sideways false
 256 status open
 257
 258 \begin_layout Plain Layout
 259 \begin_inset ERT
 260 status open
 261
 262 \begin_layout Plain Layout
 263
 264 <<sample-figure, fig.width=5, fig.height=3, out.width='.4
 265 \backslash
 266
 267 \backslash
 268 linewidth', fig.align='center', dev=c('pdf','postscript')>>=
 269 \end_layout
 270
 271 \begin_layout Plain Layout
 272
 273 par(mar = c(4,4,.1,.1))
 274 \end_layout
 275
 276 \begin_layout Plain Layout
 277
 278 plot(x, pch=19, col=1:10)
 279 \end_layout
 280
 281 \begin_layout Plain Layout
 282
 283 @
 284 \end_layout
 285
 286 \end_inset
 287
 288
 289 \end_layout
 290
 291 \begin_layout Plain Layout
 292 \begin_inset Caption Standard
 293
 294 \begin_layout Plain Layout
 295 A sample figure.
 296 \begin_inset CommandInset label
 297 LatexCommand label
 298 name "fig:sample-figure"
 299
 300 \end_inset
 301
 302
 303 \end_layout
 304
 305 \end_inset
 306
 307
 308 \end_layout
 309
 310 \end_inset
 311
 312
 313 \end_layout
 314
 315 \begin_layout Standard
 316 \begin_inset Note Note
 317 status open
 318
 319 \begin_layout Plain Layout
 320 When you insert a Bib\SpecialChar TeX
 321  bibliography here, do not use any bib styles.
 322  The R Journal has declared the style to be
 323 \begin_inset Quotes eld
 324 \end_inset
 325
 326 abbrvnat
 327 \begin_inset Quotes erd
 328 \end_inset
 329
 330 .
 331 \end_layout
 332
 333 \end_inset
 334
 335
 336 \end_layout
 337
 338 \begin_layout Standard
 339 \begin_inset CommandInset bibtex
 340 LatexCommand bibtex
 341 bibfiles "xampl"
 342
 343 \end_inset
 344
 345
 346 \end_layout
 347
 348 \begin_layout Address
 349 Author A
 350 \begin_inset Newline newline
 351 \end_inset
 352
 353 Press
 354 \begin_inset Info
 355 type  "shortcut"
 356 arg   "newline-insert newline"
 357 \end_inset
 358
 359  to input
 360 \begin_inset Newline newline
 361 \end_inset
 362
 363 address here
 364 \begin_inset Newline newline
 365 \end_inset
 366
 367
 368 \begin_inset Flex Email
 369 status open
 370
 371 \begin_layout Plain Layout
 372 author.a@email
 373 \end_layout
 374
 375 \end_inset
 376
 377
 378 \end_layout
 379
 380 \begin_layout Address
 381 Author B
 382 \begin_inset Newline newline
 383 \end_inset
 384
 385
 386 \begin_inset Flex Email
 387 status open
 388
 389 \begin_layout Plain Layout
 390 author.b@email
 391 \end_layout
 392
 393 \end_inset
 394
 395
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 398 \end_body
 399 \end_document