lib/templates/Articles/Journal_of_Statistical_Software_%28JSS%29_version_2.lyx

   1 #LyX 2.4 created this file. For more info see https://www.lyx.org/
   2 \lyxformat 600
   3 \begin_document
   4 \begin_header
   5 \save_transient_properties true
   6 \origin /systemlyxdir/templates/Articles/
   7 \textclass jss
   8 \begin_preamble
   9 %the following commands are used only for book or software reviews
  10
  11 %\Reviewer{Some Author\\University of Somewhere}
  12 %\Plainreviewer{Some Author}
  13
  14 %the following commands are used for articles, codesnippets, book reviews and software reviews
  15
  16 %publication information
  17 %do not use these commands before the article has been accepted
  18 %\Volume{00}
  19 %\Issue{0}
  20 %\Month{Month}
  21 %\Year{2000}
  22 %\Submitdate{2000-00-00}
  23 %\Acceptdate{2000-00-00}
  24
  25 %if you use Sweave,  include the following line (with % symbols):
  26 %% need no \usepackage{Sweave.sty}
  27 \end_preamble
  28 \options article
  29 \use_default_options false
  30 \maintain_unincluded_children no
  31 \language english
  32 \language_package default
  33 \inputencoding utf8
  34 \fontencoding auto
  35 \font_roman "default" "default"
  36 \font_sans "default" "default"
  37 \font_typewriter "default" "default"
  38 \font_math "auto" "auto"
  39 \font_default_family default
  40 \use_non_tex_fonts false
  41 \font_sc false
  42 \font_sans_osf false
  43 \font_typewriter_osf false
  44 \font_roman_osf false
  45 \font_sf_scale 100 100
  46 \font_tt_scale 100 100
  47 \use_microtype false
  48 \use_dash_ligatures true
  49 \graphics default
  50 \default_output_format pdf2
  51 \output_sync 0
  52 \bibtex_command default
  53 \index_command default
  54 \paperfontsize default
  55 \spacing single
  56 \use_hyperref false
  57 \papersize default
  58 \use_geometry false
  59 \use_package amsmath 1
  60 \use_package amssymb 1
  61 \use_package cancel 1
  62 \use_package esint 1
  63 \use_package mathdots 1
  64 \use_package mathtools 1
  65 \use_package mhchem 1
  66 \use_package stackrel 1
  67 \use_package stmaryrd 1
  68 \use_package undertilde 1
  69 \cite_engine natbib
  70 \cite_engine_type authoryear
  71 \biblio_style plainnat
  72 \use_bibtopic false
  73 \use_indices false
  74 \paperorientation portrait
  75 \suppress_date false
  76 \justification true
  77 \use_refstyle 0
  78 \use_minted 0
  79 \use_lineno 0
  80 \index Index
  81 \shortcut idx
  82 \color #008000
  83 \end_index
  84 \secnumdepth 3
  85 \tocdepth 3
  86 \paragraph_separation indent
  87 \paragraph_indentation default
  88 \is_math_indent 0
  89 \math_numbering_side default
  90 \quotes_style english
  91 \dynamic_quotes 0
  92 \papercolumns 1
  93 \papersides 1
  94 \paperpagestyle default
  95 \tracking_changes false
  96 \postpone_fragile_content false
  97 \output_changes false
  98 \html_math_output 0
  99 \html_css_as_file 0
 100 \html_be_strict false
 101 \end_header
 102
 103 \begin_body
 104
 105 \begin_layout Standard
 106 \begin_inset Note Note
 107 status open
 108
 109 \begin_layout Plain Layout
 110 This is a template \SpecialChar LyX
 111  file for articles to be submitted to the Journal of
 112  Statistical Software (JSS).
 113  How to install the JSS \SpecialChar LaTeX
 114  class to your \SpecialChar LaTeX
 115  system is explained in
 116 \begin_inset Flex URL
 117 status open
 118
 119 \begin_layout Plain Layout
 120
 121 https://wiki.lyx.org/Layouts/JSS
 122 \end_layout
 123
 124 \end_inset
 125
 126 .
 127 \end_layout
 128
 129 \end_inset
 130
 131
 132 \begin_inset Note Note
 133 status open
 134
 135 \begin_layout Plain Layout
 136 To use the JSS codesnippet, bookreview or softwarereview styles, replace
 137  the option
 138 \begin_inset Quotes eld
 139 \end_inset
 140
 141 article
 142 \begin_inset Quotes erd
 143 \end_inset
 144
 145  in Document\SpecialChar menuseparator
 146 Settings\SpecialChar menuseparator
 147 Document Class\SpecialChar menuseparator
 148 Options with
 149 \begin_inset Quotes eld
 150 \end_inset
 151
 152 codesnippet
 153 \begin_inset Quotes erd
 154 \end_inset
 155
 156 ,
 157 \begin_inset Quotes eld
 158 \end_inset
 159
 160 bookreview
 161 \begin_inset Quotes erd
 162 \end_inset
 163
 164  or
 165 \begin_inset Quotes eld
 166 \end_inset
 167
 168 softwarereview
 169 \begin_inset Quotes erd
 170 \end_inset
 171
 172  and remove/uncomment the relevant parts in the \SpecialChar LaTeX
 173  Preamble.
 174
 175 \end_layout
 176
 177 \begin_layout Plain Layout
 178 If you want to use this JSS article style for a non-JSS article, replace
 179  the option
 180 \begin_inset Quotes eld
 181 \end_inset
 182
 183 article
 184 \begin_inset Quotes erd
 185 \end_inset
 186
 187  with
 188 \begin_inset Quotes eld
 189 \end_inset
 190
 191 nojss
 192 \begin_inset Quotes erd
 193 \end_inset
 194
 195 .
 196  This will suppress the JSS-specific parts of the layout.
 197 \end_layout
 198
 199 \begin_layout Plain Layout
 200 To include the JSS-specific parts of the layout, the article has to be processed
 201  with PDF, i.
 202 \begin_inset space \thinspace{}
 203 \end_inset
 204
 205 e.
 206 \begin_inset space ~
 207 \end_inset
 208
 209 you cannot process it with DVI or PS.
 210  However, if the option
 211 \begin_inset Quotes eld
 212 \end_inset
 213
 214 nojss
 215 \begin_inset Quotes erd
 216 \end_inset
 217
 218  is used, it can be processed with DVI or PS.
 219 \end_layout
 220
 221 \end_inset
 222
 223
 224 \end_layout
 225
 226 \begin_layout Title
 227 A Capitalized Title: Something about a Package
 228 \begin_inset Flex Pkg
 229 status open
 230
 231 \begin_layout Plain Layout
 232 foo
 233 \end_layout
 234
 235 \end_inset
 236
 237
 238 \end_layout
 239
 240 \begin_layout Plain Title
 241 A Capitalized Title: Something about a Package foo
 242 \begin_inset Note Note
 243 status open
 244
 245 \begin_layout Plain Layout
 246 optional
 247 \end_layout
 248
 249 \end_inset
 250
 251
 252 \end_layout
 253
 254 \begin_layout Author
 255 Achim Zeileis
 256 \begin_inset Newline newline
 257 \end_inset
 258
 259 Universität Innsbruck
 260 \begin_inset ERT
 261 status collapsed
 262
 263 \begin_layout Plain Layout
 264
 265
 266 \backslash
 267 And
 268 \end_layout
 269
 270 \end_inset
 271
 272 Second Author
 273 \begin_inset Newline newline
 274 \end_inset
 275
 276 Plus Affiliation
 277 \end_layout
 278
 279 \begin_layout Plain Author
 280 Achim Zeileis, Second Author
 281 \begin_inset Note Note
 282 status open
 283
 284 \begin_layout Plain Layout
 285 optional
 286 \end_layout
 287
 288 \end_inset
 289
 290
 291 \end_layout
 292
 293 \begin_layout Short Title
 294 \begin_inset Flex Pkg
 295 status open
 296
 297 \begin_layout Plain Layout
 298 foo
 299 \end_layout
 300
 301 \end_inset
 302
 303 : A Capitalized Title
 304 \begin_inset Note Note
 305 status collapsed
 306
 307 \begin_layout Plain Layout
 308 only if necessary
 309 \end_layout
 310
 311 \end_inset
 312
 313
 314 \end_layout
 315
 316 \begin_layout Abstract
 317 \noindent
 318 The abstract of the article.
 319  The abstract of the article.The abstract of the article.The abstract of the
 320  article.The abstract of the article.The abstract of the article.The abstract
 321  of the article.The abstract of the article.The abstract of the article.The
 322  abstract of the article.The abstract of the article.The abstract of the article.Th
 323 e abstract of the article.The abstract of the article.The abstract of the
 324  article.The abstract of the article.The abstract of the article.
 325 \end_layout
 326
 327 \begin_layout Keywords
 328 keywords, comma-separated, not capitalized,
 329 \begin_inset Flex Proglang
 330 status open
 331
 332 \begin_layout Plain Layout
 333 Java
 334 \end_layout
 335
 336 \end_inset
 337
 338
 339 \begin_inset Note Note
 340 status open
 341
 342 \begin_layout Plain Layout
 343 at least one keyword must be supplied
 344 \end_layout
 345
 346 \end_inset
 347
 348
 349 \end_layout
 350
 351 \begin_layout Plain Keywords
 352 keyword 1, keyword 2, foo, R
 353 \end_layout
 354
 355 \begin_layout Address
 356 Achim Zeileis
 357 \begin_inset Newline newline
 358 \end_inset
 359
 360 Department of Statistics and Mathematics
 361 \begin_inset Newline newline
 362 \end_inset
 363
 364 Faculty of Economics and Statistics
 365 \begin_inset Newline newline
 366 \end_inset
 367
 368 Universität Innsbruck
 369 \begin_inset Newline newline
 370 \end_inset
 371
 372 6020 Innsbruck, Austria
 373 \begin_inset Newline newline
 374 \end_inset
 375
 376 E-mail:
 377 \begin_inset Flex E-mail
 378 status open
 379
 380 \begin_layout Plain Layout
 381
 382 Achim.Zeileis@uibk.ac.at
 383 \end_layout
 384
 385 \end_inset
 386
 387
 388 \begin_inset Newline newline
 389 \end_inset
 390
 391 URL:
 392 \begin_inset Flex URL
 393 status open
 394
 395 \begin_layout Plain Layout
 396
 397 http://eeecon.uibk.ac.at/~zeileis/
 398 \end_layout
 399
 400 \end_inset
 401
 402
 403 \begin_inset Note Note
 404 status open
 405
 406 \begin_layout Plain Layout
 407 It is also possible to add a telephone and fax number before the e-mail
 408  in the following format:
 409 \begin_inset Newline newline
 410 \end_inset
 411
 412 Telephone: +43/512/507-7103
 413 \end_layout
 414
 415 \begin_layout Plain Layout
 416 Fax: +43/512/507-2851
 417 \end_layout
 418
 419 \end_inset
 420
 421
 422 \end_layout
 423
 424 \begin_layout Section
 425 About package
 426 \begin_inset Flex Pkg
 427 status open
 428
 429 \begin_layout Plain Layout
 430 foo
 431 \end_layout
 432
 433 \end_inset
 434
 435  in
 436 \begin_inset Flex Proglang
 437 status open
 438
 439 \begin_layout Plain Layout
 440 R
 441 \end_layout
 442
 443 \end_inset
 444
 445
 446 \begin_inset Argument 1
 447 status open
 448
 449 \begin_layout Plain Layout
 450 About package foo in R
 451 \end_layout
 452
 453 \end_inset
 454
 455
 456 \begin_inset Note Note
 457 status collapsed
 458
 459 \begin_layout Plain Layout
 460 The short title provides bookmarks for PDF files
 461 \end_layout
 462
 463 \end_inset
 464
 465
 466 \end_layout
 467
 468 \begin_layout Standard
 469 The special JSS style commands related to software and mathematical formulas
 470  are written as follows in \SpecialChar LyX
 471 :
 472 \begin_inset Flex Proglang
 473 status open
 474
 475 \begin_layout Plain Layout
 476 R
 477 \end_layout
 478
 479 \end_inset
 480
 481  or
 482 \begin_inset Flex Proglang
 483 status open
 484
 485 \begin_layout Plain Layout
 486 R
 487 \end_layout
 488
 489 \end_inset
 490
 491  for the names of programming languages,
 492 \begin_inset Flex Pkg
 493 status open
 494
 495 \begin_layout Plain Layout
 496 foo
 497 \end_layout
 498
 499 \end_inset
 500
 501  or
 502 \begin_inset Flex Pkg
 503 status open
 504
 505 \begin_layout Plain Layout
 506 foo
 507 \end_layout
 508
 509 \end_inset
 510
 511  for software packages, and
 512 \begin_inset Flex Code
 513 status open
 514
 515 \begin_layout Plain Layout
 516 some code
 517 \end_layout
 518
 519 \end_inset
 520
 521  or
 522 \begin_inset Flex Pkg
 523 status open
 524
 525 \begin_layout Plain Layout
 526 some code
 527 \end_layout
 528
 529 \end_inset
 530
 531  for code;
 532 \begin_inset Formula $\E$
 533 \end_inset
 534
 535
 536 \begin_inset Note Note
 537 status collapsed
 538
 539 \begin_layout Plain Layout
 540 written as
 541 \backslash
 542 E
 543 \end_layout
 544
 545 \end_inset
 546
 547  for expectations,
 548 \begin_inset Formula $\VAR$
 549 \end_inset
 550
 551
 552 \begin_inset Note Note
 553 status collapsed
 554
 555 \begin_layout Plain Layout
 556 written as
 557 \backslash
 558 VAR
 559 \end_layout
 560
 561 \end_inset
 562
 563  for variances,
 564 \begin_inset Formula $\COV$
 565 \end_inset
 566
 567
 568 \begin_inset Note Note
 569 status collapsed
 570
 571 \begin_layout Plain Layout
 572 written as
 573 \backslash
 574 COV
 575 \end_layout
 576
 577 \end_inset
 578
 579  for covariances, and
 580 \begin_inset Formula $\Prob$
 581 \end_inset
 582
 583
 584 \begin_inset Note Note
 585 status collapsed
 586
 587 \begin_layout Plain Layout
 588 written as
 589 \backslash
 590 Prob
 591 \end_layout
 592
 593 \end_inset
 594
 595  for probabilities.
 596 \end_layout
 597
 598 \begin_layout Standard
 599 Writing several lines of code:
 600 \end_layout
 601
 602 \begin_layout Standard
 603 \begin_inset Flex Code Chunk
 604 status open
 605
 606 \begin_layout Code
 607
 608 first line of code
 609 \end_layout
 610
 611 \begin_layout Code
 612
 613 second line of code
 614 \end_layout
 615
 616 \begin_layout Code
 617
 618 third line of code
 619 \end_layout
 620
 621 \end_inset
 622
 623
 624 \end_layout
 625
 626 \begin_layout Standard
 627 Alternatively, you can distinguish between input and output code:
 628 \end_layout
 629
 630 \begin_layout Standard
 631 \begin_inset Flex Code Chunk
 632 status open
 633
 634 \begin_layout Code Input
 635
 636 first line of input code
 637 \end_layout
 638
 639 \begin_layout Code Input
 640
 641 second line of input code
 642 \end_layout
 643
 644 \begin_layout Code Output
 645
 646 first line of output code
 647 \end_layout
 648
 649 \begin_layout Code Output
 650
 651 second line of output code
 652 \end_layout
 653
 654 \begin_layout Code Output
 655
 656 third line of output code
 657 \end_layout
 658
 659 \end_inset
 660
 661
 662 \end_layout
 663
 664 \begin_layout Section*
 665 Acknowledgments
 666 \end_layout
 667
 668 \begin_layout Standard
 669 Here you can write some acknowledgments.
 670 \end_layout
 671
 672 \begin_layout Section
 673 \start_of_appendix
 674 This is the first appendix section
 675 \end_layout
 676
 677 \begin_layout Subsection
 678 A subsection
 679 \end_layout
 680
 681 \begin_layout Subsubsection
 682 A subsubsection
 683 \end_layout
 684
 685 \begin_layout Standard
 686 some text
 687 \end_layout
 688
 689 \end_body
 690 \end_document