lib/scripts/lyxsweave.R

   1 # file lyxsweave.R
   2 # This file is part of LyX, the document processor.
   3 # Licence details can be found in the file COPYING.
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   5 # author Jean-Marc Lasgouttes
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   7 # Full author contact details are available in file CREDITS
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   9 # Wrapper around Sweave that sets up some things for LyX
  10 # argument 1 is the absolute name of the input file
  11 # argument 2 is the absolute name of the output file
  12 # argument 3 is the iconv name for the encoding of the file
  13 # argument 4 is the original document directory
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  15 ls.args <- commandArgs(trailingOnly=TRUE)
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  17 # check whether Sweave.sty is seen by LaTeX. if it is not, we will
  18 # pass the option stylepath=TRUE to sweave so that a full path is given
  19 # to \usepackage.
  20 ls.sweavesty <- system("kpsewhich Sweave.sty", intern=TRUE, ignore.stderr=TRUE)
  21 ls.sp <- (length(ls.sweavesty) == 0)
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  23 # set default encoding for input and output files; ls.enc is used in
  24 # the sweave module preamble to reset the encoding to what it was.
  25 ls.enc <- getOption("encoding")
  26 options(encoding=ls.args[3])
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  28 # Change current directory to the document directory, so that R can find
  29 # data files.
  30 setwd(ls.args[4])
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  32 # this is passed as a prefix.string to tell where temporary files should go
  33 ls.pr <- gsub('\\.([^/]*)$', '-\\1', sub("\\.tex$", "", ls.args[2]))
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  35 # Replace the default pdf device by the null device (tip from Yihui Xie)
  36 # See: http://yihui.name/en/2010/12/a-special-graphics-device-in-r-the-null-device/
  37 .Call("R_GD_nullDevice", PACKAGE = "grDevices")
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  40 # finally run sweave
  41 Sweave(file=ls.args[1], output=ls.args[2], syntax="SweaveSyntaxNoweb", stylepath=ls.sp, prefix.string=ls.pr)