lib/templates/Articles/Journal_of_Statistical_Software_%28JSS%29_version_2.lyx

   1 #LyX 2.4 created this file. For more info see https://www.lyx.org/
   2 \lyxformat 620
   3 \begin_document
   4 \begin_header
   5 \save_transient_properties true
   6 \origin /systemlyxdir/templates/Articles/
   7 \textclass jss
   8 \begin_preamble
   9 %the following commands are used only for book or software reviews
  10
  11 %\Reviewer{Some Author\\University of Somewhere}
  12 %\Plainreviewer{Some Author}
  13
  14 %the following commands are used for articles, codesnippets, book reviews and software reviews
  15
  16 %publication information
  17 %do not use these commands before the article has been accepted
  18 %\Volume{00}
  19 %\Issue{0}
  20 %\Month{Month}
  21 %\Year{2000}
  22 %\Submitdate{2000-00-00}
  23 %\Acceptdate{2000-00-00}
  24
  25 %if you use Sweave,  include the following line (with % symbols):
  26 %% need no \usepackage{Sweave.sty}
  27 \end_preamble
  28 \options article
  29 \use_default_options false
  30 \maintain_unincluded_children no
  31 \language english
  32 \language_package default
  33 \inputencoding utf8
  34 \fontencoding auto
  35 \font_roman "default" "default"
  36 \font_sans "default" "default"
  37 \font_typewriter "default" "default"
  38 \font_math "auto" "auto"
  39 \font_default_family default
  40 \use_non_tex_fonts false
  41 \font_sc false
  42 \font_roman_osf false
  43 \font_sans_osf false
  44 \font_typewriter_osf false
  45 \font_sf_scale 100 100
  46 \font_tt_scale 100 100
  47 \use_microtype false
  48 \use_dash_ligatures true
  49 \graphics default
  50 \default_output_format pdf2
  51 \output_sync 0
  52 \bibtex_command default
  53 \index_command default
  54 \paperfontsize default
  55 \spacing single
  56 \use_hyperref false
  57 \papersize default
  58 \use_geometry false
  59 \use_package amsmath 1
  60 \use_package amssymb 1
  61 \use_package cancel 1
  62 \use_package esint 1
  63 \use_package mathdots 1
  64 \use_package mathtools 1
  65 \use_package mhchem 1
  66 \use_package stackrel 1
  67 \use_package stmaryrd 1
  68 \use_package undertilde 1
  69 \cite_engine natbib
  70 \cite_engine_type authoryear
  71 \biblio_style plainnat
  72 \use_bibtopic false
  73 \use_indices false
  74 \paperorientation portrait
  75 \suppress_date false
  76 \justification true
  77 \use_refstyle 0
  78 \use_minted 0
  79 \use_lineno 0
  80 \index Index
  81 \shortcut idx
  82 \color #008000
  83 \end_index
  84 \secnumdepth 3
  85 \tocdepth 3
  86 \paragraph_separation indent
  87 \paragraph_indentation default
  88 \is_math_indent 0
  89 \math_numbering_side default
  90 \quotes_style english
  91 \dynamic_quotes 0
  92 \papercolumns 1
  93 \papersides 1
  94 \paperpagestyle default
  95 \tablestyle default
  96 \tracking_changes false
  97 \output_changes false
  98 \change_bars false
  99 \postpone_fragile_content false
 100 \html_math_output 0
 101 \html_css_as_file 0
 102 \html_be_strict false
 103 \docbook_table_output 0
 104 \docbook_mathml_prefix 1
 105 \end_header
 106
 107 \begin_body
 108
 109 \begin_layout Standard
 110 \begin_inset Note Note
 111 status open
 112
 113 \begin_layout Plain Layout
 114 This is a template \SpecialChar LyX
 115  file for articles to be submitted to the Journal of Statistical Software (JSS).
 116  How to install the JSS \SpecialChar LaTeX
 117  class to your \SpecialChar LaTeX
 118  system is explained in
 119 \begin_inset Flex URL
 120 status open
 121
 122 \begin_layout Plain Layout
 123
 124 https://wiki.lyx.org/Layouts/JSS
 125 \end_layout
 126
 127 \end_inset
 128
 129 .
 130 \end_layout
 131
 132 \end_inset
 133
 134
 135 \begin_inset Note Note
 136 status open
 137
 138 \begin_layout Plain Layout
 139 To use the JSS codesnippet,
 140  bookreview or softwarereview styles,
 141  replace the option
 142 \begin_inset Quotes eld
 143 \end_inset
 144
 145 article
 146 \begin_inset Quotes erd
 147 \end_inset
 148
 149  in Document\SpecialChar menuseparator
 150 Settings\SpecialChar menuseparator
 151 Document Class\SpecialChar menuseparator
 152 Options with
 153 \begin_inset Quotes eld
 154 \end_inset
 155
 156 codesnippet
 157 \begin_inset Quotes erd
 158 \end_inset
 159
 160 ,
 161
 162 \begin_inset Quotes eld
 163 \end_inset
 164
 165 bookreview
 166 \begin_inset Quotes erd
 167 \end_inset
 168
 169  or
 170 \begin_inset Quotes eld
 171 \end_inset
 172
 173 softwarereview
 174 \begin_inset Quotes erd
 175 \end_inset
 176
 177  and remove/uncomment the relevant parts in the \SpecialChar LaTeX
 178  Preamble.
 179
 180 \end_layout
 181
 182 \begin_layout Plain Layout
 183 If you want to use this JSS article style for a non-JSS article,
 184  replace the option
 185 \begin_inset Quotes eld
 186 \end_inset
 187
 188 article
 189 \begin_inset Quotes erd
 190 \end_inset
 191
 192  with
 193 \begin_inset Quotes eld
 194 \end_inset
 195
 196 nojss
 197 \begin_inset Quotes erd
 198 \end_inset
 199
 200 .
 201  This will suppress the JSS-specific parts of the layout.
 202 \end_layout
 203
 204 \begin_layout Plain Layout
 205 To include the JSS-specific parts of the layout,
 206  the article has to be processed with PDF,
 207  i.
 208 \begin_inset space \thinspace{}
 209 \end_inset
 210
 211 e.
 212 \begin_inset space ~
 213 \end_inset
 214
 215 you cannot process it with DVI or PS.
 216  However,
 217  if the option
 218 \begin_inset Quotes eld
 219 \end_inset
 220
 221 nojss
 222 \begin_inset Quotes erd
 223 \end_inset
 224
 225  is used,
 226  it can be processed with DVI or PS.
 227 \end_layout
 228
 229 \end_inset
 230
 231
 232 \end_layout
 233
 234 \begin_layout Title
 235 A Capitalized Title:
 236  Something about a Package
 237 \begin_inset Flex Pkg
 238 status open
 239
 240 \begin_layout Plain Layout
 241 foo
 242 \end_layout
 243
 244 \end_inset
 245
 246
 247 \end_layout
 248
 249 \begin_layout Plain Title
 250 A Capitalized Title:
 251  Something about a Package foo
 252 \begin_inset Note Note
 253 status open
 254
 255 \begin_layout Plain Layout
 256 optional
 257 \end_layout
 258
 259 \end_inset
 260
 261
 262 \end_layout
 263
 264 \begin_layout Author
 265 Achim Zeileis
 266 \begin_inset Newline newline
 267 \end_inset
 268
 269 Universität Innsbruck
 270 \begin_inset ERT
 271 status collapsed
 272
 273 \begin_layout Plain Layout
 274
 275
 276 \backslash
 277 And
 278 \end_layout
 279
 280 \end_inset
 281
 282 Second Author
 283 \begin_inset Newline newline
 284 \end_inset
 285
 286 Plus Affiliation
 287 \end_layout
 288
 289 \begin_layout Plain Author
 290 Achim Zeileis,
 291  Second Author
 292 \begin_inset Note Note
 293 status open
 294
 295 \begin_layout Plain Layout
 296 optional
 297 \end_layout
 298
 299 \end_inset
 300
 301
 302 \end_layout
 303
 304 \begin_layout Short Title
 305 \begin_inset Flex Pkg
 306 status open
 307
 308 \begin_layout Plain Layout
 309 foo
 310 \end_layout
 311
 312 \end_inset
 313
 314 :
 315  A Capitalized Title
 316 \begin_inset Note Note
 317 status collapsed
 318
 319 \begin_layout Plain Layout
 320 only if necessary
 321 \end_layout
 322
 323 \end_inset
 324
 325
 326 \end_layout
 327
 328 \begin_layout Abstract
 329 \noindent
 330 The abstract of the article.
 331  The abstract of the article.The abstract of the article.The abstract of the article.The abstract of the article.The abstract of the article.The abstract of the article.The abstract of the article.The abstract of the article.The abstract of the article.The abstract of the article.The abstract of the article.The abstract of the article.The abstract of the article.The abstract of the article.The abstract of the article.The abstract of the article.
 332 \end_layout
 333
 334 \begin_layout Keywords
 335 keywords,
 336  comma-separated,
 337  not capitalized,
 338
 339 \begin_inset Flex Proglang
 340 status open
 341
 342 \begin_layout Plain Layout
 343 Java
 344 \end_layout
 345
 346 \end_inset
 347
 348
 349 \begin_inset Note Note
 350 status open
 351
 352 \begin_layout Plain Layout
 353 at least one keyword must be supplied
 354 \end_layout
 355
 356 \end_inset
 357
 358
 359 \end_layout
 360
 361 \begin_layout Plain Keywords
 362 keyword 1,
 363  keyword 2,
 364  foo,
 365  R
 366 \end_layout
 367
 368 \begin_layout Address
 369 Achim Zeileis
 370 \begin_inset Newline newline
 371 \end_inset
 372
 373 Department of Statistics and Mathematics
 374 \begin_inset Newline newline
 375 \end_inset
 376
 377 Faculty of Economics and Statistics
 378 \begin_inset Newline newline
 379 \end_inset
 380
 381 Universität Innsbruck
 382 \begin_inset Newline newline
 383 \end_inset
 384
 385 6020 Innsbruck,
 386  Austria
 387 \begin_inset Newline newline
 388 \end_inset
 389
 390 E-mail:
 391
 392 \begin_inset Flex E-mail
 393 status open
 394
 395 \begin_layout Plain Layout
 396
 397 Achim.Zeileis@uibk.ac.at
 398 \end_layout
 399
 400 \end_inset
 401
 402
 403 \begin_inset Newline newline
 404 \end_inset
 405
 406 URL:
 407
 408 \begin_inset Flex URL
 409 status open
 410
 411 \begin_layout Plain Layout
 412
 413 http://eeecon.uibk.ac.at/~zeileis/
 414 \end_layout
 415
 416 \end_inset
 417
 418
 419 \begin_inset Note Note
 420 status open
 421
 422 \begin_layout Plain Layout
 423 It is also possible to add a telephone and fax number before the e-mail in the following format:
 424 \begin_inset Newline newline
 425 \end_inset
 426
 427 Telephone:
 428  +43/512/507-7103
 429 \end_layout
 430
 431 \begin_layout Plain Layout
 432 Fax:
 433  +43/512/507-2851
 434 \end_layout
 435
 436 \end_inset
 437
 438
 439 \end_layout
 440
 441 \begin_layout Section
 442 About package
 443 \begin_inset Flex Pkg
 444 status open
 445
 446 \begin_layout Plain Layout
 447 foo
 448 \end_layout
 449
 450 \end_inset
 451
 452  in
 453 \begin_inset Flex Proglang
 454 status open
 455
 456 \begin_layout Plain Layout
 457 R
 458 \end_layout
 459
 460 \end_inset
 461
 462
 463 \begin_inset Argument 1
 464 status open
 465
 466 \begin_layout Plain Layout
 467 About package foo in R
 468 \end_layout
 469
 470 \end_inset
 471
 472
 473 \begin_inset Note Note
 474 status collapsed
 475
 476 \begin_layout Plain Layout
 477 The short title provides bookmarks for PDF files
 478 \end_layout
 479
 480 \end_inset
 481
 482
 483 \end_layout
 484
 485 \begin_layout Standard
 486 The special JSS style commands related to software and mathematical formulas are written as follows in \SpecialChar LyX
 487 :
 488
 489 \begin_inset Flex Proglang
 490 status open
 491
 492 \begin_layout Plain Layout
 493 R
 494 \end_layout
 495
 496 \end_inset
 497
 498  or
 499 \begin_inset Flex Proglang
 500 status open
 501
 502 \begin_layout Plain Layout
 503 R
 504 \end_layout
 505
 506 \end_inset
 507
 508  for the names of programming languages,
 509
 510 \begin_inset Flex Pkg
 511 status open
 512
 513 \begin_layout Plain Layout
 514 foo
 515 \end_layout
 516
 517 \end_inset
 518
 519  or
 520 \begin_inset Flex Pkg
 521 status open
 522
 523 \begin_layout Plain Layout
 524 foo
 525 \end_layout
 526
 527 \end_inset
 528
 529  for software packages,
 530  and
 531 \begin_inset Flex Code
 532 status open
 533
 534 \begin_layout Plain Layout
 535 some code
 536 \end_layout
 537
 538 \end_inset
 539
 540  or
 541 \begin_inset Flex Pkg
 542 status open
 543
 544 \begin_layout Plain Layout
 545 some code
 546 \end_layout
 547
 548 \end_inset
 549
 550  for code;
 551
 552 \begin_inset Formula $\E$
 553 \end_inset
 554
 555
 556 \begin_inset Note Note
 557 status collapsed
 558
 559 \begin_layout Plain Layout
 560 written as
 561 \backslash
 562 E
 563 \end_layout
 564
 565 \end_inset
 566
 567  for expectations,
 568
 569 \begin_inset Formula $\VAR$
 570 \end_inset
 571
 572
 573 \begin_inset Note Note
 574 status collapsed
 575
 576 \begin_layout Plain Layout
 577 written as
 578 \backslash
 579 VAR
 580 \end_layout
 581
 582 \end_inset
 583
 584  for variances,
 585
 586 \begin_inset Formula $\COV$
 587 \end_inset
 588
 589
 590 \begin_inset Note Note
 591 status collapsed
 592
 593 \begin_layout Plain Layout
 594 written as
 595 \backslash
 596 COV
 597 \end_layout
 598
 599 \end_inset
 600
 601  for covariances,
 602  and
 603 \begin_inset Formula $\Prob$
 604 \end_inset
 605
 606
 607 \begin_inset Note Note
 608 status collapsed
 609
 610 \begin_layout Plain Layout
 611 written as
 612 \backslash
 613 Prob
 614 \end_layout
 615
 616 \end_inset
 617
 618  for probabilities.
 619 \end_layout
 620
 621 \begin_layout Standard
 622 Writing several lines of code:
 623 \end_layout
 624
 625 \begin_layout Standard
 626 \begin_inset Flex Code Chunk
 627 status open
 628
 629 \begin_layout Code
 630
 631 first line of code
 632 \end_layout
 633
 634 \begin_layout Code
 635
 636 second line of code
 637 \end_layout
 638
 639 \begin_layout Code
 640
 641 third line of code
 642 \end_layout
 643
 644 \end_inset
 645
 646
 647 \end_layout
 648
 649 \begin_layout Standard
 650 Alternatively,
 651  you can distinguish between input and output code:
 652 \end_layout
 653
 654 \begin_layout Standard
 655 \begin_inset Flex Code Chunk
 656 status open
 657
 658 \begin_layout Code Input
 659
 660 first line of input code
 661 \end_layout
 662
 663 \begin_layout Code Input
 664
 665 second line of input code
 666 \end_layout
 667
 668 \begin_layout Code Output
 669
 670 first line of output code
 671 \end_layout
 672
 673 \begin_layout Code Output
 674
 675 second line of output code
 676 \end_layout
 677
 678 \begin_layout Code Output
 679
 680 third line of output code
 681 \end_layout
 682
 683 \end_inset
 684
 685
 686 \end_layout
 687
 688 \begin_layout Section*
 689 Acknowledgments
 690 \end_layout
 691
 692 \begin_layout Standard
 693 Here you can write some acknowledgments.
 694 \end_layout
 695
 696 \begin_layout Section
 697 \start_of_appendix
 698 This is the first appendix section
 699 \end_layout
 700
 701 \begin_layout Subsection
 702 A subsection
 703 \end_layout
 704
 705 \begin_layout Subsubsection
 706 A subsubsection
 707 \end_layout
 708
 709 \begin_layout Standard
 710 some text
 711 \end_layout
 712
 713 \end_body
 714 \end_document